MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_007513	TGC	2	6	860821	860826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184435
17502	NC_007513	CGC	2	6	860831	860836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184435
17503	NC_007513	AGC	2	6	860844	860849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184435
17504	NC_007513	CGG	2	6	860906	860911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184435
17505	NC_007513	GTAA	2	8	861111	861118	50 %	25 %	25 %	0 %	78184435
17506	NC_007513	GGT	2	6	861217	861222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184435
17507	NC_007513	CCG	2	6	861234	861239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184435
17508	NC_007513	TG	3	6	861245	861250	0 %	50 %	50 %	0 %	78184435
17509	NC_007513	CCGAG	2	10	861383	861392	20 %	0 %	40 %	40 %	78184435
17510	NC_007513	TC	3	6	861517	861522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17511	NC_007513	AAC	2	6	861532	861537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17512	NC_007513	TCAA	2	8	861570	861577	50 %	25 %	0 %	25 %	78184436
17513	NC_007513	GGC	2	6	861596	861601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184436
17514	NC_007513	CGC	2	6	861637	861642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184436
17515	NC_007513	CG	3	6	861654	861659	0 %	0 %	50 %	50 %	78184436
17516	NC_007513	AGG	2	6	861684	861689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184436
17517	NC_007513	TCA	2	6	861796	861801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184436
17518	NC_007513	ACA	2	6	861850	861855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184436
17519	NC_007513	C	6	6	861941	861946	0 %	0 %	0 %	100 %	78184436
17520	NC_007513	GCT	2	6	861960	861965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184436
17521	NC_007513	CAC	2	6	861969	861974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184436
17522	NC_007513	TCC	2	6	861984	861989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184436
17523	NC_007513	CAT	2	6	862082	862087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184436
17524	NC_007513	CCA	2	6	862105	862110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184436
17525	NC_007513	GCTG	2	8	862120	862127	0 %	25 %	50 %	25 %	78184436
17526	NC_007513	GGC	2	6	862271	862276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184436
17527	NC_007513	AAG	2	6	862295	862300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184436
17528	NC_007513	GCA	2	6	862318	862323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184436
17529	NC_007513	GCT	2	6	862425	862430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184436
17530	NC_007513	CAC	2	6	862736	862741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184436
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17532	NC_007513	AGC	2	6	862878	862883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184436
17533	NC_007513	GCAA	2	8	862902	862909	50 %	0 %	25 %	25 %	78184436
17534	NC_007513	A	6	6	863049	863054	100 %	0 %	0 %	0 %	78184436
17535	NC_007513	ACTC	2	8	863125	863132	25 %	25 %	0 %	50 %	78184437
17536	NC_007513	ATGG	2	8	863309	863316	25 %	25 %	50 %	0 %	78184437
17537	NC_007513	GTT	2	6	863329	863334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184437
17538	NC_007513	GCT	2	6	863393	863398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184437
17539	NC_007513	CAG	2	6	863663	863668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184437
17540	NC_007513	GATT	2	8	863699	863706	25 %	50 %	25 %	0 %	78184437
17541	NC_007513	TTG	3	9	863762	863770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184438
17542	NC_007513	CCA	2	6	863817	863822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184438
17543	NC_007513	GGT	2	6	863867	863872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184438
17544	NC_007513	TCGA	2	8	863914	863921	25 %	25 %	25 %	25 %	78184438
17545	NC_007513	AAC	2	6	863968	863973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184438
17546	NC_007513	GGTG	2	8	864001	864008	0 %	25 %	75 %	0 %	78184438
17547	NC_007513	GTGAAC	2	12	864083	864094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78184438
17548	NC_007513	GGGA	2	8	864109	864116	25 %	0 %	75 %	0 %	78184438
17549	NC_007513	ACCC	2	8	864154	864161	25 %	0 %	0 %	75 %	78184438
17550	NC_007513	TGC	2	6	864162	864167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184438
17551	NC_007513	CGTTGC	2	12	864168	864179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184438
17552	NC_007513	G	6	6	864202	864207	0 %	0 %	100 %	0 %	78184439
17553	NC_007513	ACG	2	6	864282	864287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184439
17554	NC_007513	AGC	3	9	864332	864340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184439
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17557	NC_007513	CAGC	2	8	864509	864516	25 %	0 %	25 %	50 %	78184439
17558	NC_007513	AAG	2	6	864558	864563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184439
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17561	NC_007513	TCC	2	6	864636	864641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184439
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17565	NC_007513	G	6	6	864832	864837	0 %	0 %	100 %	0 %	78184439
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17570	NC_007513	TCC	3	9	865080	865088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184439
17571	NC_007513	GCCCT	2	10	865157	865166	0 %	20 %	20 %	60 %	78184439
17572	NC_007513	AGC	2	6	865186	865191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184439
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17584	NC_007513	TGC	2	6	866119	866124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184440
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17593	NC_007513	GTT	2	6	866458	866463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184440
17594	NC_007513	GGGT	2	8	866514	866521	0 %	25 %	75 %	0 %	78184440
17595	NC_007513	GA	3	6	866626	866631	50 %	0 %	50 %	0 %	78184440
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17602	NC_007513	TCG	2	6	867030	867035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184441
17603	NC_007513	CGG	2	6	867063	867068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184441
17604	NC_007513	TGG	2	6	867101	867106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184441
17605	NC_007513	TGAA	2	8	867161	867168	50 %	25 %	25 %	0 %	78184441
17606	NC_007513	CTCC	2	8	867385	867392	0 %	25 %	0 %	75 %	78184441
17607	NC_007513	ACT	2	6	867459	867464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184441
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17610	NC_007513	CTT	2	6	867691	867696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184441
17611	NC_007513	ATTCA	2	10	867722	867731	40 %	40 %	0 %	20 %	78184441
17612	NC_007513	ATG	2	6	867817	867822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17613	NC_007513	TTGA	2	8	867824	867831	25 %	50 %	25 %	0 %	78184442
17614	NC_007513	TC	3	6	867854	867859	0 %	50 %	0 %	50 %	78184442
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17991	NC_007513	GGCGAT	2	12	888050	888061	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78184466
17992	NC_007513	GTG	2	6	888072	888077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184466
17993	NC_007513	GGTG	2	8	888230	888237	0 %	25 %	75 %	0 %	78184466
17994	NC_007513	CTG	2	6	888396	888401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184466
17995	NC_007513	CCG	2	6	888441	888446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184466
17996	NC_007513	AGC	2	6	888452	888457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184466
17997	NC_007513	GGT	2	6	888489	888494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184466
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17999	NC_007513	GGT	2	6	888566	888571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184466
18000	NC_007513	GGT	2	6	888657	888662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184466

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