MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_007604	GTC	2	6	295388	295393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299108
5502	NC_007604	CCG	2	6	295422	295427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299108
5503	NC_007604	TGC	2	6	295452	295457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299108
5504	NC_007604	TCC	2	6	295465	295470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81299108
5505	NC_007604	TGGC	2	8	295503	295510	0 %	25 %	50 %	25 %	81299108
5506	NC_007604	CTT	2	6	295525	295530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299108
5507	NC_007604	TCG	2	6	295563	295568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299108
5508	NC_007604	AAGCCA	2	12	295605	295616	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	81299108
5509	NC_007604	GTC	2	6	295659	295664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299108
5510	NC_007604	CGG	2	6	295681	295686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299108
5511	NC_007604	ACG	2	6	295692	295697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299108
5512	NC_007604	ATGG	2	8	295733	295740	25 %	25 %	50 %	0 %	81299108
5513	NC_007604	CAT	3	9	295759	295767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299108
5514	NC_007604	GCG	2	6	295772	295777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299108
5515	NC_007604	GTG	2	6	295838	295843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299108
5516	NC_007604	GTC	2	6	295866	295871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299108
5517	NC_007604	CGCC	2	8	295936	295943	0 %	0 %	25 %	75 %	81299108
5518	NC_007604	CTG	2	6	295979	295984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299108
5519	NC_007604	GCT	2	6	296003	296008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299108
5520	NC_007604	CGC	2	6	296009	296014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299108
5521	NC_007604	GATG	2	8	296032	296039	25 %	25 %	50 %	0 %	81299108
5522	NC_007604	CGAT	2	8	296052	296059	25 %	25 %	25 %	25 %	81299108
5523	NC_007604	GAA	2	6	296080	296085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299108
5524	NC_007604	TGG	2	6	296118	296123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299108
5525	NC_007604	A	6	6	296184	296189	100 %	0 %	0 %	0 %	81299108
5526	NC_007604	ATT	2	6	296195	296200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81299108
5527	NC_007604	TACC	2	8	296275	296282	25 %	25 %	0 %	50 %	81299108
5528	NC_007604	GTC	2	6	296313	296318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299108
5529	NC_007604	GAA	2	6	296324	296329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299108
5530	NC_007604	GAA	2	6	296345	296350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299108
5531	NC_007604	GAC	2	6	296353	296358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299108
5532	NC_007604	GCA	2	6	296377	296382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299108
5533	NC_007604	TGC	2	6	296491	296496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299108
5534	NC_007604	GCC	2	6	296522	296527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299108
5535	NC_007604	GAC	2	6	296534	296539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299108
5536	NC_007604	TGG	2	6	296553	296558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299108
5537	NC_007604	TTGA	2	8	296588	296595	25 %	50 %	25 %	0 %	81299108
5538	NC_007604	GAAA	2	8	296638	296645	75 %	0 %	25 %	0 %	81299108
5539	NC_007604	GAA	2	6	296657	296662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299108
5540	NC_007604	CAA	3	9	296677	296685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299108
5541	NC_007604	TTGA	2	8	296722	296729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_007604	T	6	6	296760	296765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_007604	CAAG	2	8	296792	296799	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5544	NC_007604	CACCG	2	10	296827	296836	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5545	NC_007604	ATCC	2	8	296927	296934	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_007604	TAGC	2	8	296963	296970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5547	NC_007604	TGA	2	6	297051	297056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299109
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5549	NC_007604	AGGCC	2	10	297063	297072	20 %	0 %	40 %	40 %	81299109
5550	NC_007604	GCA	2	6	297159	297164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299109
5551	NC_007604	GAT	2	6	297184	297189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299109
5552	NC_007604	ATT	2	6	297223	297228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81299109
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5554	NC_007604	CGG	2	6	297335	297340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299109
5555	NC_007604	GGGTA	2	10	297390	297399	20 %	20 %	60 %	0 %	81299109
5556	NC_007604	ATA	2	6	297446	297451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81299109
5557	NC_007604	AGCT	2	8	297520	297527	25 %	25 %	25 %	25 %	81299109
5558	NC_007604	AAC	2	6	297545	297550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299109
5559	NC_007604	CTC	2	6	297607	297612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81299109
5560	NC_007604	CTG	2	6	297631	297636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299110
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5565	NC_007604	ATC	2	6	297895	297900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299110
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5570	NC_007604	GAT	2	6	298077	298082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299110
5571	NC_007604	GCT	2	6	298127	298132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299110
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5573	NC_007604	GCA	2	6	298358	298363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299110
5574	NC_007604	CTG	2	6	298380	298385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_007604	TGA	2	6	298505	298510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299111
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5579	NC_007604	T	6	6	298616	298621	0 %	100 %	0 %	0 %	81299111
5580	NC_007604	GCT	2	6	298687	298692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299111
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5582	NC_007604	CCGAC	2	10	298781	298790	20 %	0 %	20 %	60 %	81299111
5583	NC_007604	CTCA	2	8	298866	298873	25 %	25 %	0 %	50 %	81299111
5584	NC_007604	CGCC	2	8	298880	298887	0 %	0 %	25 %	75 %	81299111
5585	NC_007604	TCA	2	6	298925	298930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299111
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5588	NC_007604	CGA	2	6	298961	298966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299111
5589	NC_007604	GCA	2	6	299011	299016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299111
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5593	NC_007604	GT	3	6	299369	299374	0 %	50 %	50 %	0 %	81299111
5594	NC_007604	GGGAGA	2	12	299405	299416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299111
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5596	NC_007604	TGA	2	6	299450	299455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_007604	AGTGG	2	10	299497	299506	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_007604	CCT	2	6	299532	299537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5599	NC_007604	CGG	2	6	299566	299571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5606	NC_007604	CAA	3	9	299873	299881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299112
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5609	NC_007604	GCT	2	6	299921	299926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299112
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5614	NC_007604	TGG	2	6	300276	300281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299113
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5618	NC_007604	GATC	2	8	300523	300530	25 %	25 %	25 %	25 %	81299113
5619	NC_007604	CAG	2	6	300620	300625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299113
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5621	NC_007604	GAT	2	6	300778	300783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299113
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5623	NC_007604	GCG	2	6	300866	300871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299113
5624	NC_007604	GAT	2	6	300875	300880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299113
5625	NC_007604	CGT	2	6	300919	300924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299113
5626	NC_007604	GTC	2	6	300929	300934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299113
5627	NC_007604	GC	3	6	300951	300956	0 %	0 %	50 %	50 %	81299113
5628	NC_007604	CGG	2	6	300991	300996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299113
5629	NC_007604	ATCG	2	8	301205	301212	25 %	25 %	25 %	25 %	81299113
5630	NC_007604	GAG	2	6	301238	301243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299113
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5633	NC_007604	CT	4	8	301464	301471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5634	NC_007604	TGA	2	6	301482	301487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5636	NC_007604	CCGACT	2	12	301566	301577	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	81299114
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5639	NC_007604	GGT	2	6	301656	301661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299114
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5656	NC_007604	TGCA	2	8	302582	302589	25 %	25 %	25 %	25 %	81299114
5657	NC_007604	GCGT	2	8	302678	302685	0 %	25 %	50 %	25 %	81299114
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5678	NC_007604	AAATC	2	10	303725	303734	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5679	NC_007604	AAT	2	6	303787	303792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5992	NC_007604	GCG	2	6	320167	320172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299134
5993	NC_007604	AGG	2	6	320185	320190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299134
5994	NC_007604	AGC	2	6	320229	320234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299134
5995	NC_007604	GCC	2	6	320257	320262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299134
5996	NC_007604	CAAG	2	8	320266	320273	50 %	0 %	25 %	25 %	81299134
5997	NC_007604	GC	3	6	320341	320346	0 %	0 %	50 %	50 %	81299134
5998	NC_007604	TCC	2	6	320362	320367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81299134
5999	NC_007604	GCA	2	6	320408	320413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299134
6000	NC_007604	CAG	2	6	320418	320423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299134

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