MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_007516	CAG	2	6	508539	508544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212066
11003	NC_007516	CCA	2	6	508562	508567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212066
11004	NC_007516	G	8	8	508593	508600	0 %	0 %	100 %	0 %	78212066
11005	NC_007516	CAG	2	6	508623	508628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212066
11006	NC_007516	CAGG	2	8	508645	508652	25 %	0 %	50 %	25 %	78212066
11007	NC_007516	CCAG	2	8	508736	508743	25 %	0 %	25 %	50 %	78212066
11008	NC_007516	CTGCG	2	10	508796	508805	0 %	20 %	40 %	40 %	78212066
11009	NC_007516	CGG	2	6	508833	508838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212066
11010	NC_007516	TGC	2	6	508850	508855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212066
11011	NC_007516	GCCG	2	8	508872	508879	0 %	0 %	50 %	50 %	78212066
11012	NC_007516	GCCCA	2	10	508890	508899	20 %	0 %	20 %	60 %	78212066
11013	NC_007516	TTGCCA	2	12	508911	508922	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78212066
11014	NC_007516	GGC	2	6	508938	508943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212066
11015	NC_007516	TCAG	2	8	509013	509020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11016	NC_007516	TGG	2	6	509063	509068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212067
11017	NC_007516	TGC	2	6	509105	509110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212067
11018	NC_007516	CTGAT	2	10	509129	509138	20 %	40 %	20 %	20 %	78212067
11019	NC_007516	GGCT	2	8	509145	509152	0 %	25 %	50 %	25 %	78212067
11020	NC_007516	GCC	2	6	509192	509197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212067
11021	NC_007516	GCT	2	6	509228	509233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212067
11022	NC_007516	TCC	2	6	509234	509239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212067
11023	NC_007516	AGC	2	6	509321	509326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212067
11024	NC_007516	CTGTG	2	10	509328	509337	0 %	40 %	40 %	20 %	78212067
11025	NC_007516	CAC	2	6	509355	509360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212067
11026	NC_007516	CGGC	2	8	509391	509398	0 %	0 %	50 %	50 %	78212067
11027	NC_007516	CAG	2	6	509476	509481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212067
11028	NC_007516	TTG	2	6	509492	509497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212067
11029	NC_007516	CTTGG	2	10	509581	509590	0 %	40 %	40 %	20 %	78212067
11030	NC_007516	TGG	2	6	509651	509656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212067
11031	NC_007516	TGC	2	6	509781	509786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212067
11032	NC_007516	GACC	2	8	509793	509800	25 %	0 %	25 %	50 %	78212067
11033	NC_007516	CCG	2	6	509886	509891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212067
11034	NC_007516	GCT	2	6	509937	509942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212067
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11037	NC_007516	CAGAT	2	10	509989	509998	40 %	20 %	20 %	20 %	78212068
11038	NC_007516	GTC	2	6	510036	510041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212068
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11040	NC_007516	AGCGCT	2	12	510177	510188	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78212068
11041	NC_007516	GCT	2	6	510222	510227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212068
11042	NC_007516	CGC	2	6	510271	510276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212068
11043	NC_007516	CAG	2	6	510307	510312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_007516	CTCCAG	2	12	510363	510374	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11045	NC_007516	TCC	2	6	510409	510414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11046	NC_007516	GGC	2	6	510515	510520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_007516	AC	3	6	510546	510551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11048	NC_007516	CAGG	2	8	510579	510586	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11049	NC_007516	CCTT	2	8	510597	510604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11050	NC_007516	TTTC	2	8	510625	510632	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11051	NC_007516	ACC	3	9	510643	510651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212069
11052	NC_007516	CAG	2	6	510655	510660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212069
11053	NC_007516	CCA	2	6	510707	510712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212069
11054	NC_007516	GGTT	2	8	510730	510737	0 %	50 %	50 %	0 %	78212069
11055	NC_007516	TGA	2	6	510746	510751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212069
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11057	NC_007516	CCA	2	6	510770	510775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212069
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11069	NC_007516	ACC	2	6	511318	511323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212069
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11078	NC_007516	CTC	2	6	511765	511770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11079	NC_007516	AAG	2	6	511820	511825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_007516	TAT	2	6	511857	511862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_007516	A	6	6	511889	511894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11084	NC_007516	ACTGG	2	10	512245	512254	20 %	20 %	40 %	20 %	78212070
11085	NC_007516	GAGGT	2	10	512294	512303	20 %	20 %	60 %	0 %	78212070
11086	NC_007516	AC	3	6	512325	512330	50 %	0 %	0 %	50 %	78212070
11087	NC_007516	ATCA	2	8	512333	512340	50 %	25 %	0 %	25 %	78212070
11088	NC_007516	CTG	2	6	512516	512521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212070
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11093	NC_007516	TGC	2	6	513075	513080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212070
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11102	NC_007516	CAA	2	6	513671	513676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_007516	CTTG	2	8	513688	513695	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11104	NC_007516	T	6	6	513799	513804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11107	NC_007516	GTTG	2	8	513907	513914	0 %	50 %	50 %	0 %	78212071
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11112	NC_007516	CAATC	2	10	514164	514173	40 %	20 %	0 %	40 %	78212071
11113	NC_007516	TA	3	6	514219	514224	50 %	50 %	0 %	0 %	78212071
11114	NC_007516	AAG	2	6	514289	514294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_007516	AC	3	6	514321	514326	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11116	NC_007516	AGC	2	6	514352	514357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_007516	TGG	2	6	514361	514366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_007516	TGT	2	6	514374	514379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_007516	GAA	2	6	514450	514455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_007516	T	6	6	514459	514464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_007516	CATC	2	8	514491	514498	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11122	NC_007516	TCA	2	6	514502	514507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11124	NC_007516	T	7	7	514564	514570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11241	NC_007516	CTCG	2	8	520332	520339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11242	NC_007516	GAA	2	6	520370	520375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212082
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11245	NC_007516	AGTC	2	8	520559	520566	25 %	25 %	25 %	25 %	78212082
11246	NC_007516	CTT	2	6	520569	520574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212082
11247	NC_007516	CTG	2	6	520579	520584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212082
11248	NC_007516	GTC	2	6	520594	520599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212082
11249	NC_007516	CTC	2	6	520609	520614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212082
11250	NC_007516	TCA	2	6	520656	520661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212082
11251	NC_007516	CGAT	2	8	520693	520700	25 %	25 %	25 %	25 %	78212082
11252	NC_007516	TCA	2	6	520773	520778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212083
11253	NC_007516	TGG	2	6	520789	520794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212083
11254	NC_007516	TTC	2	6	520815	520820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212083
11255	NC_007516	CTC	2	6	520833	520838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212083
11256	NC_007516	G	6	6	520844	520849	0 %	0 %	100 %	0 %	78212083
11257	NC_007516	CGG	2	6	520868	520873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212083
11258	NC_007516	TGAA	2	8	520894	520901	50 %	25 %	25 %	0 %	78212083
11259	NC_007516	TTCCG	2	10	520910	520919	0 %	40 %	20 %	40 %	78212083
11260	NC_007516	CTG	2	6	520962	520967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212083
11261	NC_007516	AGC	2	6	521103	521108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11262	NC_007516	CCT	2	6	521120	521125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11263	NC_007516	GAC	2	6	521297	521302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11264	NC_007516	GTCTG	2	10	521371	521380	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11265	NC_007516	TGC	2	6	521458	521463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212084
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11268	NC_007516	GCC	2	6	521591	521596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212084
11269	NC_007516	CAA	2	6	521708	521713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11270	NC_007516	CTT	2	6	521769	521774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11271	NC_007516	CGAC	2	8	521805	521812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11272	NC_007516	AAG	2	6	521817	521822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11273	NC_007516	AGC	2	6	521927	521932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11274	NC_007516	AGC	2	6	521948	521953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11275	NC_007516	GCA	2	6	522034	522039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11276	NC_007516	CCTCA	2	10	522052	522061	20 %	20 %	0 %	60 %	78212085
11277	NC_007516	CGT	2	6	522186	522191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212085
11278	NC_007516	TGC	2	6	522208	522213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212085
11279	NC_007516	TTC	2	6	522222	522227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212085
11280	NC_007516	ATG	2	6	522320	522325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212086
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11285	NC_007516	GTC	2	6	522515	522520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11286	NC_007516	GTG	2	6	522565	522570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11287	NC_007516	CGG	2	6	522590	522595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11288	NC_007516	GCT	2	6	522721	522726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11289	NC_007516	CTT	2	6	522763	522768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11290	NC_007516	GTA	2	6	522782	522787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11291	NC_007516	GGT	2	6	522806	522811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11292	NC_007516	GCA	2	6	522860	522865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11294	NC_007516	TTCA	2	8	523050	523057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11295	NC_007516	CTG	2	6	523079	523084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11296	NC_007516	GCC	2	6	523141	523146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11297	NC_007516	CTCG	2	8	523173	523180	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11298	NC_007516	GA	3	6	523246	523251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11299	NC_007516	GTC	2	6	523377	523382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11300	NC_007516	GGTTG	2	10	523400	523409	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11301	NC_007516	GCT	2	6	523440	523445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11303	NC_007516	CA	3	6	523500	523505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11304	NC_007516	T	6	6	523668	523673	0 %	100 %	0 %	0 %	78212087
11305	NC_007516	CCTGC	2	10	523744	523753	0 %	20 %	20 %	60 %	78212087
11306	NC_007516	TGT	2	6	523885	523890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11307	NC_007516	AGGA	2	8	523892	523899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11308	NC_007516	TTC	2	6	523995	524000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11309	NC_007516	CT	3	6	524059	524064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11310	NC_007516	GTCCA	2	10	524080	524089	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11311	NC_007516	ACT	2	6	524157	524162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11312	NC_007516	TATC	2	8	524235	524242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11313	NC_007516	TGT	2	6	524270	524275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11314	NC_007516	CAC	2	6	524287	524292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11315	NC_007516	GCT	2	6	524325	524330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11316	NC_007516	CCT	2	6	524516	524521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11317	NC_007516	GCT	2	6	524573	524578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11318	NC_007516	AGG	2	6	524588	524593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11319	NC_007516	TCG	2	6	524604	524609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11320	NC_007516	GCA	2	6	524610	524615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11321	NC_007516	GA	3	6	524616	524621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11322	NC_007516	TCAG	2	8	524639	524646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11323	NC_007516	AGA	2	6	524713	524718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11324	NC_007516	GGC	2	6	524723	524728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11325	NC_007516	GCA	2	6	524824	524829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11326	NC_007516	CTG	2	6	524861	524866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11327	NC_007516	CGAC	2	8	524909	524916	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11328	NC_007516	A	8	8	524929	524936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11329	NC_007516	TGA	2	6	525052	525057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11330	NC_007516	TTG	2	6	525115	525120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11331	NC_007516	GCAG	2	8	525152	525159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11332	NC_007516	GAT	2	6	525180	525185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11334	NC_007516	TGAC	2	8	525314	525321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11335	NC_007516	ACA	2	6	525415	525420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11336	NC_007516	TGGCT	2	10	525581	525590	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11337	NC_007516	GAT	2	6	525600	525605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11342	NC_007516	CTG	2	6	525840	525845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212088
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11344	NC_007516	TTGG	2	8	525876	525883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11345	NC_007516	G	6	6	525885	525890	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11346	NC_007516	GAT	2	6	525907	525912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11348	NC_007516	CAA	2	6	526160	526165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11349	NC_007516	ACT	2	6	526207	526212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11353	NC_007516	A	6	6	526336	526341	100 %	0 %	0 %	0 %	78212089
11354	NC_007516	CAGCCG	2	12	526374	526385	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78212089
11355	NC_007516	CAC	2	6	526416	526421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212089
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11357	NC_007516	ACG	2	6	526522	526527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212089
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11359	NC_007516	GGA	2	6	526562	526567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212089
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11361	NC_007516	CATC	2	8	526643	526650	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11362	NC_007516	A	6	6	526665	526670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11363	NC_007516	TTG	2	6	526754	526759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212090
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11366	NC_007516	GCCT	2	8	526863	526870	0 %	25 %	25 %	50 %	78212090
11367	NC_007516	CACT	2	8	526889	526896	25 %	25 %	0 %	50 %	78212090
11368	NC_007516	GTG	2	6	526943	526948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212090
11369	NC_007516	GAA	2	6	526959	526964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212090
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11371	NC_007516	ATC	2	6	527062	527067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212090
11372	NC_007516	AAC	2	6	527092	527097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11373	NC_007516	ATC	2	6	527106	527111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11374	NC_007516	GCA	2	6	527142	527147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11375	NC_007516	GTC	2	6	527247	527252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212091
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11388	NC_007516	GC	3	6	527842	527847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11389	NC_007516	CGAG	2	8	527952	527959	25 %	0 %	50 %	25 %	78212092
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11410	NC_007516	TCAG	2	8	529102	529109	25 %	25 %	25 %	25 %	78212094
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11499	NC_007516	GA	3	6	533620	533625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11500	NC_007516	TGT	2	6	533791	533796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212101

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