MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3503	NC_007516	GGT	2	6	155556	155561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211704
3504	NC_007516	CAT	2	6	155574	155579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211704
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3507	NC_007516	AAC	2	6	155729	155734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211704
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3509	NC_007516	A	6	6	155886	155891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3622	NC_007516	CATGG	2	10	160536	160545	20 %	20 %	40 %	20 %	78211709
3623	NC_007516	GAC	2	6	160701	160706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211710
3624	NC_007516	GCT	3	9	160742	160750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211710
3625	NC_007516	CGC	2	6	160795	160800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211710
3626	NC_007516	TGT	2	6	160801	160806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211710
3627	NC_007516	CTG	2	6	160809	160814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211710
3628	NC_007516	GCG	2	6	160869	160874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211710
3629	NC_007516	GGGA	2	8	160897	160904	25 %	0 %	75 %	0 %	78211710
3630	NC_007516	TGC	2	6	160921	160926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211710
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3632	NC_007516	G	7	7	161039	161045	0 %	0 %	100 %	0 %	78211710
3633	NC_007516	CAC	2	6	161048	161053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211710
3634	NC_007516	TCC	2	6	161071	161076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211710
3635	NC_007516	CAC	2	6	161093	161098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211710
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3637	NC_007516	GATC	2	8	161252	161259	25 %	25 %	25 %	25 %	78211710
3638	NC_007516	TC	3	6	161268	161273	0 %	50 %	0 %	50 %	78211710
3639	NC_007516	TGG	3	9	161290	161298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211710
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3642	NC_007516	CCG	3	9	161418	161426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211710
3643	NC_007516	TGG	2	6	161497	161502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211710
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3646	NC_007516	CTG	3	9	161622	161630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211710
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3652	NC_007516	GCT	2	6	161897	161902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211710
3653	NC_007516	CGTC	2	8	161922	161929	0 %	25 %	25 %	50 %	78211710
3654	NC_007516	GGT	2	6	161979	161984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211710
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3656	NC_007516	CAGC	2	8	162032	162039	25 %	0 %	25 %	50 %	78211711
3657	NC_007516	TGC	2	6	162052	162057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211711
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3659	NC_007516	CGG	2	6	162173	162178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211711
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3662	NC_007516	GC	3	6	162268	162273	0 %	0 %	50 %	50 %	78211711
3663	NC_007516	CATG	2	8	162329	162336	25 %	25 %	25 %	25 %	78211711
3664	NC_007516	CGC	2	6	162341	162346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211711
3665	NC_007516	CAG	2	6	162450	162455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211711
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3668	NC_007516	AGCTCC	2	12	162571	162582	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78211711
3669	NC_007516	TGG	3	9	162586	162594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211711
3670	NC_007516	CACCG	2	10	162597	162606	20 %	0 %	20 %	60 %	78211711
3671	NC_007516	CAG	2	6	162607	162612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211711
3672	NC_007516	CAC	2	6	162630	162635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211711
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3677	NC_007516	GCT	2	6	162806	162811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211711
3678	NC_007516	CGG	2	6	162856	162861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211711
3679	NC_007516	GTG	2	6	162875	162880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211711
3680	NC_007516	GCA	2	6	162905	162910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211711
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3682	NC_007516	GCA	3	9	162944	162952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211711
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3685	NC_007516	TGGC	2	8	163093	163100	0 %	25 %	50 %	25 %	78211711
3686	NC_007516	CTG	2	6	163241	163246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211711
3687	NC_007516	CGG	2	6	163250	163255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211711
3688	NC_007516	GAG	2	6	163282	163287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211711
3689	NC_007516	T	6	6	163352	163357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3690	NC_007516	TGG	2	6	163425	163430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3691	NC_007516	TGT	2	6	163509	163514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3692	NC_007516	AGAT	2	8	163527	163534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3693	NC_007516	T	6	6	163776	163781	0 %	100 %	0 %	0 %	78211712
3694	NC_007516	CTG	2	6	163801	163806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211712
3695	NC_007516	T	7	7	163892	163898	0 %	100 %	0 %	0 %	78211712
3696	NC_007516	A	6	6	163905	163910	100 %	0 %	0 %	0 %	78211712
3697	NC_007516	CTTT	2	8	163989	163996	0 %	75 %	0 %	25 %	78211712
3698	NC_007516	CCA	2	6	164112	164117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211712
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3700	NC_007516	T	6	6	164196	164201	0 %	100 %	0 %	0 %	78211712
3701	NC_007516	GCT	2	6	164208	164213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211712
3702	NC_007516	A	6	6	164259	164264	100 %	0 %	0 %	0 %	78211712
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3704	NC_007516	TGAT	2	8	164281	164288	25 %	50 %	25 %	0 %	78211712
3705	NC_007516	GAC	2	6	164296	164301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3706	NC_007516	CTG	2	6	164302	164307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3707	NC_007516	GGC	2	6	164421	164426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211713
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3709	NC_007516	CAT	2	6	164481	164486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211713
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3711	NC_007516	GTGG	2	8	164553	164560	0 %	25 %	75 %	0 %	78211713
3712	NC_007516	GGC	2	6	164571	164576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211713
3713	NC_007516	GCG	2	6	164629	164634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211713
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3717	NC_007516	GCT	2	6	164775	164780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211713
3718	NC_007516	TGG	2	6	164963	164968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211713
3719	NC_007516	ATG	2	6	165013	165018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211713
3720	NC_007516	GCTG	2	8	165098	165105	0 %	25 %	50 %	25 %	78211713
3721	NC_007516	GATGCC	2	12	165126	165137	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78211713
3722	NC_007516	ACC	2	6	165187	165192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211713
3723	NC_007516	CAT	2	6	165227	165232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211713
3724	NC_007516	GTA	2	6	165333	165338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211713
3725	NC_007516	GCC	2	6	165405	165410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211713
3726	NC_007516	GTG	2	6	165421	165426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211713
3727	NC_007516	TCC	2	6	165475	165480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211713
3728	NC_007516	TGC	2	6	165554	165559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211713
3729	NC_007516	GAT	2	6	165648	165653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211713
3730	NC_007516	CCA	2	6	165665	165670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211713
3731	NC_007516	CTGG	2	8	165705	165712	0 %	25 %	50 %	25 %	78211713
3732	NC_007516	CAG	2	6	165758	165763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3733	NC_007516	GTG	2	6	165844	165849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211714
3734	NC_007516	GT	3	6	165896	165901	0 %	50 %	50 %	0 %	78211714
3735	NC_007516	CTG	3	9	165925	165933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211714
3736	NC_007516	TGA	2	6	165936	165941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211714
3737	NC_007516	TCC	2	6	165946	165951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211714
3738	NC_007516	GCA	2	6	165981	165986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211714
3739	NC_007516	AGG	2	6	166040	166045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211714
3740	NC_007516	GCA	2	6	166116	166121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211714
3741	NC_007516	CCG	2	6	166123	166128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211714
3742	NC_007516	GGT	2	6	166173	166178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211714
3743	NC_007516	GAC	2	6	166192	166197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211714
3744	NC_007516	TCGAT	2	10	166265	166274	20 %	40 %	20 %	20 %	78211714
3745	NC_007516	GTG	2	6	166321	166326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211714
3746	NC_007516	GAG	2	6	166399	166404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211714
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3752	NC_007516	TGG	2	6	166794	166799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211715
3753	NC_007516	A	6	6	166805	166810	100 %	0 %	0 %	0 %	78211715
3754	NC_007516	CTG	2	6	166819	166824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211715
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3756	NC_007516	GCA	2	6	166850	166855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211715
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3762	NC_007516	CCGGC	2	10	167006	167015	0 %	0 %	40 %	60 %	78211715
3763	NC_007516	CAG	2	6	167041	167046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211715
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3767	NC_007516	TCG	2	6	167159	167164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211715
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3769	NC_007516	TGC	2	6	167273	167278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211715
3770	NC_007516	G	6	6	167298	167303	0 %	0 %	100 %	0 %	78211715
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3774	NC_007516	GACA	2	8	167403	167410	50 %	0 %	25 %	25 %	78211715
3775	NC_007516	GGT	2	6	167423	167428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211715
3776	NC_007516	GGC	2	6	167458	167463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211715
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3778	NC_007516	GCC	2	6	167505	167510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211715
3779	NC_007516	GTC	2	6	167563	167568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211715
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3782	NC_007516	AGC	2	6	167654	167659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211715
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3792	NC_007516	GCA	2	6	167937	167942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211715
3793	NC_007516	CAT	2	6	167959	167964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211716
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3802	NC_007516	GCA	2	6	168200	168205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211716
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3815	NC_007516	GTG	2	6	169032	169037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211717
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3821	NC_007516	ACC	2	6	169256	169261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3822	NC_007516	TGTC	2	8	169314	169321	0 %	50 %	25 %	25 %	78211718
3823	NC_007516	TGC	2	6	169327	169332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211718
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3834	NC_007516	ATGG	2	8	169754	169761	25 %	25 %	50 %	0 %	78211718
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3842	NC_007516	CCGC	2	8	170125	170132	0 %	0 %	25 %	75 %	78211719
3843	NC_007516	TGG	2	6	170134	170139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211719
3844	NC_007516	ATC	2	6	170188	170193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211719
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3848	NC_007516	CGAT	2	8	170494	170501	25 %	25 %	25 %	25 %	78211719
3849	NC_007516	AGC	2	6	170523	170528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211719
3850	NC_007516	TGG	2	6	170578	170583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211719
3851	NC_007516	CAG	2	6	170738	170743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211719
3852	NC_007516	GCT	2	6	170810	170815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211719
3853	NC_007516	GCT	2	6	170838	170843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211719
3854	NC_007516	GCA	2	6	170844	170849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211719
3855	NC_007516	GGC	2	6	170863	170868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211719
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3857	NC_007516	CTC	2	6	170992	170997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211719
3858	NC_007516	GCA	2	6	171017	171022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211719
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3861	NC_007516	GTTC	2	8	171248	171255	0 %	50 %	25 %	25 %	78211720
3862	NC_007516	T	6	6	171267	171272	0 %	100 %	0 %	0 %	78211720
3863	NC_007516	TCT	3	9	171287	171295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211720
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3865	NC_007516	TTG	2	6	171477	171482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211720
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3988	NC_007516	ACCG	2	8	177887	177894	25 %	0 %	25 %	50 %	78211724
3989	NC_007516	TGG	2	6	177905	177910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211724
3990	NC_007516	CCG	2	6	178032	178037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211724
3991	NC_007516	AGC	2	6	178151	178156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211724
3992	NC_007516	A	6	6	178222	178227	100 %	0 %	0 %	0 %	78211724
3993	NC_007516	TGG	2	6	178304	178309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211724
3994	NC_007516	CGT	2	6	178329	178334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211724
3995	NC_007516	GTG	2	6	178405	178410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211724
3996	NC_007516	GCA	2	6	178440	178445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211724
3997	NC_007516	TGA	2	6	178467	178472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211724
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3999	NC_007516	GCTG	2	8	178629	178636	0 %	25 %	50 %	25 %	78211724
4000	NC_007516	GCT	2	6	178654	178659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211724

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