MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43502	NC_007516	CCT	2	6	2010258	2010263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213711
43503	NC_007516	CGG	2	6	2010295	2010300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213711
43504	NC_007516	GCC	2	6	2010462	2010467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213711
43505	NC_007516	GGT	2	6	2010476	2010481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213711
43506	NC_007516	CAG	2	6	2010500	2010505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213711
43507	NC_007516	GGT	2	6	2010539	2010544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213711
43508	NC_007516	CAC	2	6	2010559	2010564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213711
43509	NC_007516	TGG	2	6	2010619	2010624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213711
43510	NC_007516	TGA	2	6	2010649	2010654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213711
43511	NC_007516	CGC	2	6	2010728	2010733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213711
43512	NC_007516	CTT	2	6	2010853	2010858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213711
43513	NC_007516	GTG	2	6	2010863	2010868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213711
43514	NC_007516	CAG	2	6	2011021	2011026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213711
43515	NC_007516	AGT	2	6	2011061	2011066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213711
43516	NC_007516	CAA	2	6	2011178	2011183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213711
43517	NC_007516	GCG	2	6	2011216	2011221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213711
43518	NC_007516	TGG	2	6	2011249	2011254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213711
43519	NC_007516	TTC	2	6	2011279	2011284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213711
43520	NC_007516	CG	3	6	2011288	2011293	0 %	0 %	50 %	50 %	78213711
43521	NC_007516	GCATGG	2	12	2011314	2011325	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78213711
43522	NC_007516	CTG	2	6	2011422	2011427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213711
43523	NC_007516	AGC	2	6	2011443	2011448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213711
43524	NC_007516	TGACC	2	10	2011519	2011528	20 %	20 %	20 %	40 %	78213711
43525	NC_007516	CTG	2	6	2011622	2011627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213711
43526	NC_007516	CCA	2	6	2011635	2011640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213711
43527	NC_007516	ACG	2	6	2011730	2011735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213711
43528	NC_007516	CCA	2	6	2011782	2011787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213711
43529	NC_007516	C	6	6	2011832	2011837	0 %	0 %	0 %	100 %	78213711
43530	NC_007516	GGT	2	6	2011900	2011905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43531	NC_007516	TG	3	6	2011907	2011912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43532	NC_007516	CGT	2	6	2011957	2011962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43533	NC_007516	CTT	2	6	2012006	2012011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43534	NC_007516	GAA	2	6	2012031	2012036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43535	NC_007516	GAGC	2	8	2012099	2012106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43536	NC_007516	GGC	2	6	2012236	2012241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43537	NC_007516	ATC	2	6	2012286	2012291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213712
43538	NC_007516	CGG	2	6	2012357	2012362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213712
43539	NC_007516	TGG	2	6	2012426	2012431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213712
43540	NC_007516	CGG	2	6	2012468	2012473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213712
43541	NC_007516	ATT	2	6	2012521	2012526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78213712
43542	NC_007516	GTGAC	2	10	2012560	2012569	20 %	20 %	40 %	20 %	78213712
43543	NC_007516	CCT	2	6	2012681	2012686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213712
43544	NC_007516	CCT	2	6	2012775	2012780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43545	NC_007516	TCA	2	6	2012812	2012817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213713
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43547	NC_007516	GC	3	6	2012903	2012908	0 %	0 %	50 %	50 %	78213713
43548	NC_007516	TGC	2	6	2012909	2012914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213713
43549	NC_007516	CAT	2	6	2012939	2012944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213713
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43551	NC_007516	CGG	2	6	2012993	2012998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213713
43552	NC_007516	CGC	2	6	2013015	2013020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213713
43553	NC_007516	CGC	2	6	2013023	2013028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213713
43554	NC_007516	CGA	2	6	2013101	2013106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213713
43555	NC_007516	GAAG	2	8	2013188	2013195	50 %	0 %	50 %	0 %	78213713
43556	NC_007516	CCG	2	6	2013199	2013204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213713
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43560	NC_007516	CAT	2	6	2013430	2013435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213714
43561	NC_007516	CAG	2	6	2013461	2013466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213714
43562	NC_007516	T	8	8	2013528	2013535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43563	NC_007516	CCA	2	6	2013561	2013566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213715
43564	NC_007516	TCCC	2	8	2013598	2013605	0 %	25 %	0 %	75 %	78213715
43565	NC_007516	CCA	2	6	2013657	2013662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213715
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43575	NC_007516	G	7	7	2014170	2014176	0 %	0 %	100 %	0 %	78213715
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43581	NC_007516	ACC	2	6	2014449	2014454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43582	NC_007516	GGT	2	6	2014471	2014476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43583	NC_007516	GCC	2	6	2014531	2014536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213716
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43587	NC_007516	GGCAA	2	10	2014709	2014718	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43588	NC_007516	GAC	2	6	2014798	2014803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213717
43589	NC_007516	ACA	2	6	2014808	2014813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213717
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43602	NC_007516	TGC	2	6	2015305	2015310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213717
43603	NC_007516	CAACC	2	10	2015322	2015331	40 %	0 %	0 %	60 %	78213717
43604	NC_007516	TGG	2	6	2015368	2015373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213717
43605	NC_007516	CGGC	2	8	2015380	2015387	0 %	0 %	50 %	50 %	78213717
43606	NC_007516	CTG	2	6	2015403	2015408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213717
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43614	NC_007516	GCA	2	6	2015773	2015778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213717
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43972	NC_007516	GCG	2	6	2033403	2033408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213735
43973	NC_007516	CAG	2	6	2033493	2033498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213735
43974	NC_007516	CTG	2	6	2033521	2033526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213735
43975	NC_007516	GTG	2	6	2033560	2033565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213735
43976	NC_007516	ATG	2	6	2033603	2033608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213735
43977	NC_007516	CAC	2	6	2033625	2033630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213735
43978	NC_007516	GCA	2	6	2033634	2033639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213735
43979	NC_007516	CCA	2	6	2033657	2033662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213735
43980	NC_007516	GCT	2	6	2033712	2033717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213735
43981	NC_007516	CT	3	6	2033723	2033728	0 %	50 %	0 %	50 %	78213735
43982	NC_007516	T	6	6	2033739	2033744	0 %	100 %	0 %	0 %	78213735
43983	NC_007516	GT	3	6	2033834	2033839	0 %	50 %	50 %	0 %	78213735
43984	NC_007516	GCTG	2	8	2033906	2033913	0 %	25 %	50 %	25 %	78213735
43985	NC_007516	ATGG	2	8	2033916	2033923	25 %	25 %	50 %	0 %	78213735
43986	NC_007516	CAG	2	6	2033932	2033937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213735
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43989	NC_007516	GCT	2	6	2034105	2034110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213735
43990	NC_007516	GCAA	2	8	2034114	2034121	50 %	0 %	25 %	25 %	78213735
43991	NC_007516	ATG	2	6	2034124	2034129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213735
43992	NC_007516	CGC	2	6	2034154	2034159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213735
43993	NC_007516	GCCAA	2	10	2034173	2034182	40 %	0 %	20 %	40 %	78213735
43994	NC_007516	CTG	2	6	2034205	2034210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213735
43995	NC_007516	AAGT	2	8	2034229	2034236	50 %	25 %	25 %	0 %	78213735
43996	NC_007516	GGC	2	6	2034257	2034262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43997	NC_007516	TGT	2	6	2034384	2034389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213736
43998	NC_007516	GCG	2	6	2034455	2034460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213736
43999	NC_007516	CCGG	2	8	2034474	2034481	0 %	0 %	50 %	50 %	78213736
44000	NC_007516	CAT	2	6	2034564	2034569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213736

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