MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_007513	GA	3	6	1640928	1640933	50 %	0 %	50 %	0 %	78185263
33002	NC_007513	ACC	2	6	1641002	1641007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185263
33003	NC_007513	GGT	2	6	1641018	1641023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185263
33004	NC_007513	TTCAAG	2	12	1641076	1641087	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	78185263
33005	NC_007513	CACGC	2	10	1641106	1641115	20 %	0 %	20 %	60 %	78185263
33006	NC_007513	GC	3	6	1641209	1641214	0 %	0 %	50 %	50 %	78185263
33007	NC_007513	GTG	2	6	1641248	1641253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33008	NC_007513	CTG	2	6	1641331	1641336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185264
33009	NC_007513	CAG	2	6	1641390	1641395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185264
33010	NC_007513	CGGA	2	8	1641418	1641425	25 %	0 %	50 %	25 %	78185264
33011	NC_007513	AGC	2	6	1641443	1641448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185264
33012	NC_007513	CGC	2	6	1641493	1641498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185264
33013	NC_007513	CCT	2	6	1641513	1641518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185264
33014	NC_007513	TGT	2	6	1641707	1641712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185264
33015	NC_007513	AAGC	2	8	1641739	1641746	50 %	0 %	25 %	25 %	78185264
33016	NC_007513	CAA	2	6	1641778	1641783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185264
33017	NC_007513	G	6	6	1641835	1641840	0 %	0 %	100 %	0 %	78185264
33018	NC_007513	CGA	2	6	1641933	1641938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185264
33019	NC_007513	CAA	3	9	1641982	1641990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185264
33020	NC_007513	ACA	2	6	1642004	1642009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185264
33021	NC_007513	TGC	2	6	1642050	1642055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185264
33022	NC_007513	GCT	3	9	1642096	1642104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185264
33023	NC_007513	GAG	2	6	1642184	1642189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185265
33024	NC_007513	CCA	2	6	1642221	1642226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185265
33025	NC_007513	ACA	2	6	1642314	1642319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185265
33026	NC_007513	AGC	2	6	1642416	1642421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33027	NC_007513	C	6	6	1642634	1642639	0 %	0 %	0 %	100 %	78185266
33028	NC_007513	TCA	2	6	1642718	1642723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185266
33029	NC_007513	TGG	2	6	1643044	1643049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185266
33030	NC_007513	CGA	2	6	1643112	1643117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185266
33031	NC_007513	GTT	2	6	1643118	1643123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185266
33032	NC_007513	CCA	2	6	1643215	1643220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185266
33033	NC_007513	CGA	3	9	1643223	1643231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185266
33034	NC_007513	CTG	2	6	1643260	1643265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185266
33035	NC_007513	AAC	2	6	1643277	1643282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185267
33036	NC_007513	CGTG	2	8	1643330	1643337	0 %	25 %	50 %	25 %	78185267
33037	NC_007513	GAA	2	6	1643344	1643349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185267
33038	NC_007513	CGC	2	6	1643473	1643478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185267
33039	NC_007513	TGC	2	6	1643516	1643521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185267
33040	NC_007513	CGC	2	6	1643654	1643659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185267
33041	NC_007513	GCT	2	6	1643675	1643680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185267
33042	NC_007513	GAC	2	6	1643687	1643692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185267
33043	NC_007513	TCT	2	6	1643784	1643789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185267
33044	NC_007513	GCCCCA	2	12	1643808	1643819	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	78185267
33045	NC_007513	CCG	3	9	1643893	1643901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185267
33046	NC_007513	TCG	2	6	1643916	1643921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185267
33047	NC_007513	GAA	2	6	1643927	1643932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185267
33048	NC_007513	CTG	2	6	1643977	1643982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185267
33049	NC_007513	GCA	2	6	1643983	1643988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185267
33050	NC_007513	GCT	2	6	1643994	1643999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185267
33051	NC_007513	AGC	2	6	1644051	1644056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185267
33052	NC_007513	CAC	2	6	1644209	1644214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185267
33053	NC_007513	ACC	2	6	1644306	1644311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185267
33054	NC_007513	GGT	2	6	1644403	1644408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185267
33055	NC_007513	CCA	2	6	1644472	1644477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185267
33056	NC_007513	CAA	2	6	1644540	1644545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185267
33057	NC_007513	GAA	2	6	1644547	1644552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185267
33058	NC_007513	CAG	2	6	1644553	1644558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185267
33059	NC_007513	GTT	2	6	1644570	1644575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185267
33060	NC_007513	CGGG	2	8	1644669	1644676	0 %	0 %	75 %	25 %	78185267
33061	NC_007513	CGG	2	6	1644684	1644689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185267
33062	NC_007513	AGC	2	6	1644704	1644709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185267
33063	NC_007513	ACAGA	2	10	1644787	1644796	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33064	NC_007513	GAT	2	6	1644821	1644826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33065	NC_007513	ACA	2	6	1644865	1644870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162138552
33066	NC_007513	GCGCA	2	10	1644908	1644917	20 %	0 %	40 %	40 %	162138552
33067	NC_007513	GC	3	6	1644951	1644956	0 %	0 %	50 %	50 %	162138552
33068	NC_007513	GGT	2	6	1644970	1644975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162138552
33069	NC_007513	AATA	2	8	1645030	1645037	75 %	25 %	0 %	0 %	162138552
33070	NC_007513	GC	3	6	1645100	1645105	0 %	0 %	50 %	50 %	162138552
33071	NC_007513	GC	3	6	1645260	1645265	0 %	0 %	50 %	50 %	162138552
33072	NC_007513	GCT	2	6	1645301	1645306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162138552
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33076	NC_007513	TGA	2	6	1645590	1645595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162138552
33077	NC_007513	TGA	2	6	1645598	1645603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162138552
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33082	NC_007513	CAT	2	6	1646087	1646092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162138552
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33084	NC_007513	TCC	2	6	1646203	1646208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185269
33085	NC_007513	AGC	2	6	1646240	1646245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185269
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33088	NC_007513	ACA	2	6	1646534	1646539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185269
33089	NC_007513	ATA	2	6	1646706	1646711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33090	NC_007513	CAA	3	9	1646716	1646724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33091	NC_007513	CCAA	2	8	1646821	1646828	50 %	0 %	0 %	50 %	78185270
33092	NC_007513	CTC	2	6	1646869	1646874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185270
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33098	NC_007513	CCAG	2	8	1647049	1647056	25 %	0 %	25 %	50 %	78185270
33099	NC_007513	AATC	2	8	1647066	1647073	50 %	25 %	0 %	25 %	78185270
33100	NC_007513	CAA	2	6	1647129	1647134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185270
33101	NC_007513	GCG	2	6	1647199	1647204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185270
33102	NC_007513	TCA	2	6	1647246	1647251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185271
33103	NC_007513	CCA	2	6	1647323	1647328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185271
33104	NC_007513	GAAGCC	2	12	1647379	1647390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185271
33105	NC_007513	GTCC	2	8	1647399	1647406	0 %	25 %	25 %	50 %	78185271
33106	NC_007513	CAT	2	6	1647418	1647423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185271
33107	NC_007513	CGA	2	6	1647424	1647429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185271
33108	NC_007513	CAAA	2	8	1647494	1647501	75 %	0 %	0 %	25 %	78185271
33109	NC_007513	ACC	2	6	1647503	1647508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185271
33110	NC_007513	AC	3	6	1647523	1647528	50 %	0 %	0 %	50 %	78185271
33111	NC_007513	TCC	2	6	1647659	1647664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185272
33112	NC_007513	CTG	2	6	1647699	1647704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185272
33113	NC_007513	CG	3	6	1647706	1647711	0 %	0 %	50 %	50 %	78185272
33114	NC_007513	GA	3	6	1647885	1647890	50 %	0 %	50 %	0 %	78185272
33115	NC_007513	CGAT	2	8	1647918	1647925	25 %	25 %	25 %	25 %	78185273
33116	NC_007513	CAAT	2	8	1647944	1647951	50 %	25 %	0 %	25 %	78185273
33117	NC_007513	TTGAT	2	10	1648079	1648088	20 %	60 %	20 %	0 %	78185273
33118	NC_007513	CAA	2	6	1648261	1648266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185273
33119	NC_007513	AGC	2	6	1648297	1648302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185273
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33132	NC_007513	TCT	2	6	1648737	1648742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185273
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33141	NC_007513	AATA	2	8	1649063	1649070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33142	NC_007513	A	6	6	1649078	1649083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33143	NC_007513	TGC	2	6	1649086	1649091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33148	NC_007513	TGG	2	6	1649325	1649330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33149	NC_007513	ACC	3	9	1649387	1649395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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33156	NC_007513	GCA	2	6	1649719	1649724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185274
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33232	NC_007513	CGA	2	6	1653303	1653308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185280
33233	NC_007513	GAG	2	6	1653454	1653459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185280
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33237	NC_007513	GT	3	6	1653876	1653881	0 %	50 %	50 %	0 %	78185281
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33344	NC_007513	TGCC	2	8	1659708	1659715	0 %	25 %	25 %	50 %	78185289
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33352	NC_007513	CGATG	2	10	1660110	1660119	20 %	20 %	40 %	20 %	78185290
33353	NC_007513	CAG	2	6	1660233	1660238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185290
33354	NC_007513	ATCA	2	8	1660242	1660249	50 %	25 %	0 %	25 %	78185290
33355	NC_007513	CGC	2	6	1660446	1660451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185290
33356	NC_007513	G	6	6	1660504	1660509	0 %	0 %	100 %	0 %	78185290
33357	NC_007513	ATC	2	6	1660521	1660526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185290
33358	NC_007513	CGCAG	2	10	1660542	1660551	20 %	0 %	40 %	40 %	78185290
33359	NC_007513	GTG	2	6	1660574	1660579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185290
33360	NC_007513	ATCA	2	8	1660829	1660836	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33361	NC_007513	CAG	2	6	1660842	1660847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33393	NC_007513	T	6	6	1662250	1662255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33462	NC_007513	CAG	2	6	1665705	1665710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185297
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33473	NC_007513	CCT	2	6	1666001	1666006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185297
33474	NC_007513	ATC	2	6	1666111	1666116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185297
33475	NC_007513	GCG	2	6	1666153	1666158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185297
33476	NC_007513	GAC	2	6	1666233	1666238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185297
33477	NC_007513	GGC	2	6	1666259	1666264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185297
33478	NC_007513	GGT	2	6	1666301	1666306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185297
33479	NC_007513	CCG	2	6	1666520	1666525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185298
33480	NC_007513	GAA	2	6	1666598	1666603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185298
33481	NC_007513	AGC	2	6	1666648	1666653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185298
33482	NC_007513	CTG	2	6	1666688	1666693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185298
33483	NC_007513	TGGC	2	8	1666764	1666771	0 %	25 %	50 %	25 %	78185298
33484	NC_007513	TGC	2	6	1666827	1666832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185298
33485	NC_007513	GTT	2	6	1666891	1666896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185298
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33489	NC_007513	CTG	2	6	1667021	1667026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185298
33490	NC_007513	TGC	2	6	1667061	1667066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185298
33491	NC_007513	CTT	2	6	1667072	1667077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185298
33492	NC_007513	TGT	2	6	1667224	1667229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185298
33493	NC_007513	AAC	2	6	1667256	1667261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185298
33494	NC_007513	CG	3	6	1667351	1667356	0 %	0 %	50 %	50 %	78185299
33495	NC_007513	CGCC	2	8	1667538	1667545	0 %	0 %	25 %	75 %	78185299
33496	NC_007513	CCT	2	6	1667570	1667575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185299
33497	NC_007513	CAG	2	6	1667591	1667596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185299
33498	NC_007513	GAA	2	6	1667599	1667604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185299
33499	NC_007513	GTC	3	9	1667763	1667771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185300
33500	NC_007513	CT	3	6	1667823	1667828	0 %	50 %	0 %	50 %	78185300

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