MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_007516	ATC	2	6	835776	835781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212409
18003	NC_007516	AAC	2	6	835876	835881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212409
18004	NC_007516	TG	3	6	835920	835925	0 %	50 %	50 %	0 %	78212409
18005	NC_007516	TCA	2	6	835947	835952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212409
18006	NC_007516	TCA	2	6	836019	836024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212409
18007	NC_007516	TTTTG	2	10	836057	836066	0 %	80 %	20 %	0 %	78212409
18008	NC_007516	ACAT	2	8	836076	836083	50 %	25 %	0 %	25 %	78212409
18009	NC_007516	TCTT	2	8	836097	836104	0 %	75 %	0 %	25 %	78212409
18010	NC_007516	TGT	2	6	836110	836115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212409
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18012	NC_007516	CAG	2	6	836171	836176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212409
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18015	NC_007516	GCA	2	6	836407	836412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212409
18016	NC_007516	GCA	2	6	836421	836426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212409
18017	NC_007516	TTG	2	6	836448	836453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212409
18018	NC_007516	CCA	2	6	836455	836460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212409
18019	NC_007516	GCT	2	6	836503	836508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212409
18020	NC_007516	TCC	2	6	836521	836526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212409
18021	NC_007516	TCA	2	6	836569	836574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212409
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18023	NC_007516	ACA	2	6	836628	836633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212409
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18027	NC_007516	CAGT	2	8	836733	836740	25 %	25 %	25 %	25 %	78212409
18028	NC_007516	CAT	2	6	836825	836830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212409
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18031	NC_007516	CT	3	6	837073	837078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18032	NC_007516	ATTG	2	8	837212	837219	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18033	NC_007516	CAG	2	6	837261	837266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212410
18034	NC_007516	GTC	2	6	837286	837291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212410
18035	NC_007516	GCCA	2	8	837349	837356	25 %	0 %	25 %	50 %	78212410
18036	NC_007516	GGCTGC	2	12	837364	837375	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78212410
18037	NC_007516	TGC	2	6	837438	837443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212410
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18041	NC_007516	TGGA	2	8	837662	837669	25 %	25 %	50 %	0 %	78212410
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18053	NC_007516	CAGG	2	8	838158	838165	25 %	0 %	50 %	25 %	78212410
18054	NC_007516	AGC	2	6	838193	838198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212410
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18057	NC_007516	AGGG	2	8	838245	838252	25 %	0 %	75 %	0 %	78212410
18058	NC_007516	GA	3	6	838357	838362	50 %	0 %	50 %	0 %	78212410
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18066	NC_007516	TTG	2	6	838614	838619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18067	NC_007516	TTC	2	6	838659	838664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18068	NC_007516	GTG	2	6	838728	838733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18071	NC_007516	CACC	2	8	839171	839178	25 %	0 %	0 %	75 %	78212412
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18122	NC_007516	C	6	6	841404	841409	0 %	0 %	0 %	100 %	78212414
18123	NC_007516	ACG	3	9	841453	841461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212414
18124	NC_007516	GCC	2	6	841518	841523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212414
18125	NC_007516	AGC	2	6	841552	841557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212414
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18128	NC_007516	A	6	6	841641	841646	100 %	0 %	0 %	0 %	78212414
18129	NC_007516	TGG	2	6	841715	841720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212414
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18132	NC_007516	TGG	2	6	841780	841785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212414
18133	NC_007516	CTCTG	2	10	841810	841819	0 %	40 %	20 %	40 %	78212414
18134	NC_007516	TGC	2	6	841882	841887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212414
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18142	NC_007516	GTGA	2	8	842133	842140	25 %	25 %	50 %	0 %	78212414
18143	NC_007516	GCC	2	6	842181	842186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212414
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18147	NC_007516	CTG	2	6	842290	842295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18151	NC_007516	GCC	2	6	842432	842437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212415
18152	NC_007516	GTC	2	6	842539	842544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212415
18153	NC_007516	CTG	2	6	842573	842578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212415
18154	NC_007516	GTG	2	6	842579	842584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212415
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18161	NC_007516	TGC	2	6	842736	842741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212415
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18178	NC_007516	ATCG	2	8	843258	843265	25 %	25 %	25 %	25 %	78212416
18179	NC_007516	GCA	3	9	843277	843285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212416
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18181	NC_007516	GCA	2	6	843304	843309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212416
18182	NC_007516	CTG	3	9	843325	843333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18183	NC_007516	G	6	6	843338	843343	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18184	NC_007516	CGG	2	6	843429	843434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212417
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18193	NC_007516	GCA	2	6	843828	843833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212417
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18202	NC_007516	GTC	2	6	844303	844308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212418
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18218	NC_007516	GCT	2	6	844946	844951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212420
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18223	NC_007516	CTG	2	6	845067	845072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212420
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18226	NC_007516	CTGG	2	8	845168	845175	0 %	25 %	50 %	25 %	78212420
18227	NC_007516	GCG	2	6	845225	845230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212420
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18230	NC_007516	TCGGCG	2	12	845329	845340	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78212420
18231	NC_007516	CAC	2	6	845342	845347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212420
18232	NC_007516	TGGTT	2	10	845385	845394	0 %	60 %	40 %	0 %	78212420
18233	NC_007516	GCT	2	6	845428	845433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212420
18234	NC_007516	CTG	2	6	845436	845441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212420
18235	NC_007516	GCTG	2	8	845524	845531	0 %	25 %	50 %	25 %	78212420
18236	NC_007516	GCC	4	12	845540	845551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212420
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18239	NC_007516	ATGCG	2	10	845650	845659	20 %	20 %	40 %	20 %	78212420
18240	NC_007516	CAA	2	6	845672	845677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212420
18241	NC_007516	GCT	2	6	845682	845687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212420
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18483	NC_007516	ATCG	2	8	856841	856848	25 %	25 %	25 %	25 %	78212429
18484	NC_007516	GCC	2	6	856852	856857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212429
18485	NC_007516	GTG	2	6	856893	856898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212429
18486	NC_007516	GTTCA	2	10	856935	856944	20 %	40 %	20 %	20 %	78212429
18487	NC_007516	TGA	2	6	856993	856998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212429
18488	NC_007516	GTT	2	6	857018	857023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212429
18489	NC_007516	TTCATC	2	12	857127	857138	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	78212429
18490	NC_007516	ATC	2	6	857148	857153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212429
18491	NC_007516	CGG	2	6	857162	857167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212429
18492	NC_007516	GTC	2	6	857170	857175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212429
18493	NC_007516	CGT	2	6	857323	857328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212430
18494	NC_007516	CAG	2	6	857384	857389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212430
18495	NC_007516	CAG	2	6	857423	857428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212430
18496	NC_007516	GCT	2	6	857450	857455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212430
18497	NC_007516	GCCT	2	8	857468	857475	0 %	25 %	25 %	50 %	78212430
18498	NC_007516	TGA	2	6	857502	857507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212430
18499	NC_007516	CGA	2	6	857584	857589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212430
18500	NC_007516	CGCC	2	8	857623	857630	0 %	0 %	25 %	75 %	78212430

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