MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_007516	AAG	2	6	533949	533954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212101
11502	NC_007516	TCG	2	6	534019	534024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212101
11503	NC_007516	ACA	2	6	534044	534049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212101
11504	NC_007516	CAG	2	6	534123	534128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_007516	CAG	2	6	534138	534143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_007516	TCA	2	6	534278	534283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212102
11507	NC_007516	GC	3	6	534336	534341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11508	NC_007516	TCT	2	6	534342	534347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_007516	TTGC	2	8	534350	534357	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11510	NC_007516	GCT	2	6	534528	534533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_007516	A	7	7	534564	534570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_007516	CTA	2	6	534626	534631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_007516	TTGTC	2	10	534730	534739	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11514	NC_007516	AAC	2	6	534849	534854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_007516	GCA	2	6	534885	534890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_007516	GAGG	3	12	534914	534925	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_007516	GAA	2	6	534941	534946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_007516	AC	3	6	535015	535020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11519	NC_007516	GTC	2	6	535118	535123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_007516	GAA	2	6	535131	535136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_007516	T	6	6	535203	535208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_007516	A	7	7	535215	535221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_007516	TGAC	2	8	535296	535303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11524	NC_007516	GAT	2	6	535318	535323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_007516	CCA	2	6	535374	535379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11526	NC_007516	TCA	2	6	535385	535390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_007516	GCA	2	6	535410	535415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_007516	GTAG	2	8	535434	535441	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_007516	GA	3	6	535462	535467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_007516	GAGCT	2	10	535679	535688	20 %	20 %	40 %	20 %	78212103
11531	NC_007516	TGG	2	6	535697	535702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212103
11532	NC_007516	CTG	2	6	535780	535785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212103
11533	NC_007516	ACG	2	6	535803	535808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212103
11534	NC_007516	CAT	2	6	535884	535889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212103
11535	NC_007516	GGT	2	6	535897	535902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212103
11536	NC_007516	CTGG	2	8	535986	535993	0 %	25 %	50 %	25 %	78212103
11537	NC_007516	CGT	2	6	535994	535999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212103
11538	NC_007516	CAA	2	6	536030	536035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212103
11539	NC_007516	GCA	2	6	536158	536163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212103
11540	NC_007516	CTC	2	6	536238	536243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212104
11541	NC_007516	CAG	2	6	536256	536261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212104
11542	NC_007516	CCA	2	6	536306	536311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212104
11543	NC_007516	GAG	2	6	536324	536329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212104
11544	NC_007516	TGC	2	6	536454	536459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212104
11545	NC_007516	CTG	2	6	536499	536504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212104
11546	NC_007516	GCT	2	6	536507	536512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212104
11547	NC_007516	CCA	2	6	536534	536539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212104
11548	NC_007516	AACC	2	8	536596	536603	50 %	0 %	0 %	50 %	78212104
11549	NC_007516	AGTTCG	2	12	536671	536682	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78212104
11550	NC_007516	GTGG	2	8	536699	536706	0 %	25 %	75 %	0 %	78212104
11551	NC_007516	ACA	2	6	536891	536896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212104
11552	NC_007516	CCA	2	6	536939	536944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212104
11553	NC_007516	CCA	2	6	536987	536992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212104
11554	NC_007516	T	6	6	536997	537002	0 %	100 %	0 %	0 %	78212104
11555	NC_007516	TGG	2	6	537105	537110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212104
11556	NC_007516	AAG	2	6	537139	537144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212104
11557	NC_007516	CTT	2	6	537146	537151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212104
11558	NC_007516	GCA	2	6	537221	537226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212104
11559	NC_007516	GCT	2	6	537257	537262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212104
11560	NC_007516	CAG	3	9	537338	537346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212104
11561	NC_007516	AAGA	2	8	537446	537453	75 %	0 %	25 %	0 %	78212104
11562	NC_007516	CTCC	2	8	537476	537483	0 %	25 %	0 %	75 %	78212104
11563	NC_007516	CACC	2	8	537533	537540	25 %	0 %	0 %	75 %	78212104
11564	NC_007516	TCA	2	6	537607	537612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212104
11565	NC_007516	CAA	2	6	537654	537659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212104
11566	NC_007516	CAG	2	6	537678	537683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212104
11567	NC_007516	GTT	2	6	537696	537701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212104
11568	NC_007516	ACA	2	6	537745	537750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212104
11569	NC_007516	CGG	2	6	537790	537795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212104
11570	NC_007516	ATT	2	6	537802	537807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78212104
11571	NC_007516	GCT	2	6	537823	537828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_007516	TTC	2	6	537853	537858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_007516	ATA	2	6	537990	537995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_007516	A	6	6	537998	538003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_007516	CT	3	6	538044	538049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11576	NC_007516	TAAG	2	8	538062	538069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_007516	AAGG	2	8	538076	538083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_007516	CAG	2	6	538094	538099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11579	NC_007516	GCA	2	6	538133	538138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11581	NC_007516	ACA	2	6	538375	538380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11582	NC_007516	A	7	7	538466	538472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_007516	ACT	2	6	538487	538492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11584	NC_007516	A	6	6	538513	538518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_007516	TTG	2	6	538576	538581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_007516	TCA	2	6	538584	538589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11588	NC_007516	AGA	2	6	538612	538617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_007516	AAC	2	6	538712	538717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212105
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11591	NC_007516	AGA	2	6	539187	539192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212105
11592	NC_007516	AGGA	2	8	539230	539237	50 %	0 %	50 %	0 %	78212105
11593	NC_007516	G	7	7	539281	539287	0 %	0 %	100 %	0 %	78212105
11594	NC_007516	ATG	2	6	539407	539412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212105
11595	NC_007516	AATC	2	8	539489	539496	50 %	25 %	0 %	25 %	78212105
11596	NC_007516	AT	3	6	539530	539535	50 %	50 %	0 %	0 %	78212105
11597	NC_007516	CTA	2	6	539572	539577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212105
11598	NC_007516	AAT	2	6	539629	539634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78212105
11599	NC_007516	CTT	2	6	539640	539645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11600	NC_007516	G	6	6	539748	539753	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_007516	TCA	2	6	539783	539788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212106
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11604	NC_007516	GTA	2	6	539891	539896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212106
11605	NC_007516	TCACC	2	10	539973	539982	20 %	20 %	0 %	60 %	78212106
11606	NC_007516	GAG	2	6	540049	540054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212106
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11608	NC_007516	AAC	3	9	540085	540093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212106
11609	NC_007516	CAC	2	6	540100	540105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212106
11610	NC_007516	CAG	2	6	540198	540203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11611	NC_007516	TTC	2	6	540211	540216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_007516	GCG	2	6	540233	540238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_007516	CGCT	2	8	540366	540373	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11614	NC_007516	C	6	6	540385	540390	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11615	NC_007516	CAG	2	6	540436	540441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212107
11616	NC_007516	CTG	2	6	540514	540519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212107
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11618	NC_007516	TGA	2	6	540636	540641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212107
11619	NC_007516	CAG	2	6	540688	540693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212107
11620	NC_007516	CAG	2	6	540739	540744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212107
11621	NC_007516	GAA	2	6	540772	540777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212107
11622	NC_007516	GCT	2	6	540802	540807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212107
11623	NC_007516	CCAG	2	8	540810	540817	25 %	0 %	25 %	50 %	78212107
11624	NC_007516	GCA	2	6	540822	540827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212107
11625	NC_007516	TGC	2	6	540924	540929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212107
11626	NC_007516	CGAC	2	8	541054	541061	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11627	NC_007516	GCT	2	6	541082	541087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11628	NC_007516	GCA	2	6	541090	541095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11629	NC_007516	GTT	2	6	541151	541156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11630	NC_007516	CTT	2	6	541222	541227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212108
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11647	NC_007516	CAGG	2	8	542147	542154	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11656	NC_007516	TTC	2	6	542483	542488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11672	NC_007516	AGTAA	2	10	543332	543341	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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11929	NC_007516	CGG	2	6	556470	556475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212120
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11934	NC_007516	ACG	2	6	556583	556588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212120
11935	NC_007516	ACG	2	6	556668	556673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11936	NC_007516	CGA	2	6	556680	556685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11938	NC_007516	CGC	2	6	556780	556785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212121
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11941	NC_007516	TGC	2	6	556916	556921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212121
11942	NC_007516	GC	3	6	556920	556925	0 %	0 %	50 %	50 %	78212121
11943	NC_007516	ATC	2	6	556974	556979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212121
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11947	NC_007516	CACG	2	8	557095	557102	25 %	0 %	25 %	50 %	78212122
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11951	NC_007516	GCCA	2	8	557218	557225	25 %	0 %	25 %	50 %	78212122
11952	NC_007516	AGC	2	6	557229	557234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212122
11953	NC_007516	ATTG	2	8	557264	557271	25 %	50 %	25 %	0 %	78212122
11954	NC_007516	C	6	6	557304	557309	0 %	0 %	0 %	100 %	78212122
11955	NC_007516	GCTG	2	8	557311	557318	0 %	25 %	50 %	25 %	78212122
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11979	NC_007516	TCGC	2	8	558173	558180	0 %	25 %	25 %	50 %	78212123
11980	NC_007516	GCA	2	6	558208	558213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212123
11981	NC_007516	GCC	2	6	558252	558257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212123
11982	NC_007516	GGCCA	2	10	558272	558281	20 %	0 %	40 %	40 %	78212123
11983	NC_007516	GCCTT	2	10	558312	558321	0 %	40 %	20 %	40 %	78212123
11984	NC_007516	CGT	2	6	558342	558347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212123
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11989	NC_007516	CGG	2	6	558642	558647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212123
11990	NC_007516	GGC	2	6	558662	558667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212123
11991	NC_007516	GAT	2	6	558695	558700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212123
11992	NC_007516	GTC	2	6	558755	558760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212123
11993	NC_007516	GCA	2	6	558844	558849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212123
11994	NC_007516	CGGA	2	8	558957	558964	25 %	0 %	50 %	25 %	78212123
11995	NC_007516	TCA	2	6	559023	559028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212123
11996	NC_007516	G	6	6	559033	559038	0 %	0 %	100 %	0 %	78212123
11997	NC_007516	GCG	2	6	559046	559051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212123
11998	NC_007516	GTC	2	6	559064	559069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212123
11999	NC_007516	CAG	2	6	559118	559123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212123
12000	NC_007516	CTG	2	6	559124	559129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212123

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