MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53502	NC_007516	CAG	2	6	2464301	2464306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214156
53503	NC_007516	CCA	2	6	2464317	2464322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214156
53504	NC_007516	GCT	2	6	2464393	2464398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214156
53505	NC_007516	CCA	2	6	2464553	2464558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214156
53506	NC_007516	GCA	2	6	2464582	2464587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214156
53507	NC_007516	CAA	2	6	2464661	2464666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214156
53508	NC_007516	AAC	2	6	2464796	2464801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214156
53509	NC_007516	GCC	2	6	2464802	2464807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214156
53510	NC_007516	CAC	2	6	2464820	2464825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214156
53511	NC_007516	TTG	2	6	2464914	2464919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53512	NC_007516	CGT	2	6	2464949	2464954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53513	NC_007516	ACG	2	6	2465028	2465033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53514	NC_007516	GAC	2	6	2465039	2465044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53515	NC_007516	CGAC	2	8	2465083	2465090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53516	NC_007516	ACCGC	2	10	2465097	2465106	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
53517	NC_007516	TGC	2	6	2465134	2465139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53518	NC_007516	GAT	2	6	2465158	2465163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53519	NC_007516	CCGGA	2	10	2465164	2465173	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53520	NC_007516	CAG	2	6	2465249	2465254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53521	NC_007516	GA	3	6	2465361	2465366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53522	NC_007516	GATT	2	8	2465414	2465421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53523	NC_007516	CAA	2	6	2465515	2465520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214157
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53525	NC_007516	CGA	2	6	2465605	2465610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214157
53526	NC_007516	TTG	2	6	2465742	2465747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78214157
53527	NC_007516	GA	3	6	2465757	2465762	50 %	0 %	50 %	0 %	78214157
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53530	NC_007516	GAAG	2	8	2465848	2465855	50 %	0 %	50 %	0 %	78214157
53531	NC_007516	AC	3	6	2465958	2465963	50 %	0 %	0 %	50 %	78214157
53532	NC_007516	TCACC	2	10	2465977	2465986	20 %	20 %	0 %	60 %	78214157
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53535	NC_007516	TTTA	2	8	2466288	2466295	25 %	75 %	0 %	0 %	78214157
53536	NC_007516	A	6	6	2466323	2466328	100 %	0 %	0 %	0 %	78214157
53537	NC_007516	GAA	2	6	2466536	2466541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214157
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53539	NC_007516	ATAC	2	8	2466666	2466673	50 %	25 %	0 %	25 %	78214157
53540	NC_007516	AGG	2	6	2466883	2466888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214157
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53542	NC_007516	CGA	2	6	2467140	2467145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53543	NC_007516	CT	3	6	2467156	2467161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53544	NC_007516	CTGA	2	8	2467185	2467192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53545	NC_007516	ACA	2	6	2467223	2467228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53553	NC_007516	TTG	2	6	2467684	2467689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78214158
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53562	NC_007516	GTGG	2	8	2468013	2468020	0 %	25 %	75 %	0 %	78214158
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53570	NC_007516	CTG	2	6	2468563	2468568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214159
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53589	NC_007516	GCC	2	6	2469392	2469397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53590	NC_007516	ACGCAG	2	12	2469444	2469455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53591	NC_007516	TAA	2	6	2469459	2469464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53592	NC_007516	CGAGG	2	10	2469498	2469507	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
53593	NC_007516	CAGG	2	8	2469518	2469525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53594	NC_007516	AGAT	2	8	2469549	2469556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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53599	NC_007516	CA	3	6	2469775	2469780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53600	NC_007516	TC	3	6	2469811	2469816	0 %	50 %	0 %	50 %	78214161
53601	NC_007516	AGC	2	6	2469834	2469839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214161
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53603	NC_007516	GGC	2	6	2469895	2469900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214161
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53615	NC_007516	AAGC	2	8	2470478	2470485	50 %	0 %	25 %	25 %	78214161
53616	NC_007516	GGAG	2	8	2470519	2470526	25 %	0 %	75 %	0 %	78214161
53617	NC_007516	AGCGG	2	10	2470582	2470591	20 %	0 %	60 %	20 %	78214161
53618	NC_007516	ACG	2	6	2470623	2470628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214161
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53735	NC_007516	ACCA	2	8	2475934	2475941	50 %	0 %	0 %	50 %	78214165
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53855	NC_007516	CGA	2	6	2480586	2480591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214169
53856	NC_007516	GTG	2	6	2480605	2480610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214169
53857	NC_007516	CTCCC	2	10	2480611	2480620	0 %	20 %	0 %	80 %	78214169
53858	NC_007516	CGG	2	6	2480631	2480636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214169
53859	NC_007516	CT	3	6	2480665	2480670	0 %	50 %	0 %	50 %	78214169
53860	NC_007516	CAT	2	6	2480700	2480705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214169
53861	NC_007516	TGG	2	6	2480762	2480767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214169
53862	NC_007516	CAT	2	6	2480772	2480777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214169
53863	NC_007516	CCG	2	6	2480816	2480821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214169
53864	NC_007516	GGC	2	6	2480830	2480835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214169
53865	NC_007516	GCTG	2	8	2480858	2480865	0 %	25 %	50 %	25 %	78214169
53866	NC_007516	GCC	2	6	2480899	2480904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214169
53867	NC_007516	GGT	3	9	2480905	2480913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214169
53868	NC_007516	GCC	2	6	2480923	2480928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214169
53869	NC_007516	GAG	2	6	2480968	2480973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214169
53870	NC_007516	GTG	2	6	2480995	2481000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214169
53871	NC_007516	CTG	2	6	2481004	2481009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214169
53872	NC_007516	ATC	2	6	2481013	2481018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214169
53873	NC_007516	ACC	2	6	2481019	2481024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214169
53874	NC_007516	GCG	2	6	2481080	2481085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214169
53875	NC_007516	C	6	6	2481128	2481133	0 %	0 %	0 %	100 %	78214169
53876	NC_007516	CTG	2	6	2481157	2481162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214169
53877	NC_007516	GTG	2	6	2481181	2481186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214169
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53879	NC_007516	CCTG	2	8	2481318	2481325	0 %	25 %	25 %	50 %	78214169
53880	NC_007516	CCTTGC	2	12	2481387	2481398	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	78214169
53881	NC_007516	CTT	2	6	2481414	2481419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78214169
53882	NC_007516	GGC	2	6	2481432	2481437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214169
53883	NC_007516	G	6	6	2481454	2481459	0 %	0 %	100 %	0 %	78214169
53884	NC_007516	TGGCC	2	10	2481495	2481504	0 %	20 %	40 %	40 %	78214169
53885	NC_007516	CAC	2	6	2481543	2481548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214169
53886	NC_007516	TCG	2	6	2481575	2481580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214169
53887	NC_007516	CTG	2	6	2481640	2481645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214169
53888	NC_007516	TGG	2	6	2481662	2481667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214169
53889	NC_007516	CGC	2	6	2481797	2481802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214169
53890	NC_007516	GCT	2	6	2481851	2481856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53891	NC_007516	GCGAT	2	10	2482015	2482024	20 %	20 %	40 %	20 %	78214170
53892	NC_007516	TGGA	2	8	2482069	2482076	25 %	25 %	50 %	0 %	78214170
53893	NC_007516	TGC	2	6	2482081	2482086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214170
53894	NC_007516	CGG	3	9	2482157	2482165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214170
53895	NC_007516	T	6	6	2482203	2482208	0 %	100 %	0 %	0 %	78214170
53896	NC_007516	TGC	2	6	2482216	2482221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214170
53897	NC_007516	CTG	3	9	2482236	2482244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214170
53898	NC_007516	GAGCG	2	10	2482288	2482297	20 %	0 %	60 %	20 %	78214170
53899	NC_007516	CGAT	2	8	2482390	2482397	25 %	25 %	25 %	25 %	78214170
53900	NC_007516	GGT	2	6	2482460	2482465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214170
53901	NC_007516	GCC	2	6	2482476	2482481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214170
53902	NC_007516	TGG	2	6	2482498	2482503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214170
53903	NC_007516	GC	3	6	2482509	2482514	0 %	0 %	50 %	50 %	78214170
53904	NC_007516	TCTG	2	8	2482537	2482544	0 %	50 %	25 %	25 %	78214170
53905	NC_007516	CGT	2	6	2482576	2482581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214170
53906	NC_007516	CCA	2	6	2482624	2482629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214170
53907	NC_007516	CTG	2	6	2482641	2482646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214170
53908	NC_007516	CGTCAG	2	12	2482724	2482735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78214170
53909	NC_007516	GCC	2	6	2482746	2482751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214170
53910	NC_007516	CGCT	2	8	2482797	2482804	0 %	25 %	25 %	50 %	78214170
53911	NC_007516	CCATCG	2	12	2482807	2482818	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78214170
53912	NC_007516	GTG	2	6	2482845	2482850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214170
53913	NC_007516	CAC	2	6	2482862	2482867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214170
53914	NC_007516	CCAT	2	8	2482873	2482880	25 %	25 %	0 %	50 %	78214170
53915	NC_007516	GGC	2	6	2482883	2482888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214170
53916	NC_007516	TGCCA	2	10	2482890	2482899	20 %	20 %	20 %	40 %	78214170
53917	NC_007516	GGC	2	6	2482905	2482910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214170
53918	NC_007516	TGG	2	6	2482936	2482941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214170
53919	NC_007516	GAC	2	6	2482962	2482967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214170
53920	NC_007516	CGG	2	6	2482978	2482983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214170
53921	NC_007516	G	6	6	2483258	2483263	0 %	0 %	100 %	0 %	78214170
53922	NC_007516	GAA	2	6	2483267	2483272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214170
53923	NC_007516	GCC	2	6	2483327	2483332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214170
53924	NC_007516	CCG	2	6	2483334	2483339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214170
53925	NC_007516	TGC	2	6	2483425	2483430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214170
53926	NC_007516	CCT	2	6	2483472	2483477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214170
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53928	NC_007516	GCAT	2	8	2483555	2483562	25 %	25 %	25 %	25 %	78214171
53929	NC_007516	CCA	2	6	2483565	2483570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214171
53930	NC_007516	CCA	2	6	2483587	2483592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214171
53931	NC_007516	CGC	2	6	2483627	2483632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214171
53932	NC_007516	CCA	2	6	2483637	2483642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214171
53933	NC_007516	CAA	2	6	2483647	2483652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214171
53934	NC_007516	CAAC	2	8	2483667	2483674	50 %	0 %	0 %	50 %	78214171
53935	NC_007516	GGC	2	6	2483776	2483781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214171
53936	NC_007516	C	6	6	2483784	2483789	0 %	0 %	0 %	100 %	78214171
53937	NC_007516	CCAG	2	8	2483793	2483800	25 %	0 %	25 %	50 %	78214171
53938	NC_007516	CAAC	2	8	2483811	2483818	50 %	0 %	0 %	50 %	78214171
53939	NC_007516	GT	3	6	2483849	2483854	0 %	50 %	50 %	0 %	78214171
53940	NC_007516	CAC	2	6	2483956	2483961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214171
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53942	NC_007516	GGCGA	2	10	2483972	2483981	20 %	0 %	60 %	20 %	78214171
53943	NC_007516	AGC	2	6	2483987	2483992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214171
53944	NC_007516	AGC	2	6	2484118	2484123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214171
53945	NC_007516	CGC	2	6	2484128	2484133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214171
53946	NC_007516	ACCA	2	8	2484135	2484142	50 %	0 %	0 %	50 %	78214171
53947	NC_007516	GCA	2	6	2484150	2484155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214171
53948	NC_007516	GCC	2	6	2484158	2484163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214171
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53950	NC_007516	ACC	2	6	2484247	2484252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214171
53951	NC_007516	CGA	2	6	2484258	2484263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214171
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53954	NC_007516	AGC	2	6	2484335	2484340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214171
53955	NC_007516	CCA	2	6	2484357	2484362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214171
53956	NC_007516	GCT	2	6	2484384	2484389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214171
53957	NC_007516	AAC	2	6	2484431	2484436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214171
53958	NC_007516	CCCAG	2	10	2484454	2484463	20 %	0 %	20 %	60 %	78214171
53959	NC_007516	CACC	2	8	2484492	2484499	25 %	0 %	0 %	75 %	78214171
53960	NC_007516	GAGCA	2	10	2484610	2484619	40 %	0 %	40 %	20 %	78214171
53961	NC_007516	CAAGG	2	10	2484747	2484756	40 %	0 %	40 %	20 %	78214172
53962	NC_007516	TCC	2	6	2484787	2484792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214172
53963	NC_007516	GGT	2	6	2484819	2484824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214172
53964	NC_007516	GCAG	2	8	2484937	2484944	25 %	0 %	50 %	25 %	78214172
53965	NC_007516	GCA	2	6	2485058	2485063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214172
53966	NC_007516	CCG	2	6	2485065	2485070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214172
53967	NC_007516	ACG	2	6	2485127	2485132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214172
53968	NC_007516	CA	3	6	2485133	2485138	50 %	0 %	0 %	50 %	78214172
53969	NC_007516	GCAG	2	8	2485223	2485230	25 %	0 %	50 %	25 %	78214172
53970	NC_007516	TGCT	2	8	2485237	2485244	0 %	50 %	25 %	25 %	78214172
53971	NC_007516	CCCA	2	8	2485296	2485303	25 %	0 %	0 %	75 %	78214172
53972	NC_007516	GTG	2	6	2485413	2485418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214172
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