MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49002	NC_007516	CAG	2	6	2260384	2260389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213963
49003	NC_007516	CTG	2	6	2260420	2260425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213963
49004	NC_007516	GGT	2	6	2260468	2260473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213963
49005	NC_007516	CAG	2	6	2260558	2260563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213963
49006	NC_007516	CGA	2	6	2260644	2260649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213963
49007	NC_007516	CGAA	2	8	2260697	2260704	50 %	0 %	25 %	25 %	78213963
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49117	NC_007516	CCT	2	6	2265488	2265493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213966
49118	NC_007516	GCC	2	6	2265496	2265501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213966
49119	NC_007516	TGA	2	6	2265524	2265529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213966
49120	NC_007516	CAAC	2	8	2265552	2265559	50 %	0 %	0 %	50 %	78213966
49121	NC_007516	GCT	3	9	2265647	2265655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213966
49122	NC_007516	AACGCA	2	12	2265706	2265717	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49123	NC_007516	GCCATT	2	12	2265764	2265775	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49124	NC_007516	CGA	2	6	2265930	2265935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213967
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49126	NC_007516	CTG	2	6	2266081	2266086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213967
49127	NC_007516	TGC	2	6	2266169	2266174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213967
49128	NC_007516	TTC	2	6	2266189	2266194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213967
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49130	NC_007516	ACG	2	6	2266262	2266267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213967
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49132	NC_007516	TCG	2	6	2266412	2266417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213967
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49134	NC_007516	TGG	2	6	2266547	2266552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213967
49135	NC_007516	GCCAAG	2	12	2266588	2266599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213967
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49140	NC_007516	CCA	2	6	2266841	2266846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213967
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49143	NC_007516	CGG	3	9	2266956	2266964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213967
49144	NC_007516	CTG	2	6	2266978	2266983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213967
49145	NC_007516	TGC	2	6	2266994	2266999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213967
49146	NC_007516	CGC	2	6	2267019	2267024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213967
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49148	NC_007516	T	6	6	2267154	2267159	0 %	100 %	0 %	0 %	78213968
49149	NC_007516	TGA	2	6	2267193	2267198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213968
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49187	NC_007516	CTTC	2	8	2269005	2269012	0 %	50 %	0 %	50 %	78213970
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49213	NC_007516	GCT	2	6	2269880	2269885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213971
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49215	NC_007516	CTG	2	6	2269946	2269951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213971
49216	NC_007516	GGC	2	6	2269982	2269987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213971
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49218	NC_007516	GCC	2	6	2270010	2270015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213971
49219	NC_007516	AGC	2	6	2270116	2270121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213971
49220	NC_007516	CGCT	2	8	2270140	2270147	0 %	25 %	25 %	50 %	78213971
49221	NC_007516	GGC	2	6	2270201	2270206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213971
49222	NC_007516	GTGAA	2	10	2270223	2270232	40 %	20 %	40 %	0 %	78213971
49223	NC_007516	CTC	2	6	2270257	2270262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213972
49224	NC_007516	GCG	2	6	2270281	2270286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213972
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49226	NC_007516	GCG	2	6	2270293	2270298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213972
49227	NC_007516	ATCCG	2	10	2270307	2270316	20 %	20 %	20 %	40 %	78213972
49228	NC_007516	TGC	2	6	2270516	2270521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213972
49229	NC_007516	CGG	2	6	2270525	2270530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213972
49230	NC_007516	TCAG	2	8	2270570	2270577	25 %	25 %	25 %	25 %	78213972
49231	NC_007516	GCA	2	6	2270582	2270587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213972
49232	NC_007516	AAC	2	6	2270684	2270689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213972
49233	NC_007516	CAC	2	6	2270707	2270712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213972
49234	NC_007516	GTG	2	6	2270722	2270727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213972
49235	NC_007516	ATC	2	6	2270741	2270746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213972
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49244	NC_007516	GGC	2	6	2271259	2271264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213972
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49290	NC_007516	TGC	2	6	2273295	2273300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213974
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49293	NC_007516	ACCT	2	8	2273391	2273398	25 %	25 %	0 %	50 %	78213975
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49315	NC_007516	T	6	6	2274282	2274287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49336	NC_007516	GGATC	2	10	2275363	2275372	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49337	NC_007516	TGAC	2	8	2275498	2275505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49338	NC_007516	CTG	2	6	2275524	2275529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49339	NC_007516	GCAGA	2	10	2275616	2275625	40 %	0 %	40 %	20 %	78213978
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49341	NC_007516	TTG	2	6	2275705	2275710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213978
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49344	NC_007516	TGCC	2	8	2275874	2275881	0 %	25 %	25 %	50 %	78213978
49345	NC_007516	CAT	2	6	2275941	2275946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213978
49346	NC_007516	CCA	2	6	2276000	2276005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213978
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49348	NC_007516	CAC	2	6	2276070	2276075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213978
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49467	NC_007516	TTC	2	6	2281954	2281959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213984
49468	NC_007516	GGC	2	6	2281984	2281989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213984
49469	NC_007516	TGG	2	6	2282009	2282014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213984
49470	NC_007516	TGG	2	6	2282030	2282035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213984
49471	NC_007516	TCGA	2	8	2282053	2282060	25 %	25 %	25 %	25 %	78213984
49472	NC_007516	GAC	2	6	2282077	2282082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213984
49473	NC_007516	GCT	2	6	2282097	2282102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213984
49474	NC_007516	CGG	2	6	2282115	2282120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213984
49475	NC_007516	TGG	2	6	2282132	2282137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213984
49476	NC_007516	GAC	2	6	2282140	2282145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213984
49477	NC_007516	ACC	2	6	2282323	2282328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213984
49478	NC_007516	AGCG	2	8	2282389	2282396	25 %	0 %	50 %	25 %	78213984
49479	NC_007516	GCT	2	6	2282415	2282420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213984
49480	NC_007516	ACG	2	6	2282553	2282558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213985
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49482	NC_007516	GCA	3	9	2282602	2282610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213985
49483	NC_007516	GCGG	2	8	2282630	2282637	0 %	0 %	75 %	25 %	78213985
49484	NC_007516	CGG	2	6	2282722	2282727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213985
49485	NC_007516	GCA	2	6	2282821	2282826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213985
49486	NC_007516	GCT	2	6	2282829	2282834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213985
49487	NC_007516	TGC	2	6	2282876	2282881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213985
49488	NC_007516	CCA	2	6	2282930	2282935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213985
49489	NC_007516	GGGTG	2	10	2283087	2283096	0 %	20 %	80 %	0 %	78213985
49490	NC_007516	CCT	2	6	2283101	2283106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213985
49491	NC_007516	GCA	2	6	2283107	2283112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213985
49492	NC_007516	GCC	2	6	2283169	2283174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213985
49493	NC_007516	TCC	2	6	2283181	2283186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213985
49494	NC_007516	CGC	2	6	2283192	2283197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213985
49495	NC_007516	GCA	2	6	2283208	2283213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213985
49496	NC_007516	GCG	2	6	2283214	2283219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213985
49497	NC_007516	GAC	3	9	2283236	2283244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213985
49498	NC_007516	ACA	2	6	2283257	2283262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213985
49499	NC_007516	CAT	2	6	2283267	2283272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213985
49500	NC_007516	GTA	2	6	2283282	2283287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213985

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