MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_007513	GCT	2	6	2072892	2072897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185737
41503	NC_007513	CCG	2	6	2072925	2072930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185737
41504	NC_007513	CAG	2	6	2073037	2073042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185737
41505	NC_007513	CCG	2	6	2073056	2073061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185737
41506	NC_007513	GCA	2	6	2073072	2073077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185737
41507	NC_007513	GCG	2	6	2073107	2073112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185737
41508	NC_007513	CCA	2	6	2073266	2073271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185737
41509	NC_007513	AGCGC	2	10	2073275	2073284	20 %	0 %	40 %	40 %	78185737
41510	NC_007513	CCT	2	6	2073345	2073350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185737
41511	NC_007513	TGG	2	6	2073385	2073390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185737
41512	NC_007513	CGA	2	6	2073411	2073416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185737
41513	NC_007513	CTTG	2	8	2073423	2073430	0 %	50 %	25 %	25 %	78185737
41514	NC_007513	CTGG	2	8	2073453	2073460	0 %	25 %	50 %	25 %	78185737
41515	NC_007513	GGC	2	6	2073492	2073497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185737
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41517	NC_007513	GTTCA	2	10	2073742	2073751	20 %	40 %	20 %	20 %	78185738
41518	NC_007513	ACC	2	6	2073941	2073946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185738
41519	NC_007513	TGA	2	6	2073957	2073962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185738
41520	NC_007513	CCA	2	6	2073966	2073971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185738
41521	NC_007513	GAA	2	6	2073979	2073984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185738
41522	NC_007513	CTC	2	6	2074012	2074017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185738
41523	NC_007513	CCA	2	6	2074053	2074058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185738
41524	NC_007513	CGA	2	6	2074134	2074139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185738
41525	NC_007513	GAG	2	6	2074159	2074164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41526	NC_007513	CGT	2	6	2074178	2074183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41527	NC_007513	GAC	2	6	2074233	2074238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41528	NC_007513	CCT	2	6	2074467	2074472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185739
41529	NC_007513	CGA	2	6	2074482	2074487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185739
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41531	NC_007513	CGT	2	6	2074605	2074610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185739
41532	NC_007513	CGA	2	6	2074698	2074703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185739
41533	NC_007513	CTG	2	6	2074714	2074719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185739
41534	NC_007513	GTG	3	9	2074792	2074800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185739
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41538	NC_007513	CGA	2	6	2075001	2075006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185739
41539	NC_007513	AAG	2	6	2075075	2075080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185739
41540	NC_007513	GAG	2	6	2075141	2075146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185739
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41545	NC_007513	GCCA	2	8	2075308	2075315	25 %	0 %	25 %	50 %	78185739
41546	NC_007513	GCA	2	6	2075345	2075350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185739
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41550	NC_007513	CAAG	2	8	2075505	2075512	50 %	0 %	25 %	25 %	78185739
41551	NC_007513	GCA	2	6	2075521	2075526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185739
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41554	NC_007513	GCT	2	6	2075590	2075595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185739
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41562	NC_007513	CCGTC	2	10	2076330	2076339	0 %	20 %	20 %	60 %	78185740
41563	NC_007513	CGC	4	12	2076373	2076384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185740
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41584	NC_007513	TCCG	2	8	2077309	2077316	0 %	25 %	25 %	50 %	78185740
41585	NC_007513	ACA	2	6	2077381	2077386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185740
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41596	NC_007513	AG	3	6	2077793	2077798	50 %	0 %	50 %	0 %	78185740
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41602	NC_007513	GAC	2	6	2077976	2077981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185740
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41604	NC_007513	GA	3	6	2078087	2078092	50 %	0 %	50 %	0 %	78185740
41605	NC_007513	CAT	2	6	2078104	2078109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185740
41606	NC_007513	TGG	2	6	2078115	2078120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185740
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41973	NC_007513	GAG	2	6	2096560	2096565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185755
41974	NC_007513	CCT	2	6	2096574	2096579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185755
41975	NC_007513	GCC	2	6	2096675	2096680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185755
41976	NC_007513	GTG	3	9	2096705	2096713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185755
41977	NC_007513	ACGGTG	2	12	2096714	2096725	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78185755
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41983	NC_007513	TGC	2	6	2097037	2097042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185755
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41988	NC_007513	GCA	2	6	2097330	2097335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185755
41989	NC_007513	AC	4	8	2097397	2097404	50 %	0 %	0 %	50 %	78185755
41990	NC_007513	GCC	2	6	2097522	2097527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185755
41991	NC_007513	TTC	2	6	2097659	2097664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185755
41992	NC_007513	GCGGG	2	10	2097727	2097736	0 %	0 %	80 %	20 %	78185755
41993	NC_007513	GTC	2	6	2097751	2097756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185755
41994	NC_007513	TGA	2	6	2097771	2097776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185755
41995	NC_007513	ATC	2	6	2097778	2097783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185755
41996	NC_007513	GCA	2	6	2097807	2097812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185755
41997	NC_007513	TGC	2	6	2097818	2097823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185755
41998	NC_007513	AAG	2	6	2097901	2097906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41999	NC_007513	TCA	2	6	2097922	2097927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185756
42000	NC_007513	CAC	2	6	2098000	2098005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185756

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