MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_007513	AGC	3	9	2146402	2146410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185804
43002	NC_007513	CAA	2	6	2146434	2146439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185804
43003	NC_007513	TGG	2	6	2146447	2146452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185804
43004	NC_007513	GCG	2	6	2146465	2146470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185804
43005	NC_007513	CCA	2	6	2146474	2146479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185804
43006	NC_007513	AATT	2	8	2146495	2146502	50 %	50 %	0 %	0 %	78185804
43007	NC_007513	ACG	2	6	2146651	2146656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185804
43008	NC_007513	CGC	2	6	2146852	2146857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43009	NC_007513	AAAC	2	8	2146858	2146865	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43010	NC_007513	AAC	3	9	2146863	2146871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43011	NC_007513	T	6	6	2146883	2146888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43012	NC_007513	AGG	2	6	2146968	2146973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185805
43013	NC_007513	GCC	2	6	2147039	2147044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185805
43014	NC_007513	GGA	2	6	2147108	2147113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185805
43015	NC_007513	CCAA	2	8	2147130	2147137	50 %	0 %	0 %	50 %	78185805
43016	NC_007513	CCA	2	6	2147145	2147150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185805
43017	NC_007513	GGA	2	6	2147158	2147163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185805
43018	NC_007513	GGTT	2	8	2147253	2147260	0 %	50 %	50 %	0 %	78185805
43019	NC_007513	CAC	2	6	2147388	2147393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185805
43020	NC_007513	GCG	2	6	2147475	2147480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185805
43021	NC_007513	GCG	2	6	2147493	2147498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185805
43022	NC_007513	GCCG	2	8	2147540	2147547	0 %	0 %	50 %	50 %	78185805
43023	NC_007513	GCA	2	6	2147559	2147564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185805
43024	NC_007513	TGG	2	6	2147621	2147626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185806
43025	NC_007513	CT	3	6	2147642	2147647	0 %	50 %	0 %	50 %	78185806
43026	NC_007513	GAA	2	6	2147653	2147658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185806
43027	NC_007513	CTGG	2	8	2147667	2147674	0 %	25 %	50 %	25 %	78185806
43028	NC_007513	GCAA	2	8	2147767	2147774	50 %	0 %	25 %	25 %	78185806
43029	NC_007513	CGA	2	6	2147799	2147804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185806
43030	NC_007513	GCC	3	9	2147836	2147844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185806
43031	NC_007513	ATGCC	2	10	2147876	2147885	20 %	20 %	20 %	40 %	78185806
43032	NC_007513	TTC	2	6	2147915	2147920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185806
43033	NC_007513	CAG	2	6	2147938	2147943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185806
43034	NC_007513	AACC	2	8	2147958	2147965	50 %	0 %	0 %	50 %	78185806
43035	NC_007513	CAC	2	6	2148009	2148014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185806
43036	NC_007513	AC	3	6	2148055	2148060	50 %	0 %	0 %	50 %	78185806
43037	NC_007513	CGG	2	6	2148094	2148099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185806
43038	NC_007513	CTG	2	6	2148150	2148155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185806
43039	NC_007513	ACG	2	6	2148257	2148262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185806
43040	NC_007513	CTC	2	6	2148270	2148275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185806
43041	NC_007513	CCCGGC	2	12	2148341	2148352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185806
43042	NC_007513	TGG	2	6	2148428	2148433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185806
43043	NC_007513	GCA	2	6	2148476	2148481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185806
43044	NC_007513	TCA	2	6	2148525	2148530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185806
43045	NC_007513	CTG	2	6	2148583	2148588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185806
43046	NC_007513	TGG	2	6	2148603	2148608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185806
43047	NC_007513	GCTG	2	8	2148781	2148788	0 %	25 %	50 %	25 %	78185806
43048	NC_007513	CTG	2	6	2148853	2148858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185806
43049	NC_007513	G	6	6	2148904	2148909	0 %	0 %	100 %	0 %	78185807
43050	NC_007513	CGA	2	6	2148914	2148919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185807
43051	NC_007513	GCCA	2	8	2148994	2149001	25 %	0 %	25 %	50 %	78185807
43052	NC_007513	CTG	2	6	2149020	2149025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185807
43053	NC_007513	TGC	2	6	2149040	2149045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185807
43054	NC_007513	GCT	2	6	2149046	2149051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185807
43055	NC_007513	TGC	2	6	2149100	2149105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185807
43056	NC_007513	ACC	2	6	2149207	2149212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185807
43057	NC_007513	TAG	2	6	2149271	2149276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185807
43058	NC_007513	TGCTC	2	10	2149382	2149391	0 %	40 %	20 %	40 %	78185807
43059	NC_007513	CAG	2	6	2149399	2149404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185807
43060	NC_007513	CTGTG	2	10	2149410	2149419	0 %	40 %	40 %	20 %	78185807
43061	NC_007513	CAG	2	6	2149475	2149480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185807
43062	NC_007513	GGT	2	6	2149754	2149759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185808
43063	NC_007513	G	6	6	2149817	2149822	0 %	0 %	100 %	0 %	78185808
43064	NC_007513	CTG	2	6	2149830	2149835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185808
43065	NC_007513	CGG	2	6	2149847	2149852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185808
43066	NC_007513	CTG	2	6	2149866	2149871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185808
43067	NC_007513	GCC	2	6	2149948	2149953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185808
43068	NC_007513	CGG	2	6	2150005	2150010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185808
43069	NC_007513	CTG	2	6	2150016	2150021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185808
43070	NC_007513	CCTT	2	8	2150048	2150055	0 %	50 %	0 %	50 %	78185808
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43080	NC_007513	TGC	2	6	2150449	2150454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185808
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43086	NC_007513	C	6	6	2150881	2150886	0 %	0 %	0 %	100 %	78185808
43087	NC_007513	GCT	2	6	2151011	2151016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185808
43088	NC_007513	CATC	2	8	2151023	2151030	25 %	25 %	0 %	50 %	78185808
43089	NC_007513	CGTT	2	8	2151056	2151063	0 %	50 %	25 %	25 %	78185808
43090	NC_007513	TGG	2	6	2151072	2151077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185808
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43101	NC_007513	CTTTGC	2	12	2151499	2151510	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	78185809
43102	NC_007513	CAC	2	6	2151551	2151556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185809
43103	NC_007513	ATCC	2	8	2151563	2151570	25 %	25 %	0 %	50 %	78185809
43104	NC_007513	GCC	2	6	2151595	2151600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185809
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43106	NC_007513	GAAC	2	8	2151616	2151623	50 %	0 %	25 %	25 %	78185809
43107	NC_007513	GCA	2	6	2151632	2151637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185809
43108	NC_007513	CGC	2	6	2151639	2151644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185809
43109	NC_007513	CGC	2	6	2151664	2151669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185809
43110	NC_007513	CAA	2	6	2151677	2151682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185809
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43118	NC_007513	CCA	2	6	2152025	2152030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185809
43119	NC_007513	AACC	2	8	2152060	2152067	50 %	0 %	0 %	50 %	78185810
43120	NC_007513	C	6	6	2152157	2152162	0 %	0 %	0 %	100 %	78185810
43121	NC_007513	CCA	2	6	2152212	2152217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185810
43122	NC_007513	C	7	7	2152224	2152230	0 %	0 %	0 %	100 %	78185810
43123	NC_007513	AGC	2	6	2152349	2152354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185810
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43131	NC_007513	AACC	2	8	2152808	2152815	50 %	0 %	0 %	50 %	78185810
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43141	NC_007513	GGA	2	6	2153319	2153324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185810
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43143	NC_007513	T	6	6	2153439	2153444	0 %	100 %	0 %	0 %	78185810
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43146	NC_007513	CGT	2	6	2153610	2153615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185810
43147	NC_007513	GCA	2	6	2153679	2153684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185810
43148	NC_007513	CGA	2	6	2153689	2153694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185810
43149	NC_007513	ATC	2	6	2153719	2153724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185810
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43152	NC_007513	TCT	2	6	2153816	2153821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43153	NC_007513	TGT	2	6	2153827	2153832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43177	NC_007513	GCA	2	6	2155477	2155482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185812
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43217	NC_007513	GCCA	2	8	2157460	2157467	25 %	0 %	25 %	50 %	78185815
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43222	NC_007513	CTG	2	6	2157730	2157735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185815
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43224	NC_007513	A	6	6	2157751	2157756	100 %	0 %	0 %	0 %	78185815
43225	NC_007513	CAA	2	6	2157760	2157765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185815
43226	NC_007513	AGCAG	2	10	2157830	2157839	40 %	0 %	40 %	20 %	78185815
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43229	NC_007513	GAA	2	6	2158018	2158023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185815
43230	NC_007513	CAGAT	2	10	2158061	2158070	40 %	20 %	20 %	20 %	78185815
43231	NC_007513	CAA	2	6	2158083	2158088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185815
43232	NC_007513	A	6	6	2158179	2158184	100 %	0 %	0 %	0 %	78185815
43233	NC_007513	GTT	2	6	2158203	2158208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185815
43234	NC_007513	TCA	2	6	2158218	2158223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185815
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43236	NC_007513	A	6	6	2158337	2158342	100 %	0 %	0 %	0 %	78185816
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43300	NC_007513	GAAG	2	8	2160814	2160821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43301	NC_007513	CTT	2	6	2160840	2160845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43303	NC_007513	A	7	7	2160879	2160885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43304	NC_007513	CCA	2	6	2161025	2161030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185818
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43334	NC_007513	GCA	2	6	2162526	2162531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185820
43335	NC_007513	TC	3	6	2162536	2162541	0 %	50 %	0 %	50 %	78185820
43336	NC_007513	TGC	2	6	2162588	2162593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185820
43337	NC_007513	CGA	2	6	2162598	2162603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185820
43338	NC_007513	ATCGC	2	10	2162630	2162639	20 %	20 %	20 %	40 %	78185820
43339	NC_007513	ACC	2	6	2162663	2162668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43340	NC_007513	GGCAC	2	10	2162762	2162771	20 %	0 %	40 %	40 %	78185821
43341	NC_007513	GCCGAC	2	12	2162791	2162802	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78185821
43342	NC_007513	ACC	2	6	2162803	2162808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185821
43343	NC_007513	CAT	2	6	2162809	2162814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185821
43344	NC_007513	GCACC	2	10	2162825	2162834	20 %	0 %	20 %	60 %	78185821
43345	NC_007513	ACG	2	6	2162864	2162869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185821
43346	NC_007513	CGG	2	6	2162901	2162906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185821
43347	NC_007513	GTGG	2	8	2162911	2162918	0 %	25 %	75 %	0 %	78185821
43348	NC_007513	GGAA	2	8	2162947	2162954	50 %	0 %	50 %	0 %	78185821
43349	NC_007513	TCA	2	6	2162966	2162971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185821
43350	NC_007513	TGC	2	6	2162979	2162984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185821
43351	NC_007513	CCAA	2	8	2163041	2163048	50 %	0 %	0 %	50 %	78185821
43352	NC_007513	CGA	2	6	2163156	2163161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185821
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43354	NC_007513	GCG	2	6	2163311	2163316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185821
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