MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_007513	G	6	6	913900	913905	0 %	0 %	100 %	0 %	78184500
18503	NC_007513	CACT	2	8	913962	913969	25 %	25 %	0 %	50 %	78184500
18504	NC_007513	TGC	2	6	913978	913983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184500
18505	NC_007513	TGGC	2	8	913987	913994	0 %	25 %	50 %	25 %	78184500
18506	NC_007513	CCCAA	2	10	914107	914116	40 %	0 %	0 %	60 %	78184500
18507	NC_007513	CAC	2	6	914208	914213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184500
18508	NC_007513	TGCAA	2	10	914227	914236	40 %	20 %	20 %	20 %	78184500
18509	NC_007513	G	7	7	914251	914257	0 %	0 %	100 %	0 %	78184500
18510	NC_007513	CTT	2	6	914300	914305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184500
18511	NC_007513	GTG	2	6	914333	914338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184500
18512	NC_007513	GC	3	6	914413	914418	0 %	0 %	50 %	50 %	78184500
18513	NC_007513	TGA	2	6	914455	914460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184500
18514	NC_007513	GGT	2	6	914489	914494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184500
18515	NC_007513	TCA	2	6	914520	914525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184500
18516	NC_007513	CT	3	6	914745	914750	0 %	50 %	0 %	50 %	78184500
18517	NC_007513	G	7	7	914753	914759	0 %	0 %	100 %	0 %	78184500
18518	NC_007513	CTT	2	6	914773	914778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184500
18519	NC_007513	ATG	2	6	914825	914830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184500
18520	NC_007513	CGC	2	6	914877	914882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184500
18521	NC_007513	TTC	2	6	914890	914895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184500
18522	NC_007513	GTC	2	6	914957	914962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184500
18523	NC_007513	GTG	2	6	915000	915005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184500
18524	NC_007513	GTG	2	6	915017	915022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184500
18525	NC_007513	ACC	2	6	915099	915104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184500
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18527	NC_007513	GCA	2	6	915123	915128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184500
18528	NC_007513	CAGG	2	8	915137	915144	25 %	0 %	50 %	25 %	78184500
18529	NC_007513	GTG	3	9	915206	915214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184500
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18532	NC_007513	GTG	2	6	915374	915379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184500
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18534	NC_007513	GC	3	6	915431	915436	0 %	0 %	50 %	50 %	78184500
18535	NC_007513	GGAT	2	8	915511	915518	25 %	25 %	50 %	0 %	78184500
18536	NC_007513	CGC	2	6	915525	915530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184500
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18539	NC_007513	GGA	2	6	915646	915651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184500
18540	NC_007513	TGCC	2	8	915702	915709	0 %	25 %	25 %	50 %	78184500
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18547	NC_007513	ACC	2	6	916058	916063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184500
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18550	NC_007513	TTG	2	6	916166	916171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184500
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18555	NC_007513	GTG	2	6	916439	916444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184500
18556	NC_007513	CTGT	2	8	916481	916488	0 %	50 %	25 %	25 %	78184500
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18565	NC_007513	CTGG	2	8	916886	916893	0 %	25 %	50 %	25 %	78184501
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18575	NC_007513	CTTC	2	8	917379	917386	0 %	50 %	0 %	50 %	78184501
18576	NC_007513	GCT	2	6	917488	917493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184501
18577	NC_007513	TGG	2	6	917514	917519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184501
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18580	NC_007513	CGGG	2	8	917639	917646	0 %	0 %	75 %	25 %	78184502
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18589	NC_007513	ACGA	2	8	918077	918084	50 %	0 %	25 %	25 %	78184502
18590	NC_007513	GATG	2	8	918091	918098	25 %	25 %	50 %	0 %	78184502
18591	NC_007513	AG	3	6	918124	918129	50 %	0 %	50 %	0 %	78184502
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18593	NC_007513	TTCA	2	8	918248	918255	25 %	50 %	0 %	25 %	78184502
18594	NC_007513	ACA	2	6	918258	918263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184502
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18596	NC_007513	TGATG	2	10	918325	918334	20 %	40 %	40 %	0 %	78184502
18597	NC_007513	GCG	2	6	918377	918382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184502
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18602	NC_007513	CGC	2	6	918611	918616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184502
18603	NC_007513	GCC	2	6	918784	918789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184502
18604	NC_007513	GTCG	2	8	918879	918886	0 %	25 %	50 %	25 %	78184502
18605	NC_007513	GATG	2	8	918912	918919	25 %	25 %	50 %	0 %	78184502
18606	NC_007513	GAT	2	6	919045	919050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184503
18607	NC_007513	TGT	2	6	919114	919119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184503
18608	NC_007513	TGG	2	6	919263	919268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184503
18609	NC_007513	ACC	2	6	919272	919277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184503
18610	NC_007513	GATT	2	8	919339	919346	25 %	50 %	25 %	0 %	78184504
18611	NC_007513	ATC	2	6	919509	919514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184504
18612	NC_007513	GGA	2	6	919539	919544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184504
18613	NC_007513	CCG	2	6	919556	919561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184504
18614	NC_007513	CAT	2	6	919668	919673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184504
18615	NC_007513	T	8	8	919718	919725	0 %	100 %	0 %	0 %	78184504
18616	NC_007513	GT	3	6	919743	919748	0 %	50 %	50 %	0 %	78184504
18617	NC_007513	TTC	2	6	919765	919770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184504
18618	NC_007513	TG	3	6	919796	919801	0 %	50 %	50 %	0 %	78184504
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18621	NC_007513	TCG	2	6	920039	920044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184505
18622	NC_007513	TGG	2	6	920193	920198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184505
18623	NC_007513	CCAGC	2	10	920304	920313	20 %	0 %	20 %	60 %	78184505
18624	NC_007513	TTC	2	6	920347	920352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184505
18625	NC_007513	GCT	2	6	920480	920485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184505
18626	NC_007513	TCA	2	6	920492	920497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184505
18627	NC_007513	GTG	2	6	920501	920506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184505
18628	NC_007513	TGC	2	6	920513	920518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184505
18629	NC_007513	TCA	2	6	920565	920570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184505
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18631	NC_007513	CATC	2	8	920670	920677	25 %	25 %	0 %	50 %	78184505
18632	NC_007513	GCTG	2	8	920695	920702	0 %	25 %	50 %	25 %	78184505
18633	NC_007513	AACG	2	8	920769	920776	50 %	0 %	25 %	25 %	78184505
18634	NC_007513	CGG	2	6	920805	920810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184505
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18637	NC_007513	TCG	2	6	921011	921016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184505
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18642	NC_007513	GTT	2	6	921256	921261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184505
18643	NC_007513	GCCT	2	8	921316	921323	0 %	25 %	25 %	50 %	78184505
18644	NC_007513	AGC	2	6	921331	921336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184505
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18647	NC_007513	CT	3	6	921406	921411	0 %	50 %	0 %	50 %	78184505
18648	NC_007513	TG	3	6	921467	921472	0 %	50 %	50 %	0 %	78184505
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18651	NC_007513	TGGG	2	8	921584	921591	0 %	25 %	75 %	0 %	78184505
18652	NC_007513	ACG	2	6	921602	921607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184505
18653	NC_007513	GCA	2	6	921639	921644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184505
18654	NC_007513	CAC	2	6	921676	921681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184505
18655	NC_007513	GTT	3	9	921687	921695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184505
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18658	NC_007513	ATCA	2	8	921988	921995	50 %	25 %	0 %	25 %	78184506
18659	NC_007513	GAG	2	6	922002	922007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184506
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18662	NC_007513	CTT	2	6	922265	922270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184506
18663	NC_007513	TGA	2	6	922304	922309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184506
18664	NC_007513	A	6	6	922357	922362	100 %	0 %	0 %	0 %	78184506
18665	NC_007513	GAA	2	6	922449	922454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184506
18666	NC_007513	GGC	2	6	922458	922463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184506
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18669	NC_007513	C	7	7	922716	922722	0 %	0 %	0 %	100 %	78184506
18670	NC_007513	CCA	2	6	922832	922837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184506
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18672	NC_007513	CGG	2	6	922970	922975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184506
18673	NC_007513	CCAGTT	2	12	923051	923062	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78184506
18674	NC_007513	CCAAG	2	10	923064	923073	40 %	0 %	20 %	40 %	78184506
18675	NC_007513	GAAG	2	8	923081	923088	50 %	0 %	50 %	0 %	78184506
18676	NC_007513	GA	3	6	923095	923100	50 %	0 %	50 %	0 %	78184506
18677	NC_007513	AGC	2	6	923191	923196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184506
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18679	NC_007513	AG	3	6	923229	923234	50 %	0 %	50 %	0 %	78184506
18680	NC_007513	CAT	2	6	923343	923348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184506
18681	NC_007513	AGCA	2	8	923361	923368	50 %	0 %	25 %	25 %	78184506
18682	NC_007513	GTC	2	6	923409	923414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184506
18683	NC_007513	TCA	2	6	923590	923595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184507
18684	NC_007513	CTG	2	6	923597	923602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184507
18685	NC_007513	GACT	2	8	923690	923697	25 %	25 %	25 %	25 %	78184507
18686	NC_007513	GGC	2	6	923781	923786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184507
18687	NC_007513	GCA	2	6	923894	923899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184507
18688	NC_007513	CAC	2	6	923922	923927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184507
18689	NC_007513	TCAC	2	8	923932	923939	25 %	25 %	0 %	50 %	78184507
18690	NC_007513	CG	3	6	923958	923963	0 %	0 %	50 %	50 %	78184507
18691	NC_007513	CCA	2	6	924002	924007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184507
18692	NC_007513	CGCAC	2	10	924032	924041	20 %	0 %	20 %	60 %	78184507
18693	NC_007513	GCT	2	6	924061	924066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184507
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18696	NC_007513	CCA	2	6	924173	924178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184507
18697	NC_007513	ACT	2	6	924219	924224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184507
18698	NC_007513	CGC	2	6	924291	924296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184507
18699	NC_007513	CGC	2	6	924341	924346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184507
18700	NC_007513	CTTC	2	8	924364	924371	0 %	50 %	0 %	50 %	78184507
18701	NC_007513	ATG	2	6	924373	924378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184507
18702	NC_007513	CGC	2	6	924392	924397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184507
18703	NC_007513	GTT	2	6	924426	924431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184507
18704	NC_007513	CT	3	6	924506	924511	0 %	50 %	0 %	50 %	78184507
18705	NC_007513	TCC	2	6	924540	924545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18706	NC_007513	TTTG	2	8	924718	924725	0 %	75 %	25 %	0 %	78184508
18707	NC_007513	TCC	2	6	924734	924739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184508
18708	NC_007513	CCT	2	6	924753	924758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184508
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18710	NC_007513	CTG	2	6	924853	924858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184508
18711	NC_007513	GTT	2	6	924931	924936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184508
18712	NC_007513	CAG	2	6	925041	925046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184508
18713	NC_007513	C	6	6	925091	925096	0 %	0 %	0 %	100 %	78184508
18714	NC_007513	CCTG	2	8	925185	925192	0 %	25 %	25 %	50 %	78184508
18715	NC_007513	GGA	2	6	925207	925212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184508
18716	NC_007513	TCG	2	6	925227	925232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184508
18717	NC_007513	CGAGTT	2	12	925273	925284	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78184508
18718	NC_007513	TGC	2	6	925295	925300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184508
18719	NC_007513	AAGG	2	8	925330	925337	50 %	0 %	50 %	0 %	78184508
18720	NC_007513	GTT	2	6	925358	925363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184508
18721	NC_007513	GCT	2	6	925480	925485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184508
18722	NC_007513	TCC	2	6	925544	925549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184508
18723	NC_007513	GGA	2	6	925594	925599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184508
18724	NC_007513	TC	3	6	925621	925626	0 %	50 %	0 %	50 %	78184508
18725	NC_007513	GAA	2	6	925666	925671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184509
18726	NC_007513	TGT	2	6	925693	925698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184509
18727	NC_007513	GGCT	2	8	925699	925706	0 %	25 %	50 %	25 %	78184509
18728	NC_007513	GCC	2	6	925780	925785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184509
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18730	NC_007513	CGG	2	6	925899	925904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184509
18731	NC_007513	AGT	2	6	925978	925983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184509
18732	NC_007513	GC	3	6	926092	926097	0 %	0 %	50 %	50 %	78184510
18733	NC_007513	CGG	2	6	926149	926154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184510
18734	NC_007513	CTT	2	6	926183	926188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184510
18735	NC_007513	GCT	2	6	926465	926470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184510
18736	NC_007513	TGG	2	6	926537	926542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184510
18737	NC_007513	AATC	2	8	926582	926589	50 %	25 %	0 %	25 %	78184510
18738	NC_007513	TCA	2	6	926617	926622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184510
18739	NC_007513	CAAA	2	8	926817	926824	75 %	0 %	0 %	25 %	78184510
18740	NC_007513	GT	3	6	927101	927106	0 %	50 %	50 %	0 %	78184510
18741	NC_007513	GCC	2	6	927120	927125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184510
18742	NC_007513	GCC	2	6	927140	927145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184510
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18834	NC_007513	TGCGT	2	10	932263	932272	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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18989	NC_007513	ATC	2	6	939513	939518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184525
18990	NC_007513	GA	3	6	939590	939595	50 %	0 %	50 %	0 %	78184525
18991	NC_007513	CTG	2	6	939599	939604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184525
18992	NC_007513	ATTA	2	8	939649	939656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18993	NC_007513	AGC	2	6	939717	939722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18994	NC_007513	GTG	2	6	939739	939744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18995	NC_007513	GCTG	2	8	939792	939799	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18996	NC_007513	TGC	2	6	939836	939841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18997	NC_007513	TCC	2	6	939857	939862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184526
18998	NC_007513	TGA	2	6	939873	939878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184526
18999	NC_007513	AGA	2	6	939896	939901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184526
19000	NC_007513	TTC	2	6	939910	939915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184526

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