MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_007516	GCT	2	6	317247	317252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211864
7003	NC_007516	CGT	2	6	317293	317298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211864
7004	NC_007516	CGG	2	6	317322	317327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211864
7005	NC_007516	TGGA	2	8	317395	317402	25 %	25 %	50 %	0 %	78211864
7006	NC_007516	GTT	2	6	317457	317462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211864
7007	NC_007516	GCT	2	6	317478	317483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211864
7008	NC_007516	ATTGG	2	10	317586	317595	20 %	40 %	40 %	0 %	78211864
7009	NC_007516	GCG	2	6	317599	317604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211864
7010	NC_007516	AAG	2	6	317653	317658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211864
7011	NC_007516	GCC	2	6	317660	317665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211864
7012	NC_007516	GCC	2	6	317681	317686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211864
7013	NC_007516	AGC	2	6	317751	317756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211864
7014	NC_007516	TGA	2	6	317760	317765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211864
7015	NC_007516	CTC	2	6	317863	317868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211864
7016	NC_007516	CGTC	2	8	317905	317912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7017	NC_007516	T	6	6	317987	317992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_007516	C	6	6	317997	318002	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7019	NC_007516	AGC	2	6	318165	318170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211865
7020	NC_007516	GCA	2	6	318179	318184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211865
7021	NC_007516	TGA	2	6	318205	318210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211865
7022	NC_007516	TCG	2	6	318216	318221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211865
7023	NC_007516	TGC	2	6	318289	318294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211865
7024	NC_007516	GTGAGA	2	12	318309	318320	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	78211865
7025	NC_007516	TTCA	2	8	318329	318336	25 %	50 %	0 %	25 %	78211865
7026	NC_007516	GAA	2	6	318364	318369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211865
7027	NC_007516	TGA	2	6	318426	318431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211865
7028	NC_007516	ACCG	2	8	318436	318443	25 %	0 %	25 %	50 %	78211865
7029	NC_007516	GCC	2	6	318592	318597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211865
7030	NC_007516	CTG	2	6	318608	318613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211865
7031	NC_007516	GAA	2	6	318641	318646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211865
7032	NC_007516	ATTG	2	8	318649	318656	25 %	50 %	25 %	0 %	78211865
7033	NC_007516	CCG	2	6	318719	318724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211865
7034	NC_007516	TGC	2	6	318726	318731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211865
7035	NC_007516	CGA	2	6	318739	318744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211865
7036	NC_007516	CATC	2	8	318751	318758	25 %	25 %	0 %	50 %	78211865
7037	NC_007516	TGG	2	6	318801	318806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211865
7038	NC_007516	GCC	2	6	318812	318817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211865
7039	NC_007516	CAG	2	6	318832	318837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211865
7040	NC_007516	TGG	2	6	318867	318872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211865
7041	NC_007516	ATC	2	6	318977	318982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211865
7042	NC_007516	GC	3	6	319046	319051	0 %	0 %	50 %	50 %	78211865
7043	NC_007516	CTGTG	2	10	319056	319065	0 %	40 %	40 %	20 %	78211865
7044	NC_007516	GGC	2	6	319078	319083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211865
7045	NC_007516	TCGC	2	8	319092	319099	0 %	25 %	25 %	50 %	78211865
7046	NC_007516	ATC	3	9	319130	319138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211865
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7051	NC_007516	TGG	2	6	319254	319259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211865
7052	NC_007516	TCGG	2	8	319302	319309	0 %	25 %	50 %	25 %	78211865
7053	NC_007516	TGG	2	6	319324	319329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211865
7054	NC_007516	CGG	2	6	319404	319409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211865
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7057	NC_007516	CGG	2	6	319463	319468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211865
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7061	NC_007516	CAG	2	6	319625	319630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211865
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7063	NC_007516	CCCTG	2	10	319654	319663	0 %	20 %	20 %	60 %	78211865
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7065	NC_007516	CGT	2	6	319693	319698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211865
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7081	NC_007516	GTCG	2	8	320140	320147	0 %	25 %	50 %	25 %	78211866
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7089	NC_007516	CTC	2	6	320692	320697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211867
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7093	NC_007516	AGC	2	6	320825	320830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211867
7094	NC_007516	TGGC	2	8	320833	320840	0 %	25 %	50 %	25 %	78211867
7095	NC_007516	GTC	2	6	320920	320925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211867
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7101	NC_007516	G	8	8	321448	321455	0 %	0 %	100 %	0 %	78211868
7102	NC_007516	TGC	2	6	321516	321521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211868
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7104	NC_007516	GCAGT	2	10	321598	321607	20 %	20 %	40 %	20 %	78211868
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7107	NC_007516	TGC	2	6	321700	321705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211868
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7111	NC_007516	GTGGAT	2	12	321977	321988	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	78211868
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7122	NC_007516	CGG	2	6	322452	322457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211869
7123	NC_007516	C	6	6	322482	322487	0 %	0 %	0 %	100 %	78211869
7124	NC_007516	GCA	2	6	322501	322506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211869
7125	NC_007516	TGTT	2	8	322524	322531	0 %	75 %	25 %	0 %	78211869
7126	NC_007516	TG	3	6	322647	322652	0 %	50 %	50 %	0 %	78211869
7127	NC_007516	CTGGG	2	10	322664	322673	0 %	20 %	60 %	20 %	78211869
7128	NC_007516	CTGATG	2	12	322674	322685	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78211869
7129	NC_007516	CGG	2	6	322850	322855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211869
7130	NC_007516	GCT	2	6	322894	322899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211869
7131	NC_007516	CGT	2	6	322924	322929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211869
7132	NC_007516	CGA	2	6	322949	322954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211869
7133	NC_007516	GGT	2	6	322994	322999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211869
7134	NC_007516	CCA	2	6	323014	323019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211869
7135	NC_007516	GCC	2	6	323066	323071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211870
7136	NC_007516	AGA	2	6	323141	323146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211870
7137	NC_007516	ACG	2	6	323270	323275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211870
7138	NC_007516	TCC	2	6	323342	323347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211870
7139	NC_007516	AGC	2	6	323396	323401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211870
7140	NC_007516	AACGA	2	10	323420	323429	60 %	0 %	20 %	20 %	78211870
7141	NC_007516	TCT	2	6	323444	323449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211870
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7143	NC_007516	GCA	2	6	323476	323481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211870
7144	NC_007516	GCT	2	6	323604	323609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211870
7145	NC_007516	AAC	2	6	323615	323620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211870
7146	NC_007516	ACG	2	6	323621	323626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211870
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7148	NC_007516	TCA	2	6	323774	323779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211871
7149	NC_007516	GAT	2	6	323817	323822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211871
7150	NC_007516	T	6	6	323966	323971	0 %	100 %	0 %	0 %	78211871
7151	NC_007516	AAGA	2	8	323975	323982	75 %	0 %	25 %	0 %	78211871
7152	NC_007516	GCGGAT	2	12	324012	324023	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78211871
7153	NC_007516	CTG	2	6	324027	324032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211871
7154	NC_007516	GGTT	2	8	324151	324158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7155	NC_007516	GCC	2	6	324214	324219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211872
7156	NC_007516	TGT	2	6	324288	324293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211872
7157	NC_007516	GCGG	2	8	324384	324391	0 %	0 %	75 %	25 %	78211872
7158	NC_007516	GAA	2	6	324400	324405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211872
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7160	NC_007516	CTT	2	6	324423	324428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211872
7161	NC_007516	CTT	2	6	324430	324435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211872
7162	NC_007516	CTTC	2	8	324516	324523	0 %	50 %	0 %	50 %	78211872
7163	NC_007516	AGC	2	6	324536	324541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211872
7164	NC_007516	GCCA	2	8	324556	324563	25 %	0 %	25 %	50 %	78211872
7165	NC_007516	AGC	2	6	324575	324580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211872
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7177	NC_007516	TTC	2	6	325100	325105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211872
7178	NC_007516	GTCTCG	2	12	325151	325162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211872
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7180	NC_007516	GGT	2	6	325291	325296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211872
7181	NC_007516	GGA	2	6	325401	325406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7182	NC_007516	ATG	2	6	325441	325446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211873
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7221	NC_007516	GA	3	6	327526	327531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7222	NC_007516	GCCA	2	8	327540	327547	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7223	NC_007516	TGA	2	6	327561	327566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7224	NC_007516	TTG	2	6	327606	327611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211874
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7228	NC_007516	CCAG	2	8	327739	327746	25 %	0 %	25 %	50 %	78211874
7229	NC_007516	CAC	2	6	327805	327810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211874
7230	NC_007516	CGG	2	6	327816	327821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211874
7231	NC_007516	GC	3	6	327822	327827	0 %	0 %	50 %	50 %	78211874
7232	NC_007516	CCA	2	6	327832	327837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211874
7233	NC_007516	CCG	2	6	327885	327890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211874
7234	NC_007516	CTT	2	6	327944	327949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211874
7235	NC_007516	TGC	2	6	327954	327959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211874
7236	NC_007516	CAC	2	6	327968	327973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211874
7237	NC_007516	CAT	2	6	327974	327979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211874
7238	NC_007516	GGC	2	6	327988	327993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211874
7239	NC_007516	GAA	2	6	328012	328017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211874
7240	NC_007516	GCG	2	6	328032	328037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211874
7241	NC_007516	GCG	2	6	328040	328045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211874
7242	NC_007516	GATGGG	2	12	328067	328078	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7243	NC_007516	GAA	2	6	328079	328084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7244	NC_007516	GAT	2	6	328174	328179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211875
7245	NC_007516	CCG	2	6	328214	328219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211875
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7373	NC_007516	TC	3	6	334402	334407	0 %	50 %	0 %	50 %	78211878
7374	NC_007516	CGA	2	6	334462	334467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211878
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7435	NC_007516	GTCCC	2	10	336926	336935	0 %	20 %	20 %	60 %	78211881
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7474	NC_007516	GGCT	2	8	338588	338595	0 %	25 %	50 %	25 %	78211882
7475	NC_007516	GCTT	2	8	338607	338614	0 %	50 %	25 %	25 %	78211882
7476	NC_007516	CAG	2	6	338662	338667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211882
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7489	NC_007516	CCAG	2	8	339235	339242	25 %	0 %	25 %	50 %	78211882
7490	NC_007516	TG	3	6	339261	339266	0 %	50 %	50 %	0 %	78211882
7491	NC_007516	CAC	2	6	339458	339463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211882
7492	NC_007516	GCT	2	6	339491	339496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211882
7493	NC_007516	GTC	2	6	339506	339511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211882
7494	NC_007516	GTC	2	6	339533	339538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211882
7495	NC_007516	AGA	2	6	339539	339544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211882
7496	NC_007516	GATC	2	8	339565	339572	25 %	25 %	25 %	25 %	78211882
7497	NC_007516	AGGG	2	8	339579	339586	25 %	0 %	75 %	0 %	78211882
7498	NC_007516	GGA	2	6	339630	339635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211882
7499	NC_007516	GCA	2	6	339684	339689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211882
7500	NC_007516	GAA	2	6	339707	339712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211882

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