MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_007516	GCA	2	6	1722997	1723002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37002	NC_007516	GAT	2	6	1723009	1723014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37003	NC_007516	T	6	6	1723017	1723022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37004	NC_007516	CAC	2	6	1723109	1723114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213419
37005	NC_007516	AGC	2	6	1723134	1723139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213419
37006	NC_007516	ACT	2	6	1723151	1723156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213419
37007	NC_007516	AAAC	2	8	1723319	1723326	75 %	0 %	0 %	25 %	78213419
37008	NC_007516	AG	3	6	1723333	1723338	50 %	0 %	50 %	0 %	78213419
37009	NC_007516	AGA	2	6	1723395	1723400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78213419
37010	NC_007516	TCA	2	6	1723422	1723427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213419
37011	NC_007516	GTC	2	6	1723461	1723466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213419
37012	NC_007516	ATC	2	6	1723610	1723615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213419
37013	NC_007516	CTT	2	6	1723681	1723686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213419
37014	NC_007516	CAG	2	6	1723691	1723696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213419
37015	NC_007516	CCG	2	6	1723743	1723748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213419
37016	NC_007516	CAT	2	6	1723798	1723803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213419
37017	NC_007516	GA	3	6	1723894	1723899	50 %	0 %	50 %	0 %	78213419
37018	NC_007516	AGC	2	6	1723911	1723916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213419
37019	NC_007516	AAAG	2	8	1723935	1723942	75 %	0 %	25 %	0 %	78213419
37020	NC_007516	ACC	2	6	1723970	1723975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213419
37021	NC_007516	ATG	2	6	1723987	1723992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213419
37022	NC_007516	ACA	2	6	1724092	1724097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213419
37023	NC_007516	TTA	2	6	1724142	1724147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78213419
37024	NC_007516	GCC	2	6	1724208	1724213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213419
37025	NC_007516	ATC	2	6	1724223	1724228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213419
37026	NC_007516	A	7	7	1724289	1724295	100 %	0 %	0 %	0 %	78213419
37027	NC_007516	TGTCA	2	10	1724324	1724333	20 %	40 %	20 %	20 %	78213419
37028	NC_007516	ATCA	2	8	1724366	1724373	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37029	NC_007516	AGC	2	6	1724408	1724413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37030	NC_007516	TCA	2	6	1724554	1724559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37031	NC_007516	CT	3	6	1724598	1724603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37032	NC_007516	GTC	2	6	1724618	1724623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37033	NC_007516	AAC	2	6	1724653	1724658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37034	NC_007516	ACT	2	6	1724733	1724738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37035	NC_007516	GAC	2	6	1724821	1724826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37036	NC_007516	TGA	2	6	1724838	1724843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37037	NC_007516	CTT	2	6	1724851	1724856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37038	NC_007516	TCA	2	6	1724873	1724878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37039	NC_007516	A	7	7	1724969	1724975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37040	NC_007516	AAT	2	6	1725062	1725067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78213420
37041	NC_007516	GCT	2	6	1725075	1725080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213420
37042	NC_007516	CCT	2	6	1725081	1725086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213420
37043	NC_007516	CGGG	2	8	1725088	1725095	0 %	0 %	75 %	25 %	78213420
37044	NC_007516	GTG	2	6	1725096	1725101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213420
37045	NC_007516	GCA	2	6	1725105	1725110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213420
37046	NC_007516	TGA	2	6	1725204	1725209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213420
37047	NC_007516	GAT	2	6	1725306	1725311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37048	NC_007516	AGC	2	6	1725363	1725368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37049	NC_007516	CTG	3	9	1725431	1725439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213421
37050	NC_007516	TGT	2	6	1725553	1725558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213421
37051	NC_007516	TGGG	2	8	1725737	1725744	0 %	25 %	75 %	0 %	78213421
37052	NC_007516	GA	3	6	1725828	1725833	50 %	0 %	50 %	0 %	78213421
37053	NC_007516	TCA	2	6	1725908	1725913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37054	NC_007516	TCG	2	6	1725943	1725948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37055	NC_007516	GTCA	2	8	1725972	1725979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37056	NC_007516	TCA	2	6	1725998	1726003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37057	NC_007516	CCA	2	6	1726030	1726035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37058	NC_007516	TCA	2	6	1726063	1726068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37059	NC_007516	TGG	2	6	1726092	1726097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37060	NC_007516	GCC	2	6	1726132	1726137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37061	NC_007516	TGC	2	6	1726395	1726400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37062	NC_007516	GCA	2	6	1726478	1726483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37063	NC_007516	CAG	2	6	1726491	1726496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37064	NC_007516	ATTT	2	8	1726536	1726543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37065	NC_007516	GCG	2	6	1726702	1726707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213422
37066	NC_007516	GAC	2	6	1726745	1726750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213422
37067	NC_007516	CTC	2	6	1726877	1726882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213422
37068	NC_007516	TGC	2	6	1726986	1726991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213422
37069	NC_007516	CA	3	6	1726997	1727002	50 %	0 %	0 %	50 %	78213422
37070	NC_007516	TGC	2	6	1727033	1727038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213422
37071	NC_007516	GCA	2	6	1727065	1727070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213422
37072	NC_007516	CCT	2	6	1727087	1727092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213422
37073	NC_007516	TGC	2	6	1727166	1727171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213422
37074	NC_007516	AATC	2	8	1727184	1727191	50 %	25 %	0 %	25 %	78213422
37075	NC_007516	ACA	2	6	1727265	1727270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213422
37076	NC_007516	T	6	6	1727273	1727278	0 %	100 %	0 %	0 %	78213422
37077	NC_007516	ACG	2	6	1727310	1727315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213422
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37079	NC_007516	AGCG	2	8	1727386	1727393	25 %	0 %	50 %	25 %	78213422
37080	NC_007516	CACT	2	8	1727441	1727448	25 %	25 %	0 %	50 %	78213422
37081	NC_007516	GATC	2	8	1727449	1727456	25 %	25 %	25 %	25 %	78213422
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37084	NC_007516	ATGG	2	8	1727612	1727619	25 %	25 %	50 %	0 %	78213422
37085	NC_007516	CAA	2	6	1727644	1727649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213422
37086	NC_007516	CAA	2	6	1727670	1727675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213422
37087	NC_007516	TCA	2	6	1727694	1727699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213422
37088	NC_007516	AGG	2	6	1727700	1727705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213422
37089	NC_007516	AATC	2	8	1727745	1727752	50 %	25 %	0 %	25 %	78213422
37090	NC_007516	A	6	6	1727807	1727812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37091	NC_007516	GCA	2	6	1727839	1727844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37092	NC_007516	GGAA	2	8	1727898	1727905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37093	NC_007516	G	6	6	1727939	1727944	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37094	NC_007516	ATT	2	6	1727945	1727950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37095	NC_007516	T	7	7	1727949	1727955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37096	NC_007516	GATG	2	8	1727961	1727968	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37097	NC_007516	C	6	6	1727981	1727986	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37098	NC_007516	CAG	2	6	1728040	1728045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37099	NC_007516	ATT	2	6	1728104	1728109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37100	NC_007516	TCC	2	6	1728152	1728157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37101	NC_007516	CGG	2	6	1728172	1728177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37102	NC_007516	GCA	2	6	1728209	1728214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213423
37103	NC_007516	CTG	2	6	1728216	1728221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213423
37104	NC_007516	TTG	2	6	1728271	1728276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213423
37105	NC_007516	GC	3	6	1728306	1728311	0 %	0 %	50 %	50 %	78213423
37106	NC_007516	GGCG	2	8	1728366	1728373	0 %	0 %	75 %	25 %	78213423
37107	NC_007516	TCGAG	2	10	1728380	1728389	20 %	20 %	40 %	20 %	78213423
37108	NC_007516	GCA	2	6	1728420	1728425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213423
37109	NC_007516	GGTTG	2	10	1728429	1728438	0 %	40 %	60 %	0 %	78213423
37110	NC_007516	CCAAA	2	10	1728467	1728476	60 %	0 %	0 %	40 %	78213423
37111	NC_007516	GC	3	6	1728489	1728494	0 %	0 %	50 %	50 %	78213423
37112	NC_007516	TGG	2	6	1728527	1728532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213423
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37114	NC_007516	TGA	2	6	1728656	1728661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213423
37115	NC_007516	CGT	2	6	1728662	1728667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213423
37116	NC_007516	GGC	2	6	1728695	1728700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213423
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37118	NC_007516	CAC	2	6	1728764	1728769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213423
37119	NC_007516	GGC	2	6	1728800	1728805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213423
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37121	NC_007516	GC	3	6	1728825	1728830	0 %	0 %	50 %	50 %	78213423
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37264	NC_007516	GTT	2	6	1735857	1735862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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37340	NC_007516	T	8	8	1739919	1739926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37341	NC_007516	CAA	2	6	1739934	1739939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37348	NC_007516	GATC	2	8	1740381	1740388	25 %	25 %	25 %	25 %	78213435
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37357	NC_007516	TGC	2	6	1740881	1740886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213435
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