MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43505	NC_007513	CAG	2	6	2171667	2171672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185829
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43508	NC_007513	GCA	2	6	2171821	2171826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185830
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43514	NC_007513	GCA	2	6	2172020	2172025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185830
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43538	NC_007513	GAGAA	2	10	2173018	2173027	60 %	0 %	40 %	0 %	78185830
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43543	NC_007513	ACAG	2	8	2173359	2173366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43544	NC_007513	TGA	2	6	2173376	2173381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43739	NC_007513	TGC	2	6	2183150	2183155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185839
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43760	NC_007513	CGAG	2	8	2184642	2184649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43761	NC_007513	T	6	6	2184685	2184690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43762	NC_007513	ACA	2	6	2184738	2184743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43774	NC_007513	ACACC	2	10	2185425	2185434	40 %	0 %	0 %	60 %	78185842
43775	NC_007513	GCA	2	6	2185481	2185486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185842
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43780	NC_007513	TGC	2	6	2185719	2185724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185842
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43787	NC_007513	ACT	2	6	2186178	2186183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185843
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43789	NC_007513	TGT	2	6	2186413	2186418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185844
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43793	NC_007513	CTC	2	6	2186765	2186770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185844
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43814	NC_007513	GTC	2	6	2187522	2187527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43815	NC_007513	CAC	2	6	2187528	2187533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43816	NC_007513	GCAT	2	8	2187580	2187587	25 %	25 %	25 %	25 %	78185845
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43818	NC_007513	GC	3	6	2187627	2187632	0 %	0 %	50 %	50 %	78185845
43819	NC_007513	CAC	2	6	2187671	2187676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185845
43820	NC_007513	GTCTG	2	10	2188054	2188063	0 %	40 %	40 %	20 %	78185845
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43822	NC_007513	GACA	2	8	2188132	2188139	50 %	0 %	25 %	25 %	78185845
43823	NC_007513	CAA	2	6	2188155	2188160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185845
43824	NC_007513	GAT	2	6	2188182	2188187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185845
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43828	NC_007513	TGA	2	6	2188325	2188330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185845
43829	NC_007513	GTC	2	6	2188351	2188356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185845
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43834	NC_007513	CG	3	6	2188613	2188618	0 %	0 %	50 %	50 %	78185846
43835	NC_007513	GTG	2	6	2188628	2188633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185846
43836	NC_007513	TGC	2	6	2188689	2188694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185846
43837	NC_007513	ATC	2	6	2188841	2188846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185846
43838	NC_007513	ACC	2	6	2188860	2188865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185846
43839	NC_007513	GAA	2	6	2188877	2188882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185847
43840	NC_007513	CTGAT	2	10	2188911	2188920	20 %	40 %	20 %	20 %	78185847
43841	NC_007513	CA	3	6	2188944	2188949	50 %	0 %	0 %	50 %	78185847
43842	NC_007513	GCT	2	6	2188993	2188998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185847
43843	NC_007513	CTC	2	6	2189031	2189036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185847
43844	NC_007513	AAC	2	6	2189065	2189070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185847
43845	NC_007513	TGC	2	6	2189128	2189133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43846	NC_007513	GAT	2	6	2189191	2189196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185848
43847	NC_007513	TGC	2	6	2189210	2189215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185848
43848	NC_007513	AGC	2	6	2189216	2189221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185848
43849	NC_007513	CGG	2	6	2189231	2189236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185848
43850	NC_007513	CAT	2	6	2189280	2189285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185848
43851	NC_007513	TGG	2	6	2189343	2189348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185848
43852	NC_007513	CGAT	2	8	2189408	2189415	25 %	25 %	25 %	25 %	78185848
43853	NC_007513	GT	3	6	2189435	2189440	0 %	50 %	50 %	0 %	78185848
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