MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_007516	GAA	2	6	459944	459949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212020
10002	NC_007516	GTG	2	6	460029	460034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212020
10003	NC_007516	ATG	2	6	460053	460058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212020
10004	NC_007516	CGA	2	6	460060	460065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212020
10005	NC_007516	CGG	2	6	460069	460074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212020
10006	NC_007516	TGG	2	6	460080	460085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212020
10007	NC_007516	ACCGAA	2	12	460223	460234	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	78212020
10008	NC_007516	GGC	2	6	460352	460357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212020
10009	NC_007516	CAT	2	6	460361	460366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212020
10010	NC_007516	GCA	2	6	460392	460397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212020
10011	NC_007516	TCCA	2	8	460450	460457	25 %	25 %	0 %	50 %	78212020
10012	NC_007516	AG	3	6	460567	460572	50 %	0 %	50 %	0 %	78212020
10013	NC_007516	GGC	2	6	460630	460635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212020
10014	NC_007516	CTG	2	6	460808	460813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_007516	ATG	2	6	460839	460844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_007516	GTTG	2	8	460848	460855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_007516	CGA	2	6	461034	461039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212021
10018	NC_007516	GCAC	2	8	461062	461069	25 %	0 %	25 %	50 %	78212021
10019	NC_007516	GCC	2	6	461093	461098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212021
10020	NC_007516	TGG	2	6	461132	461137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212021
10021	NC_007516	CAGG	2	8	461208	461215	25 %	0 %	50 %	25 %	78212021
10022	NC_007516	CGC	2	6	461216	461221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212021
10023	NC_007516	CGG	2	6	461225	461230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212021
10024	NC_007516	GAG	2	6	461272	461277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212021
10025	NC_007516	GCT	2	6	461317	461322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212021
10026	NC_007516	CCG	2	6	461324	461329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212021
10027	NC_007516	CTC	2	6	461352	461357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10028	NC_007516	TCG	2	6	461425	461430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212022
10029	NC_007516	AAC	2	6	461493	461498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212022
10030	NC_007516	CAG	2	6	461533	461538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212023
10031	NC_007516	GTGC	2	8	461550	461557	0 %	25 %	50 %	25 %	78212023
10032	NC_007516	CAG	2	6	461587	461592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212023
10033	NC_007516	CCA	2	6	461604	461609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212023
10034	NC_007516	ACC	2	6	461651	461656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212023
10035	NC_007516	CGT	2	6	461895	461900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212023
10036	NC_007516	CAG	2	6	461971	461976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212023
10037	NC_007516	TGC	2	6	462193	462198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212023
10038	NC_007516	TTGCT	2	10	462227	462236	0 %	60 %	20 %	20 %	78212023
10039	NC_007516	GCA	2	6	462249	462254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212023
10040	NC_007516	GGT	2	6	462391	462396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_007516	GGC	2	6	462550	462555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212024
10042	NC_007516	GCC	2	6	462569	462574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212024
10043	NC_007516	GGT	2	6	462601	462606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212024
10044	NC_007516	CGA	2	6	462646	462651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212024
10045	NC_007516	GT	4	8	462653	462660	0 %	50 %	50 %	0 %	78212024
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10047	NC_007516	TC	3	6	462705	462710	0 %	50 %	0 %	50 %	78212024
10048	NC_007516	GGT	2	6	462730	462735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212024
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10050	NC_007516	GCT	2	6	462860	462865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_007516	GTG	4	12	462906	462917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_007516	ACGC	2	8	462947	462954	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10053	NC_007516	CCTG	2	8	463147	463154	0 %	25 %	25 %	50 %	78212025
10054	NC_007516	GTT	2	6	463160	463165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212025
10055	NC_007516	GATC	2	8	463210	463217	25 %	25 %	25 %	25 %	78212025
10056	NC_007516	GCT	2	6	463218	463223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212025
10057	NC_007516	GTG	2	6	463255	463260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212025
10058	NC_007516	GAA	2	6	463300	463305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78212025
10059	NC_007516	TGC	2	6	463368	463373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212025
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10067	NC_007516	CCG	2	6	463680	463685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212025
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10070	NC_007516	CTG	2	6	463880	463885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212025
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10072	NC_007516	CTG	2	6	463927	463932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212025
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10079	NC_007516	TGG	2	6	464209	464214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212026
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10082	NC_007516	CTG	2	6	464286	464291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212026
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10090	NC_007516	GGCT	2	8	464706	464713	0 %	25 %	50 %	25 %	78212026
10091	NC_007516	GCT	2	6	464756	464761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212026
10092	NC_007516	TGG	2	6	464776	464781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212026
10093	NC_007516	CTTCG	2	10	464814	464823	0 %	40 %	20 %	40 %	78212026
10094	NC_007516	GAAG	2	8	464871	464878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_007516	GCC	2	6	464902	464907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212027
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10098	NC_007516	TGCC	2	8	465155	465162	0 %	25 %	25 %	50 %	78212027
10099	NC_007516	GGC	2	6	465196	465201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212027
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10101	NC_007516	CG	3	6	465241	465246	0 %	0 %	50 %	50 %	78212027
10102	NC_007516	CCA	3	9	465272	465280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212027
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10105	NC_007516	GCCAG	2	10	465386	465395	20 %	0 %	40 %	40 %	78212027
10106	NC_007516	GAC	2	6	465415	465420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212027
10107	NC_007516	CAG	2	6	465458	465463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212027
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10109	NC_007516	CTGC	2	8	465500	465507	0 %	25 %	25 %	50 %	78212028
10110	NC_007516	GTT	2	6	465599	465604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212028
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10112	NC_007516	GCA	2	6	465637	465642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212028
10113	NC_007516	GCT	2	6	465708	465713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_007516	CTG	2	6	465843	465848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212029
10115	NC_007516	CAA	2	6	465920	465925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212029
10116	NC_007516	GAG	2	6	465953	465958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_007516	TGC	2	6	465992	465997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212030
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10120	NC_007516	GCG	2	6	466147	466152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212030
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10122	NC_007516	CGG	2	6	466338	466343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212031
10123	NC_007516	CGT	2	6	466528	466533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212031
10124	NC_007516	CAT	2	6	466559	466564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78212031
10125	NC_007516	CGG	2	6	466651	466656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212031
10126	NC_007516	GTG	2	6	466668	466673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212031
10127	NC_007516	CAC	2	6	466676	466681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212031
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10129	NC_007516	CAG	2	6	466769	466774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212031
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10132	NC_007516	GTC	2	6	467091	467096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212031
10133	NC_007516	AAT	2	6	467126	467131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_007516	CCTG	2	8	467236	467243	0 %	25 %	25 %	50 %	78212032
10135	NC_007516	GGT	2	6	467456	467461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212032
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10137	NC_007516	ACA	2	6	467489	467494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212032
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10140	NC_007516	CTG	2	6	467728	467733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212032
10141	NC_007516	GCT	2	6	467797	467802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10142	NC_007516	GCT	4	12	467807	467818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212033
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10154	NC_007516	GCC	2	6	468167	468172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212033
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10229	NC_007516	GCA	2	6	471544	471549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212036
10230	NC_007516	TC	3	6	471565	471570	0 %	50 %	0 %	50 %	78212036
10231	NC_007516	T	6	6	471636	471641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10232	NC_007516	TGG	2	6	471654	471659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10233	NC_007516	TCG	2	6	471680	471685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212037
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10237	NC_007516	CGTG	2	8	471769	471776	0 %	25 %	50 %	25 %	78212037
10238	NC_007516	A	6	6	471949	471954	100 %	0 %	0 %	0 %	78212037
10239	NC_007516	G	7	7	472051	472057	0 %	0 %	100 %	0 %	78212037
10240	NC_007516	GTC	2	6	472200	472205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212037
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10372	NC_007516	TTG	2	6	479799	479804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212039
10373	NC_007516	CATC	2	8	479834	479841	25 %	25 %	0 %	50 %	78212039
10374	NC_007516	TG	3	6	479896	479901	0 %	50 %	50 %	0 %	78212039
10375	NC_007516	CTG	2	6	479908	479913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212039
10376	NC_007516	TTCT	2	8	479916	479923	0 %	75 %	0 %	25 %	78212039
10377	NC_007516	AGC	2	6	479986	479991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212039
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10380	NC_007516	C	6	6	480097	480102	0 %	0 %	0 %	100 %	78212040
10381	NC_007516	TGAC	2	8	480188	480195	25 %	25 %	25 %	25 %	78212040
10382	NC_007516	GCA	2	6	480221	480226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212040
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10384	NC_007516	GT	3	6	480336	480341	0 %	50 %	50 %	0 %	78212040
10385	NC_007516	CCTG	2	8	480351	480358	0 %	25 %	25 %	50 %	78212040
10386	NC_007516	CAA	2	6	480367	480372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212040
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10388	NC_007516	CAA	2	6	480442	480447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212040
10389	NC_007516	GGCA	2	8	480458	480465	25 %	0 %	50 %	25 %	78212040
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10392	NC_007516	CCA	2	6	480540	480545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212040
10393	NC_007516	GTTTG	2	10	480609	480618	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10394	NC_007516	TCT	2	6	480644	480649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10395	NC_007516	C	6	6	480685	480690	0 %	0 %	0 %	100 %	78212041
10396	NC_007516	GCA	2	6	480777	480782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212041
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10398	NC_007516	G	6	6	480848	480853	0 %	0 %	100 %	0 %	78212041
10399	NC_007516	TGA	2	6	480876	480881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212041
10400	NC_007516	CCT	2	6	480882	480887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212041
10401	NC_007516	CCG	2	6	480923	480928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212041
10402	NC_007516	GGC	2	6	480960	480965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212041
10403	NC_007516	TTC	2	6	480972	480977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212041
10404	NC_007516	TGG	2	6	481055	481060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212041
10405	NC_007516	AGG	2	6	481131	481136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212041
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10408	NC_007516	TGC	2	6	481230	481235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212041
10409	NC_007516	TCTG	2	8	481236	481243	0 %	50 %	25 %	25 %	78212041
10410	NC_007516	TTG	2	6	481283	481288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212041
10411	NC_007516	TGG	2	6	481337	481342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212041
10412	NC_007516	CAA	2	6	481377	481382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78212041
10413	NC_007516	GCA	3	9	481451	481459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212041
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10417	NC_007516	TC	3	6	481727	481732	0 %	50 %	0 %	50 %	78212042
10418	NC_007516	GCC	2	6	481794	481799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212042
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10420	NC_007516	CTG	2	6	481928	481933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212042
10421	NC_007516	GCCC	2	8	481986	481993	0 %	0 %	25 %	75 %	78212042
10422	NC_007516	CCA	2	6	481997	482002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212042
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10424	NC_007516	CTG	2	6	482038	482043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212042
10425	NC_007516	CACC	2	8	482151	482158	25 %	0 %	0 %	75 %	78212042
10426	NC_007516	CTC	3	9	482196	482204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78212042
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10434	NC_007516	TTG	2	6	482553	482558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78212043
10435	NC_007516	ATGG	2	8	482773	482780	25 %	25 %	50 %	0 %	78212044
10436	NC_007516	TGA	2	6	482781	482786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78212044
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10438	NC_007516	GCT	2	6	482865	482870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212044
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10453	NC_007516	CAG	2	6	483541	483546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212044
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10459	NC_007516	AGC	2	6	483718	483723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212044
10460	NC_007516	TGGC	2	8	483800	483807	0 %	25 %	50 %	25 %	78212044
10461	NC_007516	TGG	2	6	483830	483835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212044
10462	NC_007516	CGC	2	6	483863	483868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212044
10463	NC_007516	GT	3	6	483918	483923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10464	NC_007516	GTG	2	6	483994	483999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212045
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10467	NC_007516	TGG	3	9	484097	484105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212045
10468	NC_007516	TGG	2	6	484118	484123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212045
10469	NC_007516	GGA	2	6	484131	484136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212045
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10471	NC_007516	GCCC	2	8	484197	484204	0 %	0 %	25 %	75 %	78212045
10472	NC_007516	CAG	2	6	484210	484215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212045
10473	NC_007516	AGC	2	6	484223	484228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212045
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10480	NC_007516	GTG	2	6	484616	484621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212045
10481	NC_007516	CGT	2	6	484645	484650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212045
10482	NC_007516	GCA	2	6	484693	484698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212045
10483	NC_007516	GCA	2	6	484734	484739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212045
10484	NC_007516	TGG	2	6	484778	484783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78212045
10485	NC_007516	GCCA	2	8	484848	484855	25 %	0 %	25 %	50 %	78212045
10486	NC_007516	GC	3	6	484884	484889	0 %	0 %	50 %	50 %	78212045
10487	NC_007516	CTGGG	2	10	484951	484960	0 %	20 %	60 %	20 %	78212045
10488	NC_007516	GCA	2	6	484982	484987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212045
10489	NC_007516	GGA	2	6	484995	485000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78212045
10490	NC_007516	CGC	2	6	485005	485010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212045
10491	NC_007516	GCA	3	9	485022	485030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212045
10492	NC_007516	GCG	2	6	485034	485039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78212045
10493	NC_007516	TGC	2	6	485084	485089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78212045
10494	NC_007516	GGTC	2	8	485106	485113	0 %	25 %	50 %	25 %	78212045
10495	NC_007516	ACG	2	6	485151	485156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212045
10496	NC_007516	ACG	2	6	485324	485329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78212045
10497	NC_007516	CGC	2	6	485397	485402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78212045
10498	NC_007516	TCT	2	6	485514	485519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78212046
10499	NC_007516	GCTTGG	2	12	485667	485678	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	78212046
10500	NC_007516	ACC	2	6	485702	485707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78212046

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