MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36003	NC_007513	CCAT	2	8	1795476	1795483	25 %	25 %	0 %	50 %	78185434
36004	NC_007513	TGC	2	6	1795492	1795497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185434
36005	NC_007513	TCCA	2	8	1795702	1795709	25 %	25 %	0 %	50 %	78185434
36006	NC_007513	TGC	2	6	1795727	1795732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185434
36007	NC_007513	ACCTC	2	10	1795744	1795753	20 %	20 %	0 %	60 %	78185434
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36013	NC_007513	GGT	2	6	1795994	1795999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185434
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36015	NC_007513	GAT	2	6	1796016	1796021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185434
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36119	NC_007513	GGA	2	6	1801300	1801305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185440
36120	NC_007513	A	6	6	1801357	1801362	100 %	0 %	0 %	0 %	78185440
36121	NC_007513	TTG	2	6	1801422	1801427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185440
36122	NC_007513	T	6	6	1801443	1801448	0 %	100 %	0 %	0 %	78185440
36123	NC_007513	TGA	2	6	1801464	1801469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185440
36124	NC_007513	ATC	2	6	1801482	1801487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36125	NC_007513	CATT	2	8	1801488	1801495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36126	NC_007513	GTT	2	6	1801614	1801619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185441
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36131	NC_007513	CGA	2	6	1801874	1801879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185441
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36133	NC_007513	GCT	3	9	1802062	1802070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185441
36134	NC_007513	A	8	8	1802112	1802119	100 %	0 %	0 %	0 %	78185441
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36136	NC_007513	CGA	2	6	1802340	1802345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36137	NC_007513	GC	3	6	1802380	1802385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36138	NC_007513	AGC	2	6	1802482	1802487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36139	NC_007513	ATG	2	6	1802596	1802601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36140	NC_007513	AATT	2	8	1802605	1802612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36141	NC_007513	GGC	2	6	1802624	1802629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185442
36142	NC_007513	TAA	2	6	1802654	1802659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78185442
36143	NC_007513	ATC	2	6	1802773	1802778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185442
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36146	NC_007513	ATC	2	6	1802881	1802886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185443
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36155	NC_007513	GTC	2	6	1803404	1803409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36156	NC_007513	CTT	2	6	1803414	1803419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36157	NC_007513	TGAAG	2	10	1803437	1803446	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36158	NC_007513	TTGA	2	8	1803450	1803457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36159	NC_007513	GACC	2	8	1803522	1803529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36160	NC_007513	TAT	2	6	1803574	1803579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78185444
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36169	NC_007513	CTTG	2	8	1804103	1804110	0 %	50 %	25 %	25 %	78185444
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36173	NC_007513	CAAG	2	8	1804201	1804208	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36174	NC_007513	ATT	2	6	1804236	1804241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36175	NC_007513	GA	3	6	1804244	1804249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36176	NC_007513	CAT	2	6	1804280	1804285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36177	NC_007513	AATA	2	8	1804296	1804303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36178	NC_007513	ATC	2	6	1804609	1804614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185445
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36191	NC_007513	CTG	2	6	1805214	1805219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185446
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36226	NC_007513	GAAC	2	8	1807017	1807024	50 %	0 %	25 %	25 %	78185448
36227	NC_007513	TTGA	2	8	1807105	1807112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36228	NC_007513	AAG	2	6	1807121	1807126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36229	NC_007513	CTGA	2	8	1807146	1807153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36230	NC_007513	GAA	2	6	1807229	1807234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185449
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36234	NC_007513	GAGC	2	8	1807339	1807346	25 %	0 %	50 %	25 %	78185449
36235	NC_007513	GTC	2	6	1807437	1807442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185449
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36348	NC_007513	CAA	2	6	1812998	1813003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185457
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36351	NC_007513	CAT	2	6	1813150	1813155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185457
36352	NC_007513	ATC	2	6	1813160	1813165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185457
36353	NC_007513	CA	3	6	1813183	1813188	50 %	0 %	0 %	50 %	78185457
36354	NC_007513	TTCAGC	2	12	1813217	1813228	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78185457
36355	NC_007513	TCA	2	6	1813289	1813294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36356	NC_007513	AAATG	2	10	1813303	1813312	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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36358	NC_007513	GA	3	6	1813406	1813411	50 %	0 %	50 %	0 %	78185458
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36476	NC_007513	CAG	2	6	1819234	1819239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185464
36477	NC_007513	ATC	2	6	1819294	1819299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185464
36478	NC_007513	GA	3	6	1819398	1819403	50 %	0 %	50 %	0 %	78185464
36479	NC_007513	ATCA	2	8	1819447	1819454	50 %	25 %	0 %	25 %	78185464
36480	NC_007513	TCA	2	6	1819529	1819534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185464
36481	NC_007513	TTA	2	6	1819605	1819610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78185464
36482	NC_007513	CA	4	8	1819620	1819627	50 %	0 %	0 %	50 %	78185464
36483	NC_007513	AAG	2	6	1819684	1819689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185464
36484	NC_007513	ATC	2	6	1819717	1819722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185464
36485	NC_007513	GCT	2	6	1819731	1819736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185464
36486	NC_007513	AAAT	2	8	1819763	1819770	75 %	25 %	0 %	0 %	78185464
36487	NC_007513	AGA	2	6	1819810	1819815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185464
36488	NC_007513	TTCGC	2	10	1819848	1819857	0 %	40 %	20 %	40 %	78185464
36489	NC_007513	CTC	2	6	1819873	1819878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185464
36490	NC_007513	AATT	2	8	1819932	1819939	50 %	50 %	0 %	0 %	78185464
36491	NC_007513	TA	3	6	1819956	1819961	50 %	50 %	0 %	0 %	78185464
36492	NC_007513	ACCA	2	8	1820053	1820060	50 %	0 %	0 %	50 %	78185464
36493	NC_007513	TATG	2	8	1820075	1820082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36494	NC_007513	TAA	2	6	1820131	1820136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36495	NC_007513	TCTG	2	8	1820148	1820155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36496	NC_007513	CCA	2	6	1820156	1820161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36497	NC_007513	CAT	2	6	1820259	1820264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185465
36498	NC_007513	AGT	2	6	1820300	1820305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185465
36499	NC_007513	A	7	7	1820392	1820398	100 %	0 %	0 %	0 %	78185465
36500	NC_007513	CAA	2	6	1820411	1820416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185465

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