MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39002	NC_007516	CGC	2	6	1809394	1809399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213508
39003	NC_007516	AGA	2	6	1809506	1809511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78213508
39004	NC_007516	CCA	2	6	1809543	1809548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213508
39005	NC_007516	GA	3	6	1809557	1809562	50 %	0 %	50 %	0 %	78213508
39006	NC_007516	CTG	2	6	1809594	1809599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213508
39007	NC_007516	CCAG	2	8	1809610	1809617	25 %	0 %	25 %	50 %	78213508
39008	NC_007516	CGA	3	9	1809650	1809658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39009	NC_007516	A	6	6	1809665	1809670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39010	NC_007516	CA	3	6	1809707	1809712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39011	NC_007516	CG	3	6	1809813	1809818	0 %	0 %	50 %	50 %	78213509
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39014	NC_007516	TGGC	2	8	1809929	1809936	0 %	25 %	50 %	25 %	78213509
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39017	NC_007516	TCG	2	6	1809984	1809989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213509
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39019	NC_007516	CTG	3	9	1810056	1810064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213509
39020	NC_007516	TTCG	2	8	1810092	1810099	0 %	50 %	25 %	25 %	78213509
39021	NC_007516	CGG	2	6	1810112	1810117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213509
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39025	NC_007516	CTTC	2	8	1810331	1810338	0 %	50 %	0 %	50 %	78213509
39026	NC_007516	CTTC	2	8	1810340	1810347	0 %	50 %	0 %	50 %	78213509
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39032	NC_007516	GCTG	2	8	1810585	1810592	0 %	25 %	50 %	25 %	78213509
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39052	NC_007516	TTC	2	6	1811341	1811346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213510
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39065	NC_007516	GCCG	2	8	1812133	1812140	0 %	0 %	50 %	50 %	78213510
39066	NC_007516	GCT	4	12	1812148	1812159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213510
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39069	NC_007516	T	6	6	1812275	1812280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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39087	NC_007516	GCCA	2	8	1813235	1813242	25 %	0 %	25 %	50 %	78213511
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39102	NC_007516	CTGG	2	8	1813969	1813976	0 %	25 %	50 %	25 %	78213512
39103	NC_007516	CAG	2	6	1813996	1814001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213512
39104	NC_007516	ATCC	2	8	1814049	1814056	25 %	25 %	0 %	50 %	78213512
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39107	NC_007516	CGG	2	6	1814204	1814209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213512
39108	NC_007516	CTG	2	6	1814239	1814244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213512
39109	NC_007516	TGCCC	2	10	1814340	1814349	0 %	20 %	20 %	60 %	78213512
39110	NC_007516	GATCT	2	10	1814356	1814365	20 %	40 %	20 %	20 %	78213512
39111	NC_007516	CTCA	2	8	1814370	1814377	25 %	25 %	0 %	50 %	78213512
39112	NC_007516	GTGAT	2	10	1814399	1814408	20 %	40 %	40 %	0 %	78213512
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39115	NC_007516	GATGCC	2	12	1814491	1814502	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78213512
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39118	NC_007516	ACG	2	6	1814726	1814731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213512
39119	NC_007516	ACG	2	6	1814807	1814812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213512
39120	NC_007516	GT	3	6	1814858	1814863	0 %	50 %	50 %	0 %	78213512
39121	NC_007516	AAC	2	6	1814955	1814960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213512
39122	NC_007516	GTTT	2	8	1814988	1814995	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39123	NC_007516	CAG	2	6	1815012	1815017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39124	NC_007516	ACG	2	6	1815035	1815040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213513
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39127	NC_007516	TTG	2	6	1815224	1815229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213513
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39129	NC_007516	GTCGAT	2	12	1815312	1815323	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78213513
39130	NC_007516	GAGCT	2	10	1815353	1815362	20 %	20 %	40 %	20 %	78213513
39131	NC_007516	GCC	2	6	1815376	1815381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213513
39132	NC_007516	ACC	2	6	1815496	1815501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213513
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39143	NC_007516	T	7	7	1816076	1816082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39144	NC_007516	GGA	2	6	1816184	1816189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213514
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39148	NC_007516	GTG	2	6	1816408	1816413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213514
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39150	NC_007516	AG	4	8	1816461	1816468	50 %	0 %	50 %	0 %	78213514
39151	NC_007516	TCGA	2	8	1816490	1816497	25 %	25 %	25 %	25 %	78213514
39152	NC_007516	TGCT	2	8	1816527	1816534	0 %	50 %	25 %	25 %	78213514
39153	NC_007516	AAC	2	6	1816564	1816569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213514
39154	NC_007516	CTG	2	6	1816700	1816705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39155	NC_007516	AT	3	6	1816734	1816739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39156	NC_007516	GGCA	2	8	1816789	1816796	25 %	0 %	50 %	25 %	78213515
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39228	NC_007516	AAG	3	9	1820921	1820929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78213518
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39233	NC_007516	GCA	2	6	1821456	1821461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213518
39234	NC_007516	GT	3	6	1821475	1821480	0 %	50 %	50 %	0 %	78213518
39235	NC_007516	ACCC	2	8	1821518	1821525	25 %	0 %	0 %	75 %	78213518
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39237	NC_007516	AATC	2	8	1821670	1821677	50 %	25 %	0 %	25 %	78213518
39238	NC_007516	GGA	2	6	1821706	1821711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213518
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39241	NC_007516	ATC	3	9	1821879	1821887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213518
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39350	NC_007516	A	6	6	1826743	1826748	100 %	0 %	0 %	0 %	78213523
39351	NC_007516	TAA	2	6	1826749	1826754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78213523
39352	NC_007516	CAG	2	6	1826815	1826820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213523
39353	NC_007516	AGT	2	6	1826831	1826836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213523
39354	NC_007516	A	7	7	1826875	1826881	100 %	0 %	0 %	0 %	78213523
39355	NC_007516	CAC	2	6	1826916	1826921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213523
39356	NC_007516	AGCAAA	2	12	1826962	1826973	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39357	NC_007516	TCC	2	6	1827003	1827008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39358	NC_007516	T	6	6	1827033	1827038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39359	NC_007516	AAG	2	6	1827082	1827087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39360	NC_007516	GATG	2	8	1827094	1827101	25 %	25 %	50 %	0 %	78213524
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39362	NC_007516	GAT	2	6	1827140	1827145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213524
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39375	NC_007516	GTG	2	6	1828028	1828033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213525
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39377	NC_007516	CTG	2	6	1828201	1828206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213525
39378	NC_007516	CAG	2	6	1828216	1828221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213525
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39382	NC_007516	GCTG	2	8	1828296	1828303	0 %	25 %	50 %	25 %	78213525
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39387	NC_007516	CCAGCA	2	12	1828551	1828562	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	78213525
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39461	NC_007516	GAC	2	6	1832257	1832262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213528
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39467	NC_007516	CCA	2	6	1832431	1832436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213528
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