MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_007516	TCGT	2	8	1989345	1989352	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43002	NC_007516	CAT	2	6	1989357	1989362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43003	NC_007516	A	6	6	1989394	1989399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43004	NC_007516	CAA	2	6	1989423	1989428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43005	NC_007516	CTTGGC	2	12	1989477	1989488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213688
43006	NC_007516	TTGCCT	2	12	1989502	1989513	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	78213688
43007	NC_007516	TCC	2	6	1989514	1989519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213688
43008	NC_007516	AGT	2	6	1989524	1989529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213688
43009	NC_007516	AGA	2	6	1989638	1989643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78213688
43010	NC_007516	AGG	2	6	1989647	1989652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213688
43011	NC_007516	CCA	3	9	1989667	1989675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213688
43012	NC_007516	CAG	2	6	1989726	1989731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213688
43013	NC_007516	TCA	2	6	1989742	1989747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213688
43014	NC_007516	GGAA	2	8	1989765	1989772	50 %	0 %	50 %	0 %	78213688
43015	NC_007516	TGG	2	6	1989788	1989793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213688
43016	NC_007516	GCCTTC	2	12	1989834	1989845	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	78213688
43017	NC_007516	GCTG	2	8	1989846	1989853	0 %	25 %	50 %	25 %	78213688
43018	NC_007516	CGG	2	6	1989902	1989907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213688
43019	NC_007516	CCT	2	6	1989920	1989925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213688
43020	NC_007516	ACAA	2	8	1989984	1989991	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43021	NC_007516	CTG	2	6	1990041	1990046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43022	NC_007516	TGGC	2	8	1990075	1990082	0 %	25 %	50 %	25 %	78213689
43023	NC_007516	CCG	2	6	1990088	1990093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213689
43024	NC_007516	AAC	2	6	1990179	1990184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213689
43025	NC_007516	CTG	2	6	1990206	1990211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213689
43026	NC_007516	CTA	2	6	1990268	1990273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213689
43027	NC_007516	CGG	2	6	1990277	1990282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213689
43028	NC_007516	GCT	2	6	1990334	1990339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213689
43029	NC_007516	CTTT	2	8	1990351	1990358	0 %	75 %	0 %	25 %	78213689
43030	NC_007516	C	6	6	1990410	1990415	0 %	0 %	0 %	100 %	78213689
43031	NC_007516	AGC	2	6	1990435	1990440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213689
43032	NC_007516	CAA	2	6	1990451	1990456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213689
43033	NC_007516	GA	3	6	1990540	1990545	50 %	0 %	50 %	0 %	78213689
43034	NC_007516	GCG	2	6	1990613	1990618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213689
43035	NC_007516	CTGAG	2	10	1990621	1990630	20 %	20 %	40 %	20 %	78213689
43036	NC_007516	TCG	2	6	1990799	1990804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213690
43037	NC_007516	GCG	2	6	1990826	1990831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213690
43038	NC_007516	CCA	2	6	1990856	1990861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213690
43039	NC_007516	TGA	2	6	1990994	1990999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213690
43040	NC_007516	TGG	2	6	1991015	1991020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213690
43041	NC_007516	GTG	2	6	1991080	1991085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213690
43042	NC_007516	GGC	2	6	1991127	1991132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213690
43043	NC_007516	CAC	2	6	1991277	1991282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213690
43044	NC_007516	GTG	2	6	1991323	1991328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213690
43045	NC_007516	TCT	2	6	1991348	1991353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213690
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43050	NC_007516	GTG	2	6	1991518	1991523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213690
43051	NC_007516	TGG	2	6	1991606	1991611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213690
43052	NC_007516	CGAT	2	8	1991677	1991684	25 %	25 %	25 %	25 %	78213690
43053	NC_007516	GTCG	2	8	1991700	1991707	0 %	25 %	50 %	25 %	78213690
43054	NC_007516	TGA	2	6	1991864	1991869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213690
43055	NC_007516	TTCTG	2	10	1991882	1991891	0 %	60 %	20 %	20 %	78213690
43056	NC_007516	TGC	2	6	1991897	1991902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213690
43057	NC_007516	GCA	2	6	1991926	1991931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213691
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43059	NC_007516	GATGCC	2	12	1992003	1992014	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78213691
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43061	NC_007516	GCG	2	6	1992113	1992118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213691
43062	NC_007516	CGGTG	2	10	1992179	1992188	0 %	20 %	60 %	20 %	78213691
43063	NC_007516	CTCG	2	8	1992212	1992219	0 %	25 %	25 %	50 %	78213691
43064	NC_007516	ATG	2	6	1992220	1992225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213691
43065	NC_007516	CAG	2	6	1992243	1992248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213691
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43067	NC_007516	TGT	2	6	1992290	1992295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213691
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43078	NC_007516	CGGG	2	8	1992627	1992634	0 %	0 %	75 %	25 %	78213691
43079	NC_007516	GATC	2	8	1992636	1992643	25 %	25 %	25 %	25 %	78213691
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43086	NC_007516	TG	3	6	1992834	1992839	0 %	50 %	50 %	0 %	78213691
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43091	NC_007516	CTGTC	2	10	1993099	1993108	0 %	40 %	20 %	40 %	78213691
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43093	NC_007516	CGA	2	6	1993201	1993206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43095	NC_007516	CAG	3	9	1993238	1993246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43221	NC_007516	GCC	2	6	1997556	1997561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213695
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43225	NC_007516	ACG	2	6	1997673	1997678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213695
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43231	NC_007516	AGC	2	6	1998024	1998029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213696
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43233	NC_007516	CGC	3	9	1998136	1998144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213696
43234	NC_007516	CGA	2	6	1998166	1998171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213696
43235	NC_007516	TGG	2	6	1998189	1998194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213696
43236	NC_007516	GGA	2	6	1998217	1998222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213696
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43241	NC_007516	CTG	2	6	1998422	1998427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213696
43242	NC_007516	CGG	2	6	1998439	1998444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213696
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43246	NC_007516	TGC	2	6	1998564	1998569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213696
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43253	NC_007516	TGG	2	6	1998726	1998731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213696
43254	NC_007516	GGC	2	6	1998794	1998799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213696
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43257	NC_007516	CGGG	2	8	1998955	1998962	0 %	0 %	75 %	25 %	78213696
43258	NC_007516	GGA	2	6	1998967	1998972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213696
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43260	NC_007516	GCCT	2	8	1999082	1999089	0 %	25 %	25 %	50 %	78213696
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43262	NC_007516	GCT	2	6	1999311	1999316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213697
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43267	NC_007516	CGC	2	6	1999428	1999433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213697
43268	NC_007516	GCA	2	6	1999447	1999452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213697
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43271	NC_007516	TCCC	2	8	1999575	1999582	0 %	25 %	0 %	75 %	78213698
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43282	NC_007516	CT	3	6	2000047	2000052	0 %	50 %	0 %	50 %	78213698
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43292	NC_007516	CAGC	2	8	2000468	2000475	25 %	0 %	25 %	50 %	78213698
43293	NC_007516	GCA	2	6	2000647	2000652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213699
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43297	NC_007516	CTG	3	9	2000857	2000865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213700
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43302	NC_007516	TC	3	6	2001110	2001115	0 %	50 %	0 %	50 %	78213701
43303	NC_007516	ACC	2	6	2001177	2001182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213701
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43311	NC_007516	CCA	3	9	2001602	2001610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213701
43312	NC_007516	CAG	2	6	2001723	2001728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213701
43313	NC_007516	TGCA	2	8	2001733	2001740	25 %	25 %	25 %	25 %	78213701
43314	NC_007516	CTG	2	6	2001747	2001752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213701
43315	NC_007516	AGTTG	2	10	2001769	2001778	20 %	40 %	40 %	0 %	78213701
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43318	NC_007516	ATCG	2	8	2001897	2001904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43319	NC_007516	GCA	2	6	2001941	2001946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213702
43320	NC_007516	TTG	2	6	2001995	2002000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213702
43321	NC_007516	GTT	2	6	2002048	2002053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213702
43322	NC_007516	AGC	2	6	2002084	2002089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213702
43323	NC_007516	GCA	2	6	2002107	2002112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213702
43324	NC_007516	AGC	2	6	2002148	2002153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213702
43325	NC_007516	TGG	2	6	2002248	2002253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213702
43326	NC_007516	AGG	2	6	2002307	2002312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213702
43327	NC_007516	TGA	2	6	2002344	2002349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213702
43328	NC_007516	CGGT	2	8	2002373	2002380	0 %	25 %	50 %	25 %	78213702
43329	NC_007516	CAGC	2	8	2002398	2002405	25 %	0 %	25 %	50 %	78213702
43330	NC_007516	CGG	2	6	2002434	2002439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213702
43331	NC_007516	ACG	2	6	2002486	2002491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213702
43332	NC_007516	CAG	2	6	2002522	2002527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213702
43333	NC_007516	GCCCTT	2	12	2002543	2002554	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	78213702
43334	NC_007516	TGA	2	6	2002584	2002589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213702
43335	NC_007516	CCA	2	6	2002635	2002640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213702
43336	NC_007516	GCT	2	6	2002662	2002667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213702
43337	NC_007516	GCA	2	6	2002682	2002687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213702
43338	NC_007516	GCG	2	6	2002777	2002782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213702
43339	NC_007516	TGG	2	6	2002912	2002917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213703
43340	NC_007516	GCCTCA	2	12	2002950	2002961	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78213703
43341	NC_007516	TCA	2	6	2002966	2002971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213703
43342	NC_007516	TCT	2	6	2002975	2002980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213703
43343	NC_007516	TTG	2	6	2003007	2003012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213703
43344	NC_007516	CGT	2	6	2003068	2003073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213703
43345	NC_007516	AGC	2	6	2003151	2003156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213703
43346	NC_007516	TGC	2	6	2003184	2003189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213703
43347	NC_007516	GGC	2	6	2003228	2003233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213703
43348	NC_007516	TCG	2	6	2003238	2003243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213703
43349	NC_007516	TCT	2	6	2003278	2003283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213703
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