MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_007516	TCACC	2	10	2418302	2418311	20 %	20 %	0 %	60 %	78214106
52502	NC_007516	G	6	6	2418378	2418383	0 %	0 %	100 %	0 %	78214106
52503	NC_007516	CCA	2	6	2418439	2418444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214106
52504	NC_007516	CTG	2	6	2418468	2418473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214106
52505	NC_007516	CGA	2	6	2418709	2418714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214107
52506	NC_007516	CTG	2	6	2418821	2418826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214107
52507	NC_007516	CAC	2	6	2418837	2418842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214107
52508	NC_007516	GCA	2	6	2418939	2418944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214107
52509	NC_007516	CAC	2	6	2418980	2418985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214107
52510	NC_007516	CGC	2	6	2419058	2419063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214107
52511	NC_007516	GCTCT	2	10	2419157	2419166	0 %	40 %	20 %	40 %	78214107
52512	NC_007516	TGC	2	6	2419187	2419192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214107
52513	NC_007516	CGG	2	6	2419197	2419202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214107
52514	NC_007516	CTG	2	6	2419208	2419213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214107
52515	NC_007516	CAG	2	6	2419249	2419254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214107
52516	NC_007516	GGC	2	6	2419321	2419326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214107
52517	NC_007516	CGA	2	6	2419339	2419344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214107
52518	NC_007516	GGC	2	6	2419408	2419413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214107
52519	NC_007516	ACT	2	6	2419444	2419449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214107
52520	NC_007516	AAGC	2	8	2419462	2419469	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52521	NC_007516	GAA	2	6	2419484	2419489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214108
52522	NC_007516	CATGGG	2	12	2419514	2419525	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78214108
52523	NC_007516	G	6	6	2419523	2419528	0 %	0 %	100 %	0 %	78214108
52524	NC_007516	GCC	2	6	2419531	2419536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214108
52525	NC_007516	CAA	2	6	2419601	2419606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214108
52526	NC_007516	ACCTGC	2	12	2419666	2419677	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78214108
52527	NC_007516	GCCTT	2	10	2419711	2419720	0 %	40 %	20 %	40 %	78214108
52528	NC_007516	CAG	2	6	2419737	2419742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214108
52529	NC_007516	CAC	2	6	2419764	2419769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214108
52530	NC_007516	CCG	2	6	2419817	2419822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214108
52531	NC_007516	GGC	2	6	2419825	2419830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214108
52532	NC_007516	CAA	2	6	2419890	2419895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214108
52533	NC_007516	CAC	2	6	2420232	2420237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214108
52534	NC_007516	CCA	2	6	2420238	2420243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214108
52535	NC_007516	AACC	2	8	2420273	2420280	50 %	0 %	0 %	50 %	78214109
52536	NC_007516	CAC	2	6	2420368	2420373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214109
52537	NC_007516	GC	3	6	2420399	2420404	0 %	0 %	50 %	50 %	78214109
52538	NC_007516	TGACG	2	10	2420405	2420414	20 %	20 %	40 %	20 %	78214109
52539	NC_007516	CCA	2	6	2420425	2420430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214109
52540	NC_007516	C	7	7	2420437	2420443	0 %	0 %	0 %	100 %	78214109
52541	NC_007516	CGC	2	6	2420547	2420552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214109
52542	NC_007516	GCA	2	6	2420560	2420565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214109
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52544	NC_007516	GCC	2	6	2420685	2420690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214109
52545	NC_007516	C	6	6	2420789	2420794	0 %	0 %	0 %	100 %	78214109
52546	NC_007516	CCA	2	6	2420810	2420815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214109
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52551	NC_007516	CAG	2	6	2421065	2421070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214109
52552	NC_007516	GGC	2	6	2421075	2421080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214109
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52555	NC_007516	GA	3	6	2421129	2421134	50 %	0 %	50 %	0 %	78214109
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52562	NC_007516	CAG	2	6	2421477	2421482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214109
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52577	NC_007516	TTC	2	6	2421996	2422001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52590	NC_007516	TGTT	2	8	2422635	2422642	0 %	75 %	25 %	0 %	78214110
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52618	NC_007516	TGC	2	6	2423947	2423952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214111
52619	NC_007516	CAA	2	6	2423998	2424003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214111
52620	NC_007516	GAC	2	6	2424077	2424082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214112
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52622	NC_007516	CGG	2	6	2424162	2424167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214112
52623	NC_007516	CGC	2	6	2424219	2424224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214112
52624	NC_007516	GAAC	2	8	2424266	2424273	50 %	0 %	25 %	25 %	78214112
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52629	NC_007516	A	9	9	2424615	2424623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52630	NC_007516	T	7	7	2424625	2424631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52631	NC_007516	AAG	2	6	2424698	2424703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214113
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52672	NC_007516	TCG	2	6	2426779	2426784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214115
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52720	NC_007516	CGA	2	6	2429455	2429460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214118
52721	NC_007516	GGAC	2	8	2429496	2429503	25 %	0 %	50 %	25 %	78214118
52722	NC_007516	GTT	2	6	2429529	2429534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78214118
52723	NC_007516	CTGACG	2	12	2429625	2429636	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78214118
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52725	NC_007516	AG	3	6	2429689	2429694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52726	NC_007516	TCA	2	6	2429728	2429733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214119
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52730	NC_007516	TACCTC	2	12	2429960	2429971	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	78214119
52731	NC_007516	CAA	2	6	2430089	2430094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214119
52732	NC_007516	TCA	3	9	2430148	2430156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214119
52733	NC_007516	GCAAA	2	10	2430204	2430213	60 %	0 %	20 %	20 %	78214119
52734	NC_007516	GTG	2	6	2430298	2430303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214119
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52854	NC_007516	G	6	6	2435422	2435427	0 %	0 %	100 %	0 %	78214125
52855	NC_007516	GCT	2	6	2435446	2435451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214125
52856	NC_007516	GACG	2	8	2435471	2435478	25 %	0 %	50 %	25 %	78214125
52857	NC_007516	TGC	2	6	2435493	2435498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214125
52858	NC_007516	CCG	2	6	2435502	2435507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214125
52859	NC_007516	TGG	2	6	2435514	2435519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214125
52860	NC_007516	GCG	2	6	2435520	2435525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214125
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52862	NC_007516	GCC	2	6	2435619	2435624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214125
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52864	NC_007516	GCT	2	6	2435661	2435666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214125
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52868	NC_007516	CGG	2	6	2435914	2435919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214125
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52870	NC_007516	GGAG	2	8	2436025	2436032	25 %	0 %	75 %	0 %	78214125
52871	NC_007516	GCG	2	6	2436072	2436077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214125
52872	NC_007516	GCGAAC	2	12	2436157	2436168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214125
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52874	NC_007516	GAA	2	6	2436282	2436287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214125
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52883	NC_007516	CAC	2	6	2436986	2436991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214128
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52885	NC_007516	TGG	2	6	2437176	2437181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214128
52886	NC_007516	GTG	2	6	2437275	2437280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214128
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52892	NC_007516	ACCGG	2	10	2437419	2437428	20 %	0 %	40 %	40 %	78214128
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52909	NC_007516	ATC	2	6	2438010	2438015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214128
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52929	NC_007516	AGC	2	6	2439074	2439079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214129
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52931	NC_007516	CTG	2	6	2439134	2439139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214129
52932	NC_007516	TTC	2	6	2439142	2439147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78214129
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52934	NC_007516	CTT	2	6	2439352	2439357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78214129
52935	NC_007516	GCTT	2	8	2439574	2439581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52936	NC_007516	ACC	2	6	2439598	2439603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214130
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52940	NC_007516	CAA	2	6	2439705	2439710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214130
52941	NC_007516	ACG	2	6	2439837	2439842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52942	NC_007516	TGA	2	6	2439992	2439997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214131
52943	NC_007516	GGCC	2	8	2440019	2440026	0 %	0 %	50 %	50 %	78214131
52944	NC_007516	CCA	2	6	2440149	2440154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214132
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52946	NC_007516	CCG	2	6	2440314	2440319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214132
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52951	NC_007516	CAT	2	6	2440452	2440457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214132
52952	NC_007516	CCA	2	6	2440458	2440463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214132
52953	NC_007516	ACAG	2	8	2440478	2440485	50 %	0 %	25 %	25 %	78214132
52954	NC_007516	TGA	2	6	2440493	2440498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214132
52955	NC_007516	TGCCC	2	10	2440502	2440511	0 %	20 %	20 %	60 %	78214132
52956	NC_007516	GATC	2	8	2440557	2440564	25 %	25 %	25 %	25 %	78214132
52957	NC_007516	ATC	2	6	2440594	2440599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214132
52958	NC_007516	AAG	2	6	2440603	2440608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214132
52959	NC_007516	CG	3	6	2440714	2440719	0 %	0 %	50 %	50 %	78214132
52960	NC_007516	GGCCAC	2	12	2440759	2440770	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78214132
52961	NC_007516	GCA	2	6	2440838	2440843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214133
52962	NC_007516	CAG	2	6	2440851	2440856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214133
52963	NC_007516	GCCC	2	8	2440866	2440873	0 %	0 %	25 %	75 %	78214133
52964	NC_007516	GCC	2	6	2440917	2440922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214133
52965	NC_007516	CGG	2	6	2440957	2440962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214133
52966	NC_007516	CCT	2	6	2440967	2440972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214133
52967	NC_007516	TGGC	2	8	2440981	2440988	0 %	25 %	50 %	25 %	78214133
52968	NC_007516	CAC	2	6	2441052	2441057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214133
52969	NC_007516	CAG	2	6	2441063	2441068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214133
52970	NC_007516	CTG	2	6	2441139	2441144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214133
52971	NC_007516	CTC	2	6	2441151	2441156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214133
52972	NC_007516	AG	3	6	2441206	2441211	50 %	0 %	50 %	0 %	78214133
52973	NC_007516	GGC	2	6	2441232	2441237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214133
52974	NC_007516	GCC	2	6	2441329	2441334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214133
52975	NC_007516	GTG	2	6	2441365	2441370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214133
52976	NC_007516	TGGCC	2	10	2441381	2441390	0 %	20 %	40 %	40 %	78214133
52977	NC_007516	ACA	2	6	2441422	2441427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214133
52978	NC_007516	CGC	2	6	2441450	2441455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214133
52979	NC_007516	GCT	2	6	2441456	2441461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214133
52980	NC_007516	GGA	2	6	2441538	2441543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214133
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52982	NC_007516	GC	3	6	2441559	2441564	0 %	0 %	50 %	50 %	78214133
52983	NC_007516	TGG	2	6	2441594	2441599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214133
52984	NC_007516	CCA	2	6	2441648	2441653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214133
52985	NC_007516	CTC	2	6	2441661	2441666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214133
52986	NC_007516	TGCCG	2	10	2441690	2441699	0 %	20 %	40 %	40 %	78214133
52987	NC_007516	CAGGG	2	10	2441814	2441823	20 %	0 %	60 %	20 %	78214133
52988	NC_007516	GCT	2	6	2441894	2441899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214133
52989	NC_007516	TCC	2	6	2441935	2441940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214133
52990	NC_007516	CGC	2	6	2442036	2442041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214133
52991	NC_007516	TAGC	2	8	2442164	2442171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52992	NC_007516	CGG	2	6	2442242	2442247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214134
52993	NC_007516	GCA	2	6	2442285	2442290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214134
52994	NC_007516	TGAT	2	8	2442308	2442315	25 %	50 %	25 %	0 %	78214134
52995	NC_007516	CATC	2	8	2442321	2442328	25 %	25 %	0 %	50 %	78214134
52996	NC_007516	GGT	2	6	2442346	2442351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214134
52997	NC_007516	CAA	2	6	2442400	2442405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214134
52998	NC_007516	ATCG	2	8	2442415	2442422	25 %	25 %	25 %	25 %	78214134
52999	NC_007516	TCA	2	6	2442425	2442430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214134
53000	NC_007516	GTC	2	6	2442439	2442444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214134

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