MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_007513	TG	3	6	939971	939976	0 %	50 %	50 %	0 %	78184526
19003	NC_007513	TGA	2	6	940023	940028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184526
19004	NC_007513	TGC	2	6	940057	940062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184526
19005	NC_007513	GCG	2	6	940096	940101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184526
19006	NC_007513	CAT	2	6	940111	940116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184526
19007	NC_007513	GCC	2	6	940146	940151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19008	NC_007513	C	7	7	940150	940156	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19009	NC_007513	TCTG	2	8	940218	940225	0 %	50 %	25 %	25 %	78184527
19010	NC_007513	TG	3	6	940224	940229	0 %	50 %	50 %	0 %	78184527
19011	NC_007513	CTCA	2	8	940250	940257	25 %	25 %	0 %	50 %	78184527
19012	NC_007513	TGGAT	2	10	940258	940267	20 %	40 %	40 %	0 %	78184527
19013	NC_007513	TGG	2	6	940273	940278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184527
19014	NC_007513	GCC	2	6	940335	940340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184527
19015	NC_007513	ATCAG	2	10	940397	940406	40 %	20 %	20 %	20 %	78184527
19016	NC_007513	GAG	2	6	940419	940424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184527
19017	NC_007513	ATG	2	6	940435	940440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184528
19018	NC_007513	GCC	2	6	940512	940517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184528
19019	NC_007513	CGA	2	6	940613	940618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184528
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19021	NC_007513	TGT	2	6	940761	940766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184528
19022	NC_007513	CGA	2	6	940780	940785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184528
19023	NC_007513	TCG	2	6	940859	940864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184528
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19034	NC_007513	GCA	2	6	941458	941463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184529
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19043	NC_007513	TAA	2	6	941963	941968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19044	NC_007513	GAC	2	6	941999	942004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19045	NC_007513	CAT	3	9	942021	942029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19046	NC_007513	ACA	2	6	942096	942101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19047	NC_007513	C	7	7	942128	942134	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19048	NC_007513	ATG	2	6	942498	942503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19049	NC_007513	A	7	7	942521	942527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19050	NC_007513	CTCAA	2	10	942547	942556	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19051	NC_007513	GAC	3	9	942638	942646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19052	NC_007513	TCT	2	6	942662	942667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19053	NC_007513	GAG	2	6	942675	942680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_007513	AGA	2	6	942750	942755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184531
19055	NC_007513	GTT	2	6	942756	942761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184531
19056	NC_007513	TCG	2	6	942792	942797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184531
19057	NC_007513	CTG	2	6	942803	942808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184531
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19093	NC_007513	CTA	2	6	944847	944852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184534
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19096	NC_007513	TGT	2	6	944908	944913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19097	NC_007513	TGA	2	6	944988	944993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19098	NC_007513	TCG	2	6	944997	945002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19099	NC_007513	GA	3	6	945043	945048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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19105	NC_007513	GAGATC	2	12	945405	945416	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78184535
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19109	NC_007513	GGA	2	6	945609	945614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184536
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19111	NC_007513	GGC	2	6	945674	945679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184536
19112	NC_007513	GCG	2	6	945684	945689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184536
19113	NC_007513	A	6	6	945690	945695	100 %	0 %	0 %	0 %	78184536
19114	NC_007513	ACG	2	6	945733	945738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184536
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19123	NC_007513	CCA	2	6	946271	946276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184536
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19249	NC_007513	GAGG	2	8	952504	952511	25 %	0 %	75 %	0 %	78184545
19250	NC_007513	ATC	2	6	952543	952548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184545
19251	NC_007513	TCG	2	6	952687	952692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184545
19252	NC_007513	ATTC	2	8	952719	952726	25 %	50 %	0 %	25 %	78184545
19253	NC_007513	TTA	2	6	952787	952792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184545
19254	NC_007513	AACT	2	8	952843	952850	50 %	25 %	0 %	25 %	78184545
19255	NC_007513	TTA	2	6	952872	952877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184545
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19257	NC_007513	GTG	2	6	952956	952961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184545
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19261	NC_007513	CTC	2	6	953431	953436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184545
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19267	NC_007513	CATG	2	8	953849	953856	25 %	25 %	25 %	25 %	78184546
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19273	NC_007513	GAGG	2	8	954215	954222	25 %	0 %	75 %	0 %	78184547
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19277	NC_007513	TGA	2	6	954254	954259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184547
19278	NC_007513	A	6	6	954275	954280	100 %	0 %	0 %	0 %	78184547
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19282	NC_007513	TGAAT	2	10	954424	954433	40 %	40 %	20 %	0 %	78184547
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19286	NC_007513	TGA	2	6	954704	954709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184547
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19316	NC_007513	GGC	2	6	955827	955832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19321	NC_007513	GTT	2	6	955997	956002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19343	NC_007513	TCGA	2	8	957204	957211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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19356	NC_007513	GTC	2	6	957952	957957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184551
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19363	NC_007513	G	6	6	958200	958205	0 %	0 %	100 %	0 %	78184551
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19373	NC_007513	CGT	2	6	958607	958612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184551
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19494	NC_007513	GTT	2	6	964604	964609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184560
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19499	NC_007513	AGT	2	6	964928	964933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184560
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