MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_007516	CGC	2	6	2351617	2351622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214037
51002	NC_007516	AGC	2	6	2351675	2351680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214037
51003	NC_007516	CCG	2	6	2351712	2351717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214037
51004	NC_007516	AGC	2	6	2351748	2351753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214037
51005	NC_007516	AAGGCA	2	12	2351793	2351804	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	78214037
51006	NC_007516	CAGGC	2	10	2351808	2351817	20 %	0 %	40 %	40 %	78214037
51007	NC_007516	GAT	2	6	2351860	2351865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214037
51008	NC_007516	CGC	2	6	2351902	2351907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214037
51009	NC_007516	CGA	2	6	2351932	2351937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214037
51010	NC_007516	GCG	2	6	2351955	2351960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214037
51011	NC_007516	GGC	2	6	2352004	2352009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214037
51012	NC_007516	TCAA	2	8	2352028	2352035	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51013	NC_007516	GCA	2	6	2352125	2352130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214038
51014	NC_007516	GATC	2	8	2352154	2352161	25 %	25 %	25 %	25 %	78214038
51015	NC_007516	CGC	2	6	2352189	2352194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214038
51016	NC_007516	GCA	2	6	2352203	2352208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214038
51017	NC_007516	TGG	2	6	2352225	2352230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214038
51018	NC_007516	GC	3	6	2352273	2352278	0 %	0 %	50 %	50 %	78214038
51019	NC_007516	CCG	2	6	2352299	2352304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214038
51020	NC_007516	CGA	3	9	2352340	2352348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214038
51021	NC_007516	ACGG	2	8	2352366	2352373	25 %	0 %	50 %	25 %	78214038
51022	NC_007516	CGG	3	9	2352397	2352405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214038
51023	NC_007516	ACT	2	6	2352415	2352420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214038
51024	NC_007516	CACC	2	8	2352442	2352449	25 %	0 %	0 %	75 %	78214038
51025	NC_007516	GCT	2	6	2352475	2352480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214038
51026	NC_007516	AGCC	2	8	2352495	2352502	25 %	0 %	25 %	50 %	78214038
51027	NC_007516	GAC	2	6	2352506	2352511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214038
51028	NC_007516	CCA	2	6	2352591	2352596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214039
51029	NC_007516	CAGC	2	8	2352653	2352660	25 %	0 %	25 %	50 %	78214039
51030	NC_007516	CAGCTT	2	12	2352683	2352694	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78214039
51031	NC_007516	ACG	2	6	2352748	2352753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214039
51032	NC_007516	TGC	2	6	2352761	2352766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214039
51033	NC_007516	ATC	2	6	2352807	2352812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214039
51034	NC_007516	TGG	2	6	2352820	2352825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214039
51035	NC_007516	TGC	2	6	2352868	2352873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214039
51036	NC_007516	GCT	2	6	2352953	2352958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214039
51037	NC_007516	GCCT	2	8	2352995	2353002	0 %	25 %	25 %	50 %	78214039
51038	NC_007516	CAG	2	6	2353005	2353010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214039
51039	NC_007516	GGCGA	2	10	2353065	2353074	20 %	0 %	60 %	20 %	78214039
51040	NC_007516	CGT	2	6	2353086	2353091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214039
51041	NC_007516	CAG	2	6	2353125	2353130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214039
51042	NC_007516	TTGCCC	2	12	2353131	2353142	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	78214039
51043	NC_007516	C	6	6	2353140	2353145	0 %	0 %	0 %	100 %	78214039
51044	NC_007516	TGAT	2	8	2353174	2353181	25 %	50 %	25 %	0 %	78214039
51045	NC_007516	GCG	2	6	2353226	2353231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214039
51046	NC_007516	TGGGC	2	10	2353238	2353247	0 %	20 %	60 %	20 %	78214039
51047	NC_007516	TGC	2	6	2353306	2353311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214039
51048	NC_007516	A	6	6	2353339	2353344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51049	NC_007516	AGG	2	6	2353437	2353442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214040
51050	NC_007516	TCGGT	2	10	2353445	2353454	0 %	40 %	40 %	20 %	78214040
51051	NC_007516	CTTT	2	8	2353462	2353469	0 %	75 %	0 %	25 %	78214040
51052	NC_007516	GCTG	2	8	2353491	2353498	0 %	25 %	50 %	25 %	78214040
51053	NC_007516	TGC	2	6	2353527	2353532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214040
51054	NC_007516	CTG	2	6	2353574	2353579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214040
51055	NC_007516	GAA	2	6	2353598	2353603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214040
51056	NC_007516	CGG	2	6	2353639	2353644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214041
51057	NC_007516	GGC	2	6	2353710	2353715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214041
51058	NC_007516	GCT	2	6	2353843	2353848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214041
51059	NC_007516	TTG	3	9	2353862	2353870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78214041
51060	NC_007516	CTG	2	6	2354116	2354121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51061	NC_007516	CTC	2	6	2354122	2354127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214042
51062	NC_007516	GGC	2	6	2354137	2354142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214042
51063	NC_007516	CTG	2	6	2354143	2354148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51064	NC_007516	GTT	2	6	2354218	2354223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78214042
51065	NC_007516	CCA	2	6	2354274	2354279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214042
51066	NC_007516	GCTTTC	2	12	2354311	2354322	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	78214042
51067	NC_007516	CCA	2	6	2354331	2354336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214042
51068	NC_007516	GCGG	2	8	2354439	2354446	0 %	0 %	75 %	25 %	78214042
51069	NC_007516	TGC	2	6	2354481	2354486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51070	NC_007516	ACA	2	6	2354541	2354546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214042
51071	NC_007516	CAT	2	6	2354584	2354589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214042
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51074	NC_007516	GTGG	2	8	2354926	2354933	0 %	25 %	75 %	0 %	78214042
51075	NC_007516	GCC	2	6	2354954	2354959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214042
51076	NC_007516	GCC	2	6	2354978	2354983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214042
51077	NC_007516	CGC	2	6	2354986	2354991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214042
51078	NC_007516	CTG	2	6	2354998	2355003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51079	NC_007516	TCA	2	6	2355020	2355025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214042
51080	NC_007516	CCA	2	6	2355036	2355041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214042
51081	NC_007516	GGCC	2	8	2355048	2355055	0 %	0 %	50 %	50 %	78214042
51082	NC_007516	TGG	2	6	2355090	2355095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214042
51083	NC_007516	CAGA	2	8	2355100	2355107	50 %	0 %	25 %	25 %	78214042
51084	NC_007516	GTG	2	6	2355133	2355138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214042
51085	NC_007516	CAG	2	6	2355154	2355159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51086	NC_007516	GCA	2	6	2355206	2355211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51087	NC_007516	CAGC	2	8	2355225	2355232	25 %	0 %	25 %	50 %	78214042
51088	NC_007516	TCG	2	6	2355245	2355250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51089	NC_007516	GCG	3	9	2355338	2355346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214042
51090	NC_007516	ATC	2	6	2355377	2355382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214042
51091	NC_007516	GCA	2	6	2355429	2355434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51092	NC_007516	GCTG	2	8	2355483	2355490	0 %	25 %	50 %	25 %	78214042
51093	NC_007516	G	6	6	2355536	2355541	0 %	0 %	100 %	0 %	78214042
51094	NC_007516	CAG	2	6	2355562	2355567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214042
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51096	NC_007516	GCA	2	6	2355657	2355662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51097	NC_007516	AC	3	6	2355714	2355719	50 %	0 %	0 %	50 %	78214042
51098	NC_007516	ACGGTG	2	12	2355725	2355736	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78214042
51099	NC_007516	GCTG	2	8	2355792	2355799	0 %	25 %	50 %	25 %	78214042
51100	NC_007516	CAA	2	6	2355807	2355812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214042
51101	NC_007516	AGG	2	6	2355864	2355869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214042
51102	NC_007516	CAG	2	6	2355880	2355885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51103	NC_007516	TGG	2	6	2355909	2355914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214042
51104	NC_007516	TGC	2	6	2355932	2355937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51105	NC_007516	GAC	2	6	2356002	2356007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51106	NC_007516	GAA	2	6	2356042	2356047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214042
51107	NC_007516	GGC	2	6	2356048	2356053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214042
51108	NC_007516	ACC	2	6	2356060	2356065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214042
51109	NC_007516	CGG	2	6	2356185	2356190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214042
51110	NC_007516	CGG	2	6	2356209	2356214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214042
51111	NC_007516	CATC	2	8	2356229	2356236	25 %	25 %	0 %	50 %	78214042
51112	NC_007516	GCA	2	6	2356251	2356256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51113	NC_007516	ATCG	2	8	2356276	2356283	25 %	25 %	25 %	25 %	78214042
51114	NC_007516	GCA	2	6	2356341	2356346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51115	NC_007516	GCA	2	6	2356362	2356367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51116	NC_007516	CCA	2	6	2356377	2356382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214042
51117	NC_007516	CGG	3	9	2356440	2356448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214042
51118	NC_007516	TCA	2	6	2356454	2356459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214042
51119	NC_007516	AGC	2	6	2356460	2356465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51120	NC_007516	GAC	2	6	2356533	2356538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214042
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51122	NC_007516	TAA	2	6	2356634	2356639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78214042
51123	NC_007516	GCT	2	6	2356692	2356697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214042
51124	NC_007516	CGG	2	6	2356741	2356746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214042
51125	NC_007516	CGG	2	6	2356764	2356769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214042
51126	NC_007516	CCG	2	6	2356897	2356902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51127	NC_007516	TGA	2	6	2356931	2356936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51128	NC_007516	CAGC	2	8	2356937	2356944	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51129	NC_007516	TCA	2	6	2356990	2356995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214043
51130	NC_007516	CGG	2	6	2357008	2357013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214043
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51132	NC_007516	CAG	2	6	2357033	2357038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214043
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51218	NC_007516	ATC	2	6	2361002	2361007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214047
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51220	NC_007516	AGC	2	6	2361120	2361125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214047
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51222	NC_007516	GCA	2	6	2361190	2361195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214047
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51224	NC_007516	GCT	2	6	2361208	2361213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214047
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51226	NC_007516	GCTC	2	8	2361291	2361298	0 %	25 %	25 %	50 %	78214047
51227	NC_007516	GGC	2	6	2361303	2361308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214047
51228	NC_007516	TGA	2	6	2361342	2361347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214047
51229	NC_007516	CT	3	6	2361462	2361467	0 %	50 %	0 %	50 %	78214047
51230	NC_007516	G	6	6	2361480	2361485	0 %	0 %	100 %	0 %	78214047
51231	NC_007516	GCAC	2	8	2361491	2361498	25 %	0 %	25 %	50 %	78214047
51232	NC_007516	CAA	2	6	2361499	2361504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214047
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51234	NC_007516	TGA	2	6	2361567	2361572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214047
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51236	NC_007516	TAC	2	6	2361587	2361592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214047
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51349	NC_007516	CTC	2	6	2366459	2366464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214053
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51351	NC_007516	CAC	2	6	2366531	2366536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51352	NC_007516	CAA	2	6	2366640	2366645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214054
51353	NC_007516	GGCA	2	8	2366650	2366657	25 %	0 %	50 %	25 %	78214054
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51367	NC_007516	GTCA	2	8	2367158	2367165	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51368	NC_007516	GCA	2	6	2367221	2367226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214055
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51460	NC_007516	ACACC	2	10	2370831	2370840	40 %	0 %	0 %	60 %	78214059
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51470	NC_007516	CAG	2	6	2371314	2371319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214060
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51472	NC_007516	CCGGG	2	10	2371383	2371392	0 %	0 %	60 %	40 %	78214060
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51475	NC_007516	CAA	2	6	2371467	2371472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214060
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51477	NC_007516	GGAAT	2	10	2371487	2371496	40 %	20 %	40 %	0 %	78214060
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51499	NC_007516	CACAT	2	10	2372186	2372195	40 %	20 %	0 %	40 %	78214061
51500	NC_007516	GCT	2	6	2372238	2372243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214061

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