MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_007513	GCA	2	6	1517672	1517677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185135
30503	NC_007513	ACG	2	6	1517761	1517766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185135
30504	NC_007513	CGAAT	2	10	1517802	1517811	40 %	20 %	20 %	20 %	78185135
30505	NC_007513	TGG	2	6	1517820	1517825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185135
30506	NC_007513	GTT	2	6	1517859	1517864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185135
30507	NC_007513	ATT	2	6	1517870	1517875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78185135
30508	NC_007513	CAG	2	6	1517894	1517899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185135
30509	NC_007513	TGA	2	6	1518054	1518059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185135
30510	NC_007513	ATT	2	6	1518086	1518091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78185135
30511	NC_007513	GAA	2	6	1518101	1518106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185135
30512	NC_007513	AC	3	6	1518128	1518133	50 %	0 %	0 %	50 %	78185135
30513	NC_007513	GCA	2	6	1518239	1518244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185135
30514	NC_007513	GCTT	2	8	1518251	1518258	0 %	50 %	25 %	25 %	78185135
30515	NC_007513	CTT	2	6	1518287	1518292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185135
30516	NC_007513	CAA	2	6	1518341	1518346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185135
30517	NC_007513	TGAT	2	8	1518360	1518367	25 %	50 %	25 %	0 %	78185135
30518	NC_007513	ATT	2	6	1518419	1518424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30519	NC_007513	CGAA	2	8	1518477	1518484	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30520	NC_007513	C	9	9	1518525	1518533	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30521	NC_007513	ATC	2	6	1518628	1518633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185136
30522	NC_007513	CCAA	2	8	1518635	1518642	50 %	0 %	0 %	50 %	78185136
30523	NC_007513	AC	3	6	1518660	1518665	50 %	0 %	0 %	50 %	78185136
30524	NC_007513	GCC	2	6	1518679	1518684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185136
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30527	NC_007513	GCTC	2	8	1518802	1518809	0 %	25 %	25 %	50 %	78185136
30528	NC_007513	GCA	2	6	1518854	1518859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185136
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30530	NC_007513	CTT	2	6	1518914	1518919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30531	NC_007513	CTT	2	6	1518934	1518939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30532	NC_007513	CG	3	6	1518986	1518991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30533	NC_007513	CCT	2	6	1519083	1519088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185137
30534	NC_007513	TCA	2	6	1519091	1519096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185137
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30536	NC_007513	GCT	2	6	1519208	1519213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185137
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30539	NC_007513	GCA	2	6	1519531	1519536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185137
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30541	NC_007513	CAT	2	6	1519623	1519628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185137
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30543	NC_007513	GCT	2	6	1519665	1519670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185137
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30545	NC_007513	GCA	2	6	1519766	1519771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185138
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30551	NC_007513	C	7	7	1519853	1519859	0 %	0 %	0 %	100 %	78185138
30552	NC_007513	TCCATC	2	12	1519932	1519943	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	78185138
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30554	NC_007513	CGCC	2	8	1520026	1520033	0 %	0 %	25 %	75 %	78185138
30555	NC_007513	ACG	2	6	1520070	1520075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185138
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30618	NC_007513	CGATG	2	10	1523232	1523241	20 %	20 %	40 %	20 %	78185141
30619	NC_007513	GGA	2	6	1523269	1523274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185141
30620	NC_007513	GCA	2	6	1523284	1523289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185141
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30625	NC_007513	GGC	2	6	1523436	1523441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185141
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30647	NC_007513	CG	3	6	1524354	1524359	0 %	0 %	50 %	50 %	78185142
30648	NC_007513	AC	3	6	1524367	1524372	50 %	0 %	0 %	50 %	78185142
30649	NC_007513	ATCC	2	8	1524434	1524441	25 %	25 %	0 %	50 %	78185142
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30652	NC_007513	CTG	2	6	1524636	1524641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185142
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30655	NC_007513	C	6	6	1524707	1524712	0 %	0 %	0 %	100 %	78185142
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30689	NC_007513	GGAT	2	8	1526351	1526358	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30690	NC_007513	AAAACC	2	12	1526506	1526517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30693	NC_007513	AGC	2	6	1526617	1526622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185145
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30698	NC_007513	CTC	2	6	1526759	1526764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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30701	NC_007513	AG	3	6	1526889	1526894	50 %	0 %	50 %	0 %	78185146
30702	NC_007513	CCA	2	6	1526899	1526904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185146
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30717	NC_007513	AC	4	8	1527428	1527435	50 %	0 %	0 %	50 %	78185146
30718	NC_007513	TGT	2	6	1527483	1527488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185146
30719	NC_007513	AGCC	2	8	1527524	1527531	25 %	0 %	25 %	50 %	78185146
30720	NC_007513	CCA	2	6	1527561	1527566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185146
30721	NC_007513	CAA	2	6	1527579	1527584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185146
30722	NC_007513	AG	3	6	1527613	1527618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30723	NC_007513	TGA	2	6	1527672	1527677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30724	NC_007513	ACG	2	6	1527699	1527704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185147
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30727	NC_007513	CGG	2	6	1527794	1527799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185147
30728	NC_007513	TGGG	2	8	1527805	1527812	0 %	25 %	75 %	0 %	78185147
30729	NC_007513	AAACAC	2	12	1527836	1527847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185147
30730	NC_007513	GCA	2	6	1527851	1527856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185147
30731	NC_007513	TCCT	2	8	1528010	1528017	0 %	50 %	0 %	50 %	78185147
30732	NC_007513	CGC	2	6	1528056	1528061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185147
30733	NC_007513	GTC	2	6	1528091	1528096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185147
30734	NC_007513	GGC	2	6	1528163	1528168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185147
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30967	NC_007513	G	6	6	1538471	1538476	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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30998	NC_007513	TAA	2	6	1539644	1539649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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