MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_007513	CAA	2	6	2196861	2196866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185856
44003	NC_007513	AAG	2	6	2196965	2196970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185856
44004	NC_007513	GGC	2	6	2196979	2196984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185856
44005	NC_007513	CCA	2	6	2197085	2197090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185857
44006	NC_007513	CCA	2	6	2197092	2197097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185857
44007	NC_007513	CAAG	2	8	2197109	2197116	50 %	0 %	25 %	25 %	78185857
44008	NC_007513	TGGC	2	8	2197129	2197136	0 %	25 %	50 %	25 %	78185857
44009	NC_007513	GTG	2	6	2197141	2197146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185857
44010	NC_007513	CG	3	6	2197168	2197173	0 %	0 %	50 %	50 %	78185857
44011	NC_007513	GC	3	6	2197215	2197220	0 %	0 %	50 %	50 %	78185857
44012	NC_007513	ACA	2	6	2197238	2197243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185857
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44014	NC_007513	GCC	2	6	2197354	2197359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185857
44015	NC_007513	CTG	2	6	2197371	2197376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185857
44016	NC_007513	AGC	2	6	2197387	2197392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185857
44017	NC_007513	AATCG	2	10	2197407	2197416	40 %	20 %	20 %	20 %	78185857
44018	NC_007513	AG	3	6	2197433	2197438	50 %	0 %	50 %	0 %	78185857
44019	NC_007513	TCC	2	6	2197499	2197504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185858
44020	NC_007513	CTG	2	6	2197543	2197548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185858
44021	NC_007513	GCT	2	6	2197563	2197568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185858
44022	NC_007513	CACTC	2	10	2197692	2197701	20 %	20 %	0 %	60 %	78185858
44023	NC_007513	CGA	2	6	2197729	2197734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185858
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44025	NC_007513	CGT	2	6	2197764	2197769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185858
44026	NC_007513	TGGACT	2	12	2197770	2197781	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78185858
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44031	NC_007513	TCG	2	6	2198151	2198156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185858
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44033	NC_007513	T	6	6	2198206	2198211	0 %	100 %	0 %	0 %	78185858
44034	NC_007513	TTC	2	6	2198215	2198220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185858
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44036	NC_007513	GTC	2	6	2198332	2198337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185858
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44041	NC_007513	CTT	2	6	2198644	2198649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185858
44042	NC_007513	CGC	2	6	2198673	2198678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185858
44043	NC_007513	CTC	2	6	2198683	2198688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185858
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44045	NC_007513	CGAT	2	8	2198883	2198890	25 %	25 %	25 %	25 %	78185859
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44051	NC_007513	TCAA	2	8	2199162	2199169	50 %	25 %	0 %	25 %	78185859
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44092	NC_007513	TC	3	6	2201685	2201690	0 %	50 %	0 %	50 %	78185860
44093	NC_007513	CAACC	2	10	2201717	2201726	40 %	0 %	0 %	60 %	78185860
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44100	NC_007513	A	6	6	2201958	2201963	100 %	0 %	0 %	0 %	78185860
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44107	NC_007513	TGG	2	6	2202173	2202178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185861
44108	NC_007513	CAA	2	6	2202214	2202219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185861
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44113	NC_007513	GGAC	2	8	2202498	2202505	25 %	0 %	50 %	25 %	78185861
44114	NC_007513	ATC	2	6	2202547	2202552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185861
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44118	NC_007513	AC	3	6	2202782	2202787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44119	NC_007513	TTCA	2	8	2202821	2202828	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44120	NC_007513	GTC	2	6	2202892	2202897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185862
44121	NC_007513	ATC	2	6	2202994	2202999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185862
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44130	NC_007513	GTT	2	6	2203597	2203602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185862
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44236	NC_007513	GATT	2	8	2208724	2208731	25 %	50 %	25 %	0 %	78185865
44237	NC_007513	AAAC	2	8	2208755	2208762	75 %	0 %	0 %	25 %	78185865
44238	NC_007513	AGC	2	6	2208808	2208813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185865
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44244	NC_007513	CGCT	2	8	2209130	2209137	0 %	25 %	25 %	50 %	78185865
44245	NC_007513	GTC	2	6	2209178	2209183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185865
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44249	NC_007513	GC	3	6	2209220	2209225	0 %	0 %	50 %	50 %	78185865
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44256	NC_007513	TGAC	3	12	2209792	2209803	25 %	25 %	25 %	25 %	78185865
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44265	NC_007513	GGGC	2	8	2210131	2210138	0 %	0 %	75 %	25 %	78185866
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44273	NC_007513	CA	3	6	2210484	2210489	50 %	0 %	0 %	50 %	78185866
44274	NC_007513	CAC	2	6	2210508	2210513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185866
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44283	NC_007513	GCCC	2	8	2210784	2210791	0 %	0 %	25 %	75 %	78185866
44284	NC_007513	C	8	8	2210822	2210829	0 %	0 %	0 %	100 %	78185866
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44290	NC_007513	CAC	2	6	2211008	2211013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185866
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44293	NC_007513	TGAC	2	8	2211152	2211159	25 %	25 %	25 %	25 %	78185867
44294	NC_007513	GTC	2	6	2211167	2211172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185867
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44298	NC_007513	AGGA	2	8	2211290	2211297	50 %	0 %	50 %	0 %	78185867
44299	NC_007513	AAC	2	6	2211370	2211375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185867
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44303	NC_007513	ATC	2	6	2211616	2211621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185867
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44307	NC_007513	TCAC	2	8	2211815	2211822	25 %	25 %	0 %	50 %	78185867
44308	NC_007513	ATC	2	6	2211845	2211850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185867
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44311	NC_007513	ATT	2	6	2211935	2211940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44334	NC_007513	A	6	6	2213489	2213494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44335	NC_007513	ATT	2	6	2213538	2213543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78185870
44336	NC_007513	CGT	2	6	2213571	2213576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185870
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44340	NC_007513	GCG	2	6	2213618	2213623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185870
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44342	NC_007513	TTG	2	6	2213662	2213667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185870
44343	NC_007513	CTG	2	6	2213698	2213703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185870
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44347	NC_007513	TTC	2	6	2213867	2213872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185870
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44350	NC_007513	CTT	2	6	2214211	2214216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185870
44351	NC_007513	GTG	2	6	2214227	2214232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185870
44352	NC_007513	ATC	2	6	2214242	2214247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185870
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44354	NC_007513	GAA	2	6	2214306	2214311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185870
44355	NC_007513	C	6	6	2214338	2214343	0 %	0 %	0 %	100 %	78185870
44356	NC_007513	GCA	2	6	2214350	2214355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185870
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44403	NC_007513	CTG	2	6	2216516	2216521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44454	NC_007513	CGT	2	6	2219046	2219051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185876
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44459	NC_007513	ACGG	2	8	2219357	2219364	25 %	0 %	50 %	25 %	78185877
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44471	NC_007513	CTG	2	6	2219775	2219780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185878
44472	NC_007513	AGC	2	6	2219783	2219788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185878
44473	NC_007513	GGT	2	6	2219789	2219794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185878
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44475	NC_007513	GGC	2	6	2219910	2219915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185878
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44487	NC_007513	G	6	6	2220524	2220529	0 %	0 %	100 %	0 %	78185878
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44491	NC_007513	GGC	2	6	2220654	2220659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185878
44492	NC_007513	CCG	2	6	2220786	2220791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185879
44493	NC_007513	GAA	2	6	2220827	2220832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185879
44494	NC_007513	CAGC	2	8	2220834	2220841	25 %	0 %	25 %	50 %	78185879
44495	NC_007513	GCAA	2	8	2220888	2220895	50 %	0 %	25 %	25 %	78185879
44496	NC_007513	GAA	2	6	2220950	2220955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185879
44497	NC_007513	ACTC	2	8	2220970	2220977	25 %	25 %	0 %	50 %	78185879
44498	NC_007513	GCT	2	6	2221029	2221034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185880
44499	NC_007513	CAA	2	6	2221178	2221183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44500	NC_007513	GGA	2	6	2221185	2221190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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