MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_007513	G	9	9	1615742	1615750	0 %	0 %	100 %	0 %	78185234
32503	NC_007513	CAC	3	9	1615758	1615766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185234
32504	NC_007513	GGTT	2	8	1615786	1615793	0 %	50 %	50 %	0 %	78185234
32505	NC_007513	CGA	2	6	1615869	1615874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185234
32506	NC_007513	AGC	2	6	1615939	1615944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185234
32507	NC_007513	GAT	2	6	1615948	1615953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185234
32508	NC_007513	GAA	2	6	1616008	1616013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185234
32509	NC_007513	GCG	2	6	1616041	1616046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185234
32510	NC_007513	TGG	2	6	1616132	1616137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185234
32511	NC_007513	ATCCA	2	10	1616141	1616150	40 %	20 %	0 %	40 %	78185234
32512	NC_007513	CCT	2	6	1616166	1616171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185234
32513	NC_007513	GTC	2	6	1616264	1616269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185235
32514	NC_007513	CGA	2	6	1616308	1616313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185235
32515	NC_007513	GCA	2	6	1616326	1616331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185235
32516	NC_007513	GGC	2	6	1616345	1616350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185235
32517	NC_007513	TGA	2	6	1616362	1616367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185235
32518	NC_007513	ACA	2	6	1616368	1616373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185235
32519	NC_007513	CTGGA	2	10	1616403	1616412	20 %	20 %	40 %	20 %	78185235
32520	NC_007513	TGG	2	6	1616442	1616447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185235
32521	NC_007513	G	6	6	1616506	1616511	0 %	0 %	100 %	0 %	78185235
32522	NC_007513	GCC	2	6	1616561	1616566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185235
32523	NC_007513	CCTT	2	8	1616634	1616641	0 %	50 %	0 %	50 %	78185235
32524	NC_007513	CGAAC	2	10	1616659	1616668	40 %	0 %	20 %	40 %	78185235
32525	NC_007513	GATCTC	2	12	1616669	1616680	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78185235
32526	NC_007513	GC	3	6	1616746	1616751	0 %	0 %	50 %	50 %	78185235
32527	NC_007513	GCA	3	9	1616759	1616767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185235
32528	NC_007513	TGC	2	6	1616779	1616784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185235
32529	NC_007513	TGTTC	2	10	1616875	1616884	0 %	60 %	20 %	20 %	78185235
32530	NC_007513	CGAA	2	8	1616886	1616893	50 %	0 %	25 %	25 %	78185235
32531	NC_007513	CGA	2	6	1616920	1616925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185235
32532	NC_007513	GTC	2	6	1616999	1617004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185235
32533	NC_007513	GCG	2	6	1617009	1617014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185235
32534	NC_007513	ACC	2	6	1617062	1617067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185235
32535	NC_007513	CTGAG	2	10	1617227	1617236	20 %	20 %	40 %	20 %	78185235
32536	NC_007513	TCA	2	6	1617365	1617370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185236
32537	NC_007513	CCAT	2	8	1617385	1617392	25 %	25 %	0 %	50 %	78185236
32538	NC_007513	AG	3	6	1617416	1617421	50 %	0 %	50 %	0 %	78185236
32539	NC_007513	GGT	2	6	1617426	1617431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185236
32540	NC_007513	CA	3	6	1617441	1617446	50 %	0 %	0 %	50 %	78185236
32541	NC_007513	GTG	2	6	1617511	1617516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185236
32542	NC_007513	GGC	2	6	1617568	1617573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185237
32543	NC_007513	CAA	2	6	1617579	1617584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185237
32544	NC_007513	TGG	2	6	1617601	1617606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185237
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32546	NC_007513	AGC	2	6	1617620	1617625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185237
32547	NC_007513	GCT	2	6	1617639	1617644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185237
32548	NC_007513	CTG	2	6	1617702	1617707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185237
32549	NC_007513	GGT	2	6	1617749	1617754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185237
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32551	NC_007513	CAG	2	6	1617801	1617806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185237
32552	NC_007513	CCA	2	6	1617905	1617910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185237
32553	NC_007513	AAC	2	6	1617917	1617922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185237
32554	NC_007513	GCA	2	6	1617983	1617988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185237
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32556	NC_007513	TGC	2	6	1618028	1618033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185237
32557	NC_007513	TGGG	2	8	1618081	1618088	0 %	25 %	75 %	0 %	78185237
32558	NC_007513	ACC	2	6	1618097	1618102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185237
32559	NC_007513	TTC	2	6	1618129	1618134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185237
32560	NC_007513	CTCACC	2	12	1618226	1618237	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	78185237
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32563	NC_007513	TCGAGG	2	12	1618381	1618392	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78185238
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32565	NC_007513	GGT	2	6	1618502	1618507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185238
32566	NC_007513	TTGA	2	8	1618566	1618573	25 %	50 %	25 %	0 %	78185238
32567	NC_007513	CG	3	6	1618600	1618605	0 %	0 %	50 %	50 %	78185238
32568	NC_007513	CGGT	2	8	1618657	1618664	0 %	25 %	50 %	25 %	78185238
32569	NC_007513	CAC	2	6	1618673	1618678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185238
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32572	NC_007513	TCA	2	6	1618710	1618715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185238
32573	NC_007513	CGGCC	2	10	1618744	1618753	0 %	0 %	40 %	60 %	78185238
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32578	NC_007513	GCA	2	6	1618994	1618999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185239
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32582	NC_007513	GCCA	2	8	1619102	1619109	25 %	0 %	25 %	50 %	78185239
32583	NC_007513	ACC	2	6	1619122	1619127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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32585	NC_007513	TGGT	2	8	1619197	1619204	0 %	50 %	50 %	0 %	78185240
32586	NC_007513	CGA	2	6	1619245	1619250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185240
32587	NC_007513	ACG	2	6	1619389	1619394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185240
32588	NC_007513	ATC	2	6	1619432	1619437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185240
32589	NC_007513	GAC	3	9	1619460	1619468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185240
32590	NC_007513	C	6	6	1619471	1619476	0 %	0 %	0 %	100 %	78185240
32591	NC_007513	GAG	2	6	1619484	1619489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185240
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32595	NC_007513	TGAG	2	8	1619734	1619741	25 %	25 %	50 %	0 %	78185241
32596	NC_007513	GCCCT	2	10	1619742	1619751	0 %	20 %	20 %	60 %	78185241
32597	NC_007513	CGG	2	6	1619792	1619797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185241
32598	NC_007513	TGC	2	6	1619798	1619803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185241
32599	NC_007513	GCT	2	6	1619826	1619831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185241
32600	NC_007513	TGG	3	9	1619888	1619896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185241
32601	NC_007513	TGG	2	6	1619986	1619991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185241
32602	NC_007513	GC	3	6	1620049	1620054	0 %	0 %	50 %	50 %	78185241
32603	NC_007513	TGG	2	6	1620080	1620085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185241
32604	NC_007513	TGG	2	6	1620088	1620093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185241
32605	NC_007513	TGG	2	6	1620127	1620132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185241
32606	NC_007513	CAA	2	6	1620176	1620181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185241
32607	NC_007513	GTAC	2	8	1620185	1620192	25 %	25 %	25 %	25 %	78185241
32608	NC_007513	GCA	2	6	1620210	1620215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185241
32609	NC_007513	TTC	2	6	1620325	1620330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185241
32610	NC_007513	GGT	2	6	1620404	1620409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185241
32611	NC_007513	AGG	2	6	1620413	1620418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185241
32612	NC_007513	TGC	2	6	1620438	1620443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185241
32613	NC_007513	GCC	2	6	1620471	1620476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185241
32614	NC_007513	TGGA	2	8	1620484	1620491	25 %	25 %	50 %	0 %	78185241
32615	NC_007513	AAC	2	6	1620604	1620609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32616	NC_007513	AGC	2	6	1620610	1620615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185242
32617	NC_007513	AGCGTC	2	12	1620618	1620629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78185242
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32730	NC_007513	GGC	2	6	1626724	1626729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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32850	NC_007513	CAA	2	6	1632986	1632991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185253
32851	NC_007513	ATGA	2	8	1633057	1633064	50 %	25 %	25 %	0 %	78185253
32852	NC_007513	CAA	2	6	1633276	1633281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32853	NC_007513	A	6	6	1633280	1633285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32854	NC_007513	ACTA	2	8	1633319	1633326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32855	NC_007513	AATTT	2	10	1633327	1633336	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32856	NC_007513	AAGCA	2	10	1633352	1633361	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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32973	NC_007513	CGG	2	6	1639420	1639425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185261
32974	NC_007513	AAC	2	6	1639508	1639513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185261
32975	NC_007513	CAC	2	6	1639557	1639562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185261
32976	NC_007513	CACC	2	8	1639583	1639590	25 %	0 %	0 %	75 %	78185261
32977	NC_007513	TTCAGC	2	12	1639635	1639646	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78185261
32978	NC_007513	GA	3	6	1639690	1639695	50 %	0 %	50 %	0 %	78185261
32979	NC_007513	CAA	2	6	1639703	1639708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185261
32980	NC_007513	CCAG	2	8	1639828	1639835	25 %	0 %	25 %	50 %	78185261
32981	NC_007513	CTC	2	6	1639854	1639859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185261
32982	NC_007513	CTG	2	6	1640024	1640029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185262
32983	NC_007513	GCG	2	6	1640048	1640053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185262
32984	NC_007513	ATC	2	6	1640120	1640125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185262
32985	NC_007513	GACTC	2	10	1640183	1640192	20 %	20 %	20 %	40 %	78185262
32986	NC_007513	CCTG	2	8	1640268	1640275	0 %	25 %	25 %	50 %	78185262
32987	NC_007513	AGCG	2	8	1640282	1640289	25 %	0 %	50 %	25 %	78185262
32988	NC_007513	CCAA	2	8	1640292	1640299	50 %	0 %	0 %	50 %	78185262
32989	NC_007513	CCG	2	6	1640385	1640390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185262
32990	NC_007513	C	6	6	1640415	1640420	0 %	0 %	0 %	100 %	78185262
32991	NC_007513	GCC	2	6	1640462	1640467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185262
32992	NC_007513	ACA	2	6	1640478	1640483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185262
32993	NC_007513	GAC	2	6	1640493	1640498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185262
32994	NC_007513	GGT	2	6	1640611	1640616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185263
32995	NC_007513	ACC	2	6	1640629	1640634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185263
32996	NC_007513	CCG	2	6	1640645	1640650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185263
32997	NC_007513	TGC	2	6	1640678	1640683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185263
32998	NC_007513	GAC	2	6	1640706	1640711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185263
32999	NC_007513	ACC	2	6	1640825	1640830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185263
33000	NC_007513	AGT	2	6	1640880	1640885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185263

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