MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46502	NC_007516	GAG	2	6	2151581	2151586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213845
46503	NC_007516	GGA	2	6	2151658	2151663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213845
46504	NC_007516	CGGCA	2	10	2151664	2151673	20 %	0 %	40 %	40 %	78213845
46505	NC_007516	CCTG	2	8	2151682	2151689	0 %	25 %	25 %	50 %	78213845
46506	NC_007516	GCA	2	6	2151742	2151747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213845
46507	NC_007516	TGGG	2	8	2151776	2151783	0 %	25 %	75 %	0 %	78213845
46508	NC_007516	GAT	2	6	2151832	2151837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213845
46509	NC_007516	GCA	2	6	2151904	2151909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213845
46510	NC_007516	TGG	2	6	2151978	2151983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213845
46511	NC_007516	TTC	2	6	2152127	2152132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213846
46512	NC_007516	TGGG	2	8	2152142	2152149	0 %	25 %	75 %	0 %	78213846
46513	NC_007516	CTG	2	6	2152195	2152200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213846
46514	NC_007516	GGC	3	9	2152278	2152286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213846
46515	NC_007516	GC	3	6	2152295	2152300	0 %	0 %	50 %	50 %	78213846
46516	NC_007516	CAA	2	6	2152398	2152403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213846
46517	NC_007516	ACCT	2	8	2152444	2152451	25 %	25 %	0 %	50 %	78213846
46518	NC_007516	TGG	2	6	2152487	2152492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213846
46519	NC_007516	TCC	2	6	2152494	2152499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213846
46520	NC_007516	TGGC	2	8	2152506	2152513	0 %	25 %	50 %	25 %	78213846
46521	NC_007516	GTCC	2	8	2152529	2152536	0 %	25 %	25 %	50 %	78213846
46522	NC_007516	CAGC	2	8	2152556	2152563	25 %	0 %	25 %	50 %	78213846
46523	NC_007516	CTG	2	6	2152567	2152572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213846
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46527	NC_007516	GAG	2	6	2152688	2152693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213846
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46537	NC_007516	CGG	2	6	2153091	2153096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213846
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46539	NC_007516	GCA	2	6	2153119	2153124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213846
46540	NC_007516	CAAC	2	8	2153138	2153145	50 %	0 %	0 %	50 %	78213846
46541	NC_007516	GTG	2	6	2153182	2153187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213846
46542	NC_007516	GCTGT	2	10	2153191	2153200	0 %	40 %	40 %	20 %	78213846
46543	NC_007516	GATCA	2	10	2153235	2153244	40 %	20 %	20 %	20 %	78213846
46544	NC_007516	ATG	2	6	2153247	2153252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213846
46545	NC_007516	GCC	2	6	2153260	2153265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46546	NC_007516	GCGG	2	8	2153300	2153307	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46547	NC_007516	TTG	3	9	2153309	2153317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46548	NC_007516	TGG	2	6	2153327	2153332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46549	NC_007516	TGA	2	6	2153461	2153466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213847
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46554	NC_007516	GCC	2	6	2153610	2153615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213847
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46577	NC_007516	GGCC	2	8	2154395	2154402	0 %	0 %	50 %	50 %	78213847
46578	NC_007516	TGA	2	6	2154463	2154468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213847
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46583	NC_007516	TCCA	2	8	2154782	2154789	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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46589	NC_007516	GGC	2	6	2155096	2155101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213848
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46602	NC_007516	AGCC	2	8	2155668	2155675	25 %	0 %	25 %	50 %	78213848
46603	NC_007516	TCA	2	6	2155769	2155774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213848
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46605	NC_007516	GAT	2	6	2155851	2155856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213848
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46607	NC_007516	AACCA	2	10	2155951	2155960	60 %	0 %	0 %	40 %	78213848
46608	NC_007516	CTG	2	6	2155963	2155968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213848
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46610	NC_007516	GC	3	6	2156027	2156032	0 %	0 %	50 %	50 %	78213848
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46613	NC_007516	A	6	6	2156223	2156228	100 %	0 %	0 %	0 %	78213848
46614	NC_007516	CTG	2	6	2156236	2156241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213848
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46616	NC_007516	GAA	2	6	2156341	2156346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78213848
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46618	NC_007516	TGCTG	2	10	2156521	2156530	0 %	40 %	40 %	20 %	78213849
46619	NC_007516	CGA	2	6	2156552	2156557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213849
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46630	NC_007516	CG	3	6	2157153	2157158	0 %	0 %	50 %	50 %	78213850
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46632	NC_007516	CTC	2	6	2157229	2157234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213850
46633	NC_007516	TGC	2	6	2157243	2157248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213850
46634	NC_007516	TGC	2	6	2157272	2157277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213850
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46645	NC_007516	CCAG	2	8	2157864	2157871	25 %	0 %	25 %	50 %	78213850
46646	NC_007516	CCA	2	6	2157903	2157908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213850
46647	NC_007516	CTG	2	6	2157919	2157924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213850
46648	NC_007516	GTGA	2	8	2157962	2157969	25 %	25 %	50 %	0 %	78213850
46649	NC_007516	CAAC	2	8	2158132	2158139	50 %	0 %	0 %	50 %	78213851
46650	NC_007516	AGC	2	6	2158143	2158148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213851
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46653	NC_007516	ACC	2	6	2158412	2158417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213851
46654	NC_007516	CGGC	2	8	2158422	2158429	0 %	0 %	50 %	50 %	78213851
46655	NC_007516	CAG	2	6	2158462	2158467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213851
46656	NC_007516	CAAG	2	8	2158483	2158490	50 %	0 %	25 %	25 %	78213851
46657	NC_007516	CAGG	2	8	2158525	2158532	25 %	0 %	50 %	25 %	78213851
46658	NC_007516	C	6	6	2158536	2158541	0 %	0 %	0 %	100 %	78213851
46659	NC_007516	ACG	2	6	2158564	2158569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213851
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46661	NC_007516	GCA	2	6	2158592	2158597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213851
46662	NC_007516	CGAA	2	8	2158649	2158656	50 %	0 %	25 %	25 %	78213851
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46664	NC_007516	GA	3	6	2158852	2158857	50 %	0 %	50 %	0 %	78213852
46665	NC_007516	GCAC	2	8	2158895	2158902	25 %	0 %	25 %	50 %	78213852
46666	NC_007516	GAA	2	6	2158908	2158913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78213852
46667	NC_007516	TTG	2	6	2158924	2158929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213852
46668	NC_007516	ACC	2	6	2158954	2158959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213852
46669	NC_007516	ATC	2	6	2158962	2158967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213852
46670	NC_007516	GATC	2	8	2159015	2159022	25 %	25 %	25 %	25 %	78213852
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46672	NC_007516	TCC	2	6	2159104	2159109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213852
46673	NC_007516	CGGG	2	8	2159121	2159128	0 %	0 %	75 %	25 %	78213852
46674	NC_007516	GCG	3	9	2159140	2159148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213852
46675	NC_007516	AGTG	2	8	2159150	2159157	25 %	25 %	50 %	0 %	78213852
46676	NC_007516	GTT	2	6	2159213	2159218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213852
46677	NC_007516	GGT	2	6	2159289	2159294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213852
46678	NC_007516	ACC	2	6	2159436	2159441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213852
46679	NC_007516	TGGCCA	2	12	2159470	2159481	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78213852
46680	NC_007516	GGC	2	6	2159508	2159513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213852
46681	NC_007516	CGG	2	6	2159522	2159527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213852
46682	NC_007516	TGGC	2	8	2159551	2159558	0 %	25 %	50 %	25 %	78213852
46683	NC_007516	TGA	2	6	2159579	2159584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213852
46684	NC_007516	GCCGT	2	10	2159601	2159610	0 %	20 %	40 %	40 %	78213852
46685	NC_007516	TGG	2	6	2159740	2159745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213853
46686	NC_007516	ATG	2	6	2159748	2159753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213853
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46688	NC_007516	GATGCC	2	12	2159814	2159825	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78213853
46689	NC_007516	GGC	2	6	2159837	2159842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213853
46690	NC_007516	GCA	2	6	2159848	2159853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213853
46691	NC_007516	CAGC	2	8	2159924	2159931	25 %	0 %	25 %	50 %	78213853
46692	NC_007516	TGG	2	6	2159944	2159949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213853
46693	NC_007516	GGA	2	6	2159955	2159960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213853
46694	NC_007516	GTG	2	6	2159964	2159969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213853
46695	NC_007516	TGC	2	6	2159992	2159997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213853
46696	NC_007516	TGC	2	6	2160040	2160045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213853
46697	NC_007516	GCT	2	6	2160077	2160082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213853
46698	NC_007516	TC	3	6	2160105	2160110	0 %	50 %	0 %	50 %	78213853
46699	NC_007516	GGT	2	6	2160161	2160166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213853
46700	NC_007516	ACG	2	6	2160172	2160177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213853
46701	NC_007516	CTG	2	6	2160213	2160218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213853
46702	NC_007516	CTG	2	6	2160225	2160230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213853
46703	NC_007516	GGC	2	6	2160273	2160278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213854
46704	NC_007516	CGCTG	2	10	2160351	2160360	0 %	20 %	40 %	40 %	78213854
46705	NC_007516	CAAC	2	8	2160416	2160423	50 %	0 %	0 %	50 %	78213854
46706	NC_007516	AGC	2	6	2160456	2160461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213854
46707	NC_007516	CAC	2	6	2160485	2160490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213854
46708	NC_007516	TCA	2	6	2160495	2160500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213854
46709	NC_007516	CGG	2	6	2160531	2160536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46710	NC_007516	TGC	2	6	2160544	2160549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213855
46711	NC_007516	GCG	2	6	2160574	2160579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213855
46712	NC_007516	CAGG	2	8	2160594	2160601	25 %	0 %	50 %	25 %	78213855
46713	NC_007516	CGA	2	6	2160740	2160745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213855
46714	NC_007516	CTG	2	6	2160753	2160758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213855
46715	NC_007516	CCT	2	6	2160839	2160844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213855
46716	NC_007516	AGC	2	6	2160850	2160855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213855
46717	NC_007516	AAC	2	6	2160929	2160934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213855
46718	NC_007516	GCC	3	9	2160943	2160951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213855
46719	NC_007516	TGC	2	6	2160994	2160999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213855
46720	NC_007516	CGC	2	6	2161021	2161026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213855
46721	NC_007516	GCG	2	6	2161066	2161071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213855
46722	NC_007516	GGT	2	6	2161245	2161250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213856
46723	NC_007516	GCCA	2	8	2161273	2161280	25 %	0 %	25 %	50 %	78213856
46724	NC_007516	CTG	2	6	2161290	2161295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213856
46725	NC_007516	AGG	2	6	2161296	2161301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213856
46726	NC_007516	GAAGC	2	10	2161303	2161312	40 %	0 %	40 %	20 %	78213856
46727	NC_007516	AGC	2	6	2161324	2161329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213856
46728	NC_007516	ACCA	2	8	2161364	2161371	50 %	0 %	0 %	50 %	78213856
46729	NC_007516	GCT	2	6	2161398	2161403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213856
46730	NC_007516	CAG	2	6	2161414	2161419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213856
46731	NC_007516	CCG	2	6	2161469	2161474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213856
46732	NC_007516	TCG	2	6	2161514	2161519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213856
46733	NC_007516	GCG	2	6	2161553	2161558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213856
46734	NC_007516	AGG	2	6	2161569	2161574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213856
46735	NC_007516	GCCA	2	8	2161579	2161586	25 %	0 %	25 %	50 %	78213856
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