MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_007516	GCA	2	6	762822	762827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212341
16502	NC_007516	GGGC	2	8	762999	763006	0 %	0 %	75 %	25 %	78212342
16503	NC_007516	GCA	2	6	763008	763013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212342
16504	NC_007516	CCA	2	6	763035	763040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212342
16505	NC_007516	CAC	2	6	763048	763053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212342
16506	NC_007516	CAC	2	6	763105	763110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212342
16507	NC_007516	AGT	2	6	763118	763123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212342
16508	NC_007516	CAG	2	6	763153	763158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212342
16509	NC_007516	GCAG	2	8	763194	763201	25 %	0 %	50 %	25 %	78212342
16510	NC_007516	CAG	4	12	763231	763242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212342
16511	NC_007516	ACG	2	6	763293	763298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16512	NC_007516	CCG	2	6	763322	763327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16513	NC_007516	CAT	2	6	763370	763375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212343
16514	NC_007516	TGC	2	6	763417	763422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212343
16515	NC_007516	ACA	2	6	763471	763476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212343
16516	NC_007516	GGAGCG	2	12	763484	763495	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	78212343
16517	NC_007516	GCC	2	6	763518	763523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212343
16518	NC_007516	CGG	2	6	763537	763542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212343
16519	NC_007516	GAG	2	6	763551	763556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212343
16520	NC_007516	GATA	2	8	763571	763578	50 %	25 %	25 %	0 %	78212343
16521	NC_007516	TGG	2	6	763645	763650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212343
16522	NC_007516	GCCA	2	8	763656	763663	25 %	0 %	25 %	50 %	78212343
16523	NC_007516	CAA	2	6	763736	763741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212343
16524	NC_007516	GATC	2	8	763742	763749	25 %	25 %	25 %	25 %	78212343
16525	NC_007516	CGGATC	2	12	763759	763770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78212343
16526	NC_007516	AGG	2	6	763777	763782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212343
16527	NC_007516	ATC	2	6	763794	763799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212343
16528	NC_007516	GTG	2	6	763872	763877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212343
16529	NC_007516	CCG	2	6	763890	763895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212343
16530	NC_007516	GAA	2	6	763908	763913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212343
16531	NC_007516	CCA	2	6	763915	763920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212343
16532	NC_007516	TGA	2	6	763981	763986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212343
16533	NC_007516	AAG	2	6	764031	764036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212343
16534	NC_007516	AGA	2	6	764077	764082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212343
16535	NC_007516	GCG	2	6	764121	764126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212343
16536	NC_007516	CGG	2	6	764185	764190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212343
16537	NC_007516	GTTT	2	8	764239	764246	0 %	75 %	25 %	0 %	78212343
16538	NC_007516	GCG	2	6	764310	764315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212343
16539	NC_007516	AGC	2	6	764337	764342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212343
16540	NC_007516	CTT	2	6	764369	764374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212343
16541	NC_007516	CCT	2	6	764378	764383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212343
16542	NC_007516	TGATC	2	10	764429	764438	20 %	40 %	20 %	20 %	78212343
16543	NC_007516	TGG	2	6	764494	764499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212343
16544	NC_007516	TCGA	2	8	764538	764545	25 %	25 %	25 %	25 %	78212343
16545	NC_007516	GTG	2	6	764697	764702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212343
16546	NC_007516	CTT	2	6	764708	764713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212343
16547	NC_007516	CAC	2	6	764834	764839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212343
16548	NC_007516	TCA	2	6	764846	764851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212343
16549	NC_007516	TGG	2	6	764881	764886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212343
16550	NC_007516	CAG	2	6	764913	764918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212343
16551	NC_007516	ATCG	2	8	764939	764946	25 %	25 %	25 %	25 %	78212343
16552	NC_007516	CCA	2	6	764965	764970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212343
16553	NC_007516	GAA	3	9	765029	765037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212343
16554	NC_007516	CTG	2	6	765039	765044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212343
16555	NC_007516	AAG	2	6	765045	765050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212343
16556	NC_007516	AAG	2	6	765063	765068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212343
16557	NC_007516	ATG	2	6	765133	765138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212343
16558	NC_007516	T	8	8	765271	765278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16559	NC_007516	CCT	2	6	765287	765292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16560	NC_007516	TTC	2	6	765372	765377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16561	NC_007516	CTG	2	6	765481	765486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212344
16562	NC_007516	GTT	2	6	765504	765509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212344
16563	NC_007516	TCC	2	6	765524	765529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212344
16564	NC_007516	ACCG	2	8	765595	765602	25 %	0 %	25 %	50 %	78212344
16565	NC_007516	TG	5	10	765615	765624	0 %	50 %	50 %	0 %	78212344
16566	NC_007516	GGT	2	6	765657	765662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212344
16567	NC_007516	GTT	2	6	765663	765668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212344
16568	NC_007516	GGTG	2	8	765672	765679	0 %	25 %	75 %	0 %	78212344
16569	NC_007516	CTG	2	6	765685	765690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212344
16570	NC_007516	CGG	2	6	765726	765731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212344
16571	NC_007516	GTT	2	6	765786	765791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212344
16572	NC_007516	GGT	2	6	765798	765803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212344
16573	NC_007516	CTG	2	6	765814	765819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212344
16574	NC_007516	GCC	4	12	765838	765849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212344
16575	NC_007516	TG	3	6	765853	765858	0 %	50 %	50 %	0 %	78212344
16576	NC_007516	GCC	2	6	765931	765936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212344
16577	NC_007516	GGGGC	2	10	765946	765955	0 %	0 %	80 %	20 %	78212344
16578	NC_007516	GCG	2	6	765969	765974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212344
16579	NC_007516	TGC	2	6	766010	766015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212344
16580	NC_007516	CGC	2	6	766026	766031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212344
16581	NC_007516	GGTGCT	2	12	766038	766049	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	78212344
16582	NC_007516	GGGATT	2	12	766053	766064	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	78212344
16583	NC_007516	GCA	2	6	766126	766131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212344
16584	NC_007516	GTG	2	6	766146	766151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212344
16585	NC_007516	GCG	2	6	766235	766240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212344
16586	NC_007516	TGG	2	6	766292	766297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212345
16587	NC_007516	TTGCTG	2	12	766304	766315	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	78212345
16588	NC_007516	GCT	2	6	766327	766332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212345
16589	NC_007516	GAT	2	6	766358	766363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212345
16590	NC_007516	CCA	2	6	766392	766397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212345
16591	NC_007516	CTGGTG	2	12	766400	766411	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	78212345
16592	NC_007516	GTG	3	9	766409	766417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212345
16593	NC_007516	CTG	3	9	766433	766441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212345
16594	NC_007516	CGG	2	6	766446	766451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212345
16595	NC_007516	CGC	2	6	766459	766464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212345
16596	NC_007516	TCG	2	6	766595	766600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16597	NC_007516	TTC	2	6	766612	766617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16598	NC_007516	TGTT	2	8	766664	766671	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16599	NC_007516	GCT	2	6	766690	766695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16600	NC_007516	CAG	2	6	766742	766747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212346
16601	NC_007516	CTC	2	6	766771	766776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212346
16602	NC_007516	CTCC	2	8	766785	766792	0 %	25 %	0 %	75 %	78212346
16603	NC_007516	CTG	2	6	766870	766875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212346
16604	NC_007516	GGCC	2	8	766917	766924	0 %	0 %	50 %	50 %	78212346
16605	NC_007516	CGAC	2	8	766968	766975	25 %	0 %	25 %	50 %	78212346
16606	NC_007516	CATC	2	8	767022	767029	25 %	25 %	0 %	50 %	78212346
16607	NC_007516	AGC	2	6	767354	767359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212346
16608	NC_007516	GGT	2	6	767379	767384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212346
16609	NC_007516	GCA	2	6	767418	767423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212346
16610	NC_007516	AAG	2	6	767497	767502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212347
16611	NC_007516	CGG	2	6	767563	767568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212347
16612	NC_007516	GCG	2	6	767692	767697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212347
16613	NC_007516	GTG	2	6	767732	767737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212347
16614	NC_007516	CTG	3	9	767801	767809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212347
16615	NC_007516	TGC	2	6	767898	767903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212348
16616	NC_007516	CTG	2	6	767930	767935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212348
16617	NC_007516	TGC	2	6	768009	768014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212348
16618	NC_007516	CTGG	2	8	768100	768107	0 %	25 %	50 %	25 %	78212348
16619	NC_007516	AGC	2	6	768135	768140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212348
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16621	NC_007516	CAG	2	6	768210	768215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212348
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16729	NC_007516	CGCCAG	3	18	773551	773568	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78212353
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16740	NC_007516	AC	3	6	774011	774016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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16993	NC_007516	ACG	2	6	787341	787346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212362
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