MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007604	CGT	2	6	320532	320537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299134
6002	NC_007604	CAGA	2	8	320547	320554	50 %	0 %	25 %	25 %	81299134
6003	NC_007604	C	6	6	320602	320607	0 %	0 %	0 %	100 %	81299134
6004	NC_007604	GCA	2	6	320627	320632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299134
6005	NC_007604	TCG	2	6	320657	320662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299134
6006	NC_007604	CGC	2	6	320837	320842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299135
6007	NC_007604	GAG	2	6	320856	320861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299135
6008	NC_007604	GCC	2	6	320956	320961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299135
6009	NC_007604	TGA	2	6	320967	320972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299135
6010	NC_007604	GGCAAG	2	12	320975	320986	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	81299135
6011	NC_007604	AGC	2	6	321044	321049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299135
6012	NC_007604	CGC	2	6	321086	321091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299135
6013	NC_007604	AGC	2	6	321126	321131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299135
6014	NC_007604	AAAG	2	8	321132	321139	75 %	0 %	25 %	0 %	81299135
6015	NC_007604	CAG	2	6	321148	321153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299135
6016	NC_007604	CCAA	2	8	321158	321165	50 %	0 %	0 %	50 %	81299135
6017	NC_007604	C	6	6	321266	321271	0 %	0 %	0 %	100 %	81299135
6018	NC_007604	CAG	2	6	321283	321288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299135
6019	NC_007604	AGGA	2	8	321338	321345	50 %	0 %	50 %	0 %	81299135
6020	NC_007604	GA	3	6	321344	321349	50 %	0 %	50 %	0 %	81299135
6021	NC_007604	ACC	2	6	321386	321391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299135
6022	NC_007604	GCC	3	9	321400	321408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299135
6023	NC_007604	GCA	2	6	321446	321451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299135
6024	NC_007604	CAG	2	6	321466	321471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299135
6025	NC_007604	ATG	2	6	321515	321520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299135
6026	NC_007604	GCCA	2	8	321542	321549	25 %	0 %	25 %	50 %	81299135
6027	NC_007604	AAC	2	6	321592	321597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299135
6028	NC_007604	TCA	2	6	321624	321629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299135
6029	NC_007604	TCG	2	6	321687	321692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299135
6030	NC_007604	CCA	2	6	321720	321725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299135
6031	NC_007604	ATTC	2	8	321858	321865	25 %	50 %	0 %	25 %	81299135
6032	NC_007604	AGG	2	6	321879	321884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299135
6033	NC_007604	ACA	2	6	321888	321893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299135
6034	NC_007604	A	8	8	321918	321925	100 %	0 %	0 %	0 %	81299135
6035	NC_007604	A	7	7	322023	322029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_007604	CACT	2	8	322039	322046	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_007604	AAT	2	6	322079	322084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_007604	GGTATT	2	12	322105	322116	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	81299136
6039	NC_007604	TGA	2	6	322143	322148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299136
6040	NC_007604	GCT	3	9	322173	322181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299136
6041	NC_007604	CT	3	6	322180	322185	0 %	50 %	0 %	50 %	81299136
6042	NC_007604	AAG	2	6	322217	322222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299136
6043	NC_007604	GCTGGG	2	12	322255	322266	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	81299136
6044	NC_007604	CAAG	2	8	322267	322274	50 %	0 %	25 %	25 %	81299136
6045	NC_007604	TTGT	2	8	322296	322303	0 %	75 %	25 %	0 %	81299136
6046	NC_007604	GCTGAG	2	12	322339	322350	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6047	NC_007604	CTT	2	6	322468	322473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299137
6048	NC_007604	TGT	2	6	322522	322527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299137
6049	NC_007604	GCCA	2	8	322577	322584	25 %	0 %	25 %	50 %	81299137
6050	NC_007604	GTA	2	6	322610	322615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299137
6051	NC_007604	AGC	2	6	322634	322639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299137
6052	NC_007604	GTG	2	6	322650	322655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299137
6053	NC_007604	GCC	2	6	322664	322669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299137
6054	NC_007604	AGC	2	6	322692	322697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299137
6055	NC_007604	CTT	2	6	322711	322716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299137
6056	NC_007604	TGG	2	6	322744	322749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299137
6057	NC_007604	GCA	2	6	322752	322757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299137
6058	NC_007604	TGA	2	6	322846	322851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299137
6059	NC_007604	CAGT	2	8	322989	322996	25 %	25 %	25 %	25 %	81299138
6060	NC_007604	TTC	2	6	323098	323103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299138
6061	NC_007604	GTA	2	6	323152	323157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299138
6062	NC_007604	GCAG	2	8	323169	323176	25 %	0 %	50 %	25 %	81299138
6063	NC_007604	GTTG	2	8	323244	323251	0 %	50 %	50 %	0 %	81299138
6064	NC_007604	GCTT	2	8	323255	323262	0 %	50 %	25 %	25 %	81299138
6065	NC_007604	GAC	2	6	323307	323312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299138
6066	NC_007604	TCC	2	6	323424	323429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_007604	GAG	2	6	323568	323573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_007604	TCG	2	6	323647	323652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_007604	TAA	2	6	323683	323688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_007604	GAG	2	6	323765	323770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_007604	CAG	2	6	323819	323824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299139
6072	NC_007604	GCA	2	6	323938	323943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299139
6073	NC_007604	TTC	2	6	323992	323997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299139
6074	NC_007604	CGT	2	6	324036	324041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299139
6075	NC_007604	GCG	2	6	324057	324062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299139
6076	NC_007604	GAC	2	6	324084	324089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299139
6077	NC_007604	GTT	2	6	324096	324101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299139
6078	NC_007604	GGC	2	6	324243	324248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299139
6079	NC_007604	GTG	2	6	324265	324270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299139
6080	NC_007604	CCGA	2	8	324298	324305	25 %	0 %	25 %	50 %	81299139
6081	NC_007604	TGC	2	6	324308	324313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299139
6082	NC_007604	GCT	2	6	324321	324326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299139
6083	NC_007604	CAG	2	6	324329	324334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299139
6084	NC_007604	TTGG	2	8	324358	324365	0 %	50 %	50 %	0 %	81299139
6085	NC_007604	GTG	2	6	324367	324372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299139
6086	NC_007604	TTG	2	6	324378	324383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299139
6087	NC_007604	GCG	2	6	324388	324393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299139
6088	NC_007604	GTT	2	6	324405	324410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299139
6089	NC_007604	CGC	2	6	324413	324418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299139
6090	NC_007604	CGA	2	6	324436	324441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299139
6091	NC_007604	GTT	2	6	324474	324479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299139
6092	NC_007604	CGTG	2	8	324483	324490	0 %	25 %	50 %	25 %	81299139
6093	NC_007604	GCT	2	6	324563	324568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299139
6094	NC_007604	CTT	2	6	324668	324673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299139
6095	NC_007604	TTC	2	6	324702	324707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299139
6096	NC_007604	AGT	2	6	324713	324718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299139
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6098	NC_007604	TGC	2	6	324756	324761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299139
6099	NC_007604	CTC	2	6	324801	324806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81299139
6100	NC_007604	AAG	2	6	324829	324834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299139
6101	NC_007604	GCG	2	6	324915	324920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299139
6102	NC_007604	TTC	2	6	325045	325050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299139
6103	NC_007604	GCT	2	6	325160	325165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299139
6104	NC_007604	AGT	2	6	325211	325216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299139
6105	NC_007604	CCA	2	6	325289	325294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299139
6106	NC_007604	CGCC	2	8	325370	325377	0 %	0 %	25 %	75 %	81299139
6107	NC_007604	GC	3	6	325452	325457	0 %	0 %	50 %	50 %	81299139
6108	NC_007604	CAC	2	6	325502	325507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299139
6109	NC_007604	GAA	2	6	325530	325535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299139
6110	NC_007604	GCCACC	2	12	325536	325547	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	81299139
6111	NC_007604	ACT	2	6	325548	325553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299139
6112	NC_007604	CGA	2	6	325556	325561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299139
6113	NC_007604	GCTTC	2	10	325577	325586	0 %	40 %	20 %	40 %	81299139
6114	NC_007604	GC	3	6	325591	325596	0 %	0 %	50 %	50 %	81299139
6115	NC_007604	TTC	2	6	325599	325604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299139
6116	NC_007604	GCT	2	6	325684	325689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299139
6117	NC_007604	TGA	2	6	325718	325723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299139
6118	NC_007604	TTG	2	6	325806	325811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299139
6119	NC_007604	TCG	2	6	325826	325831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299139
6120	NC_007604	GCC	2	6	325875	325880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299139
6121	NC_007604	CGA	2	6	325986	325991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6123	NC_007604	GGC	2	6	326040	326045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6494	NC_007604	CGC	3	9	346303	346311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299164
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6496	NC_007604	GTTTT	2	10	346439	346448	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6497	NC_007604	AAT	2	6	346458	346463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6498	NC_007604	TTC	2	6	346487	346492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6499	NC_007604	ACT	2	6	346544	346549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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