MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_007516	TGC	2	6	882207	882212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212453
19002	NC_007516	TGC	2	6	882261	882266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212453
19003	NC_007516	CCA	2	6	882294	882299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212453
19004	NC_007516	GCG	2	6	882310	882315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212453
19005	NC_007516	GTG	2	6	882326	882331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212453
19006	NC_007516	GA	3	6	882343	882348	50 %	0 %	50 %	0 %	78212453
19007	NC_007516	GCG	3	9	882373	882381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212453
19008	NC_007516	CTG	2	6	882404	882409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212453
19009	NC_007516	AGG	2	6	882414	882419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212453
19010	NC_007516	CAG	2	6	882439	882444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212453
19011	NC_007516	ATT	2	6	882449	882454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78212453
19012	NC_007516	GGT	2	6	882494	882499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212453
19013	NC_007516	GT	3	6	882631	882636	0 %	50 %	50 %	0 %	78212454
19014	NC_007516	AGC	3	9	882681	882689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212454
19015	NC_007516	GCC	2	6	882718	882723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212454
19016	NC_007516	C	6	6	882753	882758	0 %	0 %	0 %	100 %	78212454
19017	NC_007516	TGCC	2	8	882840	882847	0 %	25 %	25 %	50 %	78212454
19018	NC_007516	TGC	2	6	882859	882864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212454
19019	NC_007516	CGC	2	6	882883	882888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212454
19020	NC_007516	TTGGCA	2	12	882963	882974	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78212454
19021	NC_007516	TGC	2	6	883120	883125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212455
19022	NC_007516	CAA	2	6	883134	883139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212455
19023	NC_007516	CAC	2	6	883200	883205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212455
19024	NC_007516	CCA	2	6	883210	883215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212455
19025	NC_007516	GCA	2	6	883241	883246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212455
19026	NC_007516	GCTG	2	8	883292	883299	0 %	25 %	50 %	25 %	78212455
19027	NC_007516	GC	3	6	883400	883405	0 %	0 %	50 %	50 %	78212455
19028	NC_007516	CGGCG	2	10	883409	883418	0 %	0 %	60 %	40 %	78212455
19029	NC_007516	CAG	2	6	883428	883433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212455
19030	NC_007516	CAGGC	2	10	883437	883446	20 %	0 %	40 %	40 %	78212455
19031	NC_007516	TGCCGG	2	12	883475	883486	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78212455
19032	NC_007516	TCA	2	6	883562	883567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212455
19033	NC_007516	AAC	2	6	883615	883620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212455
19034	NC_007516	CGGCG	2	10	883638	883647	0 %	0 %	60 %	40 %	78212455
19035	NC_007516	CAG	2	6	883662	883667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212455
19036	NC_007516	CAG	2	6	883674	883679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212455
19037	NC_007516	GCG	2	6	883702	883707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212455
19038	NC_007516	GCT	2	6	883788	883793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212455
19039	NC_007516	CTG	2	6	883803	883808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212455
19040	NC_007516	C	6	6	883822	883827	0 %	0 %	0 %	100 %	78212455
19041	NC_007516	GTCG	2	8	883858	883865	0 %	25 %	50 %	25 %	78212455
19042	NC_007516	CCGT	2	8	883899	883906	0 %	25 %	25 %	50 %	78212455
19043	NC_007516	CGC	2	6	884051	884056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212455
19044	NC_007516	CAC	3	9	884064	884072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212455
19045	NC_007516	CAG	2	6	884081	884086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212455
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19047	NC_007516	GCT	2	6	884127	884132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212455
19048	NC_007516	CCAG	2	8	884156	884163	25 %	0 %	25 %	50 %	78212455
19049	NC_007516	TGC	2	6	884193	884198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212455
19050	NC_007516	CGG	2	6	884204	884209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212455
19051	NC_007516	CCGC	2	8	884210	884217	0 %	0 %	25 %	75 %	78212455
19052	NC_007516	CTG	2	6	884226	884231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212455
19053	NC_007516	G	6	6	884247	884252	0 %	0 %	100 %	0 %	78212455
19054	NC_007516	ATC	2	6	884281	884286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212455
19055	NC_007516	CTG	2	6	884333	884338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212456
19056	NC_007516	TGG	2	6	884349	884354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212456
19057	NC_007516	TGC	2	6	884379	884384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212456
19058	NC_007516	CTG	2	6	884419	884424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212456
19059	NC_007516	GCT	2	6	884455	884460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212456
19060	NC_007516	TGGCT	2	10	884472	884481	0 %	40 %	40 %	20 %	78212456
19061	NC_007516	CGC	2	6	884501	884506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212456
19062	NC_007516	GAC	2	6	884528	884533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212456
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19065	NC_007516	GC	3	6	884615	884620	0 %	0 %	50 %	50 %	78212456
19066	NC_007516	CAC	2	6	884629	884634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212456
19067	NC_007516	TGC	2	6	884652	884657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212456
19068	NC_007516	CGAT	2	8	884709	884716	25 %	25 %	25 %	25 %	78212456
19069	NC_007516	GAC	2	6	884735	884740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212456
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19072	NC_007516	AGC	2	6	884865	884870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212456
19073	NC_007516	CTG	2	6	884927	884932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212456
19074	NC_007516	TGC	2	6	884970	884975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212456
19075	NC_007516	GC	3	6	884990	884995	0 %	0 %	50 %	50 %	78212456
19076	NC_007516	CGCT	2	8	885032	885039	0 %	25 %	25 %	50 %	78212456
19077	NC_007516	AGC	2	6	885051	885056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212456
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19080	NC_007516	GCT	2	6	885136	885141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212456
19081	NC_007516	TGG	2	6	885186	885191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212456
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19083	NC_007516	GGA	2	6	885378	885383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19085	NC_007516	GTA	2	6	885429	885434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212457
19086	NC_007516	GAT	2	6	885453	885458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212457
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19088	NC_007516	CGG	2	6	885565	885570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212457
19089	NC_007516	CTG	2	6	885585	885590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212457
19090	NC_007516	CAC	2	6	885610	885615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212457
19091	NC_007516	GCTGAT	2	12	885625	885636	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78212457
19092	NC_007516	GGCT	2	8	885657	885664	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19093	NC_007516	TTCG	2	8	885714	885721	0 %	50 %	25 %	25 %	78212458
19094	NC_007516	CTG	2	6	885742	885747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212458
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19096	NC_007516	CCT	2	6	885788	885793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212458
19097	NC_007516	CTGGG	2	10	885811	885820	0 %	20 %	60 %	20 %	78212458
19098	NC_007516	CGA	2	6	885855	885860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212458
19099	NC_007516	G	6	6	885885	885890	0 %	0 %	100 %	0 %	78212458
19100	NC_007516	GCTG	2	8	885898	885905	0 %	25 %	50 %	25 %	78212458
19101	NC_007516	CGGG	2	8	885909	885916	0 %	0 %	75 %	25 %	78212458
19102	NC_007516	TGC	2	6	885974	885979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212458
19103	NC_007516	GC	3	6	886023	886028	0 %	0 %	50 %	50 %	78212458
19104	NC_007516	GCA	2	6	886127	886132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212458
19105	NC_007516	CGC	2	6	886143	886148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212458
19106	NC_007516	GT	3	6	886181	886186	0 %	50 %	50 %	0 %	78212458
19107	NC_007516	ACG	2	6	886187	886192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212458
19108	NC_007516	TGG	2	6	886259	886264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212458
19109	NC_007516	TGC	2	6	886316	886321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212458
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19111	NC_007516	CGG	2	6	886367	886372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212458
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19114	NC_007516	TGT	2	6	886450	886455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212458
19115	NC_007516	CGAGGG	2	12	886515	886526	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	78212458
19116	NC_007516	GTG	2	6	886530	886535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212458
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19119	NC_007516	TGC	2	6	886692	886697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212458
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19121	NC_007516	CAG	2	6	886891	886896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212458
19122	NC_007516	GCA	2	6	886908	886913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212458
19123	NC_007516	TGC	2	6	886919	886924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212458
19124	NC_007516	GCG	2	6	886988	886993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212458
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19146	NC_007516	ACC	2	6	888418	888423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19147	NC_007516	TTG	2	6	888544	888549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212459
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19152	NC_007516	TGC	2	6	888634	888639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212459
19153	NC_007516	GCT	4	12	888646	888657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212459
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19228	NC_007516	CCAT	2	8	891675	891682	25 %	25 %	0 %	50 %	78212463
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19240	NC_007516	GAA	2	6	892010	892015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212463
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19242	NC_007516	TGC	2	6	892075	892080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212463
19243	NC_007516	TTC	2	6	892083	892088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212463
19244	NC_007516	CGC	2	6	892092	892097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212463
19245	NC_007516	GGT	2	6	892107	892112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212463
19246	NC_007516	GAG	2	6	892167	892172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212463
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19248	NC_007516	CTT	2	6	892370	892375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212463
19249	NC_007516	CAT	2	6	892376	892381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212463
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19251	NC_007516	CAT	2	6	892472	892477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212463
19252	NC_007516	CGA	2	6	892484	892489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212463
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19257	NC_007516	ACCA	2	8	892632	892639	50 %	0 %	0 %	50 %	78212463
19258	NC_007516	TGC	2	6	892663	892668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212463
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19263	NC_007516	CTG	2	6	892851	892856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212463
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19271	NC_007516	GAG	2	6	893172	893177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212463
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19273	NC_007516	TGC	2	6	893204	893209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212463
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19283	NC_007516	TGC	2	6	893624	893629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212464
19284	NC_007516	CT	3	6	893634	893639	0 %	50 %	0 %	50 %	78212464
19285	NC_007516	TTCCT	2	10	893658	893667	0 %	60 %	0 %	40 %	78212464
19286	NC_007516	CCG	2	6	893680	893685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212464
19287	NC_007516	CAG	2	6	893692	893697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212464
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19290	NC_007516	GATC	2	8	893741	893748	25 %	25 %	25 %	25 %	78212464
19291	NC_007516	CCA	2	6	893788	893793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212464
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19305	NC_007516	GCA	2	6	894608	894613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212465
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19307	NC_007516	CAG	2	6	894641	894646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212465
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19332	NC_007516	GCATG	2	10	895894	895903	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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19335	NC_007516	CAA	2	6	896153	896158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19336	NC_007516	GACT	2	8	896254	896261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19337	NC_007516	CTC	2	6	896306	896311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19338	NC_007516	GAA	2	6	896321	896326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19339	NC_007516	CGT	2	6	896334	896339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19340	NC_007516	ACC	2	6	896370	896375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19341	NC_007516	TTCATG	4	24	896436	896459	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19342	NC_007516	TGC	2	6	896513	896518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19343	NC_007516	CTCAT	2	10	896542	896551	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19344	NC_007516	AAG	2	6	896561	896566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19345	NC_007516	TGG	2	6	896594	896599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19346	NC_007516	TGC	2	6	896605	896610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19347	NC_007516	GAG	2	6	896622	896627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212468
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19349	NC_007516	TGA	2	6	896648	896653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212468
19350	NC_007516	CTG	2	6	896786	896791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212468
19351	NC_007516	CGT	2	6	896833	896838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212468
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19356	NC_007516	TTA	2	6	896969	896974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78212469
19357	NC_007516	GGC	2	6	897021	897026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212469
19358	NC_007516	CAGGC	2	10	897051	897060	20 %	0 %	40 %	40 %	78212469
19359	NC_007516	AAGG	2	8	897071	897078	50 %	0 %	50 %	0 %	78212469
19360	NC_007516	TGT	2	6	897101	897106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212469
19361	NC_007516	ACG	2	6	897190	897195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212469
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19488	NC_007516	ACA	2	6	903397	903402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19489	NC_007516	T	6	6	903440	903445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19490	NC_007516	TGCA	2	8	903452	903459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19491	NC_007516	AAAG	2	8	903511	903518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19492	NC_007516	GA	3	6	903574	903579	50 %	0 %	50 %	0 %	78212477
19493	NC_007516	TCTT	2	8	903607	903614	0 %	75 %	0 %	25 %	78212477
19494	NC_007516	CTG	2	6	903658	903663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212477
19495	NC_007516	AG	3	6	903790	903795	50 %	0 %	50 %	0 %	78212477
19496	NC_007516	AGT	2	6	903800	903805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212477
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