MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_007513	ACA	2	6	1492467	1492472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185108
30003	NC_007513	TCA	2	6	1492477	1492482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185108
30004	NC_007513	CAG	2	6	1492599	1492604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185108
30005	NC_007513	AGC	2	6	1492614	1492619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30006	NC_007513	TTGG	3	12	1492693	1492704	0 %	50 %	50 %	0 %	78185109
30007	NC_007513	GTT	2	6	1492721	1492726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185109
30008	NC_007513	GCG	2	6	1492771	1492776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185109
30009	NC_007513	CGA	2	6	1492913	1492918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185109
30010	NC_007513	TGG	2	6	1492945	1492950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185109
30011	NC_007513	GATG	2	8	1492964	1492971	25 %	25 %	50 %	0 %	78185109
30012	NC_007513	TGCCGA	2	12	1492979	1492990	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78185109
30013	NC_007513	G	7	7	1493005	1493011	0 %	0 %	100 %	0 %	78185109
30014	NC_007513	CT	3	6	1493099	1493104	0 %	50 %	0 %	50 %	78185110
30015	NC_007513	GTG	2	6	1493174	1493179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185110
30016	NC_007513	GTT	3	9	1493212	1493220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185110
30017	NC_007513	ATGG	2	8	1493226	1493233	25 %	25 %	50 %	0 %	78185110
30018	NC_007513	ACA	2	6	1493250	1493255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185110
30019	NC_007513	TCCA	2	8	1493412	1493419	25 %	25 %	0 %	50 %	78185110
30020	NC_007513	CTG	2	6	1493438	1493443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185110
30021	NC_007513	CGACA	2	10	1493466	1493475	40 %	0 %	20 %	40 %	78185110
30022	NC_007513	CAG	2	6	1493698	1493703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185110
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30025	NC_007513	TGAG	2	8	1493897	1493904	25 %	25 %	50 %	0 %	78185110
30026	NC_007513	CA	3	6	1493992	1493997	50 %	0 %	0 %	50 %	78185111
30027	NC_007513	CCT	2	6	1494040	1494045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185111
30028	NC_007513	CCAG	2	8	1494067	1494074	25 %	0 %	25 %	50 %	78185111
30029	NC_007513	GGT	2	6	1494102	1494107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185111
30030	NC_007513	CGG	2	6	1494257	1494262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185111
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30032	NC_007513	GAA	2	6	1494291	1494296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185111
30033	NC_007513	GCG	2	6	1494361	1494366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185111
30034	NC_007513	TGC	2	6	1494380	1494385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185111
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30036	NC_007513	GAC	2	6	1494600	1494605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185111
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30040	NC_007513	TCA	2	6	1494826	1494831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185111
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30042	NC_007513	TGG	2	6	1494898	1494903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185111
30043	NC_007513	CAT	2	6	1494917	1494922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185111
30044	NC_007513	CGT	2	6	1494932	1494937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185111
30045	NC_007513	TGA	2	6	1494938	1494943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185111
30046	NC_007513	GA	3	6	1494955	1494960	50 %	0 %	50 %	0 %	78185111
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30049	NC_007513	GGA	2	6	1495061	1495066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185111
30050	NC_007513	GCT	2	6	1495185	1495190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30051	NC_007513	GGC	2	6	1495377	1495382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185112
30052	NC_007513	TGG	2	6	1495400	1495405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185112
30053	NC_007513	TGG	2	6	1495421	1495426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185112
30054	NC_007513	TGC	2	6	1495469	1495474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185112
30055	NC_007513	CAG	2	6	1495519	1495524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185112
30056	NC_007513	GCT	2	6	1495527	1495532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185112
30057	NC_007513	CCTT	2	8	1495547	1495554	0 %	50 %	0 %	50 %	78185112
30058	NC_007513	TCC	2	6	1495612	1495617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185112
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30060	NC_007513	TGG	2	6	1495664	1495669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185112
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30083	NC_007513	GCTGAT	2	12	1496878	1496889	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78185113
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30101	NC_007513	CTT	2	6	1497710	1497715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185114
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30107	NC_007513	ACG	2	6	1497975	1497980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185114
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30113	NC_007513	TGA	2	6	1498141	1498146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185114
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30117	NC_007513	CAA	2	6	1498327	1498332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185114
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30119	NC_007513	GAT	2	6	1498448	1498453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30221	NC_007513	TTC	2	6	1504261	1504266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30222	NC_007513	GTT	2	6	1504348	1504353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30224	NC_007513	A	6	6	1504472	1504477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30225	NC_007513	CATT	2	8	1504481	1504488	25 %	50 %	0 %	25 %	78185122
30226	NC_007513	ATC	2	6	1504547	1504552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185122
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30231	NC_007513	C	6	6	1504822	1504827	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30232	NC_007513	AGG	2	6	1504885	1504890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30233	NC_007513	CCA	2	6	1504902	1504907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30234	NC_007513	AACCA	2	10	1504925	1504934	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
30235	NC_007513	ACAA	2	8	1504959	1504966	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30236	NC_007513	CAC	2	6	1504969	1504974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30237	NC_007513	TTG	2	6	1505019	1505024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30479	NC_007513	TGC	2	6	1516445	1516450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30480	NC_007513	ATGC	2	8	1516474	1516481	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30481	NC_007513	ACGA	2	8	1516495	1516502	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30482	NC_007513	GA	3	6	1516505	1516510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30483	NC_007513	CCA	2	6	1516524	1516529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30484	NC_007513	CAA	2	6	1516541	1516546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30485	NC_007513	AAAG	2	8	1516582	1516589	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30486	NC_007513	CAT	2	6	1516633	1516638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30487	NC_007513	AAT	2	6	1516652	1516657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30488	NC_007513	TGA	2	6	1516682	1516687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30489	NC_007513	CTT	2	6	1516707	1516712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30490	NC_007513	ATG	2	6	1516780	1516785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30491	NC_007513	CA	3	6	1516816	1516821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30492	NC_007513	AAT	2	6	1516887	1516892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30493	NC_007513	CCA	2	6	1516959	1516964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30494	NC_007513	AG	3	6	1517041	1517046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30495	NC_007513	ATCA	2	8	1517126	1517133	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30496	NC_007513	GCA	2	6	1517273	1517278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185135
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30500	NC_007513	TACAGA	2	12	1517452	1517463	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	78185135

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