MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_007513	CACG	2	8	811535	811542	25 %	0 %	25 %	50 %	78184379
16503	NC_007513	TCGAA	2	10	811571	811580	40 %	20 %	20 %	20 %	78184379
16504	NC_007513	ATC	2	6	811633	811638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78184379
16505	NC_007513	TGC	2	6	811700	811705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184379
16506	NC_007513	ACAA	2	8	811725	811732	75 %	0 %	0 %	25 %	78184379
16507	NC_007513	GACA	2	8	811738	811745	50 %	0 %	25 %	25 %	78184379
16508	NC_007513	GTT	2	6	811775	811780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184379
16509	NC_007513	CTTG	2	8	811879	811886	0 %	50 %	25 %	25 %	78184379
16510	NC_007513	GAT	2	6	812181	812186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16511	NC_007513	CAT	2	6	812203	812208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16512	NC_007513	ATT	2	6	812216	812221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16513	NC_007513	CTT	2	6	812259	812264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16514	NC_007513	GAT	2	6	812295	812300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16515	NC_007513	AACA	2	8	812365	812372	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16516	NC_007513	CAG	2	6	812434	812439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184380
16517	NC_007513	CAG	2	6	812473	812478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184380
16518	NC_007513	CTC	2	6	812534	812539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184380
16519	NC_007513	AG	3	6	812583	812588	50 %	0 %	50 %	0 %	78184380
16520	NC_007513	TTC	2	6	812614	812619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184380
16521	NC_007513	TTGT	2	8	812662	812669	0 %	75 %	25 %	0 %	78184380
16522	NC_007513	GCA	2	6	812700	812705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184380
16523	NC_007513	TGA	2	6	812745	812750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184380
16524	NC_007513	ATT	2	6	812756	812761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184380
16525	NC_007513	CAC	2	6	812816	812821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184380
16526	NC_007513	GCC	2	6	812848	812853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184380
16527	NC_007513	AGT	2	6	812882	812887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16528	NC_007513	CAA	2	6	812957	812962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184381
16529	NC_007513	GTG	2	6	812995	813000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184381
16530	NC_007513	GCT	2	6	813036	813041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184381
16531	NC_007513	CAG	2	6	813128	813133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184381
16532	NC_007513	TGAGT	2	10	813212	813221	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16533	NC_007513	ATC	2	6	813268	813273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16534	NC_007513	GTT	2	6	813295	813300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16535	NC_007513	CAG	2	6	813322	813327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16536	NC_007513	GGT	2	6	813349	813354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16537	NC_007513	TCT	2	6	813381	813386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184382
16538	NC_007513	TGG	2	6	813402	813407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184382
16539	NC_007513	GAT	2	6	813432	813437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184382
16540	NC_007513	TTGA	2	8	813457	813464	25 %	50 %	25 %	0 %	78184382
16541	NC_007513	TATTT	2	10	813468	813477	20 %	80 %	0 %	0 %	78184382
16542	NC_007513	TAG	2	6	813500	813505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184382
16543	NC_007513	AGT	2	6	813574	813579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184382
16544	NC_007513	TGC	2	6	813582	813587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184382
16545	NC_007513	AATT	2	8	813588	813595	50 %	50 %	0 %	0 %	78184382
16546	NC_007513	TTTA	2	8	813651	813658	25 %	75 %	0 %	0 %	78184382
16547	NC_007513	TTGC	2	8	813682	813689	0 %	50 %	25 %	25 %	78184382
16548	NC_007513	CCA	2	6	813708	813713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184382
16549	NC_007513	TGC	2	6	813753	813758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184382
16550	NC_007513	GGC	2	6	813841	813846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184382
16551	NC_007513	TGA	2	6	813851	813856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184382
16552	NC_007513	CTG	2	6	813878	813883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184382
16553	NC_007513	TCTG	2	8	813909	813916	0 %	50 %	25 %	25 %	78184382
16554	NC_007513	GTC	2	6	814063	814068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16556	NC_007513	GAT	2	6	814194	814199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184383
16557	NC_007513	CCA	2	6	814304	814309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184383
16558	NC_007513	A	7	7	814309	814315	100 %	0 %	0 %	0 %	78184383
16559	NC_007513	CGCAT	2	10	814328	814337	20 %	20 %	20 %	40 %	78184383
16560	NC_007513	TGA	2	6	814365	814370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16561	NC_007513	CAAT	2	8	814372	814379	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16562	NC_007513	CTG	2	6	814421	814426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16563	NC_007513	GTC	2	6	814429	814434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16564	NC_007513	TTGG	2	8	814453	814460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16565	NC_007513	ACA	2	6	814482	814487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16566	NC_007513	TTGT	2	8	814529	814536	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16567	NC_007513	CATTTG	2	12	814565	814576	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16568	NC_007513	GAA	2	6	814596	814601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16569	NC_007513	A	6	6	814600	814605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16570	NC_007513	GTT	2	6	814612	814617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16571	NC_007513	TCA	2	6	814656	814661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16573	NC_007513	GTTC	2	8	814776	814783	0 %	50 %	25 %	25 %	78184384
16574	NC_007513	A	9	9	814807	814815	100 %	0 %	0 %	0 %	78184384
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16578	NC_007513	AAGT	2	8	814975	814982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16579	NC_007513	TGG	2	6	815024	815029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16580	NC_007513	CTG	2	6	815035	815040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16581	NC_007513	GTTGA	2	10	815079	815088	20 %	40 %	40 %	0 %	78184385
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16590	NC_007513	CCAT	2	8	815630	815637	25 %	25 %	0 %	50 %	78184386
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16596	NC_007513	AAC	2	6	815783	815788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78184386
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16598	NC_007513	TGAA	2	8	815864	815871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16599	NC_007513	TCGA	2	8	815872	815879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16604	NC_007513	TGC	3	9	816030	816038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184387
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16607	NC_007513	A	6	6	816124	816129	100 %	0 %	0 %	0 %	78184387
16608	NC_007513	A	6	6	816140	816145	100 %	0 %	0 %	0 %	78184387
16609	NC_007513	ATT	2	6	816243	816248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78184388
16610	NC_007513	GGGT	2	8	816402	816409	0 %	25 %	75 %	0 %	78184388
16611	NC_007513	TCCTT	2	10	816470	816479	0 %	60 %	0 %	40 %	78184388
16612	NC_007513	CAC	2	6	816490	816495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184388
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16619	NC_007513	CGA	2	6	817137	817142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184389
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16622	NC_007513	T	6	6	817312	817317	0 %	100 %	0 %	0 %	78184389
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