MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_007604	CAACA	2	10	2675093	2675102	60 %	0 %	0 %	40 %	81301400
50003	NC_007604	CA	3	6	2675139	2675144	50 %	0 %	0 %	50 %	81301400
50004	NC_007604	GCC	2	6	2675145	2675150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301400
50005	NC_007604	CAT	2	6	2675189	2675194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301400
50006	NC_007604	CGT	2	6	2675201	2675206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301400
50007	NC_007604	AGC	2	6	2675227	2675232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301400
50008	NC_007604	TAAT	2	8	2675314	2675321	50 %	50 %	0 %	0 %	81301401
50009	NC_007604	GCT	2	6	2675343	2675348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301401
50010	NC_007604	CTT	2	6	2675388	2675393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301401
50011	NC_007604	CTG	2	6	2675416	2675421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301401
50012	NC_007604	TCGA	2	8	2675422	2675429	25 %	25 %	25 %	25 %	81301401
50013	NC_007604	AGCA	2	8	2675434	2675441	50 %	0 %	25 %	25 %	81301401
50014	NC_007604	TCC	2	6	2675497	2675502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81301401
50015	NC_007604	CAC	2	6	2675509	2675514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301401
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50017	NC_007604	CCG	2	6	2675652	2675657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301401
50018	NC_007604	CTG	2	6	2675694	2675699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301401
50019	NC_007604	GC	3	6	2675716	2675721	0 %	0 %	50 %	50 %	81301401
50020	NC_007604	AGCA	2	8	2675722	2675729	50 %	0 %	25 %	25 %	81301401
50021	NC_007604	TAA	2	6	2675786	2675791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81301401
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50024	NC_007604	GCAGA	2	10	2675845	2675854	40 %	0 %	40 %	20 %	81301401
50025	NC_007604	GAG	2	6	2675857	2675862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81301401
50026	NC_007604	CAT	2	6	2675920	2675925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301401
50027	NC_007604	AAG	2	6	2675934	2675939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50028	NC_007604	GTT	2	6	2675945	2675950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50029	NC_007604	TTTC	2	8	2675970	2675977	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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50034	NC_007604	ATT	2	6	2676260	2676265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81301402
50035	NC_007604	TGG	2	6	2676283	2676288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81301402
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50037	NC_007604	TCG	2	6	2676336	2676341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301402
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50044	NC_007604	GCC	4	12	2676531	2676542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301402
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50046	NC_007604	CAGT	2	8	2676789	2676796	25 %	25 %	25 %	25 %	81301403
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50050	NC_007604	GCTG	2	8	2676867	2676874	0 %	25 %	50 %	25 %	81301403
50051	NC_007604	GTGC	2	8	2676877	2676884	0 %	25 %	50 %	25 %	81301403
50052	NC_007604	GCCA	2	8	2676918	2676925	25 %	0 %	25 %	50 %	81301403
50053	NC_007604	TC	3	6	2676942	2676947	0 %	50 %	0 %	50 %	81301403
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50055	NC_007604	TAC	2	6	2676999	2677004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301403
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50059	NC_007604	CTGG	2	8	2677314	2677321	0 %	25 %	50 %	25 %	81301403
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50061	NC_007604	CTGC	2	8	2677387	2677394	0 %	25 %	25 %	50 %	81301404
50062	NC_007604	TGACT	2	10	2677404	2677413	20 %	40 %	20 %	20 %	81301404
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50102	NC_007604	TGCG	2	8	2679763	2679770	0 %	25 %	50 %	25 %	81301405
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50114	NC_007604	A	6	6	2680676	2680681	100 %	0 %	0 %	0 %	81301407
50115	NC_007604	GATCG	2	10	2680719	2680728	20 %	20 %	40 %	20 %	81301407
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50118	NC_007604	TCC	2	6	2680920	2680925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81301407
50119	NC_007604	CAT	2	6	2681088	2681093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301407
50120	NC_007604	CAG	2	6	2681095	2681100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301407
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50122	NC_007604	AACT	2	8	2681154	2681161	50 %	25 %	0 %	25 %	81301407
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50139	NC_007604	AGC	2	6	2682062	2682067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301409
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50206	NC_007604	CGAT	2	8	2685017	2685024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50207	NC_007604	TCAA	2	8	2685040	2685047	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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50222	NC_007604	CTG	2	6	2685549	2685554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301412
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50230	NC_007604	TTCAT	2	10	2686330	2686339	20 %	60 %	0 %	20 %	81301412
50231	NC_007604	CTT	2	6	2686367	2686372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301412
50232	NC_007604	GCCGC	2	10	2686403	2686412	0 %	0 %	40 %	60 %	81301412
50233	NC_007604	TCC	2	6	2686589	2686594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81301412
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50236	NC_007604	TTTG	2	8	2686696	2686703	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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