MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_007516	TGG	2	6	582307	582312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212150
12503	NC_007516	GTT	2	6	582335	582340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212150
12504	NC_007516	G	6	6	582344	582349	0 %	0 %	100 %	0 %	78212150
12505	NC_007516	GCTG	2	8	582362	582369	0 %	25 %	50 %	25 %	78212150
12506	NC_007516	GCCG	2	8	582395	582402	0 %	0 %	50 %	50 %	78212150
12507	NC_007516	ACC	2	6	582412	582417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212150
12508	NC_007516	GGC	2	6	582419	582424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212150
12509	NC_007516	CAC	2	6	582440	582445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212150
12510	NC_007516	GGCT	2	8	582447	582454	0 %	25 %	50 %	25 %	78212150
12511	NC_007516	TGA	2	6	582458	582463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212150
12512	NC_007516	TGC	2	6	582473	582478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212150
12513	NC_007516	CGG	2	6	582494	582499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212150
12514	NC_007516	TGG	2	6	582502	582507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212150
12515	NC_007516	GCA	2	6	582571	582576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212150
12516	NC_007516	GGGC	2	8	582628	582635	0 %	0 %	75 %	25 %	78212150
12517	NC_007516	TGC	2	6	582643	582648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212150
12518	NC_007516	AGC	2	6	582709	582714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212150
12519	NC_007516	GAT	2	6	582796	582801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212151
12520	NC_007516	GCT	2	6	582820	582825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212151
12521	NC_007516	GTC	2	6	582834	582839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212151
12522	NC_007516	CGA	2	6	582840	582845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212151
12523	NC_007516	CCAGC	2	10	582935	582944	20 %	0 %	20 %	60 %	78212151
12524	NC_007516	CGG	2	6	582957	582962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212151
12525	NC_007516	GATG	2	8	582995	583002	25 %	25 %	50 %	0 %	78212151
12526	NC_007516	CTG	2	6	583085	583090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212151
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12529	NC_007516	GTG	2	6	583223	583228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212151
12530	NC_007516	TGCGT	2	10	583294	583303	0 %	40 %	40 %	20 %	78212151
12531	NC_007516	GCT	2	6	583345	583350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212151
12532	NC_007516	GGT	3	9	583366	583374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212151
12533	NC_007516	TTG	2	6	583400	583405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212151
12534	NC_007516	CCTG	2	8	583432	583439	0 %	25 %	25 %	50 %	78212151
12535	NC_007516	CGC	2	6	583544	583549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212151
12536	NC_007516	GCA	2	6	583555	583560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212151
12537	NC_007516	GGCG	2	8	583566	583573	0 %	0 %	75 %	25 %	78212151
12538	NC_007516	GC	3	6	583619	583624	0 %	0 %	50 %	50 %	78212151
12539	NC_007516	TCCG	2	8	583642	583649	0 %	25 %	25 %	50 %	78212151
12540	NC_007516	GTTGC	2	10	583660	583669	0 %	40 %	40 %	20 %	78212151
12541	NC_007516	GCC	2	6	583741	583746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212151
12542	NC_007516	TGG	2	6	583770	583775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212152
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12544	NC_007516	CTG	2	6	584036	584041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212152
12545	NC_007516	CTGA	2	8	584078	584085	25 %	25 %	25 %	25 %	78212152
12546	NC_007516	GCG	2	6	584112	584117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212152
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12549	NC_007516	TGCAGG	2	12	584346	584357	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78212152
12550	NC_007516	CGAT	2	8	584391	584398	25 %	25 %	25 %	25 %	78212152
12551	NC_007516	TGC	2	6	584407	584412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212152
12552	NC_007516	GCT	2	6	584417	584422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212152
12553	NC_007516	CTG	2	6	584448	584453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212152
12554	NC_007516	C	6	6	584484	584489	0 %	0 %	0 %	100 %	78212152
12555	NC_007516	CTC	2	6	584507	584512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212152
12556	NC_007516	ATGG	2	8	584525	584532	25 %	25 %	50 %	0 %	78212152
12557	NC_007516	CAGCC	2	10	584553	584562	20 %	0 %	20 %	60 %	78212152
12558	NC_007516	GGC	2	6	584581	584586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212152
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12565	NC_007516	GGC	2	6	584821	584826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212152
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12567	NC_007516	GGC	2	6	584899	584904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212153
12568	NC_007516	GTC	2	6	584914	584919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212153
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12575	NC_007516	ATG	2	6	585266	585271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212153
12576	NC_007516	GATC	2	8	585288	585295	25 %	25 %	25 %	25 %	78212153
12577	NC_007516	GCA	3	9	585330	585338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212153
12578	NC_007516	GGC	2	6	585355	585360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212153
12579	NC_007516	CGG	2	6	585399	585404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12580	NC_007516	AG	3	6	585428	585433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_007516	CTG	2	6	585434	585439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12582	NC_007516	CAGT	2	8	585464	585471	25 %	25 %	25 %	25 %	78212154
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12585	NC_007516	C	6	6	585528	585533	0 %	0 %	0 %	100 %	78212154
12586	NC_007516	CGG	2	6	585576	585581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212154
12587	NC_007516	TGAG	2	8	585615	585622	25 %	25 %	50 %	0 %	78212154
12588	NC_007516	TGG	2	6	585712	585717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212154
12589	NC_007516	CACC	2	8	585757	585764	25 %	0 %	0 %	75 %	78212154
12590	NC_007516	CCTC	2	8	585772	585779	0 %	25 %	0 %	75 %	78212154
12591	NC_007516	TGGA	2	8	585855	585862	25 %	25 %	50 %	0 %	78212154
12592	NC_007516	ACG	2	6	585899	585904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212154
12593	NC_007516	GAG	2	6	585935	585940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212154
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12595	NC_007516	CTG	2	6	586029	586034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212154
12596	NC_007516	CAGC	2	8	586080	586087	25 %	0 %	25 %	50 %	78212154
12597	NC_007516	TGGC	2	8	586088	586095	0 %	25 %	50 %	25 %	78212154
12598	NC_007516	GAA	2	6	586125	586130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212155
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12601	NC_007516	GTTGCC	2	12	586222	586233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212155
12602	NC_007516	GCC	2	6	586273	586278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212155
12603	NC_007516	CTG	3	9	586286	586294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212155
12604	NC_007516	GCC	2	6	586319	586324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212155
12605	NC_007516	CCA	2	6	586335	586340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212155
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12607	NC_007516	GAC	2	6	586368	586373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212155
12608	NC_007516	AGCCGC	2	12	586389	586400	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78212155
12609	NC_007516	CAG	2	6	586447	586452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212155
12610	NC_007516	CAAGG	2	10	586513	586522	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12611	NC_007516	GCT	2	6	586592	586597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212156
12612	NC_007516	CCA	2	6	586651	586656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212156
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12616	NC_007516	CCA	2	6	586773	586778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212156
12617	NC_007516	AGGCC	2	10	586794	586803	20 %	0 %	40 %	40 %	78212156
12618	NC_007516	CAG	2	6	586819	586824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212156
12619	NC_007516	GGCC	2	8	586866	586873	0 %	0 %	50 %	50 %	78212156
12620	NC_007516	GGGCAG	2	12	586921	586932	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	78212156
12621	NC_007516	AAG	2	6	586997	587002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212156
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12623	NC_007516	CTGATC	2	12	587095	587106	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78212156
12624	NC_007516	TGG	2	6	587121	587126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212156
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12651	NC_007516	A	6	6	588662	588667	100 %	0 %	0 %	0 %	78212157
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12666	NC_007516	CA	3	6	589751	589756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12672	NC_007516	GTT	2	6	589983	589988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212159
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12726	NC_007516	CGGA	2	8	591659	591666	25 %	0 %	50 %	25 %	78212160
12727	NC_007516	CACC	2	8	591682	591689	25 %	0 %	0 %	75 %	78212160
12728	NC_007516	TC	3	6	591703	591708	0 %	50 %	0 %	50 %	78212160
12729	NC_007516	CT	3	6	591734	591739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12730	NC_007516	CTT	2	6	591880	591885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212161
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12735	NC_007516	TCGCC	2	10	592140	592149	0 %	20 %	20 %	60 %	78212161
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12738	NC_007516	GCC	2	6	592216	592221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212161
12739	NC_007516	CTG	2	6	592225	592230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212161
12740	NC_007516	TGCTCG	2	12	592244	592255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212161
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12983	NC_007516	GTT	2	6	604335	604340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212174
12984	NC_007516	TGA	2	6	604450	604455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212174
12985	NC_007516	CGC	2	6	604483	604488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212174
12986	NC_007516	GCC	2	6	604497	604502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212174
12987	NC_007516	CTGG	2	8	604526	604533	0 %	25 %	50 %	25 %	78212174
12988	NC_007516	CGC	2	6	604556	604561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212174
12989	NC_007516	GTC	2	6	604582	604587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212174
12990	NC_007516	GTC	2	6	604619	604624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212174
12991	NC_007516	TCA	2	6	604642	604647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212174
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12993	NC_007516	CCA	2	6	604735	604740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12994	NC_007516	A	6	6	604740	604745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12995	NC_007516	GAAG	2	8	604787	604794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12999	NC_007516	CAC	2	6	604929	604934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212175
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