MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_007516	TGG	2	6	2306372	2306377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214008
50003	NC_007516	AGA	2	6	2306391	2306396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214008
50004	NC_007516	CTG	2	6	2306444	2306449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214008
50005	NC_007516	CTC	2	6	2306558	2306563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214008
50006	NC_007516	CTT	2	6	2306566	2306571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78214008
50007	NC_007516	GCC	2	6	2306600	2306605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214008
50008	NC_007516	TCC	2	6	2306670	2306675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214008
50009	NC_007516	TTG	2	6	2306829	2306834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78214008
50010	NC_007516	GCG	2	6	2306953	2306958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214008
50011	NC_007516	GGC	2	6	2307023	2307028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214008
50012	NC_007516	AGG	2	6	2307045	2307050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214008
50013	NC_007516	AGG	2	6	2307130	2307135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214008
50014	NC_007516	GGC	2	6	2307149	2307154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214008
50015	NC_007516	CG	3	6	2307175	2307180	0 %	0 %	50 %	50 %	78214008
50016	NC_007516	CCA	2	6	2307222	2307227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214008
50017	NC_007516	GAT	2	6	2307418	2307423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214008
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50019	NC_007516	AAC	2	6	2307485	2307490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214009
50020	NC_007516	TGG	2	6	2307644	2307649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214009
50021	NC_007516	TG	3	6	2307703	2307708	0 %	50 %	50 %	0 %	78214009
50022	NC_007516	AAC	2	6	2307785	2307790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214009
50023	NC_007516	TCA	2	6	2307791	2307796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214009
50024	NC_007516	ATCCGA	2	12	2307829	2307840	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78214009
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50026	NC_007516	CG	3	6	2307858	2307863	0 %	0 %	50 %	50 %	78214009
50027	NC_007516	CAG	2	6	2307930	2307935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214009
50028	NC_007516	TGG	2	6	2307938	2307943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214009
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50031	NC_007516	TG	3	6	2308063	2308068	0 %	50 %	50 %	0 %	78214009
50032	NC_007516	TGC	2	6	2308097	2308102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214009
50033	NC_007516	CAC	2	6	2308110	2308115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214009
50034	NC_007516	CTG	2	6	2308175	2308180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214009
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50036	NC_007516	CGA	2	6	2308282	2308287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214009
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50038	NC_007516	GATC	2	8	2308353	2308360	25 %	25 %	25 %	25 %	78214009
50039	NC_007516	CT	3	6	2308389	2308394	0 %	50 %	0 %	50 %	78214009
50040	NC_007516	AG	3	6	2308397	2308402	50 %	0 %	50 %	0 %	78214009
50041	NC_007516	CCA	2	6	2308409	2308414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214009
50042	NC_007516	GTG	2	6	2308433	2308438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214009
50043	NC_007516	CAC	2	6	2308461	2308466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78214009
50044	NC_007516	GAA	2	6	2308498	2308503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214009
50045	NC_007516	TGC	2	6	2308607	2308612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214010
50046	NC_007516	CAT	2	6	2308622	2308627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214010
50047	NC_007516	GCA	2	6	2308631	2308636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214010
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50049	NC_007516	CGC	2	6	2308728	2308733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214010
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50051	NC_007516	GCC	2	6	2308790	2308795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78214010
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50053	NC_007516	CGG	2	6	2308967	2308972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78214010
50054	NC_007516	TGC	2	6	2308999	2309004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214010
50055	NC_007516	CTG	2	6	2309058	2309063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214010
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50060	NC_007516	CAGC	2	8	2309300	2309307	25 %	0 %	25 %	50 %	78214010
50061	NC_007516	GGA	2	6	2309367	2309372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214010
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50077	NC_007516	GCT	2	6	2310167	2310172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214010
50078	NC_007516	CTG	2	6	2310315	2310320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214010
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50082	NC_007516	CA	3	6	2310551	2310556	50 %	0 %	0 %	50 %	78214010
50083	NC_007516	CAA	2	6	2310633	2310638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214010
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50085	NC_007516	TTA	2	6	2310655	2310660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78214010
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50087	NC_007516	GCA	3	9	2310767	2310775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50088	NC_007516	CT	3	6	2310836	2310841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50089	NC_007516	AC	3	6	2310842	2310847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50090	NC_007516	CCA	2	6	2310859	2310864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50091	NC_007516	TGA	2	6	2310867	2310872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50102	NC_007516	TCA	2	6	2311256	2311261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78214011
50103	NC_007516	AGCAA	2	10	2311313	2311322	60 %	0 %	20 %	20 %	78214011
50104	NC_007516	AAG	2	6	2311338	2311343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78214011
50105	NC_007516	TCAC	2	8	2311419	2311426	25 %	25 %	0 %	50 %	78214011
50106	NC_007516	AGC	2	6	2311468	2311473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214011
50107	NC_007516	TTA	2	6	2311531	2311536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78214011
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50109	NC_007516	GCA	2	6	2311613	2311618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214011
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50114	NC_007516	CT	3	6	2311879	2311884	0 %	50 %	0 %	50 %	78214012
50115	NC_007516	TTATC	2	10	2311926	2311935	20 %	60 %	0 %	20 %	78214012
50116	NC_007516	ACA	2	6	2312047	2312052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78214012
50117	NC_007516	TCAAA	2	10	2312159	2312168	60 %	20 %	0 %	20 %	78214012
50118	NC_007516	A	6	6	2312166	2312171	100 %	0 %	0 %	0 %	78214012
50119	NC_007516	CAAG	2	8	2312261	2312268	50 %	0 %	25 %	25 %	78214012
50120	NC_007516	AGGT	2	8	2312273	2312280	25 %	25 %	50 %	0 %	78214012
50121	NC_007516	ACG	2	6	2312356	2312361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214012
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50235	NC_007516	CTG	2	6	2317424	2317429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214017
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50237	NC_007516	GGCA	2	8	2317460	2317467	25 %	0 %	50 %	25 %	78214017
50238	NC_007516	CAAGC	2	10	2317515	2317524	40 %	0 %	20 %	40 %	78214017
50239	NC_007516	CTC	2	6	2317574	2317579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78214017
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50241	NC_007516	CAG	2	6	2317643	2317648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214017
50242	NC_007516	TCG	2	6	2317677	2317682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78214017
50243	NC_007516	CAG	3	9	2317760	2317768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214017
50244	NC_007516	GCA	2	6	2317774	2317779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214017
50245	NC_007516	GCA	2	6	2317803	2317808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214017
50246	NC_007516	TCCC	2	8	2317825	2317832	0 %	25 %	0 %	75 %	78214017
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50250	NC_007516	GCG	2	6	2317922	2317927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50251	NC_007516	TCCACC	2	12	2317932	2317943	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50252	NC_007516	AGC	2	6	2318003	2318008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50254	NC_007516	GC	4	8	2318190	2318197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50255	NC_007516	CAC	2	6	2318291	2318296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50256	NC_007516	CGA	2	6	2318300	2318305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50258	NC_007516	CAA	2	6	2318420	2318425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50260	NC_007516	CAAAA	2	10	2318444	2318453	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50261	NC_007516	GCAGA	2	10	2318480	2318489	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50262	NC_007516	GCA	2	6	2318600	2318605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78214018
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50273	NC_007516	TGG	2	6	2319226	2319231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78214019
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50349	NC_007516	CCAG	2	8	2323194	2323201	25 %	0 %	25 %	50 %	78214021
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50353	NC_007516	TAG	2	6	2323241	2323246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78214021
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50356	NC_007516	GGA	2	6	2323375	2323380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78214021
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