MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_007513	AGCG	2	8	1899587	1899594	25 %	0 %	50 %	25 %	78185562
38003	NC_007513	GAA	2	6	1899600	1899605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185562
38004	NC_007513	GA	3	6	1899668	1899673	50 %	0 %	50 %	0 %	78185562
38005	NC_007513	GGT	2	6	1899904	1899909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38006	NC_007513	CGA	2	6	1899922	1899927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38007	NC_007513	TCG	2	6	1899936	1899941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38008	NC_007513	A	6	6	1900053	1900058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38009	NC_007513	CTG	2	6	1900111	1900116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38010	NC_007513	CAA	2	6	1900150	1900155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38011	NC_007513	A	7	7	1900169	1900175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38012	NC_007513	AAC	3	9	1900221	1900229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38013	NC_007513	TGC	2	6	1900328	1900333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185563
38014	NC_007513	TCA	2	6	1900334	1900339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185563
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38018	NC_007513	CAA	2	6	1900468	1900473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185563
38019	NC_007513	GAC	2	6	1900528	1900533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185563
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38024	NC_007513	T	6	6	1900986	1900991	0 %	100 %	0 %	0 %	78185563
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38029	NC_007513	CATC	2	8	1901112	1901119	25 %	25 %	0 %	50 %	78185563
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38033	NC_007513	GA	4	8	1901260	1901267	50 %	0 %	50 %	0 %	78185563
38034	NC_007513	CCAG	2	8	1901283	1901290	25 %	0 %	25 %	50 %	78185563
38035	NC_007513	CTGA	2	8	1901308	1901315	25 %	25 %	25 %	25 %	78185563
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38044	NC_007513	ACCA	2	8	1901646	1901653	50 %	0 %	0 %	50 %	78185563
38045	NC_007513	GGA	2	6	1901662	1901667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185563
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38048	NC_007513	TCC	2	6	1901773	1901778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38049	NC_007513	AGC	2	6	1901779	1901784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38050	NC_007513	CT	3	6	1901789	1901794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38051	NC_007513	ATG	2	6	1901840	1901845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38052	NC_007513	TGG	2	6	1901900	1901905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185564
38053	NC_007513	C	6	6	1901936	1901941	0 %	0 %	0 %	100 %	78185564
38054	NC_007513	CG	3	6	1902043	1902048	0 %	0 %	50 %	50 %	78185564
38055	NC_007513	AGG	2	6	1902069	1902074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185564
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38060	NC_007513	CAG	2	6	1902327	1902332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185564
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38103	NC_007513	ATT	2	6	1904698	1904703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38105	NC_007513	CAGC	2	8	1904729	1904736	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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38108	NC_007513	GAAA	2	8	1904810	1904817	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38109	NC_007513	AATC	2	8	1904832	1904839	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38110	NC_007513	CATC	2	8	1904844	1904851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38111	NC_007513	ATGA	2	8	1904969	1904976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38112	NC_007513	TG	3	6	1904999	1905004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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38481	NC_007513	CGC	2	6	1923745	1923750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185583
38482	NC_007513	AGC	2	6	1923782	1923787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185583
38483	NC_007513	ACG	2	6	1923864	1923869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185584
38484	NC_007513	AGGC	2	8	1923903	1923910	25 %	0 %	50 %	25 %	78185584
38485	NC_007513	ACC	2	6	1923926	1923931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185584
38486	NC_007513	CCG	2	6	1923949	1923954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185584
38487	NC_007513	TCT	2	6	1924095	1924100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185584
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38491	NC_007513	CTGCA	2	10	1924301	1924310	20 %	20 %	20 %	40 %	78185584
38492	NC_007513	ACC	2	6	1924417	1924422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185584
38493	NC_007513	AGC	2	6	1924445	1924450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185584
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38496	NC_007513	G	7	7	1924560	1924566	0 %	0 %	100 %	0 %	78185584
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