MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_007513	GCT	2	6	761852	761857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184323
15503	NC_007513	CCA	3	9	761871	761879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184323
15504	NC_007513	TCC	2	6	761927	761932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184323
15505	NC_007513	CGC	2	6	762070	762075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184323
15506	NC_007513	CTCA	2	8	762076	762083	25 %	25 %	0 %	50 %	78184323
15507	NC_007513	TGA	2	6	762171	762176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184323
15508	NC_007513	GCC	2	6	762254	762259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184324
15509	NC_007513	GCC	4	12	762266	762277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184324
15510	NC_007513	CCG	2	6	762305	762310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184324
15511	NC_007513	GCC	2	6	762388	762393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184324
15512	NC_007513	GCAT	2	8	762405	762412	25 %	25 %	25 %	25 %	78184324
15513	NC_007513	CAG	2	6	762546	762551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184324
15514	NC_007513	GGT	2	6	762577	762582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184324
15515	NC_007513	ATCG	2	8	762589	762596	25 %	25 %	25 %	25 %	78184324
15516	NC_007513	GCC	2	6	762641	762646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184324
15517	NC_007513	GTGAC	2	10	762698	762707	20 %	20 %	40 %	20 %	78184324
15518	NC_007513	CGG	2	6	762727	762732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184324
15519	NC_007513	GCA	2	6	762822	762827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184324
15520	NC_007513	GAT	2	6	762865	762870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184324
15521	NC_007513	CCA	2	6	762934	762939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184324
15522	NC_007513	ACC	2	6	763022	763027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184324
15523	NC_007513	CGC	2	6	763032	763037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184324
15524	NC_007513	TCT	2	6	763190	763195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78184324
15525	NC_007513	GCC	2	6	763290	763295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184324
15526	NC_007513	GCA	2	6	763298	763303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184324
15527	NC_007513	TTG	2	6	763318	763323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184324
15528	NC_007513	TGT	2	6	763364	763369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184324
15529	NC_007513	CGGTGC	2	12	763416	763427	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78184324
15530	NC_007513	TGT	2	6	763433	763438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184324
15531	NC_007513	AGGT	2	8	763460	763467	25 %	25 %	50 %	0 %	78184324
15532	NC_007513	GAA	2	6	763558	763563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_007513	GAGCA	2	10	763603	763612	40 %	0 %	40 %	20 %	78184325
15534	NC_007513	CGG	3	9	763614	763622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184325
15535	NC_007513	GGAT	2	8	763649	763656	25 %	25 %	50 %	0 %	78184325
15536	NC_007513	AGC	2	6	763691	763696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184325
15537	NC_007513	GT	3	6	763698	763703	0 %	50 %	50 %	0 %	78184325
15538	NC_007513	TCG	2	6	763727	763732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184325
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15540	NC_007513	TCG	2	6	763817	763822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184325
15541	NC_007513	ACTTC	2	10	763872	763881	20 %	40 %	0 %	40 %	78184325
15542	NC_007513	TCC	2	6	763942	763947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78184325
15543	NC_007513	GCA	2	6	763952	763957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184325
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15545	NC_007513	GGT	2	6	764101	764106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78184325
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15549	NC_007513	GTA	2	6	764362	764367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78184325
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15551	NC_007513	GCA	2	6	764469	764474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184325
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15553	NC_007513	ACC	2	6	764552	764557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78184325
15554	NC_007513	GATC	2	8	764733	764740	25 %	25 %	25 %	25 %	78184325
15555	NC_007513	CCG	2	6	764753	764758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184325
15556	NC_007513	CGA	2	6	764814	764819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184325
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15559	NC_007513	GTT	2	6	764949	764954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184325
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15561	NC_007513	CGC	2	6	765000	765005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78184325
15562	NC_007513	CAG	2	6	765148	765153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15563	NC_007513	A	9	9	765193	765201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_007513	TTCC	2	8	765300	765307	0 %	50 %	0 %	50 %	78184326
15565	NC_007513	GGC	2	6	765321	765326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78184326
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15575	NC_007513	CA	3	6	765791	765796	50 %	0 %	0 %	50 %	78184326
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15588	NC_007513	GCCT	2	8	766368	766375	0 %	25 %	25 %	50 %	78184326
15589	NC_007513	GAC	2	6	766376	766381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184326
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15594	NC_007513	AAG	2	6	766538	766543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15595	NC_007513	TCC	2	6	766544	766549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15596	NC_007513	CATCGG	2	12	766575	766586	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15603	NC_007513	GCA	2	6	766834	766839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184327
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15605	NC_007513	TTG	2	6	766856	766861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78184327
15606	NC_007513	TCG	2	6	766951	766956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78184327
15607	NC_007513	CT	3	6	766999	767004	0 %	50 %	0 %	50 %	78184327
15608	NC_007513	GAA	2	6	767057	767062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78184327
15609	NC_007513	CGA	2	6	767071	767076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184327
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15611	NC_007513	ACG	2	6	767116	767121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78184327
15612	NC_007513	CATT	2	8	767140	767147	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15613	NC_007513	A	7	7	767165	767171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_007513	T	7	7	767188	767194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15615	NC_007513	TTC	2	6	767222	767227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15616	NC_007513	GGTGAA	2	12	767420	767431	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	78184328
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15620	NC_007513	CCGA	2	8	767792	767799	25 %	0 %	25 %	50 %	78184328
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