MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 plasmid 1

Total Repeats: 803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007595	CGG	2	6	29340	29345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230376
502	NC_007595	AAGC	2	8	29394	29401	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_007595	CGC	2	6	29503	29508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_007595	AG	3	6	29562	29567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_007595	GCA	2	6	29605	29610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_007595	GCGA	2	8	29640	29647	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
507	NC_007595	GCC	2	6	29694	29699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_007595	TGC	2	6	29714	29719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_007595	TAGC	2	8	29768	29775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_007595	GGC	2	6	29844	29849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_007595	CGCCC	2	10	29903	29912	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
512	NC_007595	TGA	2	6	29914	29919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_007595	AGG	2	6	29962	29967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81230353
514	NC_007595	ATTG	2	8	29983	29990	25 %	50 %	25 %	0 %	81230353
515	NC_007595	GCAG	2	8	30044	30051	25 %	0 %	50 %	25 %	81230353
516	NC_007595	GCT	2	6	30139	30144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230353
517	NC_007595	GACC	2	8	30202	30209	25 %	0 %	25 %	50 %	81230353
518	NC_007595	TCC	2	6	30320	30325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230353
519	NC_007595	GTA	2	6	30373	30378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230353
520	NC_007595	AGCG	2	8	30433	30440	25 %	0 %	50 %	25 %	81230353
521	NC_007595	GAT	2	6	30571	30576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230353
522	NC_007595	GGTC	2	8	30582	30589	0 %	25 %	50 %	25 %	81230353
523	NC_007595	GCG	2	6	30594	30599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230353
524	NC_007595	CAG	2	6	30610	30615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230353
525	NC_007595	AAG	2	6	30632	30637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81230353
526	NC_007595	GTG	2	6	30692	30697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81230353
527	NC_007595	CGAA	2	8	30701	30708	50 %	0 %	25 %	25 %	81230353
528	NC_007595	AGG	2	6	30712	30717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81230353
529	NC_007595	CAG	2	6	30792	30797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230353
530	NC_007595	AAT	2	6	30820	30825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81230353
531	NC_007595	TGG	2	6	30889	30894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81230353
532	NC_007595	AGG	2	6	30899	30904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81230353
533	NC_007595	GAT	2	6	31015	31020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230353
534	NC_007595	GAA	2	6	31052	31057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81230353
535	NC_007595	CGG	2	6	31135	31140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230353
536	NC_007595	GTCA	2	8	31258	31265	25 %	25 %	25 %	25 %	81230353
537	NC_007595	CGGTG	2	10	31291	31300	0 %	20 %	60 %	20 %	81230353
538	NC_007595	TCA	2	6	31317	31322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230353
539	NC_007595	GA	3	6	31345	31350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007595	AGA	2	6	31352	31357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_007595	ACT	2	6	31421	31426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_007595	AAT	2	6	31434	31439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007595	TGT	2	6	31446	31451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007595	AGA	2	6	31461	31466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_007595	TTTA	2	8	31537	31544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_007595	A	6	6	31574	31579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_007595	ATG	2	6	31702	31707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_007595	ATC	2	6	31724	31729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_007595	TAT	2	6	31757	31762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81230354
550	NC_007595	TCT	2	6	31781	31786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230354
551	NC_007595	CTT	2	6	31822	31827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230354
552	NC_007595	CAGC	2	8	31882	31889	25 %	0 %	25 %	50 %	81230354
553	NC_007595	AAC	2	6	32004	32009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81230354
554	NC_007595	CT	3	6	32043	32048	0 %	50 %	0 %	50 %	81230354
555	NC_007595	GCA	4	12	32056	32067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230354
556	NC_007595	GCT	2	6	32236	32241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230354
557	NC_007595	CTAT	2	8	32290	32297	25 %	50 %	0 %	25 %	81230354
558	NC_007595	GGT	2	6	32319	32324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81230354
559	NC_007595	GA	3	6	32381	32386	50 %	0 %	50 %	0 %	81230354
560	NC_007595	CAG	2	6	32388	32393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230354
561	NC_007595	TCG	2	6	32410	32415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230354
562	NC_007595	TGG	2	6	32499	32504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81230354
563	NC_007595	TTG	2	6	32546	32551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81230354
564	NC_007595	GCCT	2	8	32749	32756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
565	NC_007595	TGA	2	6	32863	32868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_007595	CGC	2	6	32898	32903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_007595	GC	3	6	33048	33053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_007595	CAAG	2	8	33083	33090	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
569	NC_007595	AAATC	2	10	33152	33161	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
570	NC_007595	CGC	2	6	33189	33194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_007595	GTCA	2	8	33326	33333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_007595	ACG	2	6	33477	33482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230355
573	NC_007595	GAC	2	6	33506	33511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230355
574	NC_007595	GAT	2	6	33527	33532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230355
575	NC_007595	GAGGAA	2	12	33554	33565	50 %	0 %	50 %	0 %	81230355
576	NC_007595	CCCG	2	8	33595	33602	0 %	0 %	25 %	75 %	81230355
577	NC_007595	ACG	2	6	33640	33645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230355
578	NC_007595	GA	4	8	33759	33766	50 %	0 %	50 %	0 %	81230355
579	NC_007595	CGA	2	6	33795	33800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_007595	AG	3	6	33824	33829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_007595	AATG	2	8	33881	33888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_007595	AGC	2	6	33941	33946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_007595	GAA	2	6	33953	33958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_007595	TTG	2	6	33959	33964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_007595	GCT	2	6	34021	34026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_007595	CA	4	8	34117	34124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_007595	GA	4	8	34145	34152	50 %	0 %	50 %	0 %	81230377
588	NC_007595	GCA	2	6	34182	34187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230377
589	NC_007595	GAC	2	6	34269	34274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230377
590	NC_007595	CCT	2	6	34301	34306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230377
591	NC_007595	CAG	2	6	34399	34404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_007595	GTT	2	6	34425	34430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_007595	AAT	2	6	34539	34544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81230357
594	NC_007595	CT	3	6	34576	34581	0 %	50 %	0 %	50 %	81230357
595	NC_007595	GGACT	2	10	34597	34606	20 %	20 %	40 %	20 %	81230357
596	NC_007595	GCT	2	6	34612	34617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230357
597	NC_007595	AGC	2	6	34673	34678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230357
598	NC_007595	ATT	2	6	34756	34761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81230357
599	NC_007595	TAT	2	6	34798	34803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81230357
600	NC_007595	GAA	2	6	34835	34840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81230357
601	NC_007595	AGC	2	6	34963	34968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230358
602	NC_007595	TCG	2	6	35043	35048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230358
603	NC_007595	CGGG	2	8	35057	35064	0 %	0 %	75 %	25 %	81230358
604	NC_007595	CTGG	2	8	35070	35077	0 %	25 %	50 %	25 %	81230358
605	NC_007595	CCG	2	6	35137	35142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_007595	CAA	2	6	35207	35212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_007595	CCA	2	6	35219	35224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_007595	TCAG	2	8	35233	35240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
609	NC_007595	TC	4	8	35279	35286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_007595	AAAC	2	8	35312	35319	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
611	NC_007595	GAA	2	6	35323	35328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_007595	GCA	2	6	35547	35552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_007595	GCT	2	6	35710	35715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230359
614	NC_007595	TCT	2	6	35729	35734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230359
615	NC_007595	CCA	2	6	35788	35793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230359
616	NC_007595	GTA	2	6	35946	35951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230359
617	NC_007595	CTTCTG	2	12	36023	36034	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	81230359
618	NC_007595	CTG	2	6	36091	36096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_007595	GAA	2	6	36099	36104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_007595	AACATG	2	12	36116	36127	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
621	NC_007595	CAC	2	6	36155	36160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_007595	GAA	2	6	36178	36183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_007595	CAGC	2	8	36380	36387	25 %	0 %	25 %	50 %	81230360
624	NC_007595	TC	3	6	36393	36398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_007595	CCA	2	6	36434	36439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_007595	ATC	2	6	36476	36481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_007595	ACT	2	6	36514	36519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230361
628	NC_007595	GTC	2	6	36533	36538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230361
629	NC_007595	CCAG	2	8	36617	36624	25 %	0 %	25 %	50 %	81230361
630	NC_007595	TGGG	2	8	36649	36656	0 %	25 %	75 %	0 %	81230361
631	NC_007595	CCG	2	6	36678	36683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230361
632	NC_007595	AGCG	2	8	36731	36738	25 %	0 %	50 %	25 %	81230361
633	NC_007595	C	6	6	36745	36750	0 %	0 %	0 %	100 %	81230361
634	NC_007595	CAC	2	6	36764	36769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230361
635	NC_007595	GA	3	6	36773	36778	50 %	0 %	50 %	0 %	81230361
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766	NC_007595	TCC	2	6	44523	44528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
767	NC_007595	TTC	2	6	44543	44548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
768	NC_007595	TGC	2	6	44587	44592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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770	NC_007595	GCTG	2	8	44643	44650	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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793	NC_007595	TGG	2	6	45812	45817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
794	NC_007595	TTCA	2	8	45864	45871	25 %	50 %	0 %	25 %	81230372
795	NC_007595	GTT	2	6	45872	45877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81230372
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799	NC_007595	CAAGG	2	10	46259	46268	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
800	NC_007595	ATC	2	6	46286	46291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
801	NC_007595	AGA	2	6	46300	46305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
802	NC_007595	TCT	2	6	46311	46316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
803	NC_007595	GA	4	8	46338	46345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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