MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_007513	TGAA	2	8	836606	836613	50 %	25 %	25 %	0 %	78184410
17003	NC_007513	GCTG	2	8	836822	836829	0 %	25 %	50 %	25 %	78184410
17004	NC_007513	TTC	2	6	836849	836854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17005	NC_007513	GCG	2	6	836988	836993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184411
17006	NC_007513	ACG	2	6	837044	837049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184411
17007	NC_007513	GTC	2	6	837059	837064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184411
17008	NC_007513	AGC	2	6	837068	837073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184411
17009	NC_007513	GT	3	6	837088	837093	0 %	50 %	50 %	0 %	78184411
17010	NC_007513	TGA	2	6	837094	837099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184411
17011	NC_007513	TGGG	2	8	837312	837319	0 %	25 %	75 %	0 %	78184411
17012	NC_007513	GGAAG	2	10	837445	837454	40 %	0 %	60 %	0 %	78184411
17013	NC_007513	CTT	2	6	837460	837465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184411
17014	NC_007513	CGCC	2	8	837523	837530	0 %	0 %	25 %	75 %	78184411
17015	NC_007513	CGA	2	6	837577	837582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184411
17016	NC_007513	GAT	2	6	837617	837622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184411
17017	NC_007513	CGAG	2	8	837748	837755	25 %	0 %	50 %	25 %	78184411
17018	NC_007513	GGCA	2	8	837762	837769	25 %	0 %	50 %	25 %	78184411
17019	NC_007513	GAAT	2	8	837786	837793	50 %	25 %	25 %	0 %	78184411
17020	NC_007513	ACG	2	6	837831	837836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184411
17021	NC_007513	CATCCA	2	12	837859	837870	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	78184411
17022	NC_007513	TCAA	2	8	837897	837904	50 %	25 %	0 %	25 %	78184411
17023	NC_007513	GAT	2	6	837910	837915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184411
17024	NC_007513	TCG	2	6	837963	837968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184411
17025	NC_007513	CCG	2	6	837990	837995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184411
17026	NC_007513	AGG	2	6	838003	838008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184411
17027	NC_007513	CAC	2	6	838013	838018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184411
17028	NC_007513	ATCG	2	8	838044	838051	25 %	25 %	25 %	25 %	78184411
17029	NC_007513	CGAT	3	12	838143	838154	25 %	25 %	25 %	25 %	78184411
17030	NC_007513	GTCC	2	8	838192	838199	0 %	25 %	25 %	50 %	78184411
17031	NC_007513	GCA	2	6	838216	838221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184411
17032	NC_007513	GCG	2	6	838240	838245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184411
17033	NC_007513	CAA	2	6	838264	838269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184411
17034	NC_007513	GGT	2	6	838394	838399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184411
17035	NC_007513	AGG	2	6	838423	838428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78184411
17036	NC_007513	GCA	3	9	838433	838441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184411
17037	NC_007513	ATC	2	6	838491	838496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184411
17038	NC_007513	AGT	2	6	838597	838602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184411
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17040	NC_007513	TCG	2	6	838701	838706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184411
17041	NC_007513	GATG	2	8	838873	838880	25 %	25 %	50 %	0 %	78184411
17042	NC_007513	TCGCTG	2	12	838965	838976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184411
17043	NC_007513	TCCCC	2	10	838995	839004	0 %	20 %	0 %	80 %	78184411
17044	NC_007513	TTC	2	6	839051	839056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184411
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17047	NC_007513	CCG	2	6	839113	839118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184411
17048	NC_007513	GAC	2	6	839162	839167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184411
17049	NC_007513	ATCG	2	8	839171	839178	25 %	25 %	25 %	25 %	78184411
17050	NC_007513	AAGC	2	8	839187	839194	50 %	0 %	25 %	25 %	78184411
17051	NC_007513	TCG	2	6	839226	839231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184411
17052	NC_007513	AGC	2	6	839255	839260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184411
17053	NC_007513	TTGCT	2	10	839284	839293	0 %	60 %	20 %	20 %	78184411
17054	NC_007513	CAC	3	9	839336	839344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184411
17055	NC_007513	TGC	2	6	839380	839385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184411
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17057	NC_007513	TGC	2	6	839527	839532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184411
17058	NC_007513	ACG	2	6	839541	839546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184411
17059	NC_007513	TCAA	2	8	839607	839614	50 %	25 %	0 %	25 %	78184411
17060	NC_007513	GGC	2	6	839657	839662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184411
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17064	NC_007513	GCT	2	6	839738	839743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184411
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17067	NC_007513	GCTT	2	8	839826	839833	0 %	50 %	25 %	25 %	78184411
17068	NC_007513	CAG	2	6	839837	839842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184411
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17070	NC_007513	TTCT	2	8	839987	839994	0 %	75 %	0 %	25 %	78184411
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17073	NC_007513	ACC	2	6	840096	840101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184411
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17081	NC_007513	GAA	2	6	840448	840453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184412
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17089	NC_007513	ATGC	2	8	841008	841015	25 %	25 %	25 %	25 %	78184413
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17105	NC_007513	TGG	2	6	841732	841737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184414
17106	NC_007513	TGAAC	2	10	841836	841845	40 %	20 %	20 %	20 %	78184414
17107	NC_007513	ACC	2	6	841849	841854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17108	NC_007513	TCG	2	6	841927	841932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184415
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17114	NC_007513	GCA	2	6	842248	842253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184415
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17489	NC_007513	GA	3	6	860177	860182	50 %	0 %	50 %	0 %	78184434
17490	NC_007513	GC	3	6	860299	860304	0 %	0 %	50 %	50 %	78184434
17491	NC_007513	GCA	2	6	860313	860318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184434
17492	NC_007513	CGG	2	6	860322	860327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184434
17493	NC_007513	TGAAC	2	10	860423	860432	40 %	20 %	20 %	20 %	78184435
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17496	NC_007513	CG	3	6	860582	860587	0 %	0 %	50 %	50 %	78184435
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