MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_007516	GGCGA	2	10	294903	294912	20 %	0 %	60 %	20 %	78211840
6502	NC_007516	TGA	2	6	294976	294981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_007516	TGCCGT	2	12	295011	295022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211841
6504	NC_007516	GTA	2	6	295039	295044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211841
6505	NC_007516	GCC	2	6	295045	295050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211841
6506	NC_007516	GAA	2	6	295060	295065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211841
6507	NC_007516	CAGG	2	8	295066	295073	25 %	0 %	50 %	25 %	78211841
6508	NC_007516	TGT	2	6	295209	295214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211842
6509	NC_007516	CCT	2	6	295222	295227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211842
6510	NC_007516	CGC	2	6	295296	295301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211842
6511	NC_007516	CAC	2	6	295407	295412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211842
6512	NC_007516	CCA	2	6	295424	295429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211842
6513	NC_007516	GTT	2	6	295452	295457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211842
6514	NC_007516	GCT	2	6	295574	295579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211842
6515	NC_007516	TCA	2	6	295600	295605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211842
6516	NC_007516	C	6	6	295630	295635	0 %	0 %	0 %	100 %	78211842
6517	NC_007516	CAG	2	6	295647	295652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211842
6518	NC_007516	AGC	3	9	295666	295674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211842
6519	NC_007516	CAC	2	6	295683	295688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211842
6520	NC_007516	GATCA	2	10	295722	295731	40 %	20 %	20 %	20 %	78211842
6521	NC_007516	CCA	2	6	295772	295777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211842
6522	NC_007516	TGC	2	6	295796	295801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211842
6523	NC_007516	GAAG	2	8	295808	295815	50 %	0 %	50 %	0 %	78211842
6524	NC_007516	GCC	2	6	295948	295953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211843
6525	NC_007516	TTTCG	2	10	295974	295983	0 %	60 %	20 %	20 %	78211843
6526	NC_007516	T	6	6	295996	296001	0 %	100 %	0 %	0 %	78211843
6527	NC_007516	TGG	2	6	296033	296038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211843
6528	NC_007516	GAC	2	6	296062	296067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211843
6529	NC_007516	CCG	3	9	296139	296147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211843
6530	NC_007516	CCA	2	6	296214	296219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211843
6531	NC_007516	CGT	2	6	296229	296234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211843
6532	NC_007516	GT	3	6	296261	296266	0 %	50 %	50 %	0 %	78211843
6533	NC_007516	TGC	2	6	296267	296272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211843
6534	NC_007516	CTG	2	6	296323	296328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211843
6535	NC_007516	CGT	2	6	296332	296337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211843
6536	NC_007516	TGA	2	6	296355	296360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211843
6537	NC_007516	GCCA	2	8	296419	296426	25 %	0 %	25 %	50 %	78211843
6538	NC_007516	ACA	2	6	296437	296442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211843
6539	NC_007516	TC	3	6	296456	296461	0 %	50 %	0 %	50 %	78211843
6540	NC_007516	CAG	2	6	296511	296516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211843
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6542	NC_007516	GTC	2	6	296577	296582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211843
6543	NC_007516	TGGC	2	8	296588	296595	0 %	25 %	50 %	25 %	78211844
6544	NC_007516	CGG	2	6	296644	296649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211844
6545	NC_007516	TTCG	2	8	296671	296678	0 %	50 %	25 %	25 %	78211844
6546	NC_007516	TGG	2	6	296725	296730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211844
6547	NC_007516	GCA	2	6	296764	296769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211844
6548	NC_007516	TC	3	6	296792	296797	0 %	50 %	0 %	50 %	78211844
6549	NC_007516	CAG	2	6	296825	296830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211844
6550	NC_007516	GC	3	6	296865	296870	0 %	0 %	50 %	50 %	78211844
6551	NC_007516	TGG	2	6	296899	296904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211844
6552	NC_007516	GCA	2	6	296930	296935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211844
6553	NC_007516	GCA	2	6	296951	296956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211844
6554	NC_007516	GTG	2	6	296973	296978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211844
6555	NC_007516	CTG	2	6	297021	297026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211844
6556	NC_007516	GATTGT	2	12	297095	297106	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	78211844
6557	NC_007516	TCC	2	6	297188	297193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211844
6558	NC_007516	GAT	2	6	297207	297212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211844
6559	NC_007516	CAG	2	6	297363	297368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211844
6560	NC_007516	TTG	2	6	297369	297374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211844
6561	NC_007516	ACC	2	6	297391	297396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211844
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6563	NC_007516	GCTC	2	8	297493	297500	0 %	25 %	25 %	50 %	78211844
6564	NC_007516	TGG	2	6	297523	297528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211844
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6567	NC_007516	GGC	2	6	297686	297691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211845
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6569	NC_007516	AGCA	2	8	297812	297819	50 %	0 %	25 %	25 %	78211845
6570	NC_007516	AGC	2	6	297894	297899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211845
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6572	NC_007516	CGAAAT	2	12	297973	297984	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	78211845
6573	NC_007516	GATGG	2	10	298231	298240	20 %	20 %	60 %	0 %	78211845
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6578	NC_007516	TCTGC	2	10	298600	298609	0 %	40 %	20 %	40 %	78211845
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6581	NC_007516	TC	3	6	298848	298853	0 %	50 %	0 %	50 %	78211845
6582	NC_007516	GCC	3	9	299000	299008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211845
6583	NC_007516	TGCC	2	8	299077	299084	0 %	25 %	25 %	50 %	78211845
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6586	NC_007516	CGC	2	6	299403	299408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211846
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6588	NC_007516	ACA	2	6	299572	299577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_007516	A	7	7	299625	299631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_007516	GCA	2	6	299668	299673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_007516	GAG	2	6	299757	299762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211847
6592	NC_007516	CAG	2	6	299766	299771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211847
6593	NC_007516	CAA	2	6	299932	299937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_007516	CT	3	6	299938	299943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6595	NC_007516	TGG	2	6	299953	299958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_007516	GCG	2	6	299966	299971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_007516	GAC	2	6	300085	300090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_007516	GTC	2	6	300226	300231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6601	NC_007516	GAG	2	6	300311	300316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211848
6602	NC_007516	GAC	2	6	300317	300322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211848
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6607	NC_007516	GCGG	2	8	300463	300470	0 %	0 %	75 %	25 %	78211849
6608	NC_007516	TGG	2	6	300478	300483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211849
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6619	NC_007516	GACC	2	8	301066	301073	25 %	0 %	25 %	50 %	78211849
6620	NC_007516	GCA	2	6	301111	301116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211849
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6991	NC_007516	AGG	2	6	316694	316699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211864
6992	NC_007516	GCGCG	2	10	316713	316722	0 %	0 %	60 %	40 %	78211864
6993	NC_007516	GGA	2	6	316758	316763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211864
6994	NC_007516	CGC	2	6	316866	316871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211864
6995	NC_007516	GAGATG	2	12	316918	316929	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	78211864
6996	NC_007516	GGA	2	6	316962	316967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211864
6997	NC_007516	CTGG	2	8	317031	317038	0 %	25 %	50 %	25 %	78211864
6998	NC_007516	CGA	2	6	317040	317045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211864
6999	NC_007516	GCA	2	6	317099	317104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211864
7000	NC_007516	GTG	2	6	317140	317145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211864

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