MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32005	NC_007513	CGA	3	9	1590910	1590918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32234	NC_007513	TGC	2	6	1602270	1602275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185221
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32237	NC_007513	ATC	2	6	1602537	1602542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185221
32238	NC_007513	ATCA	2	8	1602603	1602610	50 %	25 %	0 %	25 %	78185221
32239	NC_007513	GTT	2	6	1602633	1602638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185221
32240	NC_007513	ACC	2	6	1602648	1602653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185221
32241	NC_007513	GTC	2	6	1602684	1602689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185221
32242	NC_007513	GCCAAG	2	12	1602715	1602726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185221
32243	NC_007513	ATTG	2	8	1602809	1602816	25 %	50 %	25 %	0 %	78185221
32244	NC_007513	CCAACA	2	12	1602839	1602850	50 %	0 %	0 %	50 %	78185221
32245	NC_007513	CATC	2	8	1602866	1602873	25 %	25 %	0 %	50 %	78185221
32246	NC_007513	TTC	2	6	1602889	1602894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185221
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32255	NC_007513	ATCG	2	8	1603425	1603432	25 %	25 %	25 %	25 %	78185221
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32266	NC_007513	CTC	2	6	1603869	1603874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185222
32267	NC_007513	TGC	2	6	1603968	1603973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185222
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32269	NC_007513	CAG	2	6	1604021	1604026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185222
32270	NC_007513	GAC	2	6	1604088	1604093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185222
32271	NC_007513	ACC	2	6	1604151	1604156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185222
32272	NC_007513	TAAG	2	8	1604171	1604178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32273	NC_007513	ACC	2	6	1604182	1604187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32274	NC_007513	GCAT	2	8	1604252	1604259	25 %	25 %	25 %	25 %	78185223
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32276	NC_007513	C	6	6	1604390	1604395	0 %	0 %	0 %	100 %	78185223
32277	NC_007513	GAA	2	6	1604424	1604429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185223
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32281	NC_007513	TAAT	2	8	1604759	1604766	50 %	50 %	0 %	0 %	78185223
32282	NC_007513	CAC	2	6	1604767	1604772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185223
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32292	NC_007513	CCA	2	6	1605144	1605149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185223
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32302	NC_007513	GCC	2	6	1605419	1605424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185223
32303	NC_007513	TCT	2	6	1605487	1605492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32304	NC_007513	AGC	2	6	1605584	1605589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185224
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32306	NC_007513	CGA	2	6	1605619	1605624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185224
32307	NC_007513	AGG	2	6	1605684	1605689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185224
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32317	NC_007513	CCTC	2	8	1606116	1606123	0 %	25 %	0 %	75 %	78185224
32318	NC_007513	AAC	2	6	1606187	1606192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185224
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32342	NC_007513	CGA	3	9	1607349	1607357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185225
32343	NC_007513	TCG	2	6	1607426	1607431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185225
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32345	NC_007513	CTG	2	6	1607545	1607550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185225
32346	NC_007513	TGG	2	6	1607665	1607670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185225
32347	NC_007513	CTGG	2	8	1607711	1607718	0 %	25 %	50 %	25 %	78185225
32348	NC_007513	TCCC	2	8	1607727	1607734	0 %	25 %	0 %	75 %	78185225
32349	NC_007513	G	9	9	1607737	1607745	0 %	0 %	100 %	0 %	78185225
32350	NC_007513	AAC	2	6	1607936	1607941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185225
32351	NC_007513	ACC	2	6	1607985	1607990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185225
32352	NC_007513	GAA	2	6	1607992	1607997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185225
32353	NC_007513	CGC	2	6	1608001	1608006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185225
32354	NC_007513	CTC	2	6	1608022	1608027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185225
32355	NC_007513	CCG	2	6	1608054	1608059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185225
32356	NC_007513	GAC	2	6	1608061	1608066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185225
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32462	NC_007513	AG	3	6	1613830	1613835	50 %	0 %	50 %	0 %	78185232
32463	NC_007513	GCT	2	6	1613938	1613943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185232
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32469	NC_007513	TTG	2	6	1614043	1614048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185232
32470	NC_007513	TGG	2	6	1614049	1614054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185232
32471	NC_007513	TTGC	2	8	1614108	1614115	0 %	50 %	25 %	25 %	78185232
32472	NC_007513	GTT	2	6	1614204	1614209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185232
32473	NC_007513	GTCG	2	8	1614210	1614217	0 %	25 %	50 %	25 %	78185232
32474	NC_007513	CTC	2	6	1614303	1614308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185232
32475	NC_007513	CG	3	6	1614613	1614618	0 %	0 %	50 %	50 %	78185233
32476	NC_007513	GTT	2	6	1614759	1614764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185233
32477	NC_007513	ACA	2	6	1614788	1614793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32478	NC_007513	GCC	2	6	1614856	1614861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32479	NC_007513	TGT	2	6	1614876	1614881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185234
32480	NC_007513	AAGGAA	2	12	1614908	1614919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185234
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32482	NC_007513	TGG	2	6	1614953	1614958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185234
32483	NC_007513	AGGG	2	8	1614968	1614975	25 %	0 %	75 %	0 %	78185234
32484	NC_007513	TCG	3	9	1614995	1615003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185234
32485	NC_007513	TCTG	2	8	1615061	1615068	0 %	50 %	25 %	25 %	78185234
32486	NC_007513	GGT	2	6	1615083	1615088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185234
32487	NC_007513	TGC	2	6	1615121	1615126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185234
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32490	NC_007513	GCG	2	6	1615226	1615231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185234
32491	NC_007513	CCG	2	6	1615233	1615238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185234
32492	NC_007513	CAC	2	6	1615245	1615250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185234
32493	NC_007513	CAGCG	2	10	1615288	1615297	20 %	0 %	40 %	40 %	78185234
32494	NC_007513	CTG	2	6	1615315	1615320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185234
32495	NC_007513	AGC	2	6	1615325	1615330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185234
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32497	NC_007513	A	7	7	1615364	1615370	100 %	0 %	0 %	0 %	78185234
32498	NC_007513	CG	3	6	1615478	1615483	0 %	0 %	50 %	50 %	78185234
32499	NC_007513	GCA	2	6	1615495	1615500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185234
32500	NC_007513	TTTG	2	8	1615518	1615525	0 %	75 %	25 %	0 %	78185234

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