MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_007516	CGA	2	6	2127255	2127260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46002	NC_007516	GCA	2	6	2127272	2127277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46003	NC_007516	CGC	2	6	2127373	2127378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213828
46004	NC_007516	ACC	2	6	2127396	2127401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213828
46005	NC_007516	CAT	2	6	2127445	2127450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213828
46006	NC_007516	CCG	2	6	2127472	2127477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213828
46007	NC_007516	GGC	2	6	2127513	2127518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213828
46008	NC_007516	CCA	2	6	2127595	2127600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213828
46009	NC_007516	GCT	2	6	2127601	2127606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213828
46010	NC_007516	TCACC	2	10	2127691	2127700	20 %	20 %	0 %	60 %	78213828
46011	NC_007516	GCCC	2	8	2127718	2127725	0 %	0 %	25 %	75 %	78213828
46012	NC_007516	CGC	2	6	2127743	2127748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213828
46013	NC_007516	TGA	2	6	2127817	2127822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213828
46014	NC_007516	CAC	2	6	2127947	2127952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213828
46015	NC_007516	CAC	2	6	2127980	2127985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213828
46016	NC_007516	CGGG	2	8	2127987	2127994	0 %	0 %	75 %	25 %	78213828
46017	NC_007516	CCT	2	6	2127998	2128003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213828
46018	NC_007516	CCA	2	6	2128042	2128047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213828
46019	NC_007516	CGG	2	6	2128184	2128189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213828
46020	NC_007516	CGGG	2	8	2128298	2128305	0 %	0 %	75 %	25 %	78213828
46021	NC_007516	CGA	2	6	2128340	2128345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46022	NC_007516	CCA	2	6	2128354	2128359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46023	NC_007516	C	6	6	2128365	2128370	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46024	NC_007516	CAG	2	6	2128375	2128380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46025	NC_007516	AGCG	2	8	2128389	2128396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46026	NC_007516	GCAGA	2	10	2128447	2128456	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46027	NC_007516	TGT	2	6	2128602	2128607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46028	NC_007516	TGA	2	6	2128623	2128628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46029	NC_007516	GC	3	6	2128665	2128670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46030	NC_007516	CTG	2	6	2128721	2128726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46031	NC_007516	GAA	2	6	2128748	2128753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46032	NC_007516	CTG	2	6	2128757	2128762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46033	NC_007516	TGACGA	2	12	2128780	2128791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46034	NC_007516	CGG	2	6	2128797	2128802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46035	NC_007516	TCA	2	6	2128890	2128895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213829
46036	NC_007516	TGA	2	6	2128932	2128937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213829
46037	NC_007516	CGT	2	6	2129033	2129038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213829
46038	NC_007516	GAG	2	6	2129186	2129191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213829
46039	NC_007516	GAG	2	6	2129201	2129206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213829
46040	NC_007516	ACC	2	6	2129208	2129213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213829
46041	NC_007516	CAG	2	6	2129245	2129250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46042	NC_007516	GAAT	2	8	2129273	2129280	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46043	NC_007516	GA	3	6	2129291	2129296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46044	NC_007516	AATC	2	8	2129314	2129321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46045	NC_007516	TTG	2	6	2129352	2129357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46046	NC_007516	GGC	2	6	2129386	2129391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46047	NC_007516	CAG	2	6	2129404	2129409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46048	NC_007516	TGA	2	6	2129427	2129432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46049	NC_007516	GAT	2	6	2129642	2129647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213830
46050	NC_007516	CGG	2	6	2129655	2129660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213830
46051	NC_007516	CCA	2	6	2129665	2129670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213830
46052	NC_007516	GCC	3	9	2129676	2129684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213830
46053	NC_007516	TGC	2	6	2129690	2129695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213830
46054	NC_007516	GC	3	6	2129718	2129723	0 %	0 %	50 %	50 %	78213830
46055	NC_007516	GCG	2	6	2129801	2129806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213830
46056	NC_007516	GCTG	2	8	2129825	2129832	0 %	25 %	50 %	25 %	78213830
46057	NC_007516	GGGTG	2	10	2129833	2129842	0 %	20 %	80 %	0 %	78213830
46058	NC_007516	TGC	2	6	2129899	2129904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213830
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46060	NC_007516	CAC	2	6	2130042	2130047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213830
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46062	NC_007516	GCAG	2	8	2130175	2130182	25 %	0 %	50 %	25 %	78213830
46063	NC_007516	GCC	2	6	2130192	2130197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213830
46064	NC_007516	CAG	3	9	2130249	2130257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213830
46065	NC_007516	GCA	2	6	2130295	2130300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213830
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46067	NC_007516	ACC	2	6	2130423	2130428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213830
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46069	NC_007516	GCAGG	2	10	2130463	2130472	20 %	0 %	60 %	20 %	78213830
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46071	NC_007516	G	6	6	2130598	2130603	0 %	0 %	100 %	0 %	78213830
46072	NC_007516	CTGGG	2	10	2130604	2130613	0 %	20 %	60 %	20 %	78213830
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46091	NC_007516	TGCCC	2	10	2131397	2131406	0 %	20 %	20 %	60 %	78213830
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46102	NC_007516	CAA	2	6	2132011	2132016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46103	NC_007516	ACGC	2	8	2132074	2132081	25 %	0 %	25 %	50 %	78213831
46104	NC_007516	GTC	2	6	2132116	2132121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213831
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46106	NC_007516	T	6	6	2132249	2132254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46107	NC_007516	TC	3	6	2132259	2132264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46108	NC_007516	GCA	2	6	2132282	2132287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46109	NC_007516	G	6	6	2132292	2132297	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46110	NC_007516	GCT	2	6	2132357	2132362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46111	NC_007516	CAG	2	6	2132363	2132368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46112	NC_007516	CTG	2	6	2132424	2132429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46113	NC_007516	CTG	2	6	2132542	2132547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213832
46114	NC_007516	T	6	6	2132568	2132573	0 %	100 %	0 %	0 %	78213832
46115	NC_007516	CTCAA	2	10	2132597	2132606	40 %	20 %	0 %	40 %	78213832
46116	NC_007516	ACGG	2	8	2132632	2132639	25 %	0 %	50 %	25 %	78213832
46117	NC_007516	GGTGT	2	10	2132656	2132665	0 %	40 %	60 %	0 %	78213832
46118	NC_007516	GTG	2	6	2132722	2132727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213832
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46120	NC_007516	TGC	2	6	2132942	2132947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213832
46121	NC_007516	CGA	2	6	2133020	2133025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213832
46122	NC_007516	TCA	2	6	2133026	2133031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213832
46123	NC_007516	CGG	2	6	2133096	2133101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213832
46124	NC_007516	GCC	2	6	2133146	2133151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213832
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46128	NC_007516	GCG	2	6	2133253	2133258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213832
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46131	NC_007516	GCTG	2	8	2133479	2133486	0 %	25 %	50 %	25 %	78213832
46132	NC_007516	CAA	2	6	2133510	2133515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213832
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46147	NC_007516	TGG	2	6	2134313	2134318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213835
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46151	NC_007516	CAAG	2	8	2134505	2134512	50 %	0 %	25 %	25 %	78213835
46152	NC_007516	CAG	2	6	2134536	2134541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213835
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46181	NC_007516	GATA	2	8	2135819	2135826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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46183	NC_007516	CAAG	2	8	2135912	2135919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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46232	NC_007516	ATCC	2	8	2139582	2139589	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46233	NC_007516	TCA	2	6	2139631	2139636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46234	NC_007516	TCC	3	9	2139652	2139660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46235	NC_007516	GT	3	6	2139716	2139721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46236	NC_007516	GTA	2	6	2139878	2139883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46237	NC_007516	GT	3	6	2139885	2139890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46238	NC_007516	ATG	2	6	2139910	2139915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46239	NC_007516	TCC	2	6	2139936	2139941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46240	NC_007516	TC	3	6	2139958	2139963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46241	NC_007516	CACGA	2	10	2140035	2140044	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46242	NC_007516	GAC	2	6	2140048	2140053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46243	NC_007516	CAC	2	6	2140061	2140066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46244	NC_007516	TTC	2	6	2140136	2140141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46245	NC_007516	TGCG	2	8	2140214	2140221	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46246	NC_007516	CAG	2	6	2140374	2140379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46247	NC_007516	TTC	2	6	2140399	2140404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46248	NC_007516	ATG	2	6	2140484	2140489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46249	NC_007516	CAG	2	6	2140511	2140516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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46251	NC_007516	AAT	2	6	2140550	2140555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46256	NC_007516	ATC	2	6	2140785	2140790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46275	NC_007516	GAA	2	6	2141693	2141698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78213837
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46361	NC_007516	GCA	2	6	2146316	2146321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213840
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46481	NC_007516	GCC	2	6	2150780	2150785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213845
46482	NC_007516	GTG	4	12	2150786	2150797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213845
46483	NC_007516	GAA	2	6	2150828	2150833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78213845
46484	NC_007516	TGG	2	6	2150847	2150852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213845
46485	NC_007516	ATC	2	6	2150879	2150884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213845
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46487	NC_007516	TTG	2	6	2150976	2150981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213845
46488	NC_007516	TGC	2	6	2150985	2150990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213845
46489	NC_007516	CGA	2	6	2151049	2151054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213845
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46491	NC_007516	CAT	2	6	2151139	2151144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213845
46492	NC_007516	G	6	6	2151156	2151161	0 %	0 %	100 %	0 %	78213845
46493	NC_007516	GCA	2	6	2151168	2151173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213845
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