MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_007516	CAAG	2	8	719499	719506	50 %	0 %	25 %	25 %	78212299
15503	NC_007516	CCGCTG	2	12	719507	719518	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	78212299
15504	NC_007516	GGTG	2	8	719532	719539	0 %	25 %	75 %	0 %	78212299
15505	NC_007516	CAC	3	9	719544	719552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212299
15506	NC_007516	ACC	2	6	719599	719604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212299
15507	NC_007516	CCA	2	6	719696	719701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212299
15508	NC_007516	CCA	2	6	719726	719731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212299
15509	NC_007516	GGT	2	6	719860	719865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212299
15510	NC_007516	C	7	7	719873	719879	0 %	0 %	0 %	100 %	78212299
15511	NC_007516	TGG	2	6	719933	719938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212299
15512	NC_007516	GTC	2	6	720029	720034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212299
15513	NC_007516	TGG	2	6	720092	720097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212299
15514	NC_007516	CCCGAA	2	12	720202	720213	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	78212299
15515	NC_007516	GCC	2	6	720214	720219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212299
15516	NC_007516	GGT	2	6	720252	720257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212299
15517	NC_007516	CGA	2	6	720297	720302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212299
15518	NC_007516	GGCC	2	8	720354	720361	0 %	0 %	50 %	50 %	78212299
15519	NC_007516	GTGG	2	8	720457	720464	0 %	25 %	75 %	0 %	78212299
15520	NC_007516	TGA	2	6	720467	720472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212299
15521	NC_007516	TGC	2	6	720600	720605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212299
15522	NC_007516	GTG	2	6	720622	720627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212299
15523	NC_007516	CCCG	2	8	720631	720638	0 %	0 %	25 %	75 %	78212299
15524	NC_007516	TGC	2	6	720639	720644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212299
15525	NC_007516	CAG	2	6	720646	720651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212299
15526	NC_007516	TGGC	2	8	720725	720732	0 %	25 %	50 %	25 %	78212299
15527	NC_007516	CAG	2	6	720790	720795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212299
15528	NC_007516	CCA	2	6	720875	720880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212299
15529	NC_007516	GAC	2	6	720892	720897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212299
15530	NC_007516	GTG	2	6	720905	720910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212299
15531	NC_007516	CGT	2	6	720946	720951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212299
15532	NC_007516	CCGGC	2	10	720960	720969	0 %	0 %	40 %	60 %	78212299
15533	NC_007516	AGCGCA	2	12	720995	721006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212299
15534	NC_007516	CGG	2	6	721086	721091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212299
15535	NC_007516	GGCG	2	8	721136	721143	0 %	0 %	75 %	25 %	78212300
15536	NC_007516	CACC	2	8	721161	721168	25 %	0 %	0 %	75 %	78212300
15537	NC_007516	TCC	2	6	721232	721237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212300
15538	NC_007516	CGC	2	6	721259	721264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212300
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15540	NC_007516	GGC	2	6	721304	721309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212300
15541	NC_007516	TGG	3	9	721315	721323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212300
15542	NC_007516	CCG	2	6	721381	721386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212300
15543	NC_007516	CCA	2	6	721398	721403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212300
15544	NC_007516	CT	3	6	721432	721437	0 %	50 %	0 %	50 %	78212300
15545	NC_007516	GCG	2	6	721475	721480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212300
15546	NC_007516	CAG	2	6	721547	721552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212300
15547	NC_007516	CAT	2	6	721639	721644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212300
15548	NC_007516	GC	3	6	721675	721680	0 %	0 %	50 %	50 %	78212300
15549	NC_007516	TTC	2	6	721730	721735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212300
15550	NC_007516	TGC	2	6	721768	721773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212300
15551	NC_007516	CGC	2	6	721901	721906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212300
15552	NC_007516	ACCGA	2	10	722003	722012	40 %	0 %	20 %	40 %	78212300
15553	NC_007516	GGT	2	6	722026	722031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212300
15554	NC_007516	TCCC	2	8	722056	722063	0 %	25 %	0 %	75 %	78212300
15555	NC_007516	GCTGC	2	10	722070	722079	0 %	20 %	40 %	40 %	78212300
15556	NC_007516	GCA	2	6	722085	722090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212300
15557	NC_007516	ACG	2	6	722091	722096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212300
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15560	NC_007516	CCA	2	6	722116	722121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212300
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15562	NC_007516	TCT	2	6	722182	722187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212300
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15565	NC_007516	GAG	2	6	722561	722566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212300
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15574	NC_007516	CAG	2	6	723012	723017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212301
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15583	NC_007516	ACA	2	6	723358	723363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212302
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15586	NC_007516	CGGA	2	8	723412	723419	25 %	0 %	50 %	25 %	78212302
15587	NC_007516	CCG	2	6	723440	723445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15588	NC_007516	TTCCG	2	10	723447	723456	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15589	NC_007516	C	6	6	723495	723500	0 %	0 %	0 %	100 %	78212303
15590	NC_007516	GTC	2	6	723501	723506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212303
15591	NC_007516	CAC	2	6	723508	723513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212303
15592	NC_007516	GCA	2	6	723516	723521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212303
15593	NC_007516	CCG	2	6	723522	723527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212303
15594	NC_007516	ACC	2	6	723611	723616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212303
15595	NC_007516	CG	3	6	723620	723625	0 %	0 %	50 %	50 %	78212303
15596	NC_007516	CCA	2	6	723627	723632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212303
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15600	NC_007516	GCT	2	6	723695	723700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212303
15601	NC_007516	CGATG	2	10	723778	723787	20 %	20 %	40 %	20 %	78212303
15602	NC_007516	GCT	2	6	723794	723799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212303
15603	NC_007516	GTGG	2	8	723827	723834	0 %	25 %	75 %	0 %	78212303
15604	NC_007516	CGGTG	2	10	723868	723877	0 %	20 %	60 %	20 %	78212303
15605	NC_007516	GTGCCG	2	12	723891	723902	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78212303
15606	NC_007516	GCT	2	6	723935	723940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212303
15607	NC_007516	CAT	2	6	723943	723948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212303
15608	NC_007516	TGGC	2	8	723981	723988	0 %	25 %	50 %	25 %	78212303
15609	NC_007516	GTG	2	6	723990	723995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212303
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15611	NC_007516	CCTT	2	8	724201	724208	0 %	50 %	0 %	50 %	78212304
15612	NC_007516	CCG	2	6	724225	724230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212304
15613	NC_007516	CGG	2	6	724245	724250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212304
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15617	NC_007516	TGG	2	6	724407	724412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212304
15618	NC_007516	CTT	2	6	724495	724500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212304
15619	NC_007516	T	7	7	724513	724519	0 %	100 %	0 %	0 %	78212304
15620	NC_007516	GTG	2	6	724533	724538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212304
15621	NC_007516	CTG	2	6	724574	724579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212304
15622	NC_007516	TATT	2	8	724601	724608	25 %	75 %	0 %	0 %	78212304
15623	NC_007516	TGG	2	6	724635	724640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212304
15624	NC_007516	TGC	3	9	724686	724694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212304
15625	NC_007516	GTG	2	6	724703	724708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212304
15626	NC_007516	CT	3	6	724775	724780	0 %	50 %	0 %	50 %	78212304
15627	NC_007516	GGC	2	6	724786	724791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212304
15628	NC_007516	CTGG	2	8	724858	724865	0 %	25 %	50 %	25 %	78212304
15629	NC_007516	GGT	3	9	724912	724920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212304
15630	NC_007516	GCG	2	6	724926	724931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212304
15631	NC_007516	CCATCG	2	12	724974	724985	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78212304
15632	NC_007516	GCA	2	6	725004	725009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212304
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15634	NC_007516	ACGC	2	8	725059	725066	25 %	0 %	25 %	50 %	78212304
15635	NC_007516	TTG	2	6	725138	725143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212304
15636	NC_007516	CTG	2	6	725144	725149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212304
15637	NC_007516	GCT	2	6	725173	725178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212304
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15640	NC_007516	CCA	3	9	725262	725270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212304
15641	NC_007516	CTGGT	2	10	725292	725301	0 %	40 %	40 %	20 %	78212304
15642	NC_007516	CTT	2	6	725323	725328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212304
15643	NC_007516	CTG	2	6	725351	725356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212304
15644	NC_007516	CTTC	2	8	725386	725393	0 %	50 %	0 %	50 %	78212304
15645	NC_007516	CCG	2	6	725470	725475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212304
15646	NC_007516	TGG	2	6	725511	725516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212304
15647	NC_007516	GCT	3	9	725545	725553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212304
15648	NC_007516	TTG	2	6	725579	725584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212304
15649	NC_007516	GCA	2	6	725600	725605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212304
15650	NC_007516	TGG	3	9	725610	725618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212304
15651	NC_007516	TGCT	2	8	725637	725644	0 %	50 %	25 %	25 %	78212304
15652	NC_007516	CTG	2	6	725693	725698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212304
15653	NC_007516	TGG	2	6	725702	725707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212304
15654	NC_007516	CTG	2	6	725714	725719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212304
15655	NC_007516	GTG	2	6	725768	725773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212304
15656	NC_007516	TC	3	6	725781	725786	0 %	50 %	0 %	50 %	78212304
15657	NC_007516	CCT	2	6	725793	725798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212304
15658	NC_007516	GTG	2	6	725813	725818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212304
15659	NC_007516	TCT	2	6	725824	725829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212304
15660	NC_007516	GC	3	6	725840	725845	0 %	0 %	50 %	50 %	78212304
15661	NC_007516	TCAGCG	2	12	725877	725888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78212304
15662	NC_007516	CTT	2	6	725982	725987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212305
15663	NC_007516	GCTCTG	2	12	726018	726029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212305
15664	NC_007516	TGC	2	6	726082	726087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212305
15665	NC_007516	TGG	2	6	726088	726093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212305
15666	NC_007516	CTG	3	9	726117	726125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212305
15667	NC_007516	GCC	2	6	726135	726140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212305
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15669	NC_007516	TGA	2	6	726238	726243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212305
15670	NC_007516	TGG	2	6	726259	726264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212305
15671	NC_007516	TCGCG	2	10	726271	726280	0 %	20 %	40 %	40 %	78212305
15672	NC_007516	CTG	2	6	726366	726371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212305
15673	NC_007516	CTT	2	6	726374	726379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212305
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15675	NC_007516	GTG	2	6	726433	726438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212305
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15678	NC_007516	GCT	3	9	726593	726601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212305
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15680	NC_007516	TTC	2	6	726703	726708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212305
15681	NC_007516	TGC	2	6	726718	726723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212305
15682	NC_007516	GCT	2	6	726789	726794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212305
15683	NC_007516	CTGG	2	8	726797	726804	0 %	25 %	50 %	25 %	78212305
15684	NC_007516	GCG	2	6	726843	726848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212305
15685	NC_007516	TGG	2	6	726874	726879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212305
15686	NC_007516	GCC	5	15	726918	726932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212305
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15688	NC_007516	TGA	2	6	727102	727107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212305
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15690	NC_007516	TGG	2	6	727219	727224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212305
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15692	NC_007516	CTG	2	6	727251	727256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212305
15693	NC_007516	CTT	2	6	727271	727276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212305
15694	NC_007516	GCT	2	6	727403	727408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212305
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15698	NC_007516	GTT	2	6	727530	727535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212306
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15700	NC_007516	CTG	2	6	727577	727582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212306
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15702	NC_007516	TGG	2	6	727641	727646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212306
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15705	NC_007516	TGGCA	2	10	727790	727799	20 %	20 %	40 %	20 %	78212306
15706	NC_007516	GCG	2	6	727800	727805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212306
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15710	NC_007516	TGA	2	6	727980	727985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212306
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15716	NC_007516	C	7	7	728140	728146	0 %	0 %	0 %	100 %	78212306
15717	NC_007516	TTC	2	6	728201	728206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212306
15718	NC_007516	TGCA	2	8	728345	728352	25 %	25 %	25 %	25 %	78212306
15719	NC_007516	ACG	2	6	728394	728399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212306
15720	NC_007516	GCC	2	6	728477	728482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212306
15721	NC_007516	AGC	2	6	728526	728531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212306
15722	NC_007516	GCC	2	6	728534	728539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212306
15723	NC_007516	CTC	2	6	728597	728602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212306
15724	NC_007516	CAG	2	6	728611	728616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15725	NC_007516	TGA	2	6	728638	728643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212307
15726	NC_007516	ACG	2	6	728704	728709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212307
15727	NC_007516	GGA	2	6	728813	728818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212307
15728	NC_007516	CTC	2	6	728880	728885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212307
15729	NC_007516	GA	3	6	728987	728992	50 %	0 %	50 %	0 %	78212308
15730	NC_007516	TGC	2	6	728994	728999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212308
15731	NC_007516	GCT	3	9	729000	729008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212308
15732	NC_007516	GCA	2	6	729024	729029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212308
15733	NC_007516	ACC	2	6	729097	729102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212308
15734	NC_007516	CGA	2	6	729177	729182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212308
15735	NC_007516	GC	3	6	729237	729242	0 %	0 %	50 %	50 %	78212308
15736	NC_007516	GTG	2	6	729248	729253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212308
15737	NC_007516	AACG	2	8	729295	729302	50 %	0 %	25 %	25 %	78212308
15738	NC_007516	CGA	3	9	729471	729479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212308
15739	NC_007516	CTC	2	6	729502	729507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212308
15740	NC_007516	TGCCGA	2	12	729531	729542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78212308
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15742	NC_007516	TTC	2	6	729586	729591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212308
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15855	NC_007516	GCA	2	6	734612	734617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15858	NC_007516	GAGCG	2	10	734698	734707	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15859	NC_007516	GGT	2	6	734825	734830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15861	NC_007516	A	6	6	734915	734920	100 %	0 %	0 %	0 %	78212315
15862	NC_007516	CGG	2	6	734961	734966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212315
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15984	NC_007516	TGCT	2	8	740894	740901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15985	NC_007516	GTTG	2	8	740922	740929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15989	NC_007516	GAT	2	6	741048	741053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212322
15990	NC_007516	GA	3	6	741068	741073	50 %	0 %	50 %	0 %	78212322
15991	NC_007516	GCT	2	6	741074	741079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212322
15992	NC_007516	TGA	2	6	741080	741085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212322
15993	NC_007516	CTG	2	6	741164	741169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212322
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15998	NC_007516	GAG	2	6	741315	741320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212322
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