MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_007513	GAG	2	6	1999497	1999502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185660
40002	NC_007513	GGAT	2	8	1999539	1999546	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40003	NC_007513	GAC	2	6	1999587	1999592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40004	NC_007513	TCC	2	6	1999598	1999603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40005	NC_007513	TGC	2	6	1999605	1999610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185661
40006	NC_007513	ACGC	2	8	1999626	1999633	25 %	0 %	25 %	50 %	78185661
40007	NC_007513	GCA	2	6	1999642	1999647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185661
40008	NC_007513	GC	3	6	1999665	1999670	0 %	0 %	50 %	50 %	78185661
40009	NC_007513	CTG	2	6	1999808	1999813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185661
40010	NC_007513	CGA	2	6	1999855	1999860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185661
40011	NC_007513	CAT	2	6	1999951	1999956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185662
40012	NC_007513	TGAA	2	8	2000028	2000035	50 %	25 %	25 %	0 %	78185662
40013	NC_007513	GCA	2	6	2000052	2000057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185662
40014	NC_007513	TGGG	2	8	2000067	2000074	0 %	25 %	75 %	0 %	78185662
40015	NC_007513	GACG	2	8	2000100	2000107	25 %	0 %	50 %	25 %	78185662
40016	NC_007513	GCT	2	6	2000114	2000119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185662
40017	NC_007513	CG	3	6	2000155	2000160	0 %	0 %	50 %	50 %	78185662
40018	NC_007513	CCA	2	6	2000198	2000203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185662
40019	NC_007513	CTG	2	6	2000369	2000374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185662
40020	NC_007513	TGT	2	6	2000390	2000395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185662
40021	NC_007513	GCA	2	6	2000491	2000496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185662
40022	NC_007513	AG	3	6	2000575	2000580	50 %	0 %	50 %	0 %	78185662
40023	NC_007513	ACC	2	6	2000585	2000590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185662
40024	NC_007513	TTG	2	6	2000640	2000645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185662
40025	NC_007513	TCCG	2	8	2000681	2000688	0 %	25 %	25 %	50 %	78185662
40026	NC_007513	CCA	2	6	2000701	2000706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185662
40027	NC_007513	GCA	2	6	2000766	2000771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185662
40028	NC_007513	CTG	2	6	2000819	2000824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185662
40029	NC_007513	GA	3	6	2000873	2000878	50 %	0 %	50 %	0 %	78185662
40030	NC_007513	CGC	2	6	2000890	2000895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185662
40031	NC_007513	CAC	2	6	2000971	2000976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185662
40032	NC_007513	GCT	2	6	2001005	2001010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185662
40033	NC_007513	GCCA	2	8	2001026	2001033	25 %	0 %	25 %	50 %	78185662
40034	NC_007513	GCG	2	6	2001065	2001070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185662
40035	NC_007513	CGT	2	6	2001076	2001081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185662
40036	NC_007513	ACCC	2	8	2001105	2001112	25 %	0 %	0 %	75 %	78185662
40037	NC_007513	GCCA	2	8	2001191	2001198	25 %	0 %	25 %	50 %	78185662
40038	NC_007513	CGT	2	6	2001246	2001251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185662
40039	NC_007513	GCCA	2	8	2001303	2001310	25 %	0 %	25 %	50 %	78185662
40040	NC_007513	AGC	2	6	2001323	2001328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185662
40041	NC_007513	GCT	2	6	2001370	2001375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185662
40042	NC_007513	TAGC	2	8	2001424	2001431	25 %	25 %	25 %	25 %	78185662
40043	NC_007513	ACA	2	6	2001442	2001447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185662
40044	NC_007513	GGC	2	6	2001449	2001454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185662
40045	NC_007513	CAC	2	6	2001611	2001616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185663
40046	NC_007513	TGA	2	6	2001647	2001652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185663
40047	NC_007513	ACG	2	6	2001668	2001673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185663
40048	NC_007513	TGC	2	6	2001674	2001679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185663
40049	NC_007513	CGT	2	6	2001695	2001700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185663
40050	NC_007513	CGT	2	6	2001747	2001752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185663
40051	NC_007513	CTC	2	6	2001799	2001804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185663
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40053	NC_007513	TGA	2	6	2001892	2001897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185663
40054	NC_007513	CGT	2	6	2001909	2001914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185664
40055	NC_007513	CCA	2	6	2002018	2002023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185664
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40057	NC_007513	CTC	2	6	2002059	2002064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185664
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40059	NC_007513	TGA	2	6	2002208	2002213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185664
40060	NC_007513	GACT	2	8	2002237	2002244	25 %	25 %	25 %	25 %	78185664
40061	NC_007513	TGA	2	6	2002258	2002263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185664
40062	NC_007513	TCA	2	6	2002267	2002272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185664
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40067	NC_007513	TGC	2	6	2002507	2002512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185664
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40089	NC_007513	CA	3	6	2003677	2003682	50 %	0 %	0 %	50 %	78185665
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40101	NC_007513	ACGGTG	2	12	2004454	2004465	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78185666
40102	NC_007513	A	6	6	2004511	2004516	100 %	0 %	0 %	0 %	78185666
40103	NC_007513	CAC	2	6	2004543	2004548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185666
40104	NC_007513	GCGG	2	8	2004634	2004641	0 %	0 %	75 %	25 %	78185666
40105	NC_007513	CTT	2	6	2004678	2004683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185667
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40113	NC_007513	T	6	6	2005080	2005085	0 %	100 %	0 %	0 %	78185667
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40127	NC_007513	CTG	2	6	2005974	2005979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185668
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40198	NC_007513	AGA	2	6	2009421	2009426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185672
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40227	NC_007513	GCTT	2	8	2010714	2010721	0 %	50 %	25 %	25 %	78185674
40228	NC_007513	AAGGC	2	10	2010758	2010767	40 %	0 %	40 %	20 %	78185674
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40230	NC_007513	GC	3	6	2010840	2010845	0 %	0 %	50 %	50 %	78185674
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40235	NC_007513	GCC	2	6	2011008	2011013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185674
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40356	NC_007513	CAA	2	6	2016579	2016584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40357	NC_007513	CTG	2	6	2016603	2016608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40358	NC_007513	CGT	2	6	2016818	2016823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185681
40359	NC_007513	CGG	2	6	2016837	2016842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185681
40360	NC_007513	GCT	2	6	2016908	2016913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185681
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40375	NC_007513	AGC	2	6	2017685	2017690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40376	NC_007513	ATGT	2	8	2017933	2017940	25 %	50 %	25 %	0 %	78185683
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40382	NC_007513	GTC	2	6	2018335	2018340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185684
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40384	NC_007513	GCT	2	6	2018412	2018417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185684
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40397	NC_007513	GC	3	6	2018996	2019001	0 %	0 %	50 %	50 %	78185684
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40457	NC_007513	CGA	2	6	2022060	2022065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185687
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40460	NC_007513	CTGG	2	8	2022133	2022140	0 %	25 %	50 %	25 %	78185687
40461	NC_007513	CCG	2	6	2022143	2022148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185687
40462	NC_007513	GAC	2	6	2022157	2022162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185687
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40466	NC_007513	GC	3	6	2022283	2022288	0 %	0 %	50 %	50 %	78185687
40467	NC_007513	CA	3	6	2022310	2022315	50 %	0 %	0 %	50 %	78185687
40468	NC_007513	AAC	2	6	2022362	2022367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185687
40469	NC_007513	CACCC	2	10	2022370	2022379	20 %	0 %	0 %	80 %	78185687
40470	NC_007513	CGC	2	6	2022400	2022405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185687
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