MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_007513	A	9	9	1418908	1418916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28502	NC_007513	ACTA	2	8	1419078	1419085	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28503	NC_007513	GGAA	2	8	1419110	1419117	50 %	0 %	50 %	0 %	78185033
28504	NC_007513	GATC	2	8	1419174	1419181	25 %	25 %	25 %	25 %	78185033
28505	NC_007513	TGG	2	6	1419219	1419224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185033
28506	NC_007513	TTGA	2	8	1419228	1419235	25 %	50 %	25 %	0 %	78185033
28507	NC_007513	CAA	2	6	1419379	1419384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185033
28508	NC_007513	AGG	2	6	1419422	1419427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28509	NC_007513	CAA	2	6	1419431	1419436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28510	NC_007513	GTC	2	6	1419455	1419460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28511	NC_007513	GTG	2	6	1419482	1419487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28512	NC_007513	ATG	2	6	1419497	1419502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28513	NC_007513	TCA	2	6	1419509	1419514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28514	NC_007513	CAC	2	6	1419523	1419528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28515	NC_007513	TCA	2	6	1419529	1419534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28516	NC_007513	TCAA	2	8	1419562	1419569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28517	NC_007513	ATT	2	6	1419578	1419583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28518	NC_007513	GTC	2	6	1419712	1419717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28519	NC_007513	TGA	2	6	1419723	1419728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28520	NC_007513	TTG	2	6	1419749	1419754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28521	NC_007513	TG	3	6	1419753	1419758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28522	NC_007513	ACA	2	6	1419770	1419775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28523	NC_007513	GCC	2	6	1419787	1419792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28524	NC_007513	ACC	2	6	1419855	1419860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28525	NC_007513	CAG	2	6	1419891	1419896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28526	NC_007513	CAAT	2	8	1419929	1419936	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28527	NC_007513	ATT	2	6	1419977	1419982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28528	NC_007513	TTG	2	6	1420044	1420049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28529	NC_007513	TTG	2	6	1420066	1420071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28530	NC_007513	ATC	2	6	1420090	1420095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28531	NC_007513	TCC	2	6	1420116	1420121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28532	NC_007513	CGA	2	6	1420157	1420162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28533	NC_007513	GTT	2	6	1420271	1420276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28534	NC_007513	AGC	2	6	1420289	1420294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28535	NC_007513	AG	3	6	1420313	1420318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28536	NC_007513	CGTC	2	8	1420338	1420345	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28537	NC_007513	ATC	2	6	1420351	1420356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28538	NC_007513	AATT	2	8	1420361	1420368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28539	NC_007513	TTC	2	6	1420376	1420381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28540	NC_007513	TTTGGA	2	12	1420403	1420414	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28541	NC_007513	CCA	2	6	1420471	1420476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28542	NC_007513	GAT	2	6	1420489	1420494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28543	NC_007513	ATC	2	6	1420539	1420544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28544	NC_007513	A	6	6	1420702	1420707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28545	NC_007513	GATC	2	8	1420764	1420771	25 %	25 %	25 %	25 %	78185034
28546	NC_007513	TCG	2	6	1420777	1420782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185034
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28549	NC_007513	GAG	2	6	1421115	1421120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185034
28550	NC_007513	ATTG	2	8	1421137	1421144	25 %	50 %	25 %	0 %	78185034
28551	NC_007513	TAAT	2	8	1421160	1421167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28552	NC_007513	TCA	2	6	1421171	1421176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28553	NC_007513	GAA	2	6	1421221	1421226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28554	NC_007513	TCGA	2	8	1421233	1421240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28555	NC_007513	GTT	2	6	1421321	1421326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28556	NC_007513	TG	3	6	1421350	1421355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28557	NC_007513	CAT	2	6	1421373	1421378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28558	NC_007513	ATC	2	6	1421465	1421470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28559	NC_007513	GCT	2	6	1421489	1421494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28560	NC_007513	TGCA	2	8	1421517	1421524	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28561	NC_007513	CAT	2	6	1421543	1421548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28562	NC_007513	CGT	2	6	1421560	1421565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28563	NC_007513	GTG	2	6	1421595	1421600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28564	NC_007513	GGA	2	6	1421622	1421627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28565	NC_007513	C	7	7	1421670	1421676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28566	NC_007513	TGT	2	6	1421684	1421689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28568	NC_007513	TGT	2	6	1421872	1421877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28569	NC_007513	CGT	2	6	1422019	1422024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28571	NC_007513	GTC	2	6	1422133	1422138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28572	NC_007513	T	6	6	1422205	1422210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28575	NC_007513	TTGA	2	8	1422262	1422269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28576	NC_007513	CA	3	6	1422312	1422317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28577	NC_007513	ATC	2	6	1422347	1422352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28579	NC_007513	AC	3	6	1422441	1422446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28580	NC_007513	GATT	2	8	1422453	1422460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28581	NC_007513	TC	3	6	1422520	1422525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28582	NC_007513	ACGGTG	2	12	1422537	1422548	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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28584	NC_007513	CATC	2	8	1422594	1422601	25 %	25 %	0 %	50 %	78185035
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28591	NC_007513	CCT	2	6	1423096	1423101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28592	NC_007513	AAT	2	6	1423126	1423131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28593	NC_007513	TCG	2	6	1423139	1423144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28594	NC_007513	GGCT	2	8	1423145	1423152	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28595	NC_007513	ATT	2	6	1423169	1423174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28596	NC_007513	AAC	2	6	1423211	1423216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28597	NC_007513	ATC	2	6	1423239	1423244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28598	NC_007513	TGATT	2	10	1423317	1423326	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28599	NC_007513	GTT	2	6	1423327	1423332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28600	NC_007513	TGA	3	9	1423357	1423365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28601	NC_007513	TTGC	2	8	1423395	1423402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28602	NC_007513	GACA	2	8	1423500	1423507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28603	NC_007513	CAC	2	6	1423515	1423520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28604	NC_007513	GCAG	2	8	1423569	1423576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28605	NC_007513	TGA	2	6	1423581	1423586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28606	NC_007513	GTT	2	6	1423653	1423658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28607	NC_007513	T	7	7	1423750	1423756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28608	NC_007513	TGG	2	6	1423822	1423827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28609	NC_007513	TCCT	2	8	1423829	1423836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28610	NC_007513	G	10	10	1423926	1423935	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28611	NC_007513	TTA	2	6	1423941	1423946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28612	NC_007513	GCC	2	6	1424060	1424065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185036
28613	NC_007513	AAG	2	6	1424066	1424071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185036
28614	NC_007513	TGC	2	6	1424191	1424196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185036
28615	NC_007513	AAGC	2	8	1424304	1424311	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28616	NC_007513	TTG	2	6	1424341	1424346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28617	NC_007513	CCT	2	6	1424355	1424360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28618	NC_007513	CAT	2	6	1424381	1424386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28619	NC_007513	ATAA	2	8	1424450	1424457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28620	NC_007513	T	6	6	1424472	1424477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28621	NC_007513	TGG	2	6	1424480	1424485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28622	NC_007513	TAA	2	6	1424490	1424495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28623	NC_007513	GTA	2	6	1424594	1424599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28624	NC_007513	GAT	2	6	1424638	1424643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28626	NC_007513	AGCACC	2	12	1424890	1424901	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	78185037
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