MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35119	NC_007513	GCT	2	6	1750033	1750038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185392
35120	NC_007513	CGTA	2	8	1750100	1750107	25 %	25 %	25 %	25 %	78185392
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35157	NC_007513	CAC	2	6	1752206	1752211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185392
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35167	NC_007513	CTAA	2	8	1752895	1752902	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35168	NC_007513	TTGAA	2	10	1752919	1752928	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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35229	NC_007513	TGC	2	6	1755824	1755829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185397
35230	NC_007513	TCA	2	6	1755842	1755847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185397
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35232	NC_007513	TCA	2	6	1755896	1755901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185397
35233	NC_007513	ACC	2	6	1755937	1755942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185397
35234	NC_007513	GTG	2	6	1755952	1755957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185397
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35236	NC_007513	TGA	2	6	1756019	1756024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185397
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35340	NC_007513	CT	3	6	1761154	1761159	0 %	50 %	0 %	50 %	78185401
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35342	NC_007513	TGGA	2	8	1761221	1761228	25 %	25 %	50 %	0 %	78185401
35343	NC_007513	GCC	3	9	1761232	1761240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185401
35344	NC_007513	CGA	2	6	1761289	1761294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185401
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35346	NC_007513	GGCGT	2	10	1761322	1761331	0 %	20 %	60 %	20 %	78185401
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35350	NC_007513	GCA	2	6	1761627	1761632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185402
35351	NC_007513	TGC	2	6	1761639	1761644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185402
35352	NC_007513	CTG	2	6	1761719	1761724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185402
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35354	NC_007513	CTA	2	6	1761811	1761816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185402
35355	NC_007513	CCA	2	6	1761889	1761894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185402
35356	NC_007513	TGA	2	6	1761961	1761966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185402
35357	NC_007513	GGT	2	6	1762036	1762041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185402
35358	NC_007513	GAC	2	6	1762065	1762070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185402
35359	NC_007513	GCC	2	6	1762076	1762081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185402
35360	NC_007513	CGT	2	6	1762126	1762131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185402
35361	NC_007513	CTT	2	6	1762309	1762314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185402
35362	NC_007513	TGG	2	6	1762326	1762331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185402
35363	NC_007513	ACC	2	6	1762334	1762339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185402
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35365	NC_007513	CTAC	2	8	1762393	1762400	25 %	25 %	0 %	50 %	78185402
35366	NC_007513	CGTG	2	8	1762408	1762415	0 %	25 %	50 %	25 %	78185402
35367	NC_007513	GGAG	2	8	1762463	1762470	25 %	0 %	75 %	0 %	78185402
35368	NC_007513	CTC	2	6	1762475	1762480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185402
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35370	NC_007513	CAG	3	9	1762504	1762512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185402
35371	NC_007513	GTG	2	6	1762514	1762519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185402
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35373	NC_007513	ACC	2	6	1762580	1762585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185402
35374	NC_007513	GCCA	2	8	1762635	1762642	25 %	0 %	25 %	50 %	78185402
35375	NC_007513	CTA	2	6	1762667	1762672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185402
35376	NC_007513	CCA	2	6	1762695	1762700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185402
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35378	NC_007513	TCT	2	6	1762738	1762743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185402
35379	NC_007513	GCC	2	6	1762823	1762828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185402
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35381	NC_007513	GCA	3	9	1762914	1762922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185402
35382	NC_007513	TGG	2	6	1762956	1762961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185402
35383	NC_007513	CCA	2	6	1763062	1763067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185402
35384	NC_007513	GGC	2	6	1763081	1763086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185403
35385	NC_007513	CTC	2	6	1763101	1763106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185403
35386	NC_007513	CGC	2	6	1763209	1763214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185403
35387	NC_007513	CTG	2	6	1763270	1763275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185403
35388	NC_007513	TGC	2	6	1763297	1763302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185403
35389	NC_007513	GCA	2	6	1763310	1763315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185403
35390	NC_007513	CCG	2	6	1763335	1763340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185403
35391	NC_007513	CAC	2	6	1763389	1763394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185403
35392	NC_007513	AGCC	2	8	1763406	1763413	25 %	0 %	25 %	50 %	78185403
35393	NC_007513	GCA	2	6	1763427	1763432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185403
35394	NC_007513	AGGCA	2	10	1763561	1763570	40 %	0 %	40 %	20 %	78185403
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35396	NC_007513	AAACC	2	10	1763690	1763699	60 %	0 %	0 %	40 %	78185403
35397	NC_007513	TGC	2	6	1763854	1763859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185403
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35401	NC_007513	AACGG	2	10	1764065	1764074	40 %	0 %	40 %	20 %	78185403
35402	NC_007513	C	6	6	1764096	1764101	0 %	0 %	0 %	100 %	78185403
35403	NC_007513	CCAG	2	8	1764105	1764112	25 %	0 %	25 %	50 %	78185403
35404	NC_007513	CGA	2	6	1764117	1764122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185403
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35406	NC_007513	TGA	2	6	1764173	1764178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185403
35407	NC_007513	GTA	2	6	1764196	1764201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185403
35408	NC_007513	GAT	2	6	1764233	1764238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185403
35409	NC_007513	TCA	2	6	1764284	1764289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185403
35410	NC_007513	GCT	2	6	1764416	1764421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185403
35411	NC_007513	GATA	2	8	1764516	1764523	50 %	25 %	25 %	0 %	78185403
35412	NC_007513	AAC	2	6	1764646	1764651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185403
35413	NC_007513	ACC	2	6	1764660	1764665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185403
35414	NC_007513	GCC	2	6	1764669	1764674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185403
35415	NC_007513	GATGCA	2	12	1764691	1764702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35416	NC_007513	TCCA	2	8	1764748	1764755	25 %	25 %	0 %	50 %	78185404
35417	NC_007513	AG	3	6	1764774	1764779	50 %	0 %	50 %	0 %	78185404
35418	NC_007513	TGA	2	6	1764836	1764841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185404
35419	NC_007513	CTTT	2	8	1764914	1764921	0 %	75 %	0 %	25 %	78185404
35420	NC_007513	CGT	2	6	1764970	1764975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185404
35421	NC_007513	CAG	2	6	1765166	1765171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185404
35422	NC_007513	TGG	2	6	1765262	1765267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185404
35423	NC_007513	T	6	6	1765288	1765293	0 %	100 %	0 %	0 %	78185404
35424	NC_007513	CTGG	2	8	1765324	1765331	0 %	25 %	50 %	25 %	78185404
35425	NC_007513	GGGA	2	8	1765368	1765375	25 %	0 %	75 %	0 %	78185404
35426	NC_007513	GCCCT	2	10	1765379	1765388	0 %	20 %	20 %	60 %	78185404
35427	NC_007513	CCG	2	6	1765422	1765427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185404
35428	NC_007513	ACC	2	6	1765478	1765483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185404
35429	NC_007513	TGG	2	6	1765487	1765492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185404
35430	NC_007513	CCT	2	6	1765512	1765517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185404
35431	NC_007513	TGCGC	2	10	1765521	1765530	0 %	20 %	40 %	40 %	78185404
35432	NC_007513	AACG	2	8	1765531	1765538	50 %	0 %	25 %	25 %	78185404
35433	NC_007513	ATC	2	6	1765588	1765593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185404
35434	NC_007513	CAG	2	6	1765600	1765605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185404
35435	NC_007513	GGC	2	6	1765663	1765668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185404
35436	NC_007513	GAT	2	6	1765717	1765722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185404
35437	NC_007513	GCT	2	6	1765761	1765766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185404
35438	NC_007513	TGC	2	6	1765772	1765777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185404
35439	NC_007513	CAA	2	6	1765816	1765821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185404
35440	NC_007513	CAC	2	6	1765884	1765889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185404
35441	NC_007513	ACG	2	6	1765913	1765918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185404
35442	NC_007513	GATTT	2	10	1766048	1766057	20 %	60 %	20 %	0 %	78185404
35443	NC_007513	CCG	2	6	1766071	1766076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185404
35444	NC_007513	GCA	2	6	1766141	1766146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35445	NC_007513	CCG	2	6	1766271	1766276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185405
35446	NC_007513	CCA	2	6	1766277	1766282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185405
35447	NC_007513	CAA	2	6	1766359	1766364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185405
35448	NC_007513	ACT	2	6	1766379	1766384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185405
35449	NC_007513	CAGC	2	8	1766395	1766402	25 %	0 %	25 %	50 %	78185405
35450	NC_007513	GAC	2	6	1766439	1766444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185405
35451	NC_007513	CAG	2	6	1766470	1766475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185405
35452	NC_007513	AGC	2	6	1766498	1766503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185405
35453	NC_007513	AC	3	6	1766644	1766649	50 %	0 %	0 %	50 %	78185405
35454	NC_007513	CAA	2	6	1766740	1766745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185405
35455	NC_007513	CAC	2	6	1766782	1766787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185405
35456	NC_007513	CAGCA	2	10	1766848	1766857	40 %	0 %	20 %	40 %	78185405
35457	NC_007513	AAG	2	6	1766867	1766872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185405
35458	NC_007513	TGCC	2	8	1766877	1766884	0 %	25 %	25 %	50 %	78185405
35459	NC_007513	G	6	6	1766974	1766979	0 %	0 %	100 %	0 %	78185405
35460	NC_007513	CCAAGG	2	12	1767007	1767018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185405
35461	NC_007513	CAA	2	6	1767046	1767051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185405
35462	NC_007513	TCC	2	6	1767261	1767266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185406
35463	NC_007513	CCAA	2	8	1767283	1767290	50 %	0 %	0 %	50 %	78185406
35464	NC_007513	ATCC	2	8	1767350	1767357	25 %	25 %	0 %	50 %	78185406
35465	NC_007513	CCT	2	6	1767358	1767363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185406
35466	NC_007513	GGT	2	6	1767412	1767417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185406
35467	NC_007513	CAG	2	6	1767476	1767481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185406
35468	NC_007513	GCT	3	9	1767535	1767543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185406
35469	NC_007513	CGT	2	6	1767558	1767563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185406
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35471	NC_007513	AGG	2	6	1767574	1767579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185406
35472	NC_007513	GA	3	6	1767634	1767639	50 %	0 %	50 %	0 %	78185406
35473	NC_007513	ACA	2	6	1767640	1767645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185406
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35475	NC_007513	AGC	2	6	1767941	1767946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185406
35476	NC_007513	GC	3	6	1768026	1768031	0 %	0 %	50 %	50 %	78185406
35477	NC_007513	CGAGC	2	10	1768032	1768041	20 %	0 %	40 %	40 %	78185406
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35480	NC_007513	CTG	2	6	1768352	1768357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185406
35481	NC_007513	TGCA	2	8	1768379	1768386	25 %	25 %	25 %	25 %	78185406
35482	NC_007513	TCC	2	6	1768431	1768436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185406
35483	NC_007513	GCG	2	6	1768450	1768455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185406
35484	NC_007513	CCT	2	6	1768515	1768520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185406
35485	NC_007513	CAA	2	6	1768567	1768572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185406
35486	NC_007513	AC	3	6	1768644	1768649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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35490	NC_007513	CTG	2	6	1768845	1768850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185407
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35494	NC_007513	CTG	2	6	1769021	1769026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185407
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35500	NC_007513	ATTG	2	8	1769392	1769399	25 %	50 %	25 %	0 %	78185407

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