MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_007513	CAA	2	6	2048849	2048854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185713
41003	NC_007513	CCA	2	6	2048863	2048868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185713
41004	NC_007513	GCCC	2	8	2048955	2048962	0 %	0 %	25 %	75 %	78185713
41005	NC_007513	GCA	2	6	2048977	2048982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185713
41006	NC_007513	CCG	2	6	2049081	2049086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41007	NC_007513	CAGC	2	8	2049108	2049115	25 %	0 %	25 %	50 %	78185714
41008	NC_007513	GGC	2	6	2049122	2049127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185714
41009	NC_007513	GCT	2	6	2049304	2049309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185714
41010	NC_007513	GGC	2	6	2049310	2049315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185714
41011	NC_007513	GCG	2	6	2049328	2049333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185714
41012	NC_007513	CAC	2	6	2049367	2049372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185714
41013	NC_007513	GC	3	6	2049407	2049412	0 %	0 %	50 %	50 %	78185714
41014	NC_007513	GCG	2	6	2049417	2049422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185714
41015	NC_007513	TGCC	2	8	2049423	2049430	0 %	25 %	25 %	50 %	78185714
41016	NC_007513	CCGG	2	8	2049456	2049463	0 %	0 %	50 %	50 %	78185714
41017	NC_007513	CCG	2	6	2049492	2049497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185714
41018	NC_007513	GCT	2	6	2049518	2049523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185714
41019	NC_007513	GCC	2	6	2049540	2049545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185714
41020	NC_007513	TCG	2	6	2049633	2049638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185714
41021	NC_007513	GTG	2	6	2049722	2049727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185714
41022	NC_007513	TGG	2	6	2049780	2049785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185714
41023	NC_007513	CGA	2	6	2049799	2049804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185714
41024	NC_007513	TGC	2	6	2049816	2049821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185714
41025	NC_007513	AGCCG	2	10	2049842	2049851	20 %	0 %	40 %	40 %	78185714
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41029	NC_007513	GTG	2	6	2049966	2049971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185714
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41031	NC_007513	GC	3	6	2050087	2050092	0 %	0 %	50 %	50 %	78185714
41032	NC_007513	GATG	2	8	2050096	2050103	25 %	25 %	50 %	0 %	78185714
41033	NC_007513	ATG	2	6	2050211	2050216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185715
41034	NC_007513	TTG	2	6	2050223	2050228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185715
41035	NC_007513	CAAC	2	8	2050252	2050259	50 %	0 %	0 %	50 %	78185715
41036	NC_007513	CAA	2	6	2050294	2050299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185715
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41040	NC_007513	CGG	2	6	2050460	2050465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185715
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41043	NC_007513	TGC	2	6	2050685	2050690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185715
41044	NC_007513	TCG	2	6	2050721	2050726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185715
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41046	NC_007513	AGCAC	2	10	2051024	2051033	40 %	0 %	20 %	40 %	78185715
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41048	NC_007513	AGTT	2	8	2051113	2051120	25 %	50 %	25 %	0 %	78185715
41049	NC_007513	AGG	2	6	2051154	2051159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185715
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41051	NC_007513	ATG	2	6	2051539	2051544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185716
41052	NC_007513	ACA	2	6	2051586	2051591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185716
41053	NC_007513	ACC	2	6	2051677	2051682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41054	NC_007513	GCG	2	6	2051700	2051705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41055	NC_007513	CCCA	2	8	2052020	2052027	25 %	0 %	0 %	75 %	78185717
41056	NC_007513	CCA	2	6	2052031	2052036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185717
41057	NC_007513	GGGC	2	8	2052043	2052050	0 %	0 %	75 %	25 %	78185717
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41059	NC_007513	GC	3	6	2052085	2052090	0 %	0 %	50 %	50 %	78185717
41060	NC_007513	CAC	2	6	2052106	2052111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185717
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41066	NC_007513	GGGC	2	8	2052293	2052300	0 %	0 %	75 %	25 %	78185717
41067	NC_007513	GCC	2	6	2052303	2052308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185717
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41089	NC_007513	GCG	2	6	2053233	2053238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185718
41090	NC_007513	AGG	2	6	2053258	2053263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185718
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41103	NC_007513	CGCT	2	8	2053898	2053905	0 %	25 %	25 %	50 %	78185719
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41108	NC_007513	GCCAG	2	10	2054399	2054408	20 %	0 %	40 %	40 %	78185719
41109	NC_007513	GCC	2	6	2054454	2054459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185719
41110	NC_007513	CCA	2	6	2054467	2054472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185719
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41113	NC_007513	CAG	2	6	2054571	2054576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185719
41114	NC_007513	AG	3	6	2054610	2054615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41115	NC_007513	GAG	2	6	2054666	2054671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41116	NC_007513	A	6	6	2054726	2054731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41117	NC_007513	CGG	2	6	2054741	2054746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41118	NC_007513	T	7	7	2054749	2054755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41119	NC_007513	ACA	2	6	2054773	2054778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41239	NC_007513	CAC	2	6	2060156	2060161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185726
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41297	NC_007513	ACC	2	6	2063026	2063031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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41343	NC_007513	GCG	2	6	2065359	2065364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185731
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41347	NC_007513	CTG	2	6	2065522	2065527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185731
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41351	NC_007513	A	7	7	2065712	2065718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41352	NC_007513	AC	3	6	2065728	2065733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41353	NC_007513	TCA	3	9	2065736	2065744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41354	NC_007513	CTT	2	6	2065757	2065762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41355	NC_007513	A	6	6	2065780	2065785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41357	NC_007513	CAT	2	6	2065841	2065846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41478	NC_007513	CCG	2	6	2071747	2071752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185736
41479	NC_007513	CAG	2	6	2071770	2071775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185736
41480	NC_007513	CCAG	2	8	2071865	2071872	25 %	0 %	25 %	50 %	78185736
41481	NC_007513	TCC	2	6	2071910	2071915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185736
41482	NC_007513	AGGT	2	8	2071946	2071953	25 %	25 %	50 %	0 %	78185736
41483	NC_007513	CCACCT	2	12	2071971	2071982	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	78185736
41484	NC_007513	GA	3	6	2072019	2072024	50 %	0 %	50 %	0 %	78185736
41485	NC_007513	TCGA	2	8	2072065	2072072	25 %	25 %	25 %	25 %	78185736
41486	NC_007513	CAC	2	6	2072176	2072181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185736
41487	NC_007513	TCG	2	6	2072204	2072209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185736
41488	NC_007513	GGT	2	6	2072215	2072220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185736
41489	NC_007513	GCC	2	6	2072225	2072230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185736
41490	NC_007513	TGC	2	6	2072305	2072310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185736
41491	NC_007513	TCA	2	6	2072371	2072376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41492	NC_007513	T	6	6	2072422	2072427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41493	NC_007513	CTG	2	6	2072453	2072458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41494	NC_007513	ACCAC	2	10	2072494	2072503	40 %	0 %	0 %	60 %	78185737
41495	NC_007513	CGT	2	6	2072563	2072568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185737
41496	NC_007513	GGC	2	6	2072622	2072627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185737
41497	NC_007513	GTT	2	6	2072667	2072672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185737
41498	NC_007513	GCA	2	6	2072682	2072687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185737
41499	NC_007513	GGA	2	6	2072787	2072792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185737
41500	NC_007513	CAG	2	6	2072796	2072801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185737

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