MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_007516	AAC	2	6	741441	741446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16002	NC_007516	TCA	2	6	741487	741492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_007516	AAGTCG	2	12	741522	741533	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16004	NC_007516	CCT	2	6	741541	741546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16005	NC_007516	AGA	2	6	741551	741556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_007516	A	6	6	741613	741618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_007516	ATC	2	6	741670	741675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_007516	TGC	2	6	741782	741787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16009	NC_007516	CTC	2	6	741852	741857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212323
16010	NC_007516	TCG	2	6	741883	741888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212323
16011	NC_007516	TC	3	6	741938	741943	0 %	50 %	0 %	50 %	78212323
16012	NC_007516	CTT	2	6	742013	742018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212323
16013	NC_007516	CGT	2	6	742022	742027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212323
16014	NC_007516	TAGT	2	8	742052	742059	25 %	50 %	25 %	0 %	78212323
16015	NC_007516	ATTCGT	2	12	742115	742126	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	78212323
16016	NC_007516	CTC	2	6	742149	742154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212323
16017	NC_007516	CAGCT	2	10	742155	742164	20 %	20 %	20 %	40 %	78212323
16018	NC_007516	TTG	2	6	742177	742182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212323
16019	NC_007516	TCG	2	6	742197	742202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212323
16020	NC_007516	GAA	2	6	742314	742319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212323
16021	NC_007516	CTC	2	6	742320	742325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212323
16022	NC_007516	AAAC	2	8	742327	742334	75 %	0 %	0 %	25 %	78212323
16023	NC_007516	GTTG	2	8	742346	742353	0 %	50 %	50 %	0 %	78212323
16024	NC_007516	GCTT	2	8	742388	742395	0 %	50 %	25 %	25 %	78212323
16025	NC_007516	CTT	2	6	742404	742409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212323
16026	NC_007516	GCT	2	6	742427	742432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212323
16027	NC_007516	T	6	6	742443	742448	0 %	100 %	0 %	0 %	78212323
16028	NC_007516	GGC	2	6	742611	742616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212323
16029	NC_007516	GAT	2	6	742628	742633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212323
16030	NC_007516	ATC	2	6	742644	742649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212323
16031	NC_007516	TGT	3	9	742682	742690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212323
16032	NC_007516	CCA	2	6	742715	742720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16033	NC_007516	AGA	2	6	742772	742777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_007516	ACT	2	6	742802	742807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_007516	ACCA	2	8	742884	742891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16036	NC_007516	ACT	2	6	742943	742948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16037	NC_007516	T	7	7	742974	742980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_007516	CCAG	2	8	742991	742998	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16039	NC_007516	GCA	2	6	743054	743059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16040	NC_007516	GTT	2	6	743225	743230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212324
16041	NC_007516	TGGAT	2	10	743263	743272	20 %	40 %	40 %	0 %	78212324
16042	NC_007516	CGT	2	6	743347	743352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212324
16043	NC_007516	AAG	2	6	743472	743477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212324
16044	NC_007516	CTT	2	6	743501	743506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212324
16045	NC_007516	AAG	2	6	743526	743531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212324
16046	NC_007516	GTAG	2	8	743611	743618	25 %	25 %	50 %	0 %	78212324
16047	NC_007516	TTC	2	6	743647	743652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212324
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16049	NC_007516	TGCT	2	8	743669	743676	0 %	50 %	25 %	25 %	78212324
16050	NC_007516	GCT	3	9	743719	743727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212324
16051	NC_007516	GCAAG	2	10	743745	743754	40 %	0 %	40 %	20 %	78212324
16052	NC_007516	GAC	2	6	743808	743813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212324
16053	NC_007516	GCT	2	6	743853	743858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212324
16054	NC_007516	ACC	2	6	743874	743879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212324
16055	NC_007516	TGA	2	6	743897	743902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212324
16056	NC_007516	GCA	2	6	743909	743914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16057	NC_007516	T	6	6	743941	743946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_007516	GTT	2	6	743967	743972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_007516	GCT	2	6	743973	743978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16060	NC_007516	GTT	2	6	744015	744020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_007516	CAT	2	6	744047	744052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212325
16062	NC_007516	AGCC	2	8	744056	744063	25 %	0 %	25 %	50 %	78212325
16063	NC_007516	CTG	2	6	744109	744114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212325
16064	NC_007516	CCAC	2	8	744130	744137	25 %	0 %	0 %	75 %	78212325
16065	NC_007516	TGA	2	6	744187	744192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212325
16066	NC_007516	TCT	2	6	744301	744306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16067	NC_007516	GATA	2	8	744321	744328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_007516	GCA	2	6	744331	744336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16069	NC_007516	GCC	2	6	744400	744405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16070	NC_007516	TCA	2	6	744420	744425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16071	NC_007516	AGC	2	6	744453	744458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16072	NC_007516	CAAG	2	8	744488	744495	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16073	NC_007516	AG	3	6	744500	744505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_007516	TCA	2	6	744600	744605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16075	NC_007516	CCT	2	6	744643	744648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212326
16076	NC_007516	ACG	2	6	744652	744657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212326
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16078	NC_007516	AG	3	6	744730	744735	50 %	0 %	50 %	0 %	78212326
16079	NC_007516	GCCA	2	8	744746	744753	25 %	0 %	25 %	50 %	78212326
16080	NC_007516	GCT	2	6	744756	744761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212326
16081	NC_007516	TGG	2	6	744784	744789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212326
16082	NC_007516	AGG	2	6	744793	744798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212326
16083	NC_007516	AACG	2	8	744863	744870	50 %	0 %	25 %	25 %	78212326
16084	NC_007516	AGT	2	6	744949	744954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212326
16085	NC_007516	AAGC	2	8	744993	745000	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16086	NC_007516	GA	3	6	745109	745114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16087	NC_007516	AAG	2	6	745138	745143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_007516	GACT	2	8	745146	745153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16089	NC_007516	GCAC	2	8	745208	745215	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16090	NC_007516	ACGCC	2	10	745220	745229	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16091	NC_007516	CCG	2	6	745249	745254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16092	NC_007516	TC	3	6	745333	745338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16093	NC_007516	AGT	2	6	745342	745347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16094	NC_007516	AGCG	2	8	745368	745375	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16095	NC_007516	CCTC	2	8	745409	745416	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16096	NC_007516	TCG	2	6	745474	745479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212327
16097	NC_007516	GTGA	2	8	745547	745554	25 %	25 %	50 %	0 %	78212327
16098	NC_007516	TGG	2	6	745597	745602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212327
16099	NC_007516	ACGTC	2	10	745617	745626	20 %	20 %	20 %	40 %	78212327
16100	NC_007516	GAA	2	6	745666	745671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212327
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16103	NC_007516	ATT	2	6	745866	745871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78212327
16104	NC_007516	GCAG	2	8	745895	745902	25 %	0 %	50 %	25 %	78212327
16105	NC_007516	GCT	2	6	746015	746020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212327
16106	NC_007516	CT	3	6	746023	746028	0 %	50 %	0 %	50 %	78212327
16107	NC_007516	TGT	2	6	746122	746127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212327
16108	NC_007516	CTT	2	6	746147	746152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212327
16109	NC_007516	TCT	2	6	746176	746181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212327
16110	NC_007516	TGA	2	6	746218	746223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212327
16111	NC_007516	AGC	2	6	746241	746246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212327
16112	NC_007516	AGT	2	6	746266	746271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212327
16113	NC_007516	CCA	2	6	746302	746307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16114	NC_007516	GGT	2	6	746335	746340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_007516	AAGA	2	8	746350	746357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_007516	TCA	2	6	746397	746402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16117	NC_007516	GC	3	6	746410	746415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16118	NC_007516	ACC	2	6	746486	746491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16119	NC_007516	GGAGG	2	10	746512	746521	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_007516	CCT	2	6	746532	746537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16121	NC_007516	GGT	2	6	746599	746604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_007516	A	7	7	746618	746624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_007516	GCT	2	6	746656	746661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16124	NC_007516	TTTAT	2	10	746729	746738	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_007516	TCATC	2	10	746764	746773	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16126	NC_007516	GCA	2	6	746853	746858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16128	NC_007516	ACC	2	6	746987	746992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16132	NC_007516	ATG	3	9	747122	747130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16136	NC_007516	TCT	2	6	747271	747276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16137	NC_007516	ACA	2	6	747317	747322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16140	NC_007516	A	9	9	747371	747379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16143	NC_007516	GGT	2	6	747438	747443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16151	NC_007516	TCT	2	6	747927	747932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16155	NC_007516	TCC	2	6	748026	748031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16165	NC_007516	TAAT	2	8	748506	748513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16244	NC_007516	CT	3	6	752128	752133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16245	NC_007516	GCA	2	6	752249	752254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16246	NC_007516	GACAA	2	10	752326	752335	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16247	NC_007516	TGCCTT	2	12	752352	752363	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16248	NC_007516	GGCA	2	8	752373	752380	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16249	NC_007516	A	7	7	752383	752389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16375	NC_007516	TTG	2	6	757967	757972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16493	NC_007516	CCGC	2	8	762596	762603	0 %	0 %	25 %	75 %	78212341
16494	NC_007516	CT	3	6	762617	762622	0 %	50 %	0 %	50 %	78212341
16495	NC_007516	ATC	2	6	762646	762651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212341
16496	NC_007516	GCA	2	6	762656	762661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212341
16497	NC_007516	GGT	2	6	762693	762698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212341
16498	NC_007516	GGC	2	6	762720	762725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212341
16499	NC_007516	CTG	2	6	762727	762732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212341
16500	NC_007516	GAGC	2	8	762746	762753	25 %	0 %	50 %	25 %	78212341

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