MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_007513	GAA	2	6	1442705	1442710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185056
29003	NC_007513	CA	3	6	1442726	1442731	50 %	0 %	0 %	50 %	78185056
29004	NC_007513	CGT	2	6	1442753	1442758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185056
29005	NC_007513	GGC	2	6	1442784	1442789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185056
29006	NC_007513	GCA	2	6	1442854	1442859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185056
29007	NC_007513	GACGC	2	10	1442864	1442873	20 %	0 %	40 %	40 %	78185056
29008	NC_007513	GC	3	6	1442905	1442910	0 %	0 %	50 %	50 %	78185056
29009	NC_007513	CAT	2	6	1442912	1442917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185056
29010	NC_007513	AG	3	6	1442935	1442940	50 %	0 %	50 %	0 %	78185056
29011	NC_007513	CCA	2	6	1442977	1442982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185056
29012	NC_007513	C	6	6	1443043	1443048	0 %	0 %	0 %	100 %	78185056
29013	NC_007513	CAT	2	6	1443071	1443076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185056
29014	NC_007513	CAGTC	2	10	1443207	1443216	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29015	NC_007513	GCG	2	6	1443281	1443286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185057
29016	NC_007513	GCG	2	6	1443357	1443362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185057
29017	NC_007513	CCAA	2	8	1443371	1443378	50 %	0 %	0 %	50 %	78185057
29018	NC_007513	AGC	2	6	1443387	1443392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185057
29019	NC_007513	TTC	2	6	1443414	1443419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185057
29020	NC_007513	CTC	2	6	1443435	1443440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185057
29021	NC_007513	TGT	2	6	1443496	1443501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185057
29022	NC_007513	TCA	2	6	1443515	1443520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185057
29023	NC_007513	CGA	2	6	1443590	1443595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185058
29024	NC_007513	GTT	2	6	1443685	1443690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185058
29025	NC_007513	CCG	2	6	1443727	1443732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185058
29026	NC_007513	CGAAT	2	10	1443873	1443882	40 %	20 %	20 %	20 %	78185058
29027	NC_007513	A	7	7	1443900	1443906	100 %	0 %	0 %	0 %	78185058
29028	NC_007513	GCG	2	6	1444046	1444051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185058
29029	NC_007513	GGT	2	6	1444052	1444057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185058
29030	NC_007513	CCG	2	6	1444070	1444075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185058
29031	NC_007513	ATGA	2	8	1444079	1444086	50 %	25 %	25 %	0 %	78185058
29032	NC_007513	TCC	2	6	1444167	1444172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185058
29033	NC_007513	CCA	2	6	1444270	1444275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185058
29034	NC_007513	AGC	2	6	1444317	1444322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185058
29035	NC_007513	CAC	2	6	1444361	1444366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185058
29036	NC_007513	GC	3	6	1444388	1444393	0 %	0 %	50 %	50 %	78185058
29037	NC_007513	GAC	2	6	1444402	1444407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185058
29038	NC_007513	CAG	2	6	1444412	1444417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185058
29039	NC_007513	CCA	2	6	1444441	1444446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185058
29040	NC_007513	CAC	2	6	1444466	1444471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185058
29041	NC_007513	TGA	2	6	1444475	1444480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185058
29042	NC_007513	AAGG	2	8	1444490	1444497	50 %	0 %	50 %	0 %	78185058
29043	NC_007513	CAA	2	6	1444504	1444509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185058
29044	NC_007513	CCA	2	6	1444585	1444590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185058
29045	NC_007513	CCA	2	6	1444606	1444611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29046	NC_007513	GAT	2	6	1444621	1444626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185059
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29048	NC_007513	CAA	3	9	1444676	1444684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185059
29049	NC_007513	CGA	2	6	1444777	1444782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185059
29050	NC_007513	TGG	2	6	1444794	1444799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185059
29051	NC_007513	GTG	2	6	1444835	1444840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185059
29052	NC_007513	GCG	2	6	1444848	1444853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185059
29053	NC_007513	TCGGC	2	10	1444891	1444900	0 %	20 %	40 %	40 %	78185059
29054	NC_007513	GCC	2	6	1444962	1444967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185059
29055	NC_007513	GGC	2	6	1445078	1445083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185059
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29057	NC_007513	AGT	2	6	1445111	1445116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185059
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29059	NC_007513	CAG	2	6	1445180	1445185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185059
29060	NC_007513	GAT	2	6	1445297	1445302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185059
29061	NC_007513	GCA	2	6	1445314	1445319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185059
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29063	NC_007513	TGA	2	6	1445337	1445342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185059
29064	NC_007513	CTG	2	6	1445366	1445371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185059
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29086	NC_007513	GCCT	2	8	1446386	1446393	0 %	25 %	25 %	50 %	78185061
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29088	NC_007513	CTG	2	6	1446480	1446485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185061
29089	NC_007513	GCA	2	6	1446524	1446529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185061
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29091	NC_007513	GTC	2	6	1446618	1446623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185061
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29101	NC_007513	AGCCC	2	10	1446889	1446898	20 %	0 %	20 %	60 %	78185061
29102	NC_007513	C	6	6	1446979	1446984	0 %	0 %	0 %	100 %	78185061
29103	NC_007513	AGC	2	6	1446991	1446996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185061
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29105	NC_007513	GGT	2	6	1447108	1447113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185062
29106	NC_007513	CGA	2	6	1447119	1447124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185062
29107	NC_007513	AC	3	6	1447129	1447134	50 %	0 %	0 %	50 %	78185062
29108	NC_007513	TCC	2	6	1447137	1447142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185062
29109	NC_007513	CAGC	2	8	1447155	1447162	25 %	0 %	25 %	50 %	78185062
29110	NC_007513	TCCA	2	8	1447166	1447173	25 %	25 %	0 %	50 %	78185062
29111	NC_007513	CCA	3	9	1447171	1447179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185062
29112	NC_007513	G	6	6	1447261	1447266	0 %	0 %	100 %	0 %	78185062
29113	NC_007513	GCA	2	6	1447282	1447287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185062
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29117	NC_007513	GCT	2	6	1447486	1447491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185062
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29220	NC_007513	CGGT	2	8	1453589	1453596	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29221	NC_007513	GTG	2	6	1453784	1453789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185068
29222	NC_007513	TCG	3	9	1454059	1454067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185068
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29227	NC_007513	TGGA	2	8	1454322	1454329	25 %	25 %	50 %	0 %	78185068
29228	NC_007513	TGA	2	6	1454352	1454357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185068
29229	NC_007513	CAAC	2	8	1454369	1454376	50 %	0 %	0 %	50 %	78185068
29230	NC_007513	A	6	6	1454486	1454491	100 %	0 %	0 %	0 %	78185068
29231	NC_007513	TGC	2	6	1454622	1454627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29232	NC_007513	GAG	2	6	1454629	1454634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29233	NC_007513	ACC	2	6	1454674	1454679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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29473	NC_007513	ACG	2	6	1466283	1466288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185084
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29475	NC_007513	CTT	2	6	1466299	1466304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185084
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