MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35502	NC_007516	CCG	2	6	1653449	1653454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213335
35503	NC_007516	CGC	2	6	1653459	1653464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213335
35504	NC_007516	GAT	2	6	1653494	1653499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213335
35505	NC_007516	CAGC	2	8	1653528	1653535	25 %	0 %	25 %	50 %	78213335
35506	NC_007516	GAG	2	6	1653554	1653559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213335
35507	NC_007516	TCCACA	2	12	1653601	1653612	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	78213335
35508	NC_007516	GA	3	6	1653631	1653636	50 %	0 %	50 %	0 %	78213335
35509	NC_007516	GCC	2	6	1653669	1653674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213335
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35511	NC_007516	TCG	2	6	1653739	1653744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213335
35512	NC_007516	CTG	2	6	1653789	1653794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213335
35513	NC_007516	CCG	2	6	1653825	1653830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213335
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35519	NC_007516	CGC	2	6	1653938	1653943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213335
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35525	NC_007516	CGA	2	6	1654117	1654122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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35617	NC_007516	GCTG	2	8	1658787	1658794	0 %	25 %	50 %	25 %	78213340
35618	NC_007516	TGA	2	6	1658800	1658805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78213340
35619	NC_007516	GC	3	6	1658809	1658814	0 %	0 %	50 %	50 %	78213340
35620	NC_007516	TCC	2	6	1658889	1658894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213340
35621	NC_007516	GAG	2	6	1658939	1658944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213340
35622	NC_007516	GTC	2	6	1658981	1658986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213340
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35639	NC_007516	CCAC	2	8	1659708	1659715	25 %	0 %	0 %	75 %	78213340
35640	NC_007516	AC	3	6	1659909	1659914	50 %	0 %	0 %	50 %	78213340
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35652	NC_007516	CTC	2	6	1660679	1660684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78213341
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35683	NC_007516	G	6	6	1662230	1662235	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35684	NC_007516	C	6	6	1662244	1662249	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35685	NC_007516	GTC	2	6	1662256	1662261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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35687	NC_007516	AGTC	2	8	1662489	1662496	25 %	25 %	25 %	25 %	78213343
35688	NC_007516	CGG	2	6	1662525	1662530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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35725	NC_007516	GCA	2	6	1664254	1664259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213344
35726	NC_007516	CGG	2	6	1664262	1664267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213344
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35853	NC_007516	GGT	2	6	1670060	1670065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213349
35854	NC_007516	CCA	2	6	1670086	1670091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213349
35855	NC_007516	CTT	2	6	1670108	1670113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78213349
35856	NC_007516	GGT	2	6	1670134	1670139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78213349
35857	NC_007516	CGGGC	2	10	1670145	1670154	0 %	0 %	60 %	40 %	78213349
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35859	NC_007516	GCT	2	6	1670203	1670208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213349
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35861	NC_007516	CCG	2	6	1670262	1670267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78213349
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35867	NC_007516	CAGC	2	8	1670566	1670573	25 %	0 %	25 %	50 %	78213349
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35882	NC_007516	GC	3	6	1671196	1671201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35883	NC_007516	GAA	2	6	1671214	1671219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35884	NC_007516	GCG	2	6	1671240	1671245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35885	NC_007516	CTG	2	6	1671298	1671303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35886	NC_007516	CGT	2	6	1671328	1671333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213350
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35888	NC_007516	ACA	2	6	1671420	1671425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78213350
35889	NC_007516	CTGGGC	2	12	1671461	1671472	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78213350
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35897	NC_007516	GCA	2	6	1671748	1671753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213350
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35903	NC_007516	GCCTG	2	10	1671976	1671985	0 %	20 %	40 %	40 %	78213350
35904	NC_007516	TGC	2	6	1672077	1672082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213350
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35915	NC_007516	AACGC	2	10	1672408	1672417	40 %	0 %	20 %	40 %	78213351
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35922	NC_007516	CCGCC	2	10	1672760	1672769	0 %	0 %	20 %	80 %	78213351
35923	NC_007516	GAG	2	6	1672773	1672778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78213351
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35925	NC_007516	CTT	2	6	1672849	1672854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35956	NC_007516	CCA	2	6	1674654	1674659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213355
35957	NC_007516	GTC	2	6	1674700	1674705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213355
35958	NC_007516	CAC	2	6	1674706	1674711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213355
35959	NC_007516	GACC	2	8	1674789	1674796	25 %	0 %	25 %	50 %	78213355
35960	NC_007516	AAGCC	2	10	1674836	1674845	40 %	0 %	20 %	40 %	78213355
35961	NC_007516	GTCG	2	8	1674846	1674853	0 %	25 %	50 %	25 %	78213355
35962	NC_007516	GATCA	2	10	1674901	1674910	40 %	20 %	20 %	20 %	78213355
35963	NC_007516	CAT	2	6	1675087	1675092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35964	NC_007516	CACC	2	8	1675125	1675132	25 %	0 %	0 %	75 %	78213356
35965	NC_007516	GC	4	8	1675137	1675144	0 %	0 %	50 %	50 %	78213356
35966	NC_007516	CGG	2	6	1675151	1675156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78213356
35967	NC_007516	TGC	2	6	1675179	1675184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213356
35968	NC_007516	CAG	2	6	1675238	1675243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213356
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35970	NC_007516	CAC	2	6	1675315	1675320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78213356
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35975	NC_007516	GTT	2	6	1675459	1675464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78213356
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35989	NC_007516	GCA	2	6	1675948	1675953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213357
35990	NC_007516	TCG	2	6	1676101	1676106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213357
35991	NC_007516	GCA	3	9	1676226	1676234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213357
35992	NC_007516	CGC	2	6	1676295	1676300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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35997	NC_007516	GTC	2	6	1676426	1676431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78213358
35998	NC_007516	GCTG	2	8	1676440	1676447	0 %	25 %	50 %	25 %	78213358
35999	NC_007516	CAG	2	6	1676486	1676491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78213358
36000	NC_007516	CAT	2	6	1676497	1676502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78213358

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